MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 2746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021814	TACCA	2	10	3970	3979	40 %	20 %	0 %	40 %	525836787
2	NC_021814	CAGTT	2	10	5730	5739	20 %	40 %	20 %	20 %	525836788
3	NC_021814	GGTGA	2	10	5803	5812	20 %	20 %	60 %	0 %	525836788
4	NC_021814	GCCAG	2	10	10603	10612	20 %	0 %	40 %	40 %	525836792
5	NC_021814	CATGG	2	10	13703	13712	20 %	20 %	40 %	20 %	525836795
6	NC_021814	GTAAT	2	10	14048	14057	40 %	40 %	20 %	0 %	525836796
7	NC_021814	CCCAG	2	10	14945	14954	20 %	0 %	20 %	60 %	525836796
8	NC_021814	CAGCA	2	10	15221	15230	40 %	0 %	20 %	40 %	525836797
9	NC_021814	AACGC	2	10	17766	17775	40 %	0 %	20 %	40 %	525836800
10	NC_021814	TAGCG	2	10	18132	18141	20 %	20 %	40 %	20 %	525836800
11	NC_021814	AGCGA	2	10	18371	18380	40 %	0 %	40 %	20 %	525836801
12	NC_021814	CGGTT	2	10	19009	19018	0 %	40 %	40 %	20 %	525836801
13	NC_021814	CGCGG	2	10	21738	21747	0 %	0 %	60 %	40 %	525836803
14	NC_021814	TATTT	2	10	24135	24144	20 %	80 %	0 %	0 %	525836805
15	NC_021814	TGCGA	2	10	24510	24519	20 %	20 %	40 %	20 %	525836805
16	NC_021814	TACTG	2	10	25170	25179	20 %	40 %	20 %	20 %	525836806
17	NC_021814	TGGCG	2	10	25704	25713	0 %	20 %	60 %	20 %	525836807
18	NC_021814	GACCT	2	10	28017	28026	20 %	20 %	20 %	40 %	525836809
19	NC_021814	CAAAG	2	10	29114	29123	60 %	0 %	20 %	20 %	525836809
20	NC_021814	CGGCG	2	10	31355	31364	0 %	0 %	60 %	40 %	525836809
21	NC_021814	CCGGT	2	10	31432	31441	0 %	20 %	40 %	40 %	525836809
22	NC_021814	GCCAG	2	10	32591	32600	20 %	0 %	40 %	40 %	525836810
23	NC_021814	CTTAT	2	10	36235	36244	20 %	60 %	0 %	20 %	525836814
24	NC_021814	CCGAT	2	10	38459	38468	20 %	20 %	20 %	40 %	525836817
25	NC_021814	CCTTA	2	10	42389	42398	20 %	40 %	0 %	40 %	525836820
26	NC_021814	GAACA	2	10	45112	45121	60 %	0 %	20 %	20 %	525836821
27	NC_021814	CGCGC	2	10	47304	47313	0 %	0 %	40 %	60 %	525836823
28	NC_021814	CAGGC	2	10	47461	47470	20 %	0 %	40 %	40 %	525836824
29	NC_021814	AATCA	2	10	49651	49660	60 %	20 %	0 %	20 %	525836826
30	NC_021814	GGCGC	2	10	50399	50408	0 %	0 %	60 %	40 %	525836826
31	NC_021814	GCCTG	2	10	51916	51925	0 %	20 %	40 %	40 %	525836827
32	NC_021814	CCTGG	2	10	51929	51938	0 %	20 %	40 %	40 %	525836827
33	NC_021814	ACGGA	2	10	52293	52302	40 %	0 %	40 %	20 %	525836828
34	NC_021814	CAGCT	2	10	52446	52455	20 %	20 %	20 %	40 %	525836828
35	NC_021814	GATCA	2	10	58877	58886	40 %	20 %	20 %	20 %	525836836
36	NC_021814	GGGCT	2	10	60645	60654	0 %	20 %	60 %	20 %	525836837
37	NC_021814	TGAGT	2	10	65756	65765	20 %	40 %	40 %	0 %	525836843
38	NC_021814	GTCAT	2	10	66820	66829	20 %	40 %	20 %	20 %	525836843
39	NC_021814	ATCGG	2	10	69123	69132	20 %	20 %	40 %	20 %	525836845
40	NC_021814	ACGGT	2	10	70827	70836	20 %	20 %	40 %	20 %	525836845
41	NC_021814	CGCAG	2	10	70984	70993	20 %	0 %	40 %	40 %	525836845
42	NC_021814	GCCAG	2	10	73907	73916	20 %	0 %	40 %	40 %	525836846
43	NC_021814	GTAGC	2	10	74512	74521	20 %	20 %	40 %	20 %	525836846
