MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 20531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021822	TCA	2	6	6177	6182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854204
2	NC_021822	TTC	2	6	6248	6253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854204
3	NC_021822	CTT	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854204
4	NC_021822	CAC	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854204
5	NC_021822	TGC	2	6	6436	6441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854204
6	NC_021822	GAG	2	6	6536	6541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525854204
7	NC_021822	GAA	2	6	6627	6632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852847
8	NC_021822	GTT	2	6	6642	6647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852847
9	NC_021822	TGA	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852847
10	NC_021822	GCG	2	6	6735	6740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852847
11	NC_021822	CAT	2	6	6746	6751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852847
12	NC_021822	CGT	2	6	6761	6766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852847
13	NC_021822	GAA	2	6	6780	6785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852847
14	NC_021822	GCG	2	6	6856	6861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852847
15	NC_021822	TGA	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852847
16	NC_021822	TCA	2	6	6899	6904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852847
17	NC_021822	GGT	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852847
18	NC_021822	TTC	2	6	6954	6959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852847
19	NC_021822	GAC	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852847
20	NC_021822	CAT	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852847
21	NC_021822	TTG	2	6	7329	7334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852847
22	NC_021822	ATC	2	6	7419	7424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852847
23	NC_021822	TTA	2	6	7531	7536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852847
24	NC_021822	TCG	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852847
25	NC_021822	CAT	2	6	7935	7940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852848
26	NC_021822	AAG	3	9	7991	7999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852848
27	NC_021822	GAA	2	6	8236	8241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852848
28	NC_021822	GTT	2	6	8401	8406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852849
29	NC_021822	CTT	2	6	8436	8441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852849
30	NC_021822	TGA	2	6	8592	8597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852849
31	NC_021822	CAT	2	6	8598	8603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852849
32	NC_021822	CTC	2	6	8755	8760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525852849
33	NC_021822	TGC	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852849
34	NC_021822	TTG	2	6	8916	8921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852849
35	NC_021822	CGC	2	6	9009	9014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852849
36	NC_021822	ATT	2	6	9346	9351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852850
37	NC_021822	GCG	2	6	9441	9446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852850
38	NC_021822	ATT	2	6	9471	9476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852850
39	NC_021822	GAT	2	6	9483	9488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852850
40	NC_021822	TTG	2	6	9514	9519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852850
41	NC_021822	CGG	2	6	9526	9531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852850
42	NC_021822	CAA	2	6	9543	9548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852850
43	NC_021822	TTG	2	6	9667	9672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852850
44	NC_021822	TAC	2	6	9683	9688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852850
45	NC_021822	CAG	2	6	9719	9724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852850
46	NC_021822	TGA	2	6	9751	9756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852850
47	NC_021822	TTG	2	6	9760	9765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852850
48	NC_021822	ATT	3	9	9877	9885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852850
49	NC_021822	TGA	2	6	9917	9922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852850
50	NC_021822	TCG	2	6	9962	9967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852850
51	NC_021822	ATA	2	6	9973	9978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852850
52	NC_021822	GAT	2	6	10061	10066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852850
53	NC_021822	CGT	2	6	10091	10096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852850
54	NC_021822	GGT	2	6	10112	10117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852850
55	NC_021822	AGA	2	6	10160	10165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852850
56	NC_021822	TTG	2	6	10425	10430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852851
57	NC_021822	ATG	3	9	10431	10439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852851
58	NC_021822	AGT	2	6	10462	10467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852851
59	NC_021822	TCT	2	6	10493	10498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852851
60	NC_021822	TCG	2	6	10600	10605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852851
61	NC_021822	GTG	2	6	10889	10894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852851
62	NC_021822	CGC	2	6	10982	10987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852851
63	NC_021822	TGA	2	6	11072	11077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852851
64	NC_021822	TCA	2	6	11156	11161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854205
65	NC_021822	TCA	2	6	11256	11261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854205
66	NC_021822	GCA	2	6	11319	11324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854205
67	NC_021822	TGA	2	6	11421	11426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854205
68	NC_021822	ATC	2	6	11455	11460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854205
69	NC_021822	CAG	2	6	11476	11481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854205
70	NC_021822	GCC	2	6	11566	11571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854205
71	NC_021822	AAG	2	6	11647	11652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854205
72	NC_021822	ATC	2	6	11921	11926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854205
