MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 5098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021822	GTAG	2	8	1578	1585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021822	TTCC	2	8	1929	1936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021822	GCCT	2	8	1986	1993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021822	TGAC	2	8	2816	2823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021822	GTAC	2	8	2899	2906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021822	AGTA	2	8	3302	3309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021822	CGTC	2	8	3339	3346	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021822	AAAG	2	8	3461	3468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021822	ATGA	2	8	5920	5927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021822	TTTA	2	8	6328	6335	25 %	75 %	0 %	0 %	525854204
11	NC_021822	TGTT	2	8	6343	6350	0 %	75 %	25 %	0 %	525854204
12	NC_021822	AAAG	2	8	7387	7394	75 %	0 %	25 %	0 %	525852847
13	NC_021822	TCCC	2	8	7590	7597	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_021822	TAAA	2	8	7615	7622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021822	ACGC	2	8	7867	7874	25 %	0 %	25 %	50 %	525852848
16	NC_021822	CGAA	2	8	8461	8468	50 %	0 %	25 %	25 %	525852849
17	NC_021822	CAAA	2	8	9706	9713	75 %	0 %	0 %	25 %	525852850
18	NC_021822	AAGC	2	8	9939	9946	50 %	0 %	25 %	25 %	525852850
19	NC_021822	CAGC	2	8	9994	10001	25 %	0 %	25 %	50 %	525852850
20	NC_021822	TAAA	2	8	10254	10261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021822	TTTA	2	8	10387	10394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021822	ACAG	2	8	10912	10919	50 %	0 %	25 %	25 %	525852851
23	NC_021822	TTTG	2	8	11331	11338	0 %	75 %	25 %	0 %	525854205
24	NC_021822	TGTC	2	8	12230	12237	0 %	50 %	25 %	25 %	525854205
25	NC_021822	ATAA	2	8	12594	12601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021822	GAAA	2	8	13255	13262	75 %	0 %	25 %	0 %	525852852
27	NC_021822	CGTA	2	8	13277	13284	25 %	25 %	25 %	25 %	525852852
28	NC_021822	GGCA	2	8	13804	13811	25 %	0 %	50 %	25 %	525852852
29	NC_021822	AAGA	2	8	14534	14541	75 %	0 %	25 %	0 %	525852852
30	NC_021822	CAAA	3	12	15524	15535	75 %	0 %	0 %	25 %	525852853
31	NC_021822	GCAA	2	8	15759	15766	50 %	0 %	25 %	25 %	525852854
32	NC_021822	ACAG	2	8	16137	16144	50 %	0 %	25 %	25 %	525852854
33	NC_021822	AGCG	2	8	16260	16267	25 %	0 %	50 %	25 %	525852854
34	NC_021822	CCAA	2	8	16489	16496	50 %	0 %	0 %	50 %	525852854
35	NC_021822	TTCT	2	8	16523	16530	0 %	75 %	0 %	25 %	525852854
36	NC_021822	GGCG	2	8	16746	16753	0 %	0 %	75 %	25 %	525852854
37	NC_021822	AAAC	2	8	17135	17142	75 %	0 %	0 %	25 %	525852855
38	NC_021822	TGGC	2	8	17157	17164	0 %	25 %	50 %	25 %	525852855
39	NC_021822	GATG	2	8	17205	17212	25 %	25 %	50 %	0 %	525852855
40	NC_021822	GTCA	2	8	17669	17676	25 %	25 %	25 %	25 %	525852856
41	NC_021822	CCAG	2	8	17788	17795	25 %	0 %	25 %	50 %	525852856
42	NC_021822	GATG	2	8	17854	17861	25 %	25 %	50 %	0 %	525852856
43	NC_021822	GTTT	2	8	17963	17970	0 %	75 %	25 %	0 %	525852857
44	NC_021822	GAAC	2	8	18863	18870	50 %	0 %	25 %	25 %	525852858
45	NC_021822	ATTT	2	8	20496	20503	25 %	75 %	0 %	0 %	525852859
46	NC_021822	TTTG	2	8	20885	20892	0 %	75 %	25 %	0 %	525852860