44	NC_021814	TGAAC	2	10	76215	76224	40 %	20 %	20 %	20 %	525840462
45	NC_021814	CGGCG	2	10	77461	77470	0 %	0 %	60 %	40 %	525836847
46	NC_021814	CCGCG	2	10	84978	84987	0 %	0 %	40 %	60 %	525840465
47	NC_021814	GCGCC	2	10	87252	87261	0 %	0 %	40 %	60 %	525836857
48	NC_021814	GCGCG	2	10	88085	88094	0 %	0 %	60 %	40 %	525836858
49	NC_021814	GTTCC	2	10	88437	88446	0 %	40 %	20 %	40 %	525836858
50	NC_021814	CGAAA	2	10	89830	89839	60 %	0 %	20 %	20 %	525836860
51	NC_021814	GGGCA	2	10	91906	91915	20 %	0 %	60 %	20 %	525836864
52	NC_021814	GTTCC	2	10	92712	92721	0 %	40 %	20 %	40 %	525836865
53	NC_021814	TGGCG	2	10	95592	95601	0 %	20 %	60 %	20 %	525840466
54	NC_021814	TGGCC	2	10	95873	95882	0 %	20 %	40 %	40 %	525840466
55	NC_021814	CGATC	2	10	96792	96801	20 %	20 %	20 %	40 %	525840467
56	NC_021814	GGGAA	2	10	96968	96977	40 %	0 %	60 %	0 %	525840467
57	NC_021814	AGATC	2	10	101250	101259	40 %	20 %	20 %	20 %	525836872
58	NC_021814	GATCA	2	10	104476	104485	40 %	20 %	20 %	20 %	525836874
59	NC_021814	CGCTA	2	10	105375	105384	20 %	20 %	20 %	40 %	525840471
60	NC_021814	ATGAA	2	10	106307	106316	60 %	20 %	20 %	0 %	525840472
61	NC_021814	ACGGC	2	10	108195	108204	20 %	0 %	40 %	40 %	525836875
62	NC_021814	ATAGA	2	10	108519	108528	60 %	20 %	20 %	0 %	525836875
63	NC_021814	GCGCG	2	10	110404	110413	0 %	0 %	60 %	40 %	525836877
64	NC_021814	GCGGT	2	10	112857	112866	0 %	20 %	60 %	20 %	525836878
65	NC_021814	ACGTA	2	10	115041	115050	40 %	20 %	20 %	20 %	525836880
66	NC_021814	GCCAG	2	10	116213	116222	20 %	0 %	40 %	40 %	525836882
67	NC_021814	CGCTG	2	10	116465	116474	0 %	20 %	40 %	40 %	525836882
68	NC_021814	CGGCG	2	10	116507	116516	0 %	0 %	60 %	40 %	525836882
69	NC_021814	CGCGC	2	10	117686	117695	0 %	0 %	40 %	60 %	525836882
70	NC_021814	TTTTA	2	10	123456	123465	20 %	80 %	0 %	0 %	525836887
71	NC_021814	GGTAC	2	10	124490	124499	20 %	20 %	40 %	20 %	525836888
72	NC_021814	GGCAG	2	10	127150	127159	20 %	0 %	60 %	20 %	525836890
73	NC_021814	GAAGC	2	10	127983	127992	40 %	0 %	40 %	20 %	525840474
74	NC_021814	AAATT	2	10	129114	129123	60 %	40 %	0 %	0 %	525836891
75	NC_021814	GACTG	2	10	132602	132611	20 %	20 %	40 %	20 %	525836896
76	NC_021814	CGTGC	2	10	135495	135504	0 %	20 %	40 %	40 %	525836897
77	NC_021814	CCGTA	2	10	135522	135531	20 %	20 %	20 %	40 %	525836897
78	NC_021814	GCCGC	2	10	135805	135814	0 %	0 %	40 %	60 %	525836897
79	NC_021814	GACCA	2	10	138387	138396	40 %	0 %	20 %	40 %	525836899
80	NC_021814	ACCGC	2	10	138796	138805	20 %	0 %	20 %	60 %	525836900
81	NC_021814	GTGCC	2	10	144301	144310	0 %	20 %	40 %	40 %	525836903
82	NC_021814	GTCTG	2	10	145458	145467	0 %	40 %	40 %	20 %	525836904
83	NC_021814	TTCCT	2	10	145518	145527	0 %	60 %	0 %	40 %	525836904
84	NC_021814	ATTTT	2	10	146326	146335	20 %	80 %	0 %	0 %	525836905
85	NC_021814	GCGCA	2	10	152218	152227	20 %	0 %	40 %	40 %	525836909
86	NC_021814	AACCC	2	10	154130	154139	40 %	0 %	0 %	60 %	525836910
