MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 9567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021814	GT	3	6	298	303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021814	TC	3	6	1031	1036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021814	AT	3	6	1129	1134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021814	AG	3	6	1480	1485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021814	GC	3	6	4327	4332	0 %	0 %	50 %	50 %	525836787
6	NC_021814	CG	3	6	4367	4372	0 %	0 %	50 %	50 %	525836787
7	NC_021814	GC	3	6	5759	5764	0 %	0 %	50 %	50 %	525836788
8	NC_021814	CG	3	6	5836	5841	0 %	0 %	50 %	50 %	525836788
9	NC_021814	AT	3	6	5926	5931	50 %	50 %	0 %	0 %	525836788
10	NC_021814	CG	3	6	6393	6398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021814	AT	4	8	6568	6575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021814	TC	3	6	6652	6657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021814	GA	3	6	7017	7022	50 %	0 %	50 %	0 %	525836789
14	NC_021814	AT	3	6	7042	7047	50 %	50 %	0 %	0 %	525836789
15	NC_021814	TA	3	6	7431	7436	50 %	50 %	0 %	0 %	525836790
16	NC_021814	AT	3	6	7449	7454	50 %	50 %	0 %	0 %	525836790
17	NC_021814	GC	3	6	8427	8432	0 %	0 %	50 %	50 %	525836790
18	NC_021814	GC	3	6	8457	8462	0 %	0 %	50 %	50 %	525836790
19	NC_021814	GC	3	6	9045	9050	0 %	0 %	50 %	50 %	525836790
20	NC_021814	AG	3	6	9079	9084	50 %	0 %	50 %	0 %	525836790
21	NC_021814	GC	3	6	9180	9185	0 %	0 %	50 %	50 %	525836790
22	NC_021814	GC	3	6	10189	10194	0 %	0 %	50 %	50 %	525836792
23	NC_021814	GC	4	8	10321	10328	0 %	0 %	50 %	50 %	525836792
24	NC_021814	CG	3	6	11330	11335	0 %	0 %	50 %	50 %	525836794
25	NC_021814	TC	3	6	12373	12378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021814	AG	3	6	12585	12590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021814	TG	3	6	12787	12792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021814	GC	3	6	14036	14041	0 %	0 %	50 %	50 %	525836796
29	NC_021814	CG	3	6	14286	14291	0 %	0 %	50 %	50 %	525836796
30	NC_021814	GC	3	6	14297	14302	0 %	0 %	50 %	50 %	525836796
31	NC_021814	CG	3	6	14731	14736	0 %	0 %	50 %	50 %	525836796
32	NC_021814	GC	3	6	15367	15372	0 %	0 %	50 %	50 %	525836797
33	NC_021814	TG	3	6	15890	15895	0 %	50 %	50 %	0 %	525836798
34	NC_021814	TG	3	6	17503	17508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021814	GC	3	6	18636	18641	0 %	0 %	50 %	50 %	525836801
36	NC_021814	TA	3	6	18855	18860	50 %	50 %	0 %	0 %	525836801
37	NC_021814	GT	3	6	19396	19401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021814	CT	3	6	20361	20366	0 %	50 %	0 %	50 %	525836802
39	NC_021814	GC	3	6	20560	20565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021814	GC	3	6	21208	21213	0 %	0 %	50 %	50 %	525836803
41	NC_021814	GC	3	6	21221	21226	0 %	0 %	50 %	50 %	525836803
42	NC_021814	CG	3	6	22451	22456	0 %	0 %	50 %	50 %	525836803
