MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021819	T	6	6	205	210	0 %	100 %	0 %	0 %	525842581
2	NC_021819	T	6	6	911	916	0 %	100 %	0 %	0 %	525842583
3	NC_021819	A	6	6	1397	1402	100 %	0 %	0 %	0 %	525842584
4	NC_021819	A	6	6	2222	2227	100 %	0 %	0 %	0 %	525842586
5	NC_021819	T	8	8	2496	2503	0 %	100 %	0 %	0 %	525842587
6	NC_021819	A	6	6	2607	2612	100 %	0 %	0 %	0 %	525842587
7	NC_021819	A	6	6	3198	3203	100 %	0 %	0 %	0 %	525842588
8	NC_021819	T	7	7	4045	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	525842589
9	NC_021819	A	8	8	5061	5068	100 %	0 %	0 %	0 %	525842590
10	NC_021819	A	6	6	5978	5983	100 %	0 %	0 %	0 %	525842566
11	NC_021819	G	6	6	7747	7752	0 %	0 %	100 %	0 %	525842592
12	NC_021819	T	7	7	7763	7769	0 %	100 %	0 %	0 %	525842592
13	NC_021819	A	6	6	8149	8154	100 %	0 %	0 %	0 %	525842592
14	NC_021819	A	6	6	8291	8296	100 %	0 %	0 %	0 %	525842593
15	NC_021819	A	6	6	8445	8450	100 %	0 %	0 %	0 %	525842593
16	NC_021819	T	6	6	8779	8784	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
17	NC_021819	T	7	7	9032	9038	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
18	NC_021819	T	6	6	9346	9351	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
19	NC_021819	T	7	7	9591	9597	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
20	NC_021819	T	6	6	9741	9746	0 %	100 %	0 %	0 %	525842594
21	NC_021819	T	7	7	9768	9774	0 %	100 %	0 %	0 %	525842595
22	NC_021819	T	7	7	10804	10810	0 %	100 %	0 %	0 %	525842596
23	NC_021819	G	6	6	10931	10936	0 %	0 %	100 %	0 %	525842596
24	NC_021819	T	7	7	11243	11249	0 %	100 %	0 %	0 %	525842567
25	NC_021819	T	7	7	12987	12993	0 %	100 %	0 %	0 %	525842598
26	NC_021819	T	6	6	13116	13121	0 %	100 %	0 %	0 %	525842598
27	NC_021819	T	6	6	14584	14589	0 %	100 %	0 %	0 %	525842599
28	NC_021819	T	6	6	14601	14606	0 %	100 %	0 %	0 %	525842599
29	NC_021819	T	6	6	14650	14655	0 %	100 %	0 %	0 %	525842599
30	NC_021819	T	6	6	15140	15145	0 %	100 %	0 %	0 %	525842600
31	NC_021819	T	6	6	16417	16422	0 %	100 %	0 %	0 %	525842568
32	NC_021819	A	6	6	16899	16904	100 %	0 %	0 %	0 %	525842568
33	NC_021819	A	6	6	17315	17320	100 %	0 %	0 %	0 %	525842568
34	NC_021819	A	6	6	17523	17528	100 %	0 %	0 %	0 %	525842568
35	NC_021819	C	6	6	17765	17770	0 %	0 %	0 %	100 %	525842601
36	NC_021819	T	6	6	18794	18799	0 %	100 %	0 %	0 %	525842602
37	NC_021819	C	6	6	19753	19758	0 %	0 %	0 %	100 %	525842569
38	NC_021819	C	6	6	19840	19845	0 %	0 %	0 %	100 %	525842569
39	NC_021819	T	6	6	21192	21197	0 %	100 %	0 %	0 %	525842603
40	NC_021819	A	6	6	24828	24833	100 %	0 %	0 %	0 %	525842607
41	NC_021819	C	6	6	27687	27692	0 %	0 %	0 %	100 %	525842609
42	NC_021819	G	6	6	30824	30829	0 %	0 %	100 %	0 %	525842611
