MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021817	TCA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833509
2	NC_021817	TCA	2	6	556	561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833509
3	NC_021817	CGA	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833510
4	NC_021817	CCA	2	6	1246	1251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833510
5	NC_021817	GGC	2	6	1292	1297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833510
6	NC_021817	CAA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833510
7	NC_021817	CGA	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833510
8	NC_021817	GTC	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833510
9	NC_021817	TCC	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833511
10	NC_021817	GTT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833511
11	NC_021817	CAG	2	6	2042	2047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833511
12	NC_021817	CAT	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833511
13	NC_021817	TCA	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833512
14	NC_021817	TCA	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833512
15	NC_021817	CCA	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833512
16	NC_021817	CAT	3	9	3402	3410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833513
17	NC_021817	CGC	2	6	3424	3429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833513
18	NC_021817	CCG	2	6	3457	3462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833513
19	NC_021817	GCT	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833513
20	NC_021817	CGC	2	6	3544	3549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833513
21	NC_021817	GCT	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833513
22	NC_021817	GCG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833513
23	NC_021817	GGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833513
24	NC_021817	AGC	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833513
25	NC_021817	ACG	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833513
26	NC_021817	GCA	2	6	4013	4018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833513
27	NC_021817	GGC	2	6	4021	4026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833513
28	NC_021817	GCG	2	6	4151	4156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833513
29	NC_021817	TAG	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833514
30	NC_021817	AGT	2	6	4594	4599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833514
31	NC_021817	GCT	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833514
32	NC_021817	CGT	2	6	4672	4677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833514
33	NC_021817	TCT	3	9	4701	4709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833514
34	NC_021817	CAG	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833515
35	NC_021817	ACC	2	6	5719	5724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833515
36	NC_021817	CGT	2	6	5739	5744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833515
37	NC_021817	CAT	2	6	5810	5815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833515
38	NC_021817	GCA	2	6	5862	5867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833515
39	NC_021817	CAG	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833515
40	NC_021817	CCA	2	6	5974	5979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833515
41	NC_021817	CGC	2	6	6014	6019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833515
42	NC_021817	ACA	2	6	6045	6050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833515
43	NC_021817	CCA	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833515
44	NC_021817	CAG	4	12	6242	6253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833515
45	NC_021817	ATG	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833515
46	NC_021817	GCT	2	6	6447	6452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833516
47	NC_021817	CAT	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833516
48	NC_021817	GCA	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833516
49	NC_021817	AGC	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833516
50	NC_021817	GTC	2	6	6547	6552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833516
51	NC_021817	TTC	2	6	6573	6578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833516
52	NC_021817	CCA	2	6	6637	6642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833516
53	NC_021817	GCC	2	6	6711	6716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833516
54	NC_021817	GCT	2	6	6759	6764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833516
55	NC_021817	TCA	2	6	6774	6779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833516
56	NC_021817	CGG	2	6	6806	6811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833516
57	NC_021817	CAC	2	6	7024	7029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833517
58	NC_021817	CTG	2	6	7066	7071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
59	NC_021817	GAC	2	6	7152	7157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
60	NC_021817	CAG	2	6	7174	7179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
61	NC_021817	GCA	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
62	NC_021817	CTG	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
63	NC_021817	CGC	2	6	7327	7332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833517
64	NC_021817	TCA	2	6	7373	7378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833517
65	NC_021817	TTC	2	6	7426	7431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833517
66	NC_021817	CAC	2	6	7447	7452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833517
67	NC_021817	CAT	2	6	7497	7502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833517
68	NC_021817	TCC	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833517
69	NC_021817	TCA	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833517
70	NC_021817	CAC	2	6	7591	7596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833517
71	NC_021817	GCA	2	6	7706	7711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
72	NC_021817	CGG	2	6	7760	7765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833517
73	NC_021817	CAG	2	6	7801	7806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
74	NC_021817	GCA	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
75	NC_021817	TCG	2	6	7910	7915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
76	NC_021817	TCC	2	6	8084	8089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833517
77	NC_021817	CGT	2	6	8148	8153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
78	NC_021817	CTG	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
79	NC_021817	TCA	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833517
80	NC_021817	TTC	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833517
81	NC_021817	CAT	2	6	8532	8537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833517
82	NC_021817	CTG	3	9	8581	8589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
83	NC_021817	ATG	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833517
84	NC_021817	CTG	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
85	NC_021817	GAT	2	6	8839	8844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833517
86	NC_021817	CAC	2	6	8896	8901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833517
87	NC_021817	GCT	2	6	8919	8924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
88	NC_021817	CCG	2	6	8996	9001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833517
