MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021819	CTTTCA	2	12	1627	1638	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525842584
2	NC_021819	TGGTTT	2	12	6332	6343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842566
3	NC_021819	TCGGTA	2	12	7328	7339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525842592
4	NC_021819	GACCAT	2	12	12128	12139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525842597
5	NC_021819	TACCGC	2	12	16835	16846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525842568
6	NC_021819	AAGCAG	2	12	18900	18911	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525842602
7	NC_021819	TTAATA	2	12	25403	25414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021819	GTAAAG	2	12	27898	27909	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525842609
9	NC_021819	CCAGTT	2	12	29251	29262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525842610
10	NC_021819	AGCCAA	2	12	30638	30649	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525842610
11	NC_021819	GGCGCT	2	12	35845	35856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525842615
12	NC_021819	AAGAGT	2	12	40162	40173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525842618
13	NC_021819	CGGCAC	2	12	43164	43175	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525842621
14	NC_021819	TGCCGC	2	12	45234	45245	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525842622
15	NC_021819	TTGACC	2	12	46106	46117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525842623
16	NC_021819	CCAGAT	2	12	50312	50323	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525842626
17	NC_021819	AATTTT	2	12	58989	59000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021819	TGCCAG	2	12	67831	67842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525842642
19	NC_021819	GTCATT	2	12	71101	71112	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021819	CCTACC	2	12	77054	77065	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525842647
21	NC_021819	TTATCG	2	12	81018	81029	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525842652
22	NC_021819	CGCCTG	2	12	84666	84677	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021819	CGTTGT	2	12	96284	96295	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525842672
24	NC_021819	ATCGAA	2	12	98643	98654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525842675
25	NC_021819	CGTCAC	2	12	100391	100402	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525842677
26	NC_021819	GTTCAG	2	12	106019	106030	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525842683
27	NC_021819	CGGTGA	2	12	109149	109160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525842687
28	NC_021819	CTGAAC	2	12	110950	110961	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525842689
29	NC_021819	GCCAGC	2	12	113281	113292	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525842691
30	NC_021819	TCTTAA	2	12	121501	121512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525842699
31	NC_021819	ATTAAA	2	12	121637	121648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842699

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.