MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 11242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021820	CAGC	2	8	297	304	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021820	GACT	2	8	315	322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021820	AACG	2	8	886	893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021820	CTTT	2	8	1063	1070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021820	GTAC	2	8	1627	1634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021820	GTCA	2	8	1710	1717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021820	TCGC	2	8	1899	1906	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021820	TTTC	2	8	2170	2177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021820	TCAC	2	8	2328	2335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021820	CTAC	2	8	2608	2615	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021820	TGCG	2	8	3467	3474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021820	ACCG	2	8	4287	4294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021820	CCGC	2	8	4791	4798	0 %	0 %	25 %	75 %	526218031
14	NC_021820	GATG	2	8	5149	5156	25 %	25 %	50 %	0 %	526218031
15	NC_021820	GCAG	2	8	5374	5381	25 %	0 %	50 %	25 %	526218031
16	NC_021820	AGCC	2	8	5511	5518	25 %	0 %	25 %	50 %	526218031
17	NC_021820	CCGA	2	8	5897	5904	25 %	0 %	25 %	50 %	526218031
18	NC_021820	CTCG	2	8	6607	6614	0 %	25 %	25 %	50 %	526218032
19	NC_021820	AGCC	2	8	6659	6666	25 %	0 %	25 %	50 %	526218032
20	NC_021820	GGCA	2	8	6789	6796	25 %	0 %	50 %	25 %	526218032
21	NC_021820	TGGC	2	8	7530	7537	0 %	25 %	50 %	25 %	526218032
22	NC_021820	TCCC	2	8	8205	8212	0 %	25 %	0 %	75 %	526218033
23	NC_021820	TTCA	2	8	8424	8431	25 %	50 %	0 %	25 %	526218033
24	NC_021820	TTAA	2	8	8569	8576	50 %	50 %	0 %	0 %	526218033
25	NC_021820	AGCC	2	8	9005	9012	25 %	0 %	25 %	50 %	526218034
26	NC_021820	CGGT	2	8	9117	9124	0 %	25 %	50 %	25 %	526218034
27	NC_021820	CTTT	2	8	9129	9136	0 %	75 %	0 %	25 %	526218034
28	NC_021820	CTGA	2	8	9293	9300	25 %	25 %	25 %	25 %	526218034
29	NC_021820	GAGT	2	8	9312	9319	25 %	25 %	50 %	0 %	526218034
30	NC_021820	CGCC	2	8	9529	9536	0 %	0 %	25 %	75 %	526218034
31	NC_021820	GTTT	2	8	9744	9751	0 %	75 %	25 %	0 %	526218034
32	NC_021820	CTTA	2	8	10316	10323	25 %	50 %	0 %	25 %	526218034
33	NC_021820	TCGT	2	8	11550	11557	0 %	50 %	25 %	25 %	526218036
34	NC_021820	GCAG	2	8	11639	11646	25 %	0 %	50 %	25 %	526218036
35	NC_021820	CAGA	2	8	11685	11692	50 %	0 %	25 %	25 %	526218036
36	NC_021820	CTTA	2	8	11742	11749	25 %	50 %	0 %	25 %	526218037
37	NC_021820	AAAC	2	8	11775	11782	75 %	0 %	0 %	25 %	526218037
38	NC_021820	ACCA	2	8	11878	11885	50 %	0 %	0 %	50 %	526218037
39	NC_021820	ATCA	2	8	11992	11999	50 %	25 %	0 %	25 %	526218037
40	NC_021820	GATG	2	8	13589	13596	25 %	25 %	50 %	0 %	526218040
41	NC_021820	CGCC	2	8	14447	14454	0 %	0 %	25 %	75 %	526218040
42	NC_021820	GCTG	2	8	15547	15554	0 %	25 %	50 %	25 %	526218042
43	NC_021820	TGAA	2	8	15631	15638	50 %	25 %	25 %	0 %	526218042
44	NC_021820	GGAA	2	8	15725	15732	50 %	0 %	50 %	0 %	526218042
45	NC_021820	TAAG	2	8	16110	16117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021820	GCCA	2	8	16627	16634	25 %	0 %	25 %	50 %	526218043
47	NC_021820	CGTG	2	8	16943	16950	0 %	25 %	50 %	25 %	526218043
48	NC_021820	CCGC	2	8	18019	18026	0 %	0 %	25 %	75 %	526218043
49	NC_021820	ATGA	2	8	18861	18868	50 %	25 %	25 %	0 %	526218044
50	NC_021820	ATTG	2	8	18953	18960	25 %	50 %	25 %	0 %	526218045
51	NC_021820	CCAG	2	8	19537	19544	25 %	0 %	25 %	50 %	526218045
52	NC_021820	ATCC	2	8	20093	20100	25 %	25 %	0 %	50 %	526218047
