MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 1905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021823	AACAA	2	10	2333	2342	80 %	0 %	0 %	20 %	525865815
2	NC_021823	TCGGA	2	10	3832	3841	20 %	20 %	40 %	20 %	525865815
3	NC_021823	CAAAT	2	10	4339	4348	60 %	20 %	0 %	20 %	525865816
4	NC_021823	AGATG	2	10	4637	4646	40 %	20 %	40 %	0 %	525865816
5	NC_021823	CTGAA	2	10	5990	5999	40 %	20 %	20 %	20 %	525865818
6	NC_021823	CAAAT	2	10	6215	6224	60 %	20 %	0 %	20 %	525865819
7	NC_021823	ACTGC	2	10	9949	9958	20 %	20 %	20 %	40 %	525865821
8	NC_021823	AATAA	2	10	16424	16433	80 %	20 %	0 %	0 %	525865827
9	NC_021823	GAATT	2	10	17322	17331	40 %	40 %	20 %	0 %	525865828
10	NC_021823	CATTT	2	10	17500	17509	20 %	60 %	0 %	20 %	525865828
11	NC_021823	TTTTC	2	10	17530	17539	0 %	80 %	0 %	20 %	525865829
12	NC_021823	CATTT	2	10	20463	20472	20 %	60 %	0 %	20 %	525865832
13	NC_021823	ACTGA	2	10	22546	22555	40 %	20 %	20 %	20 %	525868321
14	NC_021823	CCAAA	2	10	25148	25157	60 %	0 %	0 %	40 %	525865835
15	NC_021823	AAGAA	2	10	25766	25775	80 %	0 %	20 %	0 %	525865836
16	NC_021823	GGCTG	2	10	30210	30219	0 %	20 %	60 %	20 %	525865840
17	NC_021823	ATGGT	2	10	30667	30676	20 %	40 %	40 %	0 %	525865840
18	NC_021823	TAAAT	2	10	33961	33970	60 %	40 %	0 %	0 %	525865844
19	NC_021823	CCATT	2	10	36812	36821	20 %	40 %	0 %	40 %	525865847
20	NC_021823	AATAG	2	10	38041	38050	60 %	20 %	20 %	0 %	525865849
21	NC_021823	ATTTT	2	10	38450	38459	20 %	80 %	0 %	0 %	525865849
22	NC_021823	GAGAG	2	10	39271	39280	40 %	0 %	60 %	0 %	525865851
23	NC_021823	TAAAA	2	10	40887	40896	80 %	20 %	0 %	0 %	525865852
24	NC_021823	TGCCT	2	10	41071	41080	0 %	40 %	20 %	40 %	525865853
25	NC_021823	GTGAA	2	10	46508	46517	40 %	20 %	40 %	0 %	525865858
26	NC_021823	ATAAA	2	10	48400	48409	80 %	20 %	0 %	0 %	525865859
27	NC_021823	TTTAT	2	10	49178	49187	20 %	80 %	0 %	0 %	525865860
28	NC_021823	TTCCG	2	10	50885	50894	0 %	40 %	20 %	40 %	525865862
29	NC_021823	TTTGT	2	10	53656	53665	0 %	80 %	20 %	0 %	525865865
30	NC_021823	TAAAT	2	10	58658	58667	60 %	40 %	0 %	0 %	525865868
31	NC_021823	TAAAA	2	10	59406	59415	80 %	20 %	0 %	0 %	525865868
32	NC_021823	CCAAA	2	10	60616	60625	60 %	0 %	0 %	40 %	525865870
33	NC_021823	AGAAA	2	10	61367	61376	80 %	0 %	20 %	0 %	525865870
34	NC_021823	ATTTA	2	10	62570	62579	40 %	60 %	0 %	0 %	525865871
35	NC_021823	GAAAA	2	10	64578	64587	80 %	0 %	20 %	0 %	525865872
36	NC_021823	CAGCC	2	10	67129	67138	20 %	0 %	20 %	60 %	525865874
37	NC_021823	TAAAT	2	10	67301	67310	60 %	40 %	0 %	0 %	525865874
38	NC_021823	TGAAA	2	10	68762	68771	60 %	20 %	20 %	0 %	525865876
39	NC_021823	TCACT	2	10	75672	75681	20 %	40 %	0 %	40 %	525865881
40	NC_021823	AAGTA	2	10	77639	77648	60 %	20 %	20 %	0 %	525865883
41	NC_021823	TAAAG	2	10	78168	78177	60 %	20 %	20 %	0 %	525865884
42	NC_021823	GTAAA	2	10	80058	80067	60 %	20 %	20 %	0 %	525865887
43	NC_021823	AAAGA	2	10	80187	80196	80 %	0 %	20 %	0 %	525865887
44	NC_021823	AACCA	2	10	80756	80765	60 %	0 %	0 %	40 %	525865888
45	NC_021823	AATCA	2	10	84022	84031	60 %	20 %	0 %	20 %	525865890
