MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021815	GA	3	6	297	302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021815	AT	3	6	344	349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021815	TA	3	6	2659	2664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021815	TA	3	6	15690	15695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021815	TC	3	6	18117	18122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021815	AG	3	6	26584	26589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021815	AG	3	6	30408	30413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021815	TA	3	6	30414	30419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021815	GA	3	6	30625	30630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021815	CT	3	6	33942	33947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021815	CG	3	6	44664	44669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021815	GT	3	6	61561	61566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021815	TA	3	6	90874	90879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021815	AT	3	6	90911	90916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021815	AT	3	6	90922	90927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021815	GT	3	6	91729	91734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021815	CA	3	6	91786	91791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021815	AT	3	6	93230	93235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021815	TC	3	6	94870	94875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021815	CT	3	6	94945	94950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021815	GA	3	6	99052	99057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021815	CA	3	6	106412	106417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021815	CT	3	6	106508	106513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021815	TG	3	6	106597	106602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021815	CT	3	6	112269	112274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021815	GA	3	6	113183	113188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021815	CT	3	6	113997	114002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021815	GA	3	6	114233	114238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021815	TC	3	6	114259	114264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021815	CT	3	6	115363	115368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021815	TC	3	6	119275	119280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021815	GA	3	6	119293	119298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021815	AC	3	6	134955	134960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021815	AG	3	6	135452	135457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021815	CT	3	6	135466	135471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021815	TA	3	6	135786	135791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021815	AT	3	6	137699	137704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021815	AT	3	6	138592	138597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021815	AT	3	6	138680	138685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021815	AG	3	6	144545	144550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021815	GA	3	6	150824	150829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021815	AC	3	6	151654	151659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021815	AT	3	6	154493	154498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021815	TC	3	6	156462	156467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021815	TA	3	6	158312	158317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021815	AT	3	6	163462	163467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021815	TG	3	6	163578	163583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021815	AT	3	6	163790	163795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021815	CT	3	6	163927	163932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021815	AT	3	6	164104	164109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021815	GT	3	6	164171	164176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021815	CA	3	6	164453	164458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021815	CT	3	6	189038	189043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021815	AG	3	6	193874	193879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021815	CT	3	6	195374	195379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021815	AG	3	6	195433	195438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021815	GT	3	6	195647	195652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021815	TG	3	6	196374	196379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021815	AT	3	6	197974	197979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021815	TG	3	6	200062	200067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021815	TC	3	6	203410	203415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021815	TC	3	6	203420	203425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021815	TC	4	8	203430	203437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021815	CA	3	6	203454	203459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021815	CA	3	6	203578	203583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021815	CT	3	6	203657	203662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021815	CA	3	6	204522	204527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021815	AT	3	6	204553	204558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021815	TG	3	6	214384	214389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021815	CT	3	6	220702	220707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021815	TC	3	6	220890	220895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.