MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 62741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021814	CCG	2	6	1637	1642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840456
2	NC_021814	GCC	2	6	1647	1652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840456
3	NC_021814	CTG	2	6	1664	1669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840456
4	NC_021814	GCC	2	6	1721	1726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840456
5	NC_021814	GGT	2	6	1782	1787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840456
6	NC_021814	ATG	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836787
7	NC_021814	ACA	2	6	2084	2089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836787
8	NC_021814	GAA	2	6	2092	2097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836787
9	NC_021814	GAA	2	6	2107	2112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836787
10	NC_021814	TAA	2	6	2119	2124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836787
11	NC_021814	CAC	2	6	2175	2180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836787
12	NC_021814	CTT	2	6	2301	2306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836787
13	NC_021814	TGC	2	6	2674	2679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836787
14	NC_021814	TTG	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836787
15	NC_021814	GCA	2	6	2823	2828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836787
16	NC_021814	GCC	2	6	2902	2907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836787
17	NC_021814	CGC	2	6	2911	2916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836787
18	NC_021814	TCC	2	6	3103	3108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525836787
19	NC_021814	TTC	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836787
20	NC_021814	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836787
21	NC_021814	GTA	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836787
22	NC_021814	TCT	2	6	3467	3472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836787
23	NC_021814	AAG	2	6	3632	3637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836787
24	NC_021814	CAG	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836787
25	NC_021814	AGC	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836787
26	NC_021814	GCC	2	6	3784	3789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836787
27	NC_021814	TCC	2	6	3899	3904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525836787
28	NC_021814	GGC	2	6	4012	4017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836787
29	NC_021814	AAT	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836787
30	NC_021814	ACC	2	6	4196	4201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836787
31	NC_021814	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836787
32	NC_021814	GAC	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836787
33	NC_021814	GAT	2	6	4462	4467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836787
34	NC_021814	GCT	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836787
35	NC_021814	GCC	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836787
36	NC_021814	TGA	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836787
37	NC_021814	GTC	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836787
38	NC_021814	GCT	3	9	4762	4770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836787
39	NC_021814	CTG	3	9	4792	4800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836787
40	NC_021814	CTT	2	6	4803	4808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836787
41	NC_021814	CAG	2	6	4911	4916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836787
42	NC_021814	GGC	2	6	5045	5050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836787
43	NC_021814	ATT	2	6	5084	5089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836787
44	NC_021814	TCA	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836787
45	NC_021814	TAA	2	6	5148	5153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836787
46	NC_021814	TGA	2	6	5291	5296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836788
47	NC_021814	GCC	2	6	5320	5325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836788
48	NC_021814	ACC	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836788
49	NC_021814	CGC	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836788
50	NC_021814	GCG	2	6	5387	5392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836788
51	NC_021814	CTG	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836788
52	NC_021814	TCA	2	6	5443	5448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836788
53	NC_021814	GTT	2	6	5714	5719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836788
54	NC_021814	GCC	2	6	5860	5865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836788
55	NC_021814	CGG	2	6	5870	5875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836788
56	NC_021814	GCG	2	6	6191	6196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836788
57	NC_021814	CAG	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836788
58	NC_021814	GCA	2	6	6280	6285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836788
59	NC_021814	ATG	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836788
60	NC_021814	GAA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836789
61	NC_021814	GCG	2	6	6828	6833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836789
62	NC_021814	ACG	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836789
63	NC_021814	GTT	2	6	6919	6924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836789
64	NC_021814	ACC	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836789
65	NC_021814	CAG	2	6	7064	7069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836789
66	NC_021814	CAT	2	6	7154	7159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836789
67	NC_021814	GCT	2	6	7165	7170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836789
68	NC_021814	AAC	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836789
69	NC_021814	GAA	2	6	7400	7405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836789
70	NC_021814	ATT	2	6	7413	7418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836790
71	NC_021814	TTG	2	6	7552	7557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836790
72	NC_021814	CAA	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836790
73	NC_021814	GTC	2	6	7747	7752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836790
74	NC_021814	GCT	2	6	7911	7916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836790
75	NC_021814	GAT	2	6	8091	8096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836790
76	NC_021814	GAC	2	6	8374	8379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836790
77	NC_021814	AGC	2	6	8474	8479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836790
78	NC_021814	TCG	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836790
79	NC_021814	AAG	2	6	8689	8694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836790
80	NC_021814	AGT	2	6	8777	8782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836790
81	NC_021814	CAG	2	6	8821	8826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836790
82	NC_021814	GCC	2	6	9131	9136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836790