46	NC_021823	CCAAA	2	10	84126	84135	60 %	0 %	0 %	40 %	525865891
47	NC_021823	AAGAA	2	10	84798	84807	80 %	0 %	20 %	0 %	525865891
48	NC_021823	TTTTC	2	10	86366	86375	0 %	80 %	0 %	20 %	525865893
49	NC_021823	TTACT	2	10	86740	86749	20 %	60 %	0 %	20 %	525865893
50	NC_021823	ACTTT	2	10	89403	89412	20 %	60 %	0 %	20 %	525865895
51	NC_021823	TCATT	2	10	90456	90465	20 %	60 %	0 %	20 %	525865896
52	NC_021823	TTTGC	2	10	92002	92011	0 %	60 %	20 %	20 %	525865899
53	NC_021823	GAAGT	2	10	92764	92773	40 %	20 %	40 %	0 %	525865899
54	NC_021823	GATTT	2	10	93595	93604	20 %	60 %	20 %	0 %	525865900
55	NC_021823	ATAAA	2	10	99377	99386	80 %	20 %	0 %	0 %	525865908
56	NC_021823	AAAAC	2	10	100893	100902	80 %	0 %	0 %	20 %	525865909
57	NC_021823	ATGAA	2	10	102810	102819	60 %	20 %	20 %	0 %	525865909
58	NC_021823	AAAAT	2	10	106020	106029	80 %	20 %	0 %	0 %	525865911
59	NC_021823	TGGCC	2	10	106376	106385	0 %	20 %	40 %	40 %	525865911
60	NC_021823	GATAT	2	10	106906	106915	40 %	40 %	20 %	0 %	525868324
61	NC_021823	TGATT	2	10	108389	108398	20 %	60 %	20 %	0 %	525868324
62	NC_021823	AAATT	2	10	109628	109637	60 %	40 %	0 %	0 %	525868326
63	NC_021823	TGGAT	2	10	109748	109757	20 %	40 %	40 %	0 %	525868326
64	NC_021823	TTAAT	2	10	112058	112067	40 %	60 %	0 %	0 %	525865913
65	NC_021823	ATAAA	2	10	112445	112454	80 %	20 %	0 %	0 %	525865913
66	NC_021823	ATATT	2	10	112584	112593	40 %	60 %	0 %	0 %	525865913
67	NC_021823	GAAGG	2	10	113112	113121	40 %	0 %	60 %	0 %	525865914
68	NC_021823	ATATT	2	10	114081	114090	40 %	60 %	0 %	0 %	525865916
69	NC_021823	CTTTT	2	10	114533	114542	0 %	80 %	0 %	20 %	525865916
70	NC_021823	CTCTT	2	10	116635	116644	0 %	60 %	0 %	40 %	525868330
71	NC_021823	AAAAT	2	10	117419	117428	80 %	20 %	0 %	0 %	525868331
72	NC_021823	GAAAA	2	10	119006	119015	80 %	0 %	20 %	0 %	525868334
73	NC_021823	GATGG	2	10	120147	120156	20 %	20 %	60 %	0 %	525868337
74	NC_021823	GAGTT	2	10	122089	122098	20 %	40 %	40 %	0 %	525868341
75	NC_021823	CTTTA	2	10	122497	122506	20 %	60 %	0 %	20 %	525868342
76	NC_021823	GAGAT	2	10	122568	122577	40 %	20 %	40 %	0 %	525868342
77	NC_021823	AAATT	2	10	124202	124211	60 %	40 %	0 %	0 %	525868344
78	NC_021823	AGAAA	2	10	124449	124458	80 %	0 %	20 %	0 %	525868345
79	NC_021823	AAAAC	2	10	124485	124494	80 %	0 %	0 %	20 %	525868345
80	NC_021823	ATAGC	2	10	124796	124805	40 %	20 %	20 %	20 %	525868346
81	NC_021823	ATTTA	2	10	125717	125726	40 %	60 %	0 %	0 %	525865921
82	NC_021823	AAATC	2	10	128539	128548	60 %	20 %	0 %	20 %	525865922
83	NC_021823	AAAAT	2	10	128624	128633	80 %	20 %	0 %	0 %	525865922
84	NC_021823	GTTTT	2	10	128801	128810	0 %	80 %	20 %	0 %	525865922
85	NC_021823	GAAGT	2	10	129601	129610	40 %	20 %	40 %	0 %	525868352
86	NC_021823	ACAAG	2	10	132678	132687	60 %	0 %	20 %	20 %	525868354
87	NC_021823	GGATT	2	10	134446	134455	20 %	40 %	40 %	0 %	525868358
88	NC_021823	TAAAT	2	10	134647	134656	60 %	40 %	0 %	0 %	525868358
89	NC_021823	CAGAA	2	10	137735	137744	60 %	0 %	20 %	20 %	525868361
90	NC_021823	CACGA	2	10	139173	139182	40 %	0 %	20 %	40 %	525868361
91	NC_021823	GAAAG	2	10	140374	140383	60 %	0 %	40 %	0 %	525868362
