MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021822	TGAAAT	2	12	4388	4399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021822	TGCAAA	2	12	12529	12540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021822	ATCTTT	2	12	52148	52159	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021822	TATTTT	2	12	91666	91677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021822	ATAAAT	2	12	132982	132993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021822	ACATAA	2	12	167653	167664	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021822	ATGCCA	2	12	170077	170088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021822	TACCAT	2	12	194242	194253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021822	TGTTTT	2	12	197751	197762	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021822	ATATAA	2	12	205294	205305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021822	TTTGTT	2	12	209457	209468	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021822	TAGATT	2	12	217707	217718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021822	CTAAAC	2	12	278564	278575	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021822	TTTTTA	2	12	303474	303485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021822	TGCATT	2	12	388380	388391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021822	TATTTT	2	12	388440	388451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021822	TTTAGC	2	12	435313	435324	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021822	CGATGA	2	12	511924	511935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021822	TTATGA	2	12	550983	550994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021822	CGAACA	2	12	552096	552107	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021822	AAAAAC	2	12	555122	555133	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021822	AAAAAG	2	12	561962	561973	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021822	TAAAAA	2	12	610852	610863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021822	AAACTC	2	12	610917	610928	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021822	GTTAAA	2	12	636808	636819	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021822	TTAATT	2	12	670720	670731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021822	TACTAT	2	12	673273	673284	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021822	ACTTAT	2	12	680179	680190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021822	TGAGCA	2	12	746432	746443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021822	TTCCCT	2	12	802027	802038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021822	AATTGG	2	12	809966	809977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021822	TTTATT	2	12	837885	837896	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021822	TATCAT	2	12	858610	858621	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021822	TTGACT	2	12	878898	878909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021822	TTGGTT	2	12	917878	917889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021822	GATACG	2	12	967028	967039	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021822	CATTGC	2	12	1015169	1015180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021822	CCTCAC	2	12	1022670	1022681	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021822	CTTTTT	2	12	1025012	1025023	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021822	TTAACG	2	12	1102289	1102300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021822	ATATGT	2	12	1140066	1140077	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021822	ATTCTC	2	12	1147908	1147919	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021822	TACTTC	2	12	1170349	1170360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021822	ATTTTA	2	12	1195366	1195377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021822	TCGTTA	2	12	1219103	1219114	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021822	AAATGA	2	12	1235659	1235670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021822	AGAATA	2	12	1238617	1238628	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021822	ATTTTC	2	12	1262170	1262181	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021822	TTTGTA	2	12	1269288	1269299	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021822	AGCAAC	2	12	1286772	1286783	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021822	TATAAA	2	12	1347623	1347634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021822	AAAAAG	2	12	1361352	1361363	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021822	AACGAA	2	12	1382463	1382474	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021822	TAAAAA	2	12	1420938	1420949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021822	TAAAAC	2	12	1450898	1450909	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021822	ACAAAA	2	12	1459236	1459247	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021822	GTTTTT	2	12	1535861	1535872	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021822	AAACTA	2	12	1539579	1539590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021822	AAACGA	2	12	1546677	1546688	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021822	TTTTAA	2	12	1546947	1546958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021822	ATTTAG	2	12	1547671	1547682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021822	ACAATA	2	12	1582283	1582294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021822	AATTTT	2	12	1642849	1642860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021822	CTTTAT	2	12	1645442	1645453	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021822	AAACAC	2	12	1645454	1645465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021822	GATATT	2	12	1659712	1659723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021822	CAAAAA	2	12	1669687	1669698	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021822	TGAAAG	2	12	1687015	1687026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021822	TAAAAA	2	12	1701132	1701143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021822	ATTAAA	2	12	1703544	1703555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021822	AAAGCC	2	12	1704959	1704970	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021822	TAGCTT	2	12	1719937	1719948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.