MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021819	AT	3	6	619	624	50 %	50 %	0 %	0 %	525842582
2	NC_021819	CT	3	6	2207	2212	0 %	50 %	0 %	50 %	525842586
3	NC_021819	AT	3	6	2625	2630	50 %	50 %	0 %	0 %	525842587
4	NC_021819	GA	3	6	6188	6193	50 %	0 %	50 %	0 %	525842566
5	NC_021819	TC	4	8	6225	6232	0 %	50 %	0 %	50 %	525842566
6	NC_021819	AT	3	6	9801	9806	50 %	50 %	0 %	0 %	525842595
7	NC_021819	AG	5	10	10442	10451	50 %	0 %	50 %	0 %	525842595
8	NC_021819	GC	3	6	11517	11522	0 %	0 %	50 %	50 %	525842597
9	NC_021819	TC	3	6	11985	11990	0 %	50 %	0 %	50 %	525842597
10	NC_021819	CA	3	6	13694	13699	50 %	0 %	0 %	50 %	525842599
11	NC_021819	GC	3	6	15111	15116	0 %	0 %	50 %	50 %	525842600
12	NC_021819	GC	3	6	15533	15538	0 %	0 %	50 %	50 %	525842600
13	NC_021819	AC	3	6	18146	18151	50 %	0 %	0 %	50 %	525842601
14	NC_021819	TA	3	6	18681	18686	50 %	50 %	0 %	0 %	525842602
15	NC_021819	GT	3	6	18728	18733	0 %	50 %	50 %	0 %	525842602
16	NC_021819	AT	3	6	19572	19577	50 %	50 %	0 %	0 %	525842602
17	NC_021819	AG	3	6	19714	19719	50 %	0 %	50 %	0 %	525842602
18	NC_021819	GA	4	8	19876	19883	50 %	0 %	50 %	0 %	525842569
19	NC_021819	TC	3	6	19948	19953	0 %	50 %	0 %	50 %	525842569
20	NC_021819	AC	3	6	19967	19972	50 %	0 %	0 %	50 %	525842569
21	NC_021819	CG	3	6	20061	20066	0 %	0 %	50 %	50 %	525842569
22	NC_021819	CG	3	6	20151	20156	0 %	0 %	50 %	50 %	525842569
23	NC_021819	AT	3	6	20956	20961	50 %	50 %	0 %	0 %	525842603
24	NC_021819	TC	3	6	22151	22156	0 %	50 %	0 %	50 %	525842604
25	NC_021819	GC	3	6	22770	22775	0 %	0 %	50 %	50 %	525842605
26	NC_021819	GA	3	6	22889	22894	50 %	0 %	50 %	0 %	525842605
27	NC_021819	AC	3	6	25960	25965	50 %	0 %	0 %	50 %	525842571
28	NC_021819	GA	3	6	27265	27270	50 %	0 %	50 %	0 %	525842608
29	NC_021819	CA	3	6	28011	28016	50 %	0 %	0 %	50 %	525842609
30	NC_021819	GC	3	6	28707	28712	0 %	0 %	50 %	50 %	525842610
31	NC_021819	GA	3	6	29811	29816	50 %	0 %	50 %	0 %	525842610
32	NC_021819	AT	3	6	30271	30276	50 %	50 %	0 %	0 %	525842610
33	NC_021819	GA	3	6	30666	30671	50 %	0 %	50 %	0 %	525842610
34	NC_021819	GC	3	6	30772	30777	0 %	0 %	50 %	50 %	525842611
35	NC_021819	TC	3	6	32863	32868	0 %	50 %	0 %	50 %	525842613
36	NC_021819	TC	3	6	34699	34704	0 %	50 %	0 %	50 %	525842614
37	NC_021819	GA	3	6	35339	35344	50 %	0 %	50 %	0 %	525842615
38	NC_021819	CT	3	6	35895	35900	0 %	50 %	0 %	50 %	525842615
39	NC_021819	AG	3	6	36085	36090	50 %	0 %	50 %	0 %	525842615
40	NC_021819	TA	3	6	37084	37089	50 %	50 %	0 %	0 %	525842616
41	NC_021819	GC	3	6	38181	38186	0 %	0 %	50 %	50 %	525842617
42	NC_021819	GC	3	6	38225	38230	0 %	0 %	50 %	50 %	525842617
43	NC_021819	GC	3	6	41078	41083	0 %	0 %	50 %	50 %	525842619