92	NC_021823	TACAA	2	10	141037	141046	60 %	20 %	0 %	20 %	525868362
93	NC_021823	TGTGA	2	10	141362	141371	20 %	40 %	40 %	0 %	525868362
94	NC_021823	TCTGA	2	10	142033	142042	20 %	40 %	20 %	20 %	525868363
95	NC_021823	TAAAT	2	10	143517	143526	60 %	40 %	0 %	0 %	525868363
96	NC_021823	GGGTT	2	10	144560	144569	0 %	40 %	60 %	0 %	525868364
97	NC_021823	CAATG	2	10	144991	145000	40 %	20 %	20 %	20 %	525868364
98	NC_021823	GGAAA	2	10	149810	149819	60 %	0 %	40 %	0 %	525865924
99	NC_021823	AAACA	2	10	151109	151118	80 %	0 %	0 %	20 %	525865925
100	NC_021823	TATTT	2	10	152487	152496	20 %	80 %	0 %	0 %	525865926
101	NC_021823	GCCGC	2	10	154129	154138	0 %	0 %	40 %	60 %	525865927
102	NC_021823	TTCGT	2	10	155134	155143	0 %	60 %	20 %	20 %	525865929
103	NC_021823	TAAAA	2	10	156932	156941	80 %	20 %	0 %	0 %	525865929
104	NC_021823	TTTTA	2	10	157314	157323	20 %	80 %	0 %	0 %	525865930
105	NC_021823	TCGGC	2	10	158789	158798	0 %	20 %	40 %	40 %	525865931
106	NC_021823	GAGCA	2	10	160155	160164	40 %	0 %	40 %	20 %	525865933
107	NC_021823	AAATC	2	10	160417	160426	60 %	20 %	0 %	20 %	525865933
108	NC_021823	AGAAA	2	10	161505	161514	80 %	0 %	20 %	0 %	525865934
109	NC_021823	CTGAA	2	10	162302	162311	40 %	20 %	20 %	20 %	525865935
110	NC_021823	ACAAA	2	10	162841	162850	80 %	0 %	0 %	20 %	525865935
111	NC_021823	AGTTA	2	10	163662	163671	40 %	40 %	20 %	0 %	525865935
112	NC_021823	ATTGT	2	10	164573	164582	20 %	60 %	20 %	0 %	525865936
113	NC_021823	GCAAA	2	10	165494	165503	60 %	0 %	20 %	20 %	525865937
114	NC_021823	ATTTT	2	10	165535	165544	20 %	80 %	0 %	0 %	525865937
115	NC_021823	TGGAA	2	10	167192	167201	40 %	20 %	40 %	0 %	525865940
116	NC_021823	AGCAT	2	10	170650	170659	40 %	20 %	20 %	20 %	525865945
117	NC_021823	CGATG	2	10	173278	173287	20 %	20 %	40 %	20 %	525865949
118	NC_021823	ATTTT	2	10	175873	175882	20 %	80 %	0 %	0 %	525865953
119	NC_021823	ACCAA	2	10	179556	179565	60 %	0 %	0 %	40 %	525865957
120	NC_021823	TTCCA	2	10	182653	182662	20 %	40 %	0 %	40 %	525865963
121	NC_021823	AGATG	2	10	183232	183241	40 %	20 %	40 %	0 %	525865963
122	NC_021823	ATTTT	2	10	183620	183629	20 %	80 %	0 %	0 %	525865964
123	NC_021823	ACAAA	2	10	184119	184128	80 %	0 %	0 %	20 %	525865964
124	NC_021823	AATTT	2	10	185329	185338	40 %	60 %	0 %	0 %	525865965
125	NC_021823	AGCGG	2	10	187670	187679	20 %	0 %	60 %	20 %	525865966
126	NC_021823	AAGTG	2	10	187828	187837	40 %	20 %	40 %	0 %	525865967
127	NC_021823	CTTTA	2	10	188547	188556	20 %	60 %	0 %	20 %	525865968
128	NC_021823	GAAAA	2	10	189411	189420	80 %	0 %	20 %	0 %	525865969
129	NC_021823	CAGTT	2	10	190619	190628	20 %	40 %	20 %	20 %	525865971
130	NC_021823	ATAAA	2	10	191821	191830	80 %	20 %	0 %	0 %	525865972
131	NC_021823	GAAGA	2	10	194305	194314	60 %	0 %	40 %	0 %	525865974
132	NC_021823	CAAAC	2	10	195758	195767	60 %	0 %	0 %	40 %	525865975
133	NC_021823	TTAAT	2	10	198427	198436	40 %	60 %	0 %	0 %	525865978
134	NC_021823	GAAAC	2	10	199296	199305	60 %	0 %	20 %	20 %	525865980
135	NC_021823	AATGA	2	10	200266	200275	60 %	20 %	20 %	0 %	525865981
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