89	NC_021817	CCA	2	6	9045	9050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833517
90	NC_021817	TCA	2	6	9059	9064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833517
91	NC_021817	GAT	2	6	9439	9444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833517
92	NC_021817	CAG	2	6	9598	9603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
93	NC_021817	CTG	2	6	9631	9636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
94	NC_021817	TGC	2	6	9790	9795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
95	NC_021817	GCG	2	6	9810	9815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833517
96	NC_021817	CGC	2	6	9993	9998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833517
97	NC_021817	GCA	2	6	10194	10199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
98	NC_021817	TCT	2	6	10254	10259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833517
99	NC_021817	CGC	2	6	10388	10393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833517
100	NC_021817	TGC	2	6	10418	10423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
101	NC_021817	CAG	2	6	10467	10472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
102	NC_021817	GCA	3	9	10680	10688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
103	NC_021817	GCA	2	6	10776	10781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
104	NC_021817	CAT	2	6	10876	10881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833517
105	NC_021817	GAC	2	6	11202	11207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
106	NC_021817	CAG	2	6	11304	11309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833517
107	NC_021817	CAA	2	6	11367	11372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833517
108	NC_021817	CGG	2	6	11550	11555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833517
109	NC_021817	CGC	2	6	11632	11637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833517
110	NC_021817	TGG	2	6	11709	11714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833517
111	NC_021817	CCA	2	6	11865	11870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833517
112	NC_021817	CCT	2	6	11901	11906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833517
113	NC_021817	GCT	2	6	11928	11933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833517
114	NC_021817	CCT	2	6	11937	11942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833517
115	NC_021817	TCA	2	6	11943	11948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833517
116	NC_021817	TTG	2	6	12062	12067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833517
117	NC_021817	CCA	2	6	12075	12080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833517
118	NC_021817	TAG	2	6	12215	12220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833517
119	NC_021817	GAA	2	6	12260	12265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833517
120	NC_021817	ATC	2	6	12291	12296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833518
121	NC_021817	AGG	2	6	12570	12575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833518
122	NC_021817	CAG	2	6	12596	12601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833518
123	NC_021817	GAG	2	6	12623	12628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833518
124	NC_021817	TTC	3	9	12720	12728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833518
125	NC_021817	GCG	2	6	12732	12737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833518
126	NC_021817	CAG	2	6	12789	12794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833518
127	NC_021817	TTC	3	9	12927	12935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833518
128	NC_021817	TCC	2	6	13024	13029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833518
129	NC_021817	GAA	3	9	13062	13070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833518
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252	NC_021817	CTT	2	6	21390	21395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833524
253	NC_021817	GCG	2	6	21543	21548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833524
254	NC_021817	CTG	2	6	21603	21608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833524
255	NC_021817	CGG	2	6	21663	21668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833524
256	NC_021817	TGC	2	6	21777	21782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833524
257	NC_021817	CAT	2	6	21783	21788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833524
258	NC_021817	ATG	2	6	21846	21851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833525
259	NC_021817	ATC	2	6	21908	21913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833525
260	NC_021817	TCA	2	6	21931	21936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833525
261	NC_021817	ACG	2	6	22025	22030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833525
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263	NC_021817	GCT	2	6	22184	22189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833525
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265	NC_021817	TGC	2	6	22269	22274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833525
266	NC_021817	GCG	2	6	22332	22337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833525
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269	NC_021817	CCT	2	6	22453	22458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833525
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273	NC_021817	ACG	2	6	22656	22661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833525
274	NC_021817	AGC	2	6	22962	22967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833525
275	NC_021817	GTG	2	6	23232	23237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833525
276	NC_021817	CGC	2	6	23281	23286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833525
277	NC_021817	CGG	2	6	23363	23368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833525
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281	NC_021817	GCG	2	6	23611	23616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833525
282	NC_021817	GCA	2	6	23682	23687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833526
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284	NC_021817	CGG	2	6	23817	23822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833526
285	NC_021817	TGT	2	6	23826	23831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833526
286	NC_021817	GGT	2	6	23842	23847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833526
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352	NC_021817	CTG	2	6	28192	28197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833531
353	NC_021817	GTG	2	6	28238	28243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833531
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373	NC_021817	CGG	2	6	29713	29718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833532
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375	NC_021817	CAG	2	6	29918	29923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833532
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497	NC_021817	CCT	2	6	41277	41282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833549
498	NC_021817	TCA	2	6	41352	41357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833549
499	NC_021817	TCA	2	6	41424	41429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833549
500	NC_021817	CCA	2	6	41536	41541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833549

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