MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021815	TTGC	2	8	99	106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021815	AGAT	2	8	415	422	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021815	AGAT	2	8	508	515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021815	AAAG	2	8	2504	2511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021815	CAGG	2	8	2568	2575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021815	AATA	2	8	3358	3365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021815	GGTT	2	8	5243	5250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021815	TGGT	2	8	7097	7104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021815	TGGA	2	8	13720	13727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021815	AAAC	2	8	14301	14308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021815	CTTA	2	8	15667	15674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021815	TTCA	2	8	18185	18192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021815	CTTT	2	8	19230	19237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021815	TCAA	2	8	19433	19440	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021815	CCAG	2	8	19451	19458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021815	AAAG	2	8	19713	19720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021815	ATTT	2	8	20744	20751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021815	GGTT	2	8	25443	25450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021815	GAAG	2	8	26578	26585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021815	GTGA	3	12	30443	30454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021815	AACG	2	8	39661	39668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021815	GTTT	2	8	48287	48294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021815	CCTG	2	8	51466	51473	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021815	TTAT	2	8	51692	51699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021815	TTCA	2	8	69377	69384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021815	CTCC	2	8	74230	74237	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_021815	TTTC	2	8	93277	93284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021815	AAAC	2	8	94301	94308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021815	AGGG	2	8	94929	94936	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021815	AAAC	2	8	95344	95351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021815	AAAC	2	8	102713	102720	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021815	TGCT	2	8	106109	106116	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021815	CAGG	2	8	106184	106191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021815	GCAA	2	8	106212	106219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021815	AAAC	2	8	106545	106552	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021815	GGCT	2	8	111047	111054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021815	CAAA	2	8	112308	112315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021815	CTGG	2	8	113246	113253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021815	TTCG	2	8	113986	113993	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021815	ATGG	2	8	114692	114699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021815	GCTG	2	8	116081	116088	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021815	AAAC	2	8	116093	116100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021815	CAAA	2	8	119284	119291	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021815	CCAA	2	8	119556	119563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021815	AAAC	2	8	122349	122356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021815	GTCC	2	8	133957	133964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021815	CGTC	2	8	134375	134382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021815	AATA	2	8	135922	135929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021815	TCTT	2	8	135958	135965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021815	CTAC	2	8	136232	136239	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021815	TATT	2	8	137051	137058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021815	TTTA	2	8	137612	137619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021815	ATTA	2	8	138073	138080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021815	CAGG	2	8	138804	138811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021815	GGAG	2	8	138837	138844	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021815	TCTT	2	8	144528	144535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021815	AGGC	2	8	150533	150540	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021815	TTGT	2	8	151253	151260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021815	AACA	2	8	152918	152925	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021815	AACA	2	8	152927	152934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021815	ACTG	2	8	152996	153003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021815	GACT	2	8	156752	156759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021815	ATCT	2	8	158850	158857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021815	GAAA	2	8	163972	163979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021815	CCTG	2	8	164401	164408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021815	GCCT	2	8	165862	165869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021815	GCGG	2	8	166021	166028	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021815	AAAT	2	8	166111	166118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021815	TATT	2	8	166141	166148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021815	TTTA	2	8	187564	187571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021815	CAGA	2	8	188772	188779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021815	TCAC	2	8	188784	188791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021815	ACTT	2	8	188799	188806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021815	TTTG	2	8	195801	195808	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021815	TAGT	2	8	196184	196191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021815	TTAC	2	8	199427	199434	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021815	ACCA	2	8	213678	213685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021815	CAAA	2	8	214272	214279	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021815	GTAC	2	8	219199	219206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021815	AAGG	2	8	219259	219266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021815	CCAG	2	8	220202	220209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021815	CATC	2	8	220224	220231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021815	CAGG	2	8	220734	220741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021815	ATCA	2	8	220897	220904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.