MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021819	A	6	6	25	30	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021819	T	6	6	205	210	0 %	100 %	0 %	0 %	525842581
3	NC_021819	T	6	6	911	916	0 %	100 %	0 %	0 %	525842583
4	NC_021819	T	6	6	1306	1311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021819	A	6	6	1397	1402	100 %	0 %	0 %	0 %	525842584
6	NC_021819	A	6	6	2222	2227	100 %	0 %	0 %	0 %	525842586
7	NC_021819	T	8	8	2496	2503	0 %	100 %	0 %	0 %	525842587
8	NC_021819	A	6	6	2607	2612	100 %	0 %	0 %	0 %	525842587
9	NC_021819	A	9	9	2758	2766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021819	A	6	6	3198	3203	100 %	0 %	0 %	0 %	525842588
11	NC_021819	T	6	6	3348	3353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021819	A	8	8	3563	3570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021819	T	7	7	4045	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	525842589
14	NC_021819	A	6	6	4262	4267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021819	T	6	6	4319	4324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021819	A	8	8	5061	5068	100 %	0 %	0 %	0 %	525842590
17	NC_021819	A	6	6	5223	5228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021819	A	6	6	5978	5983	100 %	0 %	0 %	0 %	525842566
19	NC_021819	G	6	6	7747	7752	0 %	0 %	100 %	0 %	525842592
20	NC_021819	T	7	7	7763	7769	0 %	100 %	0 %	0 %	525842592
21	NC_021819	A	6	6	8149	8154	100 %	0 %	0 %	0 %	525842592
22	NC_021819	A	6	6	8291	8296	100 %	0 %	0 %	0 %	525842593
23	NC_021819	A	6	6	8445	8450	100 %	0 %	0 %	0 %	525842593
24	NC_021819	T	6	6	8779	8784	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
25	NC_021819	T	7	7	9032	9038	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
26	NC_021819	T	6	6	9346	9351	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
27	NC_021819	T	7	7	9591	9597	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
28	NC_021819	T	6	6	9741	9746	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
29	NC_021819	T	7	7	9768	9774	0 %	100 %	0 %	0 %	525842595
30	NC_021819	T	7	7	10804	10810	0 %	100 %	0 %	0 %	525842596
31	NC_021819	G	6	6	10931	10936	0 %	0 %	100 %	0 %	525842596
32	NC_021819	T	7	7	11243	11249	0 %	100 %	0 %	0 %	525842567
33	NC_021819	G	6	6	11379	11384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021819	G	7	7	11399	11405	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021819	A	8	8	12743	12750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021819	T	7	7	12987	12993	0 %	100 %	0 %	0 %	525842598
37	NC_021819	T	6	6	13116	13121	0 %	100 %	0 %	0 %	525842598
38	NC_021819	A	6	6	13395	13400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021819	T	6	6	14584	14589	0 %	100 %	0 %	0 %	525842599
40	NC_021819	T	6	6	14601	14606	0 %	100 %	0 %	0 %	525842599
41	NC_021819	T	6	6	14650	14655	0 %	100 %	0 %	0 %	525842599
42	NC_021819	T	6	6	15140	15145	0 %	100 %	0 %	0 %	525842600
43	NC_021819	T	6	6	16417	16422	0 %	100 %	0 %	0 %	525842568
44	NC_021819	A	6	6	16899	16904	100 %	0 %	0 %	0 %	525842568
45	NC_021819	A	6	6	17315	17320	100 %	0 %	0 %	0 %	525842568
46	NC_021819	A	6	6	17523	17528	100 %	0 %	0 %	0 %	525842568
47	NC_021819	C	6	6	17765	17770	0 %	0 %	0 %	100 %	525842601
48	NC_021819	T	6	6	18794	18799	0 %	100 %	0 %	0 %	525842602
49	NC_021819	C	6	6	19753	19758	0 %	0 %	0 %	100 %	525842569
50	NC_021819	C	6	6	19840	19845	0 %	0 %	0 %	100 %	525842569
51	NC_021819	T	6	6	21192	21197	0 %	100 %	0 %	0 %	525842603
52	NC_021819	A	6	6	24828	24833	100 %	0 %	0 %	0 %	525842607
53	NC_021819	A	6	6	27308	27313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021819	A	7	7	27348	27354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021819	T	6	6	27459	27464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021819	C	6	6	27687	27692	0 %	0 %	0 %	100 %	525842609
57	NC_021819	G	6	6	30824	30829	0 %	0 %	100 %	0 %	525842611
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59	NC_021819	A	6	6	37239	37244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021819	A	6	6	37389	37394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021819	G	6	6	38746	38751	0 %	0 %	100 %	0 %	525842617
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64	NC_021819	G	7	7	42352	42358	0 %	0 %	100 %	0 %	525842620
65	NC_021819	T	8	8	44139	44146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021819	T	7	7	44471	44477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_021819	A	6	6	50095	50100	100 %	0 %	0 %	0 %	525842626
71	NC_021819	A	6	6	50600	50605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021819	T	6	6	51272	51277	0 %	100 %	0 %	0 %	525842627
73	NC_021819	A	6	6	51777	51782	100 %	0 %	0 %	0 %	525842628
74	NC_021819	T	6	6	52610	52615	0 %	100 %	0 %	0 %	525842628
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76	NC_021819	A	7	7	56072	56078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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83	NC_021819	A	6	6	63563	63568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_021819	A	6	6	65003	65008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94	NC_021819	T	6	6	67011	67016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_021819	T	6	6	69150	69155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_021819	T	6	6	71448	71453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021819	T	6	6	71625	71630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_021819	A	6	6	73362	73367	100 %	0 %	0 %	0 %	525842645
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109	NC_021819	A	6	6	74619	74624	100 %	0 %	0 %	0 %	525842646
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113	NC_021819	T	6	6	75433	75438	0 %	100 %	0 %	0 %	525842646
114	NC_021819	T	6	6	75478	75483	0 %	100 %	0 %	0 %	525842646
115	NC_021819	T	7	7	75858	75864	0 %	100 %	0 %	0 %	525842646
116	NC_021819	A	6	6	76698	76703	100 %	0 %	0 %	0 %	525842647
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118	NC_021819	T	6	6	77169	77174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021819	A	6	6	78066	78071	100 %	0 %	0 %	0 %	525842648
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122	NC_021819	A	6	6	79329	79334	100 %	0 %	0 %	0 %	525842650
123	NC_021819	A	6	6	79461	79466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_021819	T	6	6	79775	79780	0 %	100 %	0 %	0 %	525842651
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.