43	NC_021814	CG	3	6	22605	22610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021814	CG	3	6	23202	23207	0 %	0 %	50 %	50 %	525836804
45	NC_021814	TG	3	6	23849	23854	0 %	50 %	50 %	0 %	525836804
46	NC_021814	GC	3	6	23855	23860	0 %	0 %	50 %	50 %	525836804
47	NC_021814	CG	3	6	24290	24295	0 %	0 %	50 %	50 %	525836805
48	NC_021814	GC	3	6	24725	24730	0 %	0 %	50 %	50 %	525836805
49	NC_021814	GC	3	6	25270	25275	0 %	0 %	50 %	50 %	525836806
50	NC_021814	GC	3	6	25658	25663	0 %	0 %	50 %	50 %	525836807
51	NC_021814	GC	3	6	25684	25689	0 %	0 %	50 %	50 %	525836807
52	NC_021814	CG	3	6	25787	25792	0 %	0 %	50 %	50 %	525836807
53	NC_021814	CG	3	6	26163	26168	0 %	0 %	50 %	50 %	525836808
54	NC_021814	GC	3	6	26469	26474	0 %	0 %	50 %	50 %	525836808
55	NC_021814	GT	3	6	26651	26656	0 %	50 %	50 %	0 %	525836808
56	NC_021814	GC	4	8	26953	26960	0 %	0 %	50 %	50 %	525836808
57	NC_021814	GA	3	6	27690	27695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021814	CG	3	6	28179	28184	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
59	NC_021814	TC	3	6	28253	28258	0 %	50 %	0 %	50 %	525836809
60	NC_021814	AC	3	6	28597	28602	50 %	0 %	0 %	50 %	525836809
61	NC_021814	CA	3	6	28686	28691	50 %	0 %	0 %	50 %	525836809
62	NC_021814	CG	3	6	29022	29027	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
63	NC_021814	CG	4	8	29132	29139	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
64	NC_021814	GC	3	6	29824	29829	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
65	NC_021814	GC	3	6	30337	30342	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
66	NC_021814	TC	3	6	32354	32359	0 %	50 %	0 %	50 %	525836810
67	NC_021814	CG	3	6	32657	32662	0 %	0 %	50 %	50 %	525836810
68	NC_021814	GT	3	6	33113	33118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021814	CA	3	6	33645	33650	50 %	0 %	0 %	50 %	525836811
70	NC_021814	GC	3	6	33700	33705	0 %	0 %	50 %	50 %	525836811
71	NC_021814	CT	4	8	34298	34305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021814	CG	3	6	34646	34651	0 %	0 %	50 %	50 %	525836813
73	NC_021814	CG	3	6	34653	34658	0 %	0 %	50 %	50 %	525836813
74	NC_021814	CG	3	6	34964	34969	0 %	0 %	50 %	50 %	525836813
75	NC_021814	CG	3	6	35005	35010	0 %	0 %	50 %	50 %	525836813
76	NC_021814	CG	3	6	35739	35744	0 %	0 %	50 %	50 %	525836814
77	NC_021814	AG	3	6	38159	38164	50 %	0 %	50 %	0 %	525836816
78	NC_021814	AG	3	6	38526	38531	50 %	0 %	50 %	0 %	525836817
79	NC_021814	CT	3	6	39658	39663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021814	CT	3	6	40497	40502	0 %	50 %	0 %	50 %	525836819
81	NC_021814	CG	3	6	40517	40522	0 %	0 %	50 %	50 %	525836819
82	NC_021814	CT	3	6	41453	41458	0 %	50 %	0 %	50 %	525840458
83	NC_021814	CG	3	6	41769	41774	0 %	0 %	50 %	50 %	525840459
84	NC_021814	AT	3	6	42347	42352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021814	CT	3	6	42693	42698	0 %	50 %	0 %	50 %	525836820