83	NC_021814	GAG	2	6	9245	9250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525836790
84	NC_021814	GCC	3	9	9370	9378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836790
85	NC_021814	AAC	2	6	9799	9804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836791
86	NC_021814	CCA	2	6	9808	9813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836791
87	NC_021814	ATC	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836791
88	NC_021814	GCT	2	6	9949	9954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836792
89	NC_021814	AAT	2	6	10009	10014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836792
90	NC_021814	TCT	2	6	10031	10036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836792
91	NC_021814	ATT	2	6	10058	10063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836792
92	NC_021814	CGC	2	6	10094	10099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836792
93	NC_021814	AGA	2	6	10160	10165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836792
94	NC_021814	CAT	2	6	10397	10402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836792
95	NC_021814	ATG	2	6	10542	10547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836792
96	NC_021814	TTC	2	6	10563	10568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836792
97	NC_021814	TCA	2	6	10584	10589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836792
98	NC_021814	CCA	2	6	10636	10641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836792
99	NC_021814	AAT	2	6	10742	10747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836792
100	NC_021814	CTT	2	6	10748	10753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836792
101	NC_021814	CAT	2	6	10935	10940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836793
102	NC_021814	AGC	2	6	10944	10949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836793
103	NC_021814	TTC	2	6	11068	11073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836793
104	NC_021814	GTT	2	6	11165	11170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836793
105	NC_021814	GTC	2	6	11287	11292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836794
106	NC_021814	AGC	2	6	11429	11434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836794
107	NC_021814	ATC	2	6	11501	11506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836794
108	NC_021814	TTC	2	6	11858	11863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836794
109	NC_021814	AAT	2	6	11887	11892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836794
110	NC_021814	TCA	2	6	11981	11986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836794
111	NC_021814	AGA	2	6	12037	12042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836794
112	NC_021814	CAT	2	6	12043	12048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836794
113	NC_021814	ATT	2	6	12828	12833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836795
114	NC_021814	TTC	2	6	12859	12864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836795
115	NC_021814	CGA	2	6	12870	12875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836795
116	NC_021814	CAG	2	6	12952	12957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836795
117	NC_021814	CGA	2	6	13026	13031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836795
118	NC_021814	GGT	2	6	13276	13281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836795
119	NC_021814	GTT	2	6	13443	13448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836795
120	NC_021814	CAG	2	6	13474	13479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836795
121	NC_021814	GGT	2	6	13678	13683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836795
122	NC_021814	CGC	2	6	13874	13879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836796
123	NC_021814	GCC	2	6	13968	13973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836796
124	NC_021814	CAG	2	6	13980	13985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836796
125	NC_021814	ATC	2	6	13999	14004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836796
126	NC_021814	CAG	2	6	14025	14030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836796
127	NC_021814	TCG	2	6	14135	14140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836796
128	NC_021814	GCA	2	6	14150	14155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836796
129	NC_021814	TTG	2	6	14168	14173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836796
130	NC_021814	CGC	2	6	14181	14186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836796
131	NC_021814	CGG	2	6	14210	14215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836796
132	NC_021814	CGG	2	6	14220	14225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836796
133	NC_021814	ATA	2	6	14350	14355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836796
134	NC_021814	CCG	2	6	14402	14407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836796
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152	NC_021814	CTT	2	6	16137	16142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836798
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158	NC_021814	GCG	2	6	16655	16660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836798
159	NC_021814	GAA	2	6	16809	16814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836798
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168	NC_021814	CCA	2	6	17743	17748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836800
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249	NC_021814	CGC	2	6	24316	24321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836805
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252	NC_021814	GCC	2	6	24567	24572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836805
253	NC_021814	TGG	2	6	24662	24667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836805
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255	NC_021814	CTG	3	9	24783	24791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836805
256	NC_021814	GAT	2	6	24872	24877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836805
257	NC_021814	GCC	2	6	24911	24916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836805
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260	NC_021814	TGC	2	6	25104	25109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836806
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281	NC_021814	TTC	2	6	26322	26327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836808
282	NC_021814	GGT	2	6	26590	26595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836808
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483	NC_021814	AGA	2	6	41227	41232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840458
484	NC_021814	CAG	2	6	41306	41311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840458
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497	NC_021814	GTT	2	6	42578	42583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836820
498	NC_021814	GCG	2	6	42610	42615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836820
499	NC_021814	TCA	2	6	42616	42621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836820
500	NC_021814	TGG	4	12	42664	42675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836820

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