73	NC_021822	CTA	2	6	12007	12012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854205
74	NC_021822	GTG	2	6	12115	12120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854205
75	NC_021822	AAT	2	6	12130	12135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854205
76	NC_021822	TTG	2	6	12137	12142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854205
77	NC_021822	TGG	2	6	12327	12332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854205
78	NC_021822	ATG	2	6	12373	12378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854205
79	NC_021822	GGT	2	6	12379	12384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854205
80	NC_021822	GGT	2	6	12412	12417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854205
81	NC_021822	AGC	2	6	12700	12705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852852
82	NC_021822	GGT	2	6	12920	12925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852852
83	NC_021822	AGT	2	6	12971	12976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852852
84	NC_021822	CTT	2	6	12985	12990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852852
85	NC_021822	GTC	2	6	12999	13004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852852
86	NC_021822	CAA	2	6	13131	13136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852852
87	NC_021822	GTT	2	6	13331	13336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852852
88	NC_021822	CAT	2	6	13357	13362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852852
89	NC_021822	GTG	2	6	13443	13448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852852
90	NC_021822	ACG	2	6	13488	13493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852852
91	NC_021822	AAC	2	6	13693	13698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852852
92	NC_021822	TTG	2	6	13709	13714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852852
93	NC_021822	TGG	2	6	13734	13739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852852
94	NC_021822	ATG	2	6	13895	13900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852852
95	NC_021822	ATG	2	6	14097	14102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852852
96	NC_021822	GGT	2	6	14279	14284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852852
97	NC_021822	GAA	2	6	14380	14385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852852
98	NC_021822	CAT	2	6	14602	14607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852852
99	NC_021822	GGT	3	9	14654	14662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852852
100	NC_021822	GGC	2	6	14883	14888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852853
101	NC_021822	GAA	2	6	15013	15018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852853
102	NC_021822	ATC	2	6	15044	15049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852853
103	NC_021822	AAG	2	6	15077	15082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852853
104	NC_021822	GAA	2	6	15214	15219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852853
105	NC_021822	TGA	2	6	15234	15239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852853
106	NC_021822	TGA	2	6	15242	15247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852853
107	NC_021822	GAT	2	6	15636	15641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852854
108	NC_021822	ACG	2	6	15649	15654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852854
109	NC_021822	GTT	2	6	15669	15674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852854
110	NC_021822	GCA	2	6	15684	15689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852854
111	NC_021822	CAG	2	6	15700	15705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852854
112	NC_021822	AGA	2	6	15864	15869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852854
113	NC_021822	GTT	2	6	15913	15918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852854
114	NC_021822	ACT	2	6	16173	16178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852854
115	NC_021822	TGA	2	6	16179	16184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852854
116	NC_021822	GTG	2	6	16214	16219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852854
117	NC_021822	ATC	2	6	16390	16395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852854
118	NC_021822	AGC	2	6	16475	16480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852854
119	NC_021822	AGA	2	6	16500	16505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852854
120	NC_021822	GGT	2	6	16590	16595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852854
121	NC_021822	TGA	2	6	16596	16601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852854
122	NC_021822	AAC	2	6	16915	16920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852854
123	NC_021822	TGA	2	6	17017	17022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852855
124	NC_021822	GCA	2	6	17030	17035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852855
125	NC_021822	TGG	2	6	17052	17057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852855
126	NC_021822	ACG	2	6	17115	17120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852855
127	NC_021822	CAC	2	6	17175	17180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852855
128	NC_021822	CGA	2	6	17251	17256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852855
129	NC_021822	TGG	2	6	17266	17271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852855
130	NC_021822	GCA	2	6	17347	17352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852855
131	NC_021822	CTA	2	6	17398	17403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852855
132	NC_021822	TGG	2	6	17413	17418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852855
133	NC_021822	GCA	2	6	17708	17713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852856
134	NC_021822	TGA	2	6	17818	17823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852856
135	NC_021822	GAA	2	6	17881	17886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852856
136	NC_021822	ATT	2	6	17946	17951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852857
137	NC_021822	CGT	2	6	18076	18081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852857
138	NC_021822	AGC	2	6	18098	18103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852857
139	NC_021822	CAA	2	6	18262	18267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852857
140	NC_021822	GTC	2	6	18368	18373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852857
141	NC_021822	AAG	2	6	18422	18427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852857
142	NC_021822	GAA	2	6	18441	18446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852857
143	NC_021822	ATG	2	6	18531	18536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852857