47	NC_021822	TCGT	2	8	20955	20962	0 %	50 %	25 %	25 %	525852860
48	NC_021822	CGGT	2	8	21573	21580	0 %	25 %	50 %	25 %	525852861
49	NC_021822	CGAT	2	8	22116	22123	25 %	25 %	25 %	25 %	525852862
50	NC_021822	CTTG	2	8	22363	22370	0 %	50 %	25 %	25 %	525852863
51	NC_021822	CAGA	2	8	22653	22660	50 %	0 %	25 %	25 %	525852863
52	NC_021822	CGTT	2	8	23259	23266	0 %	50 %	25 %	25 %	525852864
53	NC_021822	CGAG	2	8	23304	23311	25 %	0 %	50 %	25 %	525852864
54	NC_021822	TTGA	2	8	23738	23745	25 %	50 %	25 %	0 %	525852864
55	NC_021822	GCAA	2	8	23762	23769	50 %	0 %	25 %	25 %	525852864
56	NC_021822	GATA	2	8	23811	23818	50 %	25 %	25 %	0 %	525854206
57	NC_021822	CAAA	2	8	24129	24136	75 %	0 %	0 %	25 %	525854206
58	NC_021822	CGCT	2	8	24177	24184	0 %	25 %	25 %	50 %	525854206
59	NC_021822	TTGC	2	8	24987	24994	0 %	50 %	25 %	25 %	525852865
60	NC_021822	CGTG	2	8	25079	25086	0 %	25 %	50 %	25 %	525852865
61	NC_021822	TTGC	2	8	25270	25277	0 %	50 %	25 %	25 %	525852865
62	NC_021822	TTGG	2	8	25278	25285	0 %	50 %	50 %	0 %	525852865
63	NC_021822	TACC	2	8	25410	25417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021822	GCGT	2	8	25962	25969	0 %	25 %	50 %	25 %	525852866
65	NC_021822	TGGT	2	8	26165	26172	0 %	50 %	50 %	0 %	525852866
66	NC_021822	GTTT	2	8	26411	26418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021822	ACAA	2	8	26496	26503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021822	ATGA	2	8	27298	27305	50 %	25 %	25 %	0 %	525852867
69	NC_021822	TTCG	2	8	27471	27478	0 %	50 %	25 %	25 %	525852867
70	NC_021822	TTTC	2	8	27640	27647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021822	CAAA	2	8	27726	27733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021822	CCGC	2	8	28215	28222	0 %	0 %	25 %	75 %	525852868
73	NC_021822	TCTT	2	8	28494	28501	0 %	75 %	0 %	25 %	525852868
74	NC_021822	CGCT	2	8	28807	28814	0 %	25 %	25 %	50 %	525852868
75	NC_021822	GTAA	2	8	29335	29342	50 %	25 %	25 %	0 %	525852868
76	NC_021822	TTGT	2	8	29498	29505	0 %	75 %	25 %	0 %	525852868
77	NC_021822	GCAA	2	8	30404	30411	50 %	0 %	25 %	25 %	525852869
78	NC_021822	AAAT	2	8	30536	30543	75 %	25 %	0 %	0 %	525852869
79	NC_021822	CAGA	2	8	30855	30862	50 %	0 %	25 %	25 %	525852869
80	NC_021822	CCAA	2	8	30991	30998	50 %	0 %	0 %	50 %	525852869
81	NC_021822	TGAA	2	8	31157	31164	50 %	25 %	25 %	0 %	525852869
82	NC_021822	TGCG	2	8	32649	32656	0 %	25 %	50 %	25 %	525852870
83	NC_021822	TCAT	2	8	32801	32808	25 %	50 %	0 %	25 %	525852870
84	NC_021822	TTGT	2	8	32906	32913	0 %	75 %	25 %	0 %	525852871
85	NC_021822	CACG	2	8	33444	33451	25 %	0 %	25 %	50 %	525852871
86	NC_021822	TACG	2	8	33931	33938	25 %	25 %	25 %	25 %	525852871
87	NC_021822	CTTG	2	8	34077	34084	0 %	50 %	25 %	25 %	525852871
88	NC_021822	GCTA	2	8	34376	34383	25 %	25 %	25 %	25 %	525852871
89	NC_021822	TTTG	2	8	34442	34449	0 %	75 %	25 %	0 %	525852871
90	NC_021822	TTAA	2	8	34751	34758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021822	TGGT	2	8	35283	35290	0 %	50 %	50 %	0 %	525852872
92	NC_021822	CAAT	2	8	36137	36144	50 %	25 %	0 %	25 %	525852873
93	NC_021822	GCAA	2	8	36219	36226	50 %	0 %	25 %	25 %	525852873
94	NC_021822	GATG	2	8	37029	37036	25 %	25 %	50 %	0 %	525852874
