MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021817	ATA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021817	CCG	2	6	135	140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021817	TCA	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021817	TTG	2	6	291	296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021817	ATA	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021817	CGC	2	6	866	871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021817	ACC	2	6	876	881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021817	GCC	2	6	965	970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021817	TGA	2	6	1789	1794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021817	ATG	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021817	CTG	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021817	TCT	2	6	2443	2448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021817	ATC	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021817	CTG	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021817	GCG	2	6	2628	2633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021817	CAT	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021817	ATT	2	6	2768	2773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021817	GCG	2	6	2807	2812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021817	GTG	2	6	2823	2828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021817	TGT	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021817	TGA	2	6	3012	3017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021817	AAG	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021817	GCA	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021817	GAA	2	6	3258	3263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021817	GGC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021817	TCC	2	6	3314	3319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021817	TGG	2	6	3344	3349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021817	TGG	2	6	4318	4323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021817	TCA	2	6	4419	4424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021817	CTT	2	6	4531	4536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021817	CCT	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021817	TAC	2	6	4828	4833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021817	GAC	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021817	CGA	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021817	GCT	2	6	5132	5137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021817	GTT	3	9	5146	5154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021817	ACG	2	6	5526	5531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021817	TCC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021817	CAG	2	6	14535	14540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021817	ATT	2	6	14578	14583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021817	CGG	2	6	14641	14646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021817	TTA	2	6	15460	15465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021817	CCT	2	6	16139	16144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021817	TGG	2	6	26593	26598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021817	ACG	2	6	26627	26632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021817	TCC	2	6	26654	26659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021817	TGT	3	9	30739	30747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021817	TAT	2	6	34110	34115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021817	AAC	2	6	34122	34127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021817	TCC	2	6	34496	34501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021817	ATT	2	6	34548	34553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021817	CCT	2	6	35106	35111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021817	TAA	2	6	35163	35168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021817	TGG	2	6	35170	35175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021817	TAA	2	6	35234	35239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021817	CCA	2	6	35261	35266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_021817	TTA	2	6	35788	35793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021817	GAA	2	6	36162	36167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021817	TTA	2	6	37264	37269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021817	TCA	2	6	37282	37287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021817	AGC	2	6	37308	37313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021817	AGC	2	6	37382	37387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021817	TGA	2	6	37399	37404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021817	TTA	2	6	37501	37506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021817	GCG	2	6	37521	37526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021817	GCA	2	6	37541	37546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021817	TAT	2	6	37683	37688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021817	AGA	2	6	37725	37730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021817	ATA	3	9	37762	37770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021817	GCG	2	6	37798	37803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021817	GCA	2	6	37810	37815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021817	CAG	2	6	37851	37856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021817	CTT	2	6	39358	39363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021817	TTG	2	6	39364	39369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021817	GCC	2	6	39385	39390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021817	ATG	2	6	39395	39400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021817	CTG	2	6	39889	39894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021817	GTT	2	6	39908	39913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021817	CGC	2	6	39937	39942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021817	GAT	2	6	40015	40020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021817	GAC	2	6	40021	40026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021817	ACG	2	6	40106	40111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021817	CGG	2	6	40151	40156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021817	GCG	2	6	40180	40185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021817	CAG	2	6	40358	40363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021817	ACA	2	6	40387	40392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021817	TTC	2	6	40416	40421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021817	CAC	2	6	40488	40493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021817	ATT	2	6	40527	40532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021817	CTG	2	6	40945	40950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021817	GCT	2	6	41140	41145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021817	CCA	2	6	41147	41152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021817	GCC	2	6	42786	42791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021817	GGC	2	6	42800	42805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021817	CTC	2	6	44856	44861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_021817	GCT	2	6	44896	44901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021817	CGC	2	6	46062	46067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021817	ACG	2	6	46069	46074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021817	GCG	2	6	46165	46170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021817	GCA	2	6	46185	46190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021817	ATG	3	9	46587	46595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021817	ACA	2	6	46719	46724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021817	CTG	2	6	46817	46822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021817	TAT	2	6	46837	46842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021817	GCT	2	6	46867	46872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021817	CAC	2	6	46955	46960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021817	GCG	2	6	46995	47000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021817	CTT	2	6	47028	47033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021817	ATA	2	6	47102	47107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021817	GCG	2	6	47167	47172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021817	CGG	2	6	47465	47470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021817	CCG	2	6	47477	47482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021817	TCC	2	6	48004	48009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021817	GTC	2	6	48019	48024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021817	GGA	2	6	48071	48076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021817	ACG	2	6	48159	48164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021817	CGG	2	6	48171	48176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021817	AAC	2	6	48314	48319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021817	GGA	2	6	48322	48327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021817	GCC	3	9	48382	48390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021817	CGC	2	6	49213	49218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_021817	GCG	2	6	49223	49228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021817	GCG	2	6	50587	50592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021817	ACG	2	6	50721	50726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021817	CGG	2	6	50827	50832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021817	TTC	2	6	51706	51711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021817	ATA	2	6	51735	51740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021817	CGG	2	6	51846	51851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021817	GCC	2	6	51866	51871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_021817	GGA	2	6	51880	51885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021817	TTC	2	6	51934	51939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021817	TGG	2	6	51994	51999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021817	CTG	2	6	52098	52103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021817	GTG	2	6	52158	52163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021817	ATG	2	6	55745	55750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021817	ATA	2	6	55798	55803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021817	AGG	2	6	55822	55827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021817	TTG	2	6	55873	55878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021817	GTA	2	6	55987	55992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021817	ACA	2	6	55996	56001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021817	AGA	2	6	56730	56735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_021817	TAA	2	6	78155	78160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.