MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021815	AAAGT	2	10	5161	5170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021815	AGCAA	2	10	19549	19558	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021815	TTTCA	2	10	30482	30491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021815	CAGTT	2	10	30715	30724	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021815	CCAAA	2	10	34624	34633	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021815	GGGCT	2	10	36113	36122	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021815	GCTGG	2	10	36199	36208	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021815	CCCAG	2	10	45808	45817	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_021815	TAACC	2	10	119240	119249	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021815	AAAAC	2	10	135611	135620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021815	ATTTT	2	10	136019	136028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021815	TGTTT	2	10	138023	138032	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021815	CAGAC	2	10	150777	150786	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_021815	CGTTC	2	10	151303	151312	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021815	ACCTT	2	10	157139	157148	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021815	CCTTC	2	10	158585	158594	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_021815	GCTTT	2	10	164082	164091	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021815	TTGAT	2	10	195746	195755	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021815	CCCCA	2	10	203352	203361	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
20	NC_021815	AATCT	2	10	203444	203453	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021815	CCATT	2	10	214159	214168	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.