87	NC_021814	CAGAA	2	10	155971	155980	60 %	0 %	20 %	20 %	525836911
88	NC_021814	CGCGG	2	10	157855	157864	0 %	0 %	60 %	40 %	525836913
89	NC_021814	CGACG	2	10	158863	158872	20 %	0 %	40 %	40 %	525836914
90	NC_021814	CGATC	2	10	159718	159727	20 %	20 %	20 %	40 %	525836914
91	NC_021814	TGCGG	2	10	160765	160774	0 %	20 %	60 %	20 %	525836914
92	NC_021814	TTTGC	2	10	168412	168421	0 %	60 %	20 %	20 %	525836921
93	NC_021814	GCCCA	2	10	168454	168463	20 %	0 %	20 %	60 %	525836921
94	NC_021814	ATCAC	2	10	170464	170473	40 %	20 %	0 %	40 %	525840482
95	NC_021814	GAACA	2	10	172759	172768	60 %	0 %	20 %	20 %	525836928
96	NC_021814	GAAGG	2	10	173621	173630	40 %	0 %	60 %	0 %	525836928
97	NC_021814	CACTT	2	10	176947	176956	20 %	40 %	0 %	40 %	525836931
98	NC_021814	CCGTT	2	10	178838	178847	0 %	40 %	20 %	40 %	525836933
99	NC_021814	GATCC	2	10	180151	180160	20 %	20 %	20 %	40 %	525836934
100	NC_021814	TGGCG	2	10	180400	180409	0 %	20 %	60 %	20 %	525836934
101	NC_021814	GCTTG	2	10	183911	183920	0 %	40 %	40 %	20 %	525836936
102	NC_021814	CTTCG	2	10	189258	189267	0 %	40 %	20 %	40 %	525836940
103	NC_021814	AGCGA	2	10	192084	192093	40 %	0 %	40 %	20 %	525836941
104	NC_021814	ATGGA	2	10	192809	192818	40 %	20 %	40 %	0 %	525836941
105	NC_021814	GATCA	2	10	197299	197308	40 %	20 %	20 %	20 %	525836947
106	NC_021814	TTTGA	2	10	198693	198702	20 %	60 %	20 %	0 %	525836948
107	NC_021814	CGCTG	2	10	201627	201636	0 %	20 %	40 %	40 %	525836950
108	NC_021814	GCGCA	2	10	202756	202765	20 %	0 %	40 %	40 %	525836950
109	NC_021814	GAAAG	2	10	210033	210042	60 %	0 %	40 %	0 %	525836955
110	NC_021814	TGATC	2	10	216095	216104	20 %	40 %	20 %	20 %	525836960
111	NC_021814	GCGCC	2	10	216676	216685	0 %	0 %	40 %	60 %	525836961
112	NC_021814	TGATC	2	10	220321	220330	20 %	40 %	20 %	20 %	525836965
113	NC_021814	TGGGG	2	10	221925	221934	0 %	20 %	80 %	0 %	525836967
114	NC_021814	GAAGG	2	10	225472	225481	40 %	0 %	60 %	0 %	525836970
115	NC_021814	GCTAT	2	10	229893	229902	20 %	40 %	20 %	20 %	525836973
116	NC_021814	ACCGC	2	10	232004	232013	20 %	0 %	20 %	60 %	525836975
117	NC_021814	TCATT	2	10	233393	233402	20 %	60 %	0 %	20 %	525836976
118	NC_021814	GGTTC	2	10	243104	243113	0 %	40 %	40 %	20 %	525836982
119	NC_021814	GAAAT	2	10	244101	244110	60 %	20 %	20 %	0 %	525836983
120	NC_021814	CGTCG	2	10	247050	247059	0 %	20 %	40 %	40 %	525836986
121	NC_021814	CGCGC	2	10	247407	247416	0 %	0 %	40 %	60 %	525836986
122	NC_021814	GGGTA	2	10	247426	247435	20 %	20 %	60 %	0 %	525836986
123	NC_021814	TGGTC	2	10	247832	247841	0 %	40 %	40 %	20 %	525836987
124	NC_021814	GTAAC	2	10	248024	248033	40 %	20 %	20 %	20 %	525836988
125	NC_021814	ATTAA	2	10	249441	249450	60 %	40 %	0 %	0 %	525836990
126	NC_021814	ATGTA	2	10	250696	250705	40 %	40 %	20 %	0 %	525836991
127	NC_021814	GGGGT	2	10	251553	251562	0 %	20 %	80 %	0 %	525836992
128	NC_021814	GGCGC	2	10	252298	252307	0 %	0 %	60 %	40 %	525836992