44	NC_021819	GC	3	6	41708	41713	0 %	0 %	50 %	50 %	525842620
45	NC_021819	GA	3	6	42394	42399	50 %	0 %	50 %	0 %	525842620
46	NC_021819	CG	3	6	45414	45419	0 %	0 %	50 %	50 %	525842622
47	NC_021819	GC	3	6	46248	46253	0 %	0 %	50 %	50 %	525842623
48	NC_021819	CT	3	6	47461	47466	0 %	50 %	0 %	50 %	525842624
49	NC_021819	AG	3	6	47497	47502	50 %	0 %	50 %	0 %	525842624
50	NC_021819	CG	3	6	48505	48510	0 %	0 %	50 %	50 %	525842625
51	NC_021819	GT	3	6	49457	49462	0 %	50 %	50 %	0 %	525842626
52	NC_021819	AG	3	6	50202	50207	50 %	0 %	50 %	0 %	525842626
53	NC_021819	TG	4	8	50335	50342	0 %	50 %	50 %	0 %	525842626
54	NC_021819	AT	3	6	51561	51566	50 %	50 %	0 %	0 %	525842628
55	NC_021819	AT	3	6	52121	52126	50 %	50 %	0 %	0 %	525842628
56	NC_021819	AT	3	6	52717	52722	50 %	50 %	0 %	0 %	525842629
57	NC_021819	CT	3	6	52739	52744	0 %	50 %	0 %	50 %	525842629
58	NC_021819	TA	4	8	54517	54524	50 %	50 %	0 %	0 %	525842630
59	NC_021819	GC	3	6	54853	54858	0 %	0 %	50 %	50 %	525842574
60	NC_021819	AT	3	6	55098	55103	50 %	50 %	0 %	0 %	525842574
61	NC_021819	AC	3	6	55189	55194	50 %	0 %	0 %	50 %	525842575
62	NC_021819	TA	3	6	56195	56200	50 %	50 %	0 %	0 %	525842576
63	NC_021819	GC	3	6	59153	59158	0 %	0 %	50 %	50 %	525842633
64	NC_021819	TC	3	6	59278	59283	0 %	50 %	0 %	50 %	525842633
65	NC_021819	CA	3	6	59827	59832	50 %	0 %	0 %	50 %	525842633
66	NC_021819	GT	3	6	59890	59895	0 %	50 %	50 %	0 %	525842633
67	NC_021819	GC	3	6	63018	63023	0 %	0 %	50 %	50 %	525842636
68	NC_021819	GA	3	6	63137	63142	50 %	0 %	50 %	0 %	525842636
69	NC_021819	AG	3	6	64595	64600	50 %	0 %	50 %	0 %	525842637
70	NC_021819	AG	3	6	64756	64761	50 %	0 %	50 %	0 %	525842637
71	NC_021819	AT	3	6	66677	66682	50 %	50 %	0 %	0 %	525842641
72	NC_021819	AG	3	6	67544	67549	50 %	0 %	50 %	0 %	525842642
73	NC_021819	TA	3	6	70858	70863	50 %	50 %	0 %	0 %	525842644
74	NC_021819	AT	4	8	70888	70895	50 %	50 %	0 %	0 %	525842644
75	NC_021819	AG	3	6	72923	72928	50 %	0 %	50 %	0 %	525842645
76	NC_021819	TC	3	6	73560	73565	0 %	50 %	0 %	50 %	525842645
77	NC_021819	CT	3	6	73934	73939	0 %	50 %	0 %	50 %	525842645
78	NC_021819	TA	3	6	74083	74088	50 %	50 %	0 %	0 %	525842645
79	NC_021819	AT	3	6	74463	74468	50 %	50 %	0 %	0 %	525842646
80	NC_021819	AT	4	8	74524	74531	50 %	50 %	0 %	0 %	525842646
81	NC_021819	CA	3	6	75090	75095	50 %	0 %	0 %	50 %	525842646
82	NC_021819	TC	3	6	75580	75585	0 %	50 %	0 %	50 %	525842646
83	NC_021819	GA	3	6	75634	75639	50 %	0 %	50 %	0 %	525842646
84	NC_021819	AT	3	6	76016	76021	50 %	50 %	0 %	0 %	525842646
85	NC_021819	TA	4	8	76028	76035	50 %	50 %	0 %	0 %	525842646
86	NC_021819	GA	3	6	76206	76211	50 %	0 %	50 %	0 %	525842646
87	NC_021819	TA	3	6	76253	76258	50 %	50 %	0 %	0 %	525842647