53	NC_021820	GCTG	2	8	20109	20116	0 %	25 %	50 %	25 %	526218047
54	NC_021820	ACCG	2	8	20581	20588	25 %	0 %	25 %	50 %	526218048
55	NC_021820	GAAA	2	8	21158	21165	75 %	0 %	25 %	0 %	526218048
56	NC_021820	TTCC	2	8	21339	21346	0 %	50 %	0 %	50 %	526218048
57	NC_021820	GATG	2	8	21390	21397	25 %	25 %	50 %	0 %	526218048
58	NC_021820	ACGA	2	8	21730	21737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021820	TAAA	2	8	22149	22156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021820	ACTG	2	8	22399	22406	25 %	25 %	25 %	25 %	526221719
61	NC_021820	TACA	2	8	22504	22511	50 %	25 %	0 %	25 %	526221719
62	NC_021820	CCAT	2	8	22817	22824	25 %	25 %	0 %	50 %	526221719
63	NC_021820	AGTA	2	8	22836	22843	50 %	25 %	25 %	0 %	526221719
64	NC_021820	TAAT	2	8	22849	22856	50 %	50 %	0 %	0 %	526221719
65	NC_021820	TACT	2	8	23392	23399	25 %	50 %	0 %	25 %	526221719
66	NC_021820	TAAA	2	8	23523	23530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021820	CAAA	2	8	23594	23601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021820	CAAT	2	8	23655	23662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021820	CAAA	2	8	23888	23895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021820	AATA	3	12	24254	24265	75 %	25 %	0 %	0 %	526221721
71	NC_021820	TTTC	2	8	24402	24409	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021820	GCTG	2	8	24573	24580	0 %	25 %	50 %	25 %	526218049
73	NC_021820	ACGA	2	8	24938	24945	50 %	0 %	25 %	25 %	526218049
74	NC_021820	CACT	2	8	25615	25622	25 %	25 %	0 %	50 %	526218049
75	NC_021820	GTGG	2	8	26381	26388	0 %	25 %	75 %	0 %	526218049
76	NC_021820	CGGT	2	8	26860	26867	0 %	25 %	50 %	25 %	526218049
77	NC_021820	GATA	2	8	27100	27107	50 %	25 %	25 %	0 %	526218049
78	NC_021820	TCAG	2	8	28227	28234	25 %	25 %	25 %	25 %	526218049
79	NC_021820	AGCG	2	8	28819	28826	25 %	0 %	50 %	25 %	526218050
80	NC_021820	GCAT	2	8	29083	29090	25 %	25 %	25 %	25 %	526218050
81	NC_021820	CCAG	2	8	29822	29829	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
82	NC_021820	CGCA	2	8	30105	30112	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
83	NC_021820	ACGC	2	8	30301	30308	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
84	NC_021820	GGAC	2	8	30453	30460	25 %	0 %	50 %	25 %	526218050
85	NC_021820	GCTG	2	8	31286	31293	0 %	25 %	50 %	25 %	526218050
86	NC_021820	AGAC	2	8	31377	31384	50 %	0 %	25 %	25 %	526218050
87	NC_021820	GCAG	2	8	32200	32207	25 %	0 %	50 %	25 %	526218050
88	NC_021820	TACG	2	8	32225	32232	25 %	25 %	25 %	25 %	526218050
89	NC_021820	CCAG	2	8	32264	32271	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
90	NC_021820	TTGT	2	8	34037	34044	0 %	75 %	25 %	0 %	526218052
91	NC_021820	TTCT	2	8	34279	34286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021820	ACTC	2	8	34365	34372	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021820	TTTC	2	8	34626	34633	0 %	75 %	0 %	25 %	526218053
94	NC_021820	TACC	2	8	34899	34906	25 %	25 %	0 %	50 %	526218053
95	NC_021820	CTGA	2	8	35792	35799	25 %	25 %	25 %	25 %	526218055
96	NC_021820	AACC	2	8	36709	36716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021820	AGCC	2	8	37539	37546	25 %	0 %	25 %	50 %	526221722
98	NC_021820	ACGA	2	8	37606	37613	50 %	0 %	25 %	25 %	526221722
99	NC_021820	AGGA	2	8	38220	38227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021820	CTAC	2	8	38657	38664	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021820	ACCG	2	8	38821	38828	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021820	GAAA	2	8	39913	39920	75 %	0 %	25 %	0 %	526218057
103	NC_021820	ATCC	2	8	40357	40364	25 %	25 %	0 %	50 %	526218058
