MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 491

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021822	GT	3	6	546	551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021822	AC	3	6	1368	1373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021822	AC	3	6	1537	1542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021822	CA	3	6	1712	1717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021822	GT	3	6	2732	2737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021822	AC	3	6	3321	3326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021822	GT	3	6	3591	3596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021822	GA	3	6	4026	4031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021822	TG	3	6	4528	4533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021822	GT	3	6	5221	5226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021822	GA	3	6	5559	5564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021822	TC	3	6	5638	5643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021822	CA	3	6	5887	5892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021822	AG	3	6	12508	12513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021822	AG	3	6	30041	30046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021822	AC	3	6	30218	30223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021822	TC	3	6	31484	31489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021822	GC	3	6	34827	34832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021822	AG	3	6	36290	36295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021822	CT	3	6	36307	36312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021822	TA	3	6	39098	39103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021822	GA	4	8	39410	39417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021822	TC	4	8	41359	41366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021822	GA	3	6	41533	41538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021822	AT	3	6	41545	41550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021822	GA	3	6	51869	51874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021822	GA	3	6	52030	52035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021822	GA	3	6	60200	60205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021822	TG	3	6	62112	62117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021822	TA	3	6	67862	67867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021822	AG	3	6	70329	70334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021822	TA	3	6	71444	71449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021822	TG	3	6	77286	77291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021822	TC	4	8	78298	78305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021822	TG	3	6	78486	78491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021822	AT	3	6	78677	78682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021822	AC	3	6	91845	91850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021822	GT	3	6	96850	96855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021822	GA	3	6	101124	101129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021822	CT	3	6	106842	106847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021822	TA	3	6	109850	109855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021822	GT	4	8	109865	109872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021822	GA	3	6	116065	116070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021822	CT	4	8	117810	117817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021822	CA	3	6	127178	127183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021822	GA	4	8	127210	127217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021822	GC	3	6	129528	129533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021822	GT	3	6	130327	130332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021822	TC	3	6	143120	143125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021822	CA	3	6	146095	146100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021822	GA	3	6	152864	152869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021822	TG	3	6	153245	153250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021822	TA	3	6	159319	159324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021822	GC	3	6	163306	163311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021822	CT	3	6	170041	170046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021822	AG	3	6	170117	170122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021822	AT	3	6	171895	171900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021822	TA	3	6	175858	175863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021822	CT	3	6	177335	177340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021822	CT	3	6	177986	177991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021822	AC	3	6	178784	178789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021822	AC	3	6	194166	194171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021822	AG	3	6	194431	194436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021822	AG	3	6	194440	194445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021822	CT	3	6	194492	194497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021822	AT	3	6	200294	200299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021822	CT	3	6	200457	200462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021822	CA	3	6	200563	200568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021822	AT	3	6	205367	205372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021822	TA	3	6	205924	205929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021822	TA	3	6	206006	206011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021822	AG	3	6	206910	206915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021822	AT	4	8	208044	208051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021822	AT	3	6	208248	208253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021822	GT	3	6	209579	209584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021822	GA	3	6	222943	222948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021822	GA	3	6	223592	223597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021822	AT	3	6	233421	233426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021822	TA	3	6	238965	238970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021822	AT	3	6	245585	245590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021822	AT	3	6	257438	257443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021822	AG	3	6	257775	257780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021822	TG	3	6	262381	262386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021822	CG	3	6	262511	262516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021822	TC	4	8	263003	263010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021822	AG	3	6	264349	264354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021822	GT	3	6	265672	265677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021822	TG	3	6	271002	271007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021822	TC	3	6	273658	273663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021822	CT	3	6	276699	276704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021822	TG	3	6	277781	277786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021822	TG	3	6	277878	277883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021822	GA	3	6	291704	291709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021822	CT	3	6	309173	309178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021822	TA	3	6	309203	309208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021822	AT	3	6	313512	313517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021822	AT	4	8	313635	313642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021822	AC	3	6	313971	313976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021822	CA	3	6	314329	314334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021822	TG	3	6	316177	316182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021822	AT	3	6	322136	322141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021822	TA	3	6	324695	324700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021822	GT	3	6	325706	325711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021822	AT	3	6	325718	325723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021822	TG	3	6	330102	330107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021822	GA	3	6	332401	332406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021822	AG	3	6	334820	334825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021822	TC	3	6	343055	343060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021822	AG	3	6	354448	354453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021822	GC	3	6	361356	361361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021822	GC	3	6	361369	361374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021822	GA	3	6	366322	366327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021822	TG	3	6	367616	367621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021822	AC	3	6	371647	371652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021822	AT	3	6	371760	371765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021822	AG	3	6	372019	372024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021822	GA	3	6	372071	372076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021822	GA	3	6	373339	373344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021822	TA	3	6	377913	377918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021822	TA	3	6	379347	379352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021822	CA	3	6	383549	383554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021822	GA	3	6	397503	397508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021822	GA	3	6	400912	400917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021822	AT	3	6	409535	409540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021822	AG	3	6	414186	414191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021822	AT	3	6	428046	428051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021822	AT	3	6	430134	430139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021822	AC	3	6	435260	435265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021822	AT	3	6	437277	437282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021822	GA	3	6	440678	440683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021822	TG	3	6	442051	442056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021822	CA	3	6	442862	442867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021822	GA	3	6	449723	449728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021822	GA	3	6	451565	451570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021822	TA	3	6	455002	455007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021822	GA	3	6	461674	461679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021822	GA	3	6	462671	462676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021822	TC	3	6	462750	462755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021822	CT	3	6	463806	463811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021822	CA	3	6	468213	468218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021822	GT	3	6	481602	481607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021822	AC	3	6	482038	482043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021822	AC	3	6	490053	490058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021822	AC	3	6	490304	490309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021822	AT	3	6	495529	495534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021822	GT	3	6	498335	498340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021822	AT	3	6	499974	499979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021822	AC	3	6	500990	500995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021822	CT	3	6	503170	503175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021822	TA	3	6	507251	507256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021822	TC	3	6	510826	510831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021822	CT	3	6	511724	511729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021822	TG	3	6	511911	511916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021822	GT	3	6	515288	515293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.