95	NC_021822	TACT	2	8	37324	37331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021822	CTTT	2	8	37675	37682	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021822	GTTT	2	8	37794	37801	0 %	75 %	25 %	0 %	525852875
98	NC_021822	ATTG	2	8	37909	37916	25 %	50 %	25 %	0 %	525852875
99	NC_021822	TTCG	2	8	38110	38117	0 %	50 %	25 %	25 %	525852875
100	NC_021822	TTTG	2	8	38132	38139	0 %	75 %	25 %	0 %	525852875
101	NC_021822	GTCA	2	8	38144	38151	25 %	25 %	25 %	25 %	525852875
102	NC_021822	TGGA	2	8	38220	38227	25 %	25 %	50 %	0 %	525852875
103	NC_021822	AAAT	2	8	38648	38655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021822	TTAG	2	8	39377	39384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021822	CATC	2	8	39651	39658	25 %	25 %	0 %	50 %	525852876
106	NC_021822	CTCA	2	8	40028	40035	25 %	25 %	0 %	50 %	525852876
107	NC_021822	ATCA	2	8	40234	40241	50 %	25 %	0 %	25 %	525852876
108	NC_021822	TTGC	2	8	41003	41010	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021822	CAAG	2	8	41034	41041	50 %	0 %	25 %	25 %	525852877
110	NC_021822	GTAC	2	8	41380	41387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021822	ACTA	2	8	41686	41693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021822	CGAC	2	8	42137	42144	25 %	0 %	25 %	50 %	525852878
113	NC_021822	AATC	2	8	43999	44006	50 %	25 %	0 %	25 %	525852879
114	NC_021822	GATC	2	8	44221	44228	25 %	25 %	25 %	25 %	525852879
115	NC_021822	CATG	2	8	44494	44501	25 %	25 %	25 %	25 %	525852879
116	NC_021822	AACC	2	8	44677	44684	50 %	0 %	0 %	50 %	525852879
117	NC_021822	TGCA	2	8	44696	44703	25 %	25 %	25 %	25 %	525852879
118	NC_021822	GCAG	2	8	44992	44999	25 %	0 %	50 %	25 %	525852879
119	NC_021822	ATCG	2	8	45053	45060	25 %	25 %	25 %	25 %	525852879
120	NC_021822	GTTC	2	8	45081	45088	0 %	50 %	25 %	25 %	525852879
121	NC_021822	AATA	2	8	45433	45440	75 %	25 %	0 %	0 %	525852880
122	NC_021822	TCAA	2	8	45466	45473	50 %	25 %	0 %	25 %	525852881
123	NC_021822	TCAA	2	8	46151	46158	50 %	25 %	0 %	25 %	525852881
124	NC_021822	TGCG	2	8	46184	46191	0 %	25 %	50 %	25 %	525852881
125	NC_021822	CAAA	2	8	46495	46502	75 %	0 %	0 %	25 %	525852881
126	NC_021822	CCAA	2	8	46714	46721	50 %	0 %	0 %	50 %	525852881
127	NC_021822	ATAA	2	8	47067	47074	75 %	25 %	0 %	0 %	525852881
128	NC_021822	CAAC	2	8	47224	47231	50 %	0 %	0 %	50 %	525852881
129	NC_021822	TCCA	2	8	47545	47552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021822	TGAT	2	8	47603	47610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021822	AAAG	2	8	48377	48384	75 %	0 %	25 %	0 %	525852882
132	NC_021822	CGAG	2	8	48613	48620	25 %	0 %	50 %	25 %	525852882
133	NC_021822	CAAA	2	8	48803	48810	75 %	0 %	0 %	25 %	525852882
134	NC_021822	TTCT	2	8	48942	48949	0 %	75 %	0 %	25 %	525852882
135	NC_021822	AGCA	2	8	49391	49398	50 %	0 %	25 %	25 %	525852883
136	NC_021822	GCAA	2	8	49464	49471	50 %	0 %	25 %	25 %	525852883
137	NC_021822	GTTT	2	8	49527	49534	0 %	75 %	25 %	0 %	525852883
138	NC_021822	GTCA	2	8	49616	49623	25 %	25 %	25 %	25 %	525852883
139	NC_021822	CTGC	2	8	50932	50939	0 %	25 %	25 %	50 %	525852884
140	NC_021822	TAAG	2	8	51072	51079	50 %	25 %	25 %	0 %	525852884
141	NC_021822	AAAC	2	8	51113	51120	75 %	0 %	0 %	25 %	525852884
142	NC_021822	CCAA	2	8	51219	51226	50 %	0 %	0 %	50 %	525852884
143	NC_021822	CATC	2	8	51245	51252	25 %	25 %	0 %	50 %	525852884
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