129	NC_021814	TGGCG	2	10	252884	252893	0 %	20 %	60 %	20 %	525836992
130	NC_021814	TTCTG	2	10	253284	253293	0 %	60 %	20 %	20 %	525840492
131	NC_021814	ATCCA	2	10	253811	253820	40 %	20 %	0 %	40 %	525836993
132	NC_021814	GCGCC	2	10	254856	254865	0 %	0 %	40 %	60 %	525836994
133	NC_021814	AAAAC	2	10	256916	256925	80 %	0 %	0 %	20 %	525836995
134	NC_021814	TGCGC	2	10	260204	260213	0 %	20 %	40 %	40 %	525837000
135	NC_021814	GCGCC	2	10	262553	262562	0 %	0 %	40 %	60 %	525837003
136	NC_021814	TTCAC	2	10	269844	269853	20 %	40 %	0 %	40 %	525837007
137	NC_021814	AACGC	2	10	270936	270945	40 %	0 %	20 %	40 %	525837008
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139	NC_021814	CATTG	2	10	272714	272723	20 %	40 %	20 %	20 %	525837009
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141	NC_021814	CGGCA	2	10	280854	280863	20 %	0 %	40 %	40 %	525837015
142	NC_021814	TGCCG	2	10	285611	285620	0 %	20 %	40 %	40 %	525837019
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145	NC_021814	GCGTC	2	10	293347	293356	0 %	20 %	40 %	40 %	525837025
146	NC_021814	ATGGC	2	10	293943	293952	20 %	20 %	40 %	20 %	525837025
147	NC_021814	CCTGG	2	10	299819	299828	0 %	20 %	40 %	40 %	525837031
148	NC_021814	ACGGT	2	10	301771	301780	20 %	20 %	40 %	20 %	525837033
149	NC_021814	TCACG	2	10	303425	303434	20 %	20 %	20 %	40 %	525837035
150	NC_021814	CGAAC	2	10	303714	303723	40 %	0 %	20 %	40 %	525837035
151	NC_021814	GCCAG	2	10	304492	304501	20 %	0 %	40 %	40 %	525837036
152	NC_021814	GGTTT	2	10	306386	306395	0 %	60 %	40 %	0 %	525837038
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154	NC_021814	GCCTG	2	10	311983	311992	0 %	20 %	40 %	40 %	525837045
155	NC_021814	CGGCG	2	10	313353	313362	0 %	0 %	60 %	40 %	525837047
156	NC_021814	GGTTG	2	10	315070	315079	0 %	40 %	60 %	0 %	525837048
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159	NC_021814	TTGCA	2	10	319294	319303	20 %	40 %	20 %	20 %	525837050
160	NC_021814	TTGCA	2	10	320209	320218	20 %	40 %	20 %	20 %	525837051
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163	NC_021814	ACGCG	2	10	323924	323933	20 %	0 %	40 %	40 %	525837053
164	NC_021814	ATATT	2	10	325943	325952	40 %	60 %	0 %	0 %	525837056
165	NC_021814	TCGAG	2	10	333572	333581	20 %	20 %	40 %	20 %	525837060
166	NC_021814	CTGGT	2	10	335450	335459	0 %	40 %	40 %	20 %	525837062
167	NC_021814	TTCTC	2	10	337261	337270	0 %	60 %	0 %	40 %	525837064
168	NC_021814	ACTGA	2	10	337468	337477	40 %	20 %	20 %	20 %	525837064
169	NC_021814	CGGTA	2	10	338578	338587	20 %	20 %	40 %	20 %	525837065
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172	NC_021814	TATGG	2	10	342514	342523	20 %	40 %	40 %	0 %	525837069
173	NC_021814	CGCAG	2	10	346577	346586	20 %	0 %	40 %	40 %	525837073
174	NC_021814	GCGCC	2	10	347026	347035	0 %	0 %	40 %	60 %	525837073
175	NC_021814	AGCGC	2	10	348578	348587	20 %	0 %	40 %	40 %	525837074
176	NC_021814	GGTTG	2	10	348955	348964	0 %	40 %	60 %	0 %	525837074
