MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021821	AACCAA	2	12	18968	18979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021821	AAACAT	2	12	26259	26270	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021821	AGGCTC	2	12	29197	29208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021821	AGCAAC	2	12	52142	52153	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021821	TATAAA	2	12	112993	113004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021821	AAAAAG	2	12	126797	126808	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021821	AACGAA	2	12	147906	147917	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021821	TAAAAA	2	12	186383	186394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021821	TAAAAC	2	12	216342	216353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021821	CAAAAG	2	12	224682	224693	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021821	GTTTTT	2	12	304861	304872	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021821	AAACTA	2	12	308579	308590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021821	ATTTTA	2	12	315946	315957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021821	ATTTAG	2	12	316671	316682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021821	AAAAAC	2	12	317181	317192	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021821	ACAATA	2	12	353758	353769	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021821	AATTTT	2	12	423190	423201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021821	CTTTAT	2	12	425783	425794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021821	AAACAC	2	12	425795	425806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021821	GATATT	2	12	440079	440090	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021821	CAAAAA	2	12	450054	450065	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021821	TGAAAG	2	12	467357	467368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021821	ATTAAA	2	12	483904	483915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021821	AAAGCC	2	12	485319	485330	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021821	TAGCTT	2	12	500308	500319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021821	TGAAAT	2	12	572885	572896	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021821	TGCAAA	2	12	581011	581022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021821	AAAAAC	2	12	609424	609435	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021821	TATTTT	2	12	681977	681988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021821	ATAAAT	2	12	719241	719252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021821	ATGCCA	2	12	764642	764653	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021821	TGTTTT	2	12	791394	791405	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021821	CTTGAG	2	12	804732	804743	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021821	TAGATT	2	12	813767	813778	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021821	TATTCT	2	12	894946	894957	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021821	AAGGTG	2	12	906768	906779	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021821	TAACGA	2	12	914456	914467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021821	TAAAAT	2	12	938193	938204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021821	GAAGTA	2	12	963206	963217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021821	AGGTTT	2	12	977090	977101	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021821	ACATAT	2	12	993487	993498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021821	CGTTAA	2	12	1029340	1029351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021821	TTAATA	2	12	1064720	1064731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021821	TTATGA	2	12	1109415	1109426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021821	CGAACA	2	12	1110528	1110539	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021821	AAAAAC	2	12	1113554	1113565	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021821	AAAAAG	2	12	1120385	1120396	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021821	AAAGGA	2	12	1163841	1163852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021821	TACTAT	2	12	1175184	1175195	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021821	ACTTAT	2	12	1182072	1182083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021821	CACATC	2	12	1256728	1256739	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021821	TTCCCT	2	12	1305436	1305447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021821	AATTGG	2	12	1313376	1313387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021821	ATAAAA	2	12	1342899	1342910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021821	TATCAT	2	12	1361857	1361868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021821	TTGACT	2	12	1379325	1379336	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021821	TTGGTT	2	12	1419584	1419595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021821	GCTAGA	2	12	1462862	1462873	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021821	CCTCAC	2	12	1524386	1524397	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021821	CTTTTT	2	12	1526728	1526739	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021821	TCAAAA	2	12	1532898	1532909	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021821	GCTAAA	2	12	1629809	1629820	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021821	AAATGC	2	12	1676225	1676236	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021821	ATAAAA	2	12	1761087	1761098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021821	GTTTAG	2	12	1785361	1785372	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021821	CAGCAC	2	12	1796013	1796024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021821	TAATTT	2	12	1811622	1811633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021821	AGAAAA	2	12	1823477	1823488	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021821	TAAAAC	2	12	1829877	1829888	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021821	TACACA	2	12	1839518	1839529	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021821	TAGCCA	2	12	1853223	1853234	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.