43	NC_021819	A	6	6	33897	33902	100 %	0 %	0 %	0 %	525842614
44	NC_021819	G	6	6	38746	38751	0 %	0 %	100 %	0 %	525842617
45	NC_021819	A	6	6	40832	40837	100 %	0 %	0 %	0 %	525842619
46	NC_021819	T	6	6	41252	41257	0 %	100 %	0 %	0 %	525842619
47	NC_021819	G	7	7	42352	42358	0 %	0 %	100 %	0 %	525842620
48	NC_021819	A	6	6	47595	47600	100 %	0 %	0 %	0 %	525842624
49	NC_021819	C	6	6	49350	49355	0 %	0 %	0 %	100 %	525842626
50	NC_021819	T	6	6	49437	49442	0 %	100 %	0 %	0 %	525842626
51	NC_021819	A	6	6	50095	50100	100 %	0 %	0 %	0 %	525842626
52	NC_021819	T	6	6	51272	51277	0 %	100 %	0 %	0 %	525842627
53	NC_021819	A	6	6	51777	51782	100 %	0 %	0 %	0 %	525842628
54	NC_021819	T	6	6	52610	52615	0 %	100 %	0 %	0 %	525842628
55	NC_021819	A	6	6	55154	55159	100 %	0 %	0 %	0 %	525842574
56	NC_021819	T	6	6	56629	56634	0 %	100 %	0 %	0 %	525842577
57	NC_021819	T	7	7	57221	57227	0 %	100 %	0 %	0 %	525842631
58	NC_021819	A	7	7	58603	58609	100 %	0 %	0 %	0 %	525842632
59	NC_021819	T	6	6	63826	63831	0 %	100 %	0 %	0 %	525842637
60	NC_021819	A	7	7	63865	63871	100 %	0 %	0 %	0 %	525842637
61	NC_021819	C	6	6	64017	64022	0 %	0 %	0 %	100 %	525842637
62	NC_021819	A	6	6	64634	64639	100 %	0 %	0 %	0 %	525842637
63	NC_021819	A	6	6	66706	66711	100 %	0 %	0 %	0 %	525842641
64	NC_021819	T	7	7	67245	67251	0 %	100 %	0 %	0 %	525842642
65	NC_021819	T	6	6	67378	67383	0 %	100 %	0 %	0 %	525842642
66	NC_021819	A	6	6	67958	67963	100 %	0 %	0 %	0 %	525842642
67	NC_021819	T	7	7	68438	68444	0 %	100 %	0 %	0 %	525842642
68	NC_021819	A	8	8	68764	68771	100 %	0 %	0 %	0 %	525842642
69	NC_021819	C	6	6	73075	73080	0 %	0 %	0 %	100 %	525842645
70	NC_021819	A	6	6	73321	73326	100 %	0 %	0 %	0 %	525842645
71	NC_021819	A	6	6	73362	73367	100 %	0 %	0 %	0 %	525842645
72	NC_021819	T	6	6	73966	73971	0 %	100 %	0 %	0 %	525842645
73	NC_021819	A	6	6	74619	74624	100 %	0 %	0 %	0 %	525842646
74	NC_021819	T	6	6	74753	74758	0 %	100 %	0 %	0 %	525842646
75	NC_021819	G	6	6	75042	75047	0 %	0 %	100 %	0 %	525842646
76	NC_021819	T	7	7	75169	75175	0 %	100 %	0 %	0 %	525842646
77	NC_021819	T	6	6	75433	75438	0 %	100 %	0 %	0 %	525842646
78	NC_021819	T	6	6	75478	75483	0 %	100 %	0 %	0 %	525842646
79	NC_021819	T	7	7	75858	75864	0 %	100 %	0 %	0 %	525842646
80	NC_021819	A	6	6	76698	76703	100 %	0 %	0 %	0 %	525842647
81	NC_021819	A	6	6	78066	78071	100 %	0 %	0 %	0 %	525842648
82	NC_021819	A	6	6	79240	79245	100 %	0 %	0 %	0 %	525842650
83	NC_021819	A	7	7	79313	79319	100 %	0 %	0 %	0 %	525842650
84	NC_021819	A	6	6	79329	79334	100 %	0 %	0 %	0 %	525842650
85	NC_021819	T	6	6	79763	79768	0 %	100 %	0 %	0 %	525842651
86	NC_021819	T	6	6	79775	79780	0 %	100 %	0 %	0 %	525842651
