MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021817	TAAA	2	8	209	216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021817	GCTT	2	8	767	774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021817	TCAA	2	8	1778	1785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021817	TTAT	3	12	3023	3034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021817	CTGC	2	8	4223	4230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021817	GCCA	2	8	4454	4461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021817	ACTT	2	8	4852	4859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021817	ACTG	2	8	5086	5093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021817	ACCA	2	8	5113	5120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021817	GTCT	2	8	14556	14563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021817	ACTA	2	8	30721	30728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021817	TAGA	2	8	34481	34488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021817	ATTT	2	8	34521	34528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021817	TTAT	2	8	35178	35185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021817	ATTT	2	8	35840	35847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021817	AATA	2	8	37321	37328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021817	TATT	2	8	37358	37365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021817	AATA	2	8	37702	37709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021817	AATA	2	8	37757	37764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021817	GCGG	2	8	39959	39966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021817	TCAT	2	8	40979	40986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021817	GTTT	2	8	45783	45790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021817	TGCC	2	8	46445	46452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021817	TCCC	2	8	46782	46789	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_021817	CAGC	2	8	46942	46949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021817	TAAA	2	8	48188	48195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021817	GCTG	2	8	50682	50689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021817	AAAT	2	8	55789	55796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021817	GAAA	2	8	56718	56725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021817	CTTT	2	8	56841	56848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021817	GCAA	2	8	57167	57174	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021817	ACTC	2	8	60236	60243	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021817	GAAG	2	8	60379	60386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021817	TGTA	2	8	60588	60595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021817	GAAA	2	8	60775	60782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021817	ATGA	2	8	61408	61415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021817	TAAT	2	8	61629	61636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021817	CAGA	2	8	62764	62771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021817	CAAT	2	8	62841	62848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021817	CAGA	2	8	62850	62857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021817	GGCT	2	8	62907	62914	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021817	CTGC	2	8	67004	67011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021817	CCAT	2	8	67091	67098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021817	CGGA	2	8	67142	67149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021817	CGAT	2	8	67176	67183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021817	ATGT	2	8	67361	67368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021817	TGTC	2	8	69256	69263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021817	AATG	2	8	69381	69388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021817	ATGA	2	8	72970	72977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021817	TTCA	2	8	73073	73080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021817	CAGA	2	8	74588	74595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021817	TCGT	2	8	75139	75146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021817	ATTT	2	8	75636	75643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021817	TGAT	2	8	75785	75792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021817	AACC	2	8	75980	75987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021817	AATA	2	8	76572	76579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021817	TAAT	2	8	77261	77268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021817	TTTG	2	8	77466	77473	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021817	AATA	2	8	77701	77708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021817	TTAT	2	8	77771	77778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.