104	NC_021820	GACC	2	8	41058	41065	25 %	0 %	25 %	50 %	526218059
105	NC_021820	CCAG	2	8	41086	41093	25 %	0 %	25 %	50 %	526218059
106	NC_021820	CAGC	2	8	41249	41256	25 %	0 %	25 %	50 %	526218059
107	NC_021820	CTTC	2	8	41904	41911	0 %	50 %	0 %	50 %	526218059
108	NC_021820	TTGC	2	8	41944	41951	0 %	50 %	25 %	25 %	526218059
109	NC_021820	AGTC	2	8	42412	42419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021820	TCCT	2	8	42436	42443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021820	CAGC	2	8	43680	43687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021820	GACT	2	8	43698	43705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021820	AACG	2	8	44268	44275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021820	CTTT	2	8	44445	44452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021820	GTAC	2	8	45009	45016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021820	GTCA	2	8	45092	45099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021820	TCGC	2	8	45281	45288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021820	CTAC	2	8	46149	46156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021820	TGCG	2	8	47008	47015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021820	CATT	2	8	48358	48365	25 %	50 %	0 %	25 %	526221723
121	NC_021820	CGCC	2	8	49608	49615	0 %	0 %	25 %	75 %	526218060
122	NC_021820	ATCA	2	8	49828	49835	50 %	25 %	0 %	25 %	526218060
123	NC_021820	CACG	2	8	49893	49900	25 %	0 %	25 %	50 %	526218060
124	NC_021820	ACGC	2	8	50299	50306	25 %	0 %	25 %	50 %	526218060
125	NC_021820	TCAA	2	8	50309	50316	50 %	25 %	0 %	25 %	526218060
126	NC_021820	TCGC	2	8	51094	51101	0 %	25 %	25 %	50 %	526218061
127	NC_021820	GTCA	2	8	51104	51111	25 %	25 %	25 %	25 %	526218061
128	NC_021820	TGCG	2	8	51120	51127	0 %	25 %	50 %	25 %	526218061
129	NC_021820	CCGT	2	8	51710	51717	0 %	25 %	25 %	50 %	526218061
130	NC_021820	GCAC	2	8	52240	52247	25 %	0 %	25 %	50 %	526218062
131	NC_021820	ACAG	2	8	53229	53236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021820	CTGC	2	8	54128	54135	0 %	25 %	25 %	50 %	526218064
133	NC_021820	ACAG	2	8	54198	54205	50 %	0 %	25 %	25 %	526218064
134	NC_021820	CCAT	2	8	54757	54764	25 %	25 %	0 %	50 %	526218065
135	NC_021820	CGCC	2	8	55076	55083	0 %	0 %	25 %	75 %	526218065
136	NC_021820	TGGC	2	8	55551	55558	0 %	25 %	50 %	25 %	526218065
137	NC_021820	GCAG	2	8	56284	56291	25 %	0 %	50 %	25 %	526218066
138	NC_021820	CAGC	2	8	56654	56661	25 %	0 %	25 %	50 %	526218066
139	NC_021820	CAGT	2	8	57148	57155	25 %	25 %	25 %	25 %	526218066
140	NC_021820	TCTT	2	8	58008	58015	0 %	75 %	0 %	25 %	526218067
141	NC_021820	TAAT	2	8	58177	58184	50 %	50 %	0 %	0 %	526218067
142	NC_021820	ATTA	2	8	58665	58672	50 %	50 %	0 %	0 %	526218068
143	NC_021820	GTGG	2	8	59132	59139	0 %	25 %	75 %	0 %	526218068
144	NC_021820	TAAT	2	8	59247	59254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_021820	TTAC	2	8	188747	188754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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446	NC_021820	ACTG	2	8	189568	189575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
447	NC_021820	CTTT	2	8	190884	190891	0 %	75 %	0 %	25 %	526218174
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461	NC_021820	CTTT	2	8	199411	199418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
462	NC_021820	GTAC	2	8	199975	199982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
463	NC_021820	GTCA	2	8	200058	200065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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