88	NC_021819	CT	3	6	76593	76598	0 %	50 %	0 %	50 %	525842647
89	NC_021819	CG	3	6	79636	79641	0 %	0 %	50 %	50 %	525842651
90	NC_021819	AT	3	6	79936	79941	50 %	50 %	0 %	0 %	525842651
91	NC_021819	AC	3	6	83065	83070	50 %	0 %	0 %	50 %	525842654
92	NC_021819	TG	3	6	85079	85084	0 %	50 %	50 %	0 %	525842657
93	NC_021819	TC	3	6	85498	85503	0 %	50 %	0 %	50 %	525842657
94	NC_021819	AT	3	6	86654	86659	50 %	50 %	0 %	0 %	525842660
95	NC_021819	AT	3	6	87214	87219	50 %	50 %	0 %	0 %	525842660
96	NC_021819	TA	3	6	89612	89617	50 %	50 %	0 %	0 %	525842662
97	NC_021819	CT	3	6	89752	89757	0 %	50 %	0 %	50 %	525842662
98	NC_021819	AG	3	6	90195	90200	50 %	0 %	50 %	0 %	525842663
99	NC_021819	AT	3	6	94860	94865	50 %	50 %	0 %	0 %	525842671
100	NC_021819	TC	3	6	94909	94914	0 %	50 %	0 %	50 %	525842671
101	NC_021819	GA	3	6	96678	96683	50 %	0 %	50 %	0 %	525842672
102	NC_021819	CA	4	8	97751	97758	50 %	0 %	0 %	50 %	525842674
103	NC_021819	TG	4	8	98413	98420	0 %	50 %	50 %	0 %	525842674
104	NC_021819	AC	3	6	101422	101427	50 %	0 %	0 %	50 %	525842678
105	NC_021819	CT	3	6	102028	102033	0 %	50 %	0 %	50 %	525842678
106	NC_021819	GT	3	6	102350	102355	0 %	50 %	50 %	0 %	525842679
107	NC_021819	TG	3	6	103104	103109	0 %	50 %	50 %	0 %	525842679
108	NC_021819	AG	3	6	104177	104182	50 %	0 %	50 %	0 %	525842681
109	NC_021819	CA	3	6	104198	104203	50 %	0 %	0 %	50 %	525842681
110	NC_021819	CT	3	6	105154	105159	0 %	50 %	0 %	50 %	525842682
111	NC_021819	AG	3	6	105713	105718	50 %	0 %	50 %	0 %	525842682
112	NC_021819	TG	3	6	105879	105884	0 %	50 %	50 %	0 %	525842682
113	NC_021819	CA	3	6	105892	105897	50 %	0 %	0 %	50 %	525842682
114	NC_021819	CG	3	6	106199	106204	0 %	0 %	50 %	50 %	525842683
115	NC_021819	TC	3	6	108888	108893	0 %	50 %	0 %	50 %	525842687
116	NC_021819	GT	3	6	109748	109753	0 %	50 %	50 %	0 %	525842688
117	NC_021819	GC	3	6	113865	113870	0 %	0 %	50 %	50 %	525842691
118	NC_021819	CA	3	6	115267	115272	50 %	0 %	0 %	50 %	525842692
119	NC_021819	TG	3	6	115476	115481	0 %	50 %	50 %	0 %	525842692
120	NC_021819	TC	3	6	115601	115606	0 %	50 %	0 %	50 %	525842692
121	NC_021819	CA	3	6	116027	116032	50 %	0 %	0 %	50 %	525842580
122	NC_021819	AG	3	6	116108	116113	50 %	0 %	50 %	0 %	525842580
123	NC_021819	AG	3	6	117624	117629	50 %	0 %	50 %	0 %	525842694
124	NC_021819	AC	3	6	117671	117676	50 %	0 %	0 %	50 %	525842694
125	NC_021819	CA	3	6	117785	117790	50 %	0 %	0 %	50 %	525842694
126	NC_021819	AG	3	6	118900	118905	50 %	0 %	50 %	0 %	525842696
127	NC_021819	CA	3	6	119521	119526	50 %	0 %	0 %	50 %	525842696
128	NC_021819	TA	3	6	121515	121520	50 %	50 %	0 %	0 %	525842699

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.