144	NC_021822	GCT	2	6	18557	18562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852858
145	NC_021822	AAG	2	6	18646	18651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852858
146	NC_021822	AAG	2	6	18661	18666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852858
147	NC_021822	TTG	2	6	18718	18723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852858
148	NC_021822	AGC	2	6	18798	18803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852858
149	NC_021822	GTG	2	6	19151	19156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852858
150	NC_021822	TCG	2	6	19165	19170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852858
151	NC_021822	GAT	2	6	19188	19193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852858
152	NC_021822	GAT	2	6	19254	19259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852858
153	NC_021822	CTG	2	6	19266	19271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852858
154	NC_021822	TGC	2	6	19307	19312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852858
155	NC_021822	CAG	2	6	19365	19370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852858
156	NC_021822	TAC	2	6	19449	19454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852858
157	NC_021822	ACT	2	6	19459	19464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852858
158	NC_021822	CAA	2	6	19479	19484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852858
159	NC_021822	CAA	2	6	19494	19499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852858
160	NC_021822	GCT	2	6	19506	19511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852858
161	NC_021822	TCA	2	6	19549	19554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852858
162	NC_021822	CTA	2	6	19565	19570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852858
163	NC_021822	CAT	2	6	20033	20038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852859
164	NC_021822	CAT	3	9	20051	20059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852859
165	NC_021822	CGC	2	6	20062	20067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852859
166	NC_021822	AAG	2	6	20134	20139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852859
167	NC_021822	ACC	2	6	20292	20297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852859
168	NC_021822	CTG	2	6	20316	20321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852859
169	NC_021822	GTG	2	6	20347	20352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852859
170	NC_021822	ACT	2	6	20384	20389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852859
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174	NC_021822	GCC	2	6	20645	20650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852860
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183	NC_021822	CAG	2	6	21282	21287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852861
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188	NC_021822	CAA	2	6	21415	21420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852861
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194	NC_021822	GTG	2	6	21773	21778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852861
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217	NC_021822	TGG	2	6	23910	23915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854206
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219	NC_021822	TCG	2	6	24189	24194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854206
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226	NC_021822	CGG	2	6	24644	24649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852865
227	NC_021822	GCA	2	6	24708	24713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852865
228	NC_021822	GTT	2	6	24773	24778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852865
229	NC_021822	TGC	3	9	24802	24810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852865
230	NC_021822	GCG	2	6	24888	24893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852865
231	NC_021822	GCT	2	6	25000	25005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852865
232	NC_021822	ATC	2	6	25008	25013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852865
233	NC_021822	CTG	4	12	25014	25025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852865
234	NC_021822	ATG	2	6	25122	25127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852865
235	NC_021822	CGC	2	6	25145	25150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852865
236	NC_021822	TCT	2	6	25251	25256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852865
237	NC_021822	ATC	2	6	25335	25340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852865
238	NC_021822	GCT	2	6	25350	25355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852865
239	NC_021822	TTC	2	6	25356	25361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852865
240	NC_021822	ATT	2	6	25383	25388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852865
241	NC_021822	TCA	2	6	25490	25495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852866
242	NC_021822	TGA	2	6	25557	25562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852866
243	NC_021822	CAA	2	6	25943	25948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852866
244	NC_021822	CAA	3	9	25982	25990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852866
245	NC_021822	TGA	2	6	26028	26033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852866
246	NC_021822	AGA	2	6	26044	26049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852866
247	NC_021822	GTC	2	6	26075	26080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852866
248	NC_021822	CTT	2	6	26202	26207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852866
249	NC_021822	ATA	2	6	26238	26243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852866
250	NC_021822	GGC	2	6	26550	26555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852867
251	NC_021822	GCA	2	6	26581	26586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852867
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255	NC_021822	ATA	2	6	26936	26941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852867
256	NC_021822	GCG	2	6	27185	27190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852867
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497	NC_021822	CAG	2	6	48632	48637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852882
498	NC_021822	AGA	2	6	48673	48678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852882
499	NC_021822	TAT	2	6	48713	48718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852882
500	NC_021822	CCG	2	6	48746	48751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852882

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