177	NC_021814	CGGAC	2	10	352483	352492	20 %	0 %	40 %	40 %	525837078
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181	NC_021814	ATTGG	2	10	358836	358845	20 %	40 %	40 %	0 %	525837081
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191	NC_021814	GGTAC	2	10	376093	376102	20 %	20 %	40 %	20 %	525837094
192	NC_021814	GCATG	2	10	377168	377177	20 %	20 %	40 %	20 %	525837094
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229	NC_021814	CCTGG	2	10	429061	429070	0 %	20 %	40 %	40 %	525837122
230	NC_021814	GTGAA	2	10	429219	429228	40 %	20 %	40 %	0 %	525837122
231	NC_021814	TGCGT	2	10	429995	430004	0 %	40 %	40 %	20 %	525837123
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233	NC_021814	AGCAG	2	10	430742	430751	40 %	0 %	40 %	20 %	525837124
234	NC_021814	TCGCT	2	10	431842	431851	0 %	40 %	20 %	40 %	525837125
235	NC_021814	GCCCG	2	10	432399	432408	0 %	0 %	40 %	60 %	525837126
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237	NC_021814	CGTCA	2	10	436744	436753	20 %	20 %	20 %	40 %	525837131
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239	NC_021814	ATGGA	2	10	437215	437224	40 %	20 %	40 %	0 %	525837131
240	NC_021814	GCGCG	2	10	438217	438226	0 %	0 %	60 %	40 %	525837133
241	NC_021814	TTGCT	2	10	442490	442499	0 %	60 %	20 %	20 %	525840532
242	NC_021814	ATCGG	2	10	446528	446537	20 %	20 %	40 %	20 %	525837137
243	NC_021814	GTACG	2	10	446794	446803	20 %	20 %	40 %	20 %	525837137
244	NC_021814	GCGCC	2	10	448075	448084	0 %	0 %	40 %	60 %	525837138
245	NC_021814	CAGCG	2	10	448121	448130	20 %	0 %	40 %	40 %	525837138
246	NC_021814	GCCGT	2	10	448551	448560	0 %	20 %	40 %	40 %	525837138
247	NC_021814	CGACG	2	10	450067	450076	20 %	0 %	40 %	40 %	525837139
248	NC_021814	ATTAA	2	10	451276	451285	60 %	40 %	0 %	0 %	525837140
249	NC_021814	ACTTT	2	10	454329	454338	20 %	60 %	0 %	20 %	525837144
250	NC_021814	TGGGC	2	10	455926	455935	0 %	20 %	60 %	20 %	525837145
251	NC_021814	CGGCG	2	10	457237	457246	0 %	0 %	60 %	40 %	525837146
252	NC_021814	TCGCT	2	10	457934	457943	0 %	40 %	20 %	40 %	525837147
253	NC_021814	CTTCT	2	10	460573	460582	0 %	60 %	0 %	40 %	525837149
254	NC_021814	TGGCG	2	10	464473	464482	0 %	20 %	60 %	20 %	525837151
255	NC_021814	AGTGA	2	10	466779	466788	40 %	20 %	40 %	0 %	525840535
256	NC_021814	TACCT	2	10	469566	469575	20 %	40 %	0 %	40 %	525837153
257	NC_021814	CTGAA	2	10	471160	471169	40 %	20 %	20 %	20 %	525837154
258	NC_021814	GACGC	2	10	472776	472785	20 %	0 %	40 %	40 %	525837155
259	NC_021814	ACAAG	2	10	478004	478013	60 %	0 %	20 %	20 %	525840539
260	NC_021814	ACCAG	2	10	485538	485547	40 %	0 %	20 %	40 %	525837158
261	NC_021814	AACAG	2	10	487832	487841	60 %	0 %	20 %	20 %	525837160
262	NC_021814	TCAAT	2	10	488644	488653	40 %	40 %	0 %	20 %	525840541
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264	NC_021814	GCCTG	2	10	490216	490225	0 %	20 %	40 %	40 %	525837161
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