MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021817	AATAAA	2	12	485	496	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525833509
2	NC_021817	TACCTT	2	12	1727	1738	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021817	TGGCCA	2	12	3365	3376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525833513
4	NC_021817	CGGATT	2	12	4164	4175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525833513
5	NC_021817	ATCACC	2	12	10844	10855	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	525833517
6	NC_021817	CGCCTG	2	12	11395	11406	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525833517
7	NC_021817	CGAGGC	2	12	16851	16862	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525833521
8	NC_021817	CCTGCC	2	12	20256	20267	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	525833522
9	NC_021817	GGTTCG	2	12	21676	21687	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525833524
10	NC_021817	TCGGTC	2	12	22578	22589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833525
11	NC_021817	CAGCTG	2	12	24175	24186	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525833526
12	NC_021817	GATATT	2	12	25312	25323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525833528
13	NC_021817	CGATAC	2	12	28620	28631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525833531
14	NC_021817	CGGTGT	2	12	29525	29536	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525833532
15	NC_021817	GTGTTT	2	12	29631	29642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833532
16	NC_021817	TCCTGC	2	12	30623	30634	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525833503
17	NC_021817	AAATTT	2	12	35795	35806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021817	CGAGGC	2	12	38765	38776	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525833545
19	NC_021817	CTCAGC	2	12	39286	39297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525833546
20	NC_021817	CCAGCG	2	12	44226	44237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525833552
21	NC_021817	CCACGA	2	12	44598	44609	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525833552
22	NC_021817	AACGGG	2	12	46324	46335	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525833555
23	NC_021817	ATCCTT	2	12	48353	48364	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021817	GCTGTC	2	12	59978	59989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833568
25	NC_021817	CACTGT	2	12	59990	60001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525833568
26	NC_021817	TACTGT	2	12	60621	60632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021817	CATAAC	2	12	66475	66486	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525833573
28	NC_021817	TTATAT	2	12	69652	69663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833576
29	NC_021817	AGATAT	2	12	71886	71897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525833577
30	NC_021817	ATCTCT	2	12	74969	74980	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021817	GGGATA	2	12	76710	76721	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.