MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021819	AT	3	6	1295	1300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021819	TG	3	6	1662	1667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021819	GA	3	6	5274	5279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021819	TC	3	6	10756	10761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021819	CA	3	6	12578	12583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021819	TC	3	6	18211	18216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021819	CG	3	6	24504	24509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021819	TC	3	6	24567	24572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021819	TG	3	6	26201	26206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021819	TC	3	6	31663	31668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021819	AG	3	6	33131	33136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021819	TC	3	6	38964	38969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021819	GA	3	6	47142	47147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021819	AC	3	6	47683	47688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021819	TA	3	6	48800	48805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021819	AG	3	6	53080	53085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021819	GA	3	6	53141	53146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021819	AG	3	6	53188	53193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021819	CT	3	6	53275	53280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021819	AG	4	8	53297	53304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021819	CT	3	6	54657	54662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021819	CG	3	6	61889	61894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021819	TC	3	6	61952	61957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021819	AT	3	6	63577	63582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021819	TA	3	6	63613	63618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021819	CA	3	6	63669	63674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021819	CA	3	6	64863	64868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021819	AT	3	6	67052	67057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021819	TG	3	6	68917	68922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021819	AT	3	6	68956	68961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021819	AT	3	6	70079	70084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021819	TC	4	8	71236	71243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021819	AT	3	6	71585	71590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021819	TC	3	6	71671	71676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021819	CT	3	6	72636	72641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021819	CA	3	6	77136	77141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021819	GA	3	6	77608	77613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021819	GA	3	6	80634	80639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021819	TC	3	6	82374	82379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021819	GA	3	6	83682	83687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021819	AC	3	6	83994	83999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021819	TG	3	6	84632	84637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021819	CT	3	6	85644	85649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021819	GA	3	6	88235	88240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021819	AG	3	6	88282	88287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021819	CT	3	6	88370	88375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021819	AG	4	8	88392	88399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021819	TG	3	6	90386	90391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021819	AG	3	6	91398	91403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021819	TA	3	6	91629	91634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021819	AT	3	6	93993	93998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021819	TA	3	6	95731	95736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021819	TA	3	6	95781	95786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021819	AT	3	6	95902	95907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021819	GA	4	8	115790	115797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021819	TA	3	6	120866	120871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021819	TG	3	6	121108	121113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.