87	NC_021819	C	6	6	82917	82922	0 %	0 %	0 %	100 %	525842654
88	NC_021819	T	6	6	86365	86370	0 %	100 %	0 %	0 %	525842659
89	NC_021819	A	6	6	86870	86875	100 %	0 %	0 %	0 %	525842660
90	NC_021819	T	6	6	87703	87708	0 %	100 %	0 %	0 %	525842660
91	NC_021819	A	6	6	89947	89952	100 %	0 %	0 %	0 %	525842663
92	NC_021819	T	8	8	90032	90039	0 %	100 %	0 %	0 %	525842663
93	NC_021819	T	6	6	90327	90332	0 %	100 %	0 %	0 %	525842663
94	NC_021819	C	6	6	90673	90678	0 %	0 %	0 %	100 %	525842664
95	NC_021819	G	6	6	90847	90852	0 %	0 %	100 %	0 %	525842664
96	NC_021819	T	6	6	94052	94057	0 %	100 %	0 %	0 %	525842669
97	NC_021819	T	6	6	95099	95104	0 %	100 %	0 %	0 %	525842671
98	NC_021819	T	6	6	96381	96386	0 %	100 %	0 %	0 %	525842672
99	NC_021819	T	6	6	97787	97792	0 %	100 %	0 %	0 %	525842674
100	NC_021819	T	6	6	98820	98825	0 %	100 %	0 %	0 %	525842675
101	NC_021819	C	6	6	100067	100072	0 %	0 %	0 %	100 %	525842676
102	NC_021819	T	6	6	100566	100571	0 %	100 %	0 %	0 %	525842677
103	NC_021819	A	8	8	100983	100990	100 %	0 %	0 %	0 %	525842678
104	NC_021819	A	7	7	101066	101072	100 %	0 %	0 %	0 %	525842678
105	NC_021819	G	6	6	104993	104998	0 %	0 %	100 %	0 %	525842681
106	NC_021819	A	7	7	107549	107555	100 %	0 %	0 %	0 %	525842684
107	NC_021819	T	7	7	107948	107954	0 %	100 %	0 %	0 %	525842685
108	NC_021819	T	7	7	107984	107990	0 %	100 %	0 %	0 %	525842685
109	NC_021819	A	6	6	108744	108749	100 %	0 %	0 %	0 %	525842686
110	NC_021819	A	8	8	108871	108878	100 %	0 %	0 %	0 %	525842687
111	NC_021819	A	6	6	108964	108969	100 %	0 %	0 %	0 %	525842687
112	NC_021819	T	6	6	110215	110220	0 %	100 %	0 %	0 %	525842689
113	NC_021819	A	7	7	110260	110266	100 %	0 %	0 %	0 %	525842689
114	NC_021819	A	6	6	114311	114316	100 %	0 %	0 %	0 %	525842691
115	NC_021819	T	7	7	116126	116132	0 %	100 %	0 %	0 %	525842580
116	NC_021819	A	6	6	116712	116717	100 %	0 %	0 %	0 %	525842693
117	NC_021819	A	6	6	117522	117527	100 %	0 %	0 %	0 %	525842693
118	NC_021819	T	6	6	117591	117596	0 %	100 %	0 %	0 %	525842694
119	NC_021819	T	6	6	117989	117994	0 %	100 %	0 %	0 %	525842695
120	NC_021819	T	6	6	117997	118002	0 %	100 %	0 %	0 %	525842695
121	NC_021819	A	6	6	118589	118594	100 %	0 %	0 %	0 %	525842695
122	NC_021819	T	7	7	118702	118708	0 %	100 %	0 %	0 %	525842695
123	NC_021819	T	6	6	119162	119167	0 %	100 %	0 %	0 %	525842696
124	NC_021819	T	6	6	119260	119265	0 %	100 %	0 %	0 %	525842696
125	NC_021819	T	6	6	119396	119401	0 %	100 %	0 %	0 %	525842696
126	NC_021819	G	7	7	119660	119666	0 %	0 %	100 %	0 %	525842696
127	NC_021819	T	6	6	120271	120276	0 %	100 %	0 %	0 %	525842697
128	NC_021819	A	7	7	121658	121664	100 %	0 %	0 %	0 %	525842699

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.