86	NC_021814	GC	3	6	42829	42834	0 %	0 %	50 %	50 %	525836820
87	NC_021814	CG	3	6	44449	44454	0 %	0 %	50 %	50 %	525840460
88	NC_021814	GC	3	6	46021	46026	0 %	0 %	50 %	50 %	525836823
89	NC_021814	GC	3	6	47668	47673	0 %	0 %	50 %	50 %	525836824
90	NC_021814	GC	4	8	48131	48138	0 %	0 %	50 %	50 %	525836824
91	NC_021814	AT	3	6	48907	48912	50 %	50 %	0 %	0 %	525836825
92	NC_021814	AC	3	6	49072	49077	50 %	0 %	0 %	50 %	525836825
93	NC_021814	AG	3	6	49909	49914	50 %	0 %	50 %	0 %	525836826
94	NC_021814	GC	3	6	49953	49958	0 %	0 %	50 %	50 %	525836826
95	NC_021814	GC	3	6	51374	51379	0 %	0 %	50 %	50 %	525836827
96	NC_021814	GT	3	6	52012	52017	0 %	50 %	50 %	0 %	525836827
97	NC_021814	AG	4	8	52132	52139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021814	CG	4	8	53510	53517	0 %	0 %	50 %	50 %	525836829
99	NC_021814	GC	3	6	53712	53717	0 %	0 %	50 %	50 %	525836829
100	NC_021814	AG	3	6	54056	54061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021814	AG	4	8	55596	55603	50 %	0 %	50 %	0 %	525836832
102	NC_021814	GT	3	6	55681	55686	0 %	50 %	50 %	0 %	525836832
103	NC_021814	CG	3	6	55726	55731	0 %	0 %	50 %	50 %	525836832
104	NC_021814	GC	3	6	55770	55775	0 %	0 %	50 %	50 %	525836832
105	NC_021814	CG	4	8	56532	56539	0 %	0 %	50 %	50 %	525836833
106	NC_021814	GC	3	6	57030	57035	0 %	0 %	50 %	50 %	525836834
107	NC_021814	GC	3	6	57114	57119	0 %	0 %	50 %	50 %	525836834
108	NC_021814	AT	3	6	58403	58408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021814	AG	3	6	58604	58609	50 %	0 %	50 %	0 %	525836836
110	NC_021814	GC	3	6	58914	58919	0 %	0 %	50 %	50 %	525836836
111	NC_021814	CG	3	6	58964	58969	0 %	0 %	50 %	50 %	525836836
112	NC_021814	TC	3	6	59635	59640	0 %	50 %	0 %	50 %	525836837
113	NC_021814	GC	4	8	59957	59964	0 %	0 %	50 %	50 %	525836837
114	NC_021814	CT	3	6	59998	60003	0 %	50 %	0 %	50 %	525836837
115	NC_021814	GC	3	6	60635	60640	0 %	0 %	50 %	50 %	525836837
116	NC_021814	GC	3	6	60670	60675	0 %	0 %	50 %	50 %	525836837
117	NC_021814	CT	3	6	60750	60755	0 %	50 %	0 %	50 %	525836837
118	NC_021814	GC	3	6	61333	61338	0 %	0 %	50 %	50 %	525836838
119	NC_021814	AC	3	6	62126	62131	50 %	0 %	0 %	50 %	525836839
120	NC_021814	GT	3	6	62366	62371	0 %	50 %	50 %	0 %	525836839
121	NC_021814	CG	3	6	62421	62426	0 %	0 %	50 %	50 %	525836839
122	NC_021814	CG	3	6	63641	63646	0 %	0 %	50 %	50 %	525836841
123	NC_021814	CG	4	8	64053	64060	0 %	0 %	50 %	50 %	525836841
124	NC_021814	GC	3	6	64662	64667	0 %	0 %	50 %	50 %	525836842
125	NC_021814	GA	3	6	66489	66494	50 %	0 %	50 %	0 %	525836843
126	NC_021814	GA	3	6	66960	66965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021814	TG	3	6	67237	67242	0 %	50 %	50 %	0 %	525836844
128	NC_021814	CG	4	8	67441	67448	0 %	0 %	50 %	50 %	525836844
129	NC_021814	CA	3	6	68167	68172	50 %	0 %	0 %	50 %	525836844
130	NC_021814	CG	3	6	68888	68893	0 %	0 %	50 %	50 %	525836845
131	NC_021814	GC	3	6	69236	69241	0 %	0 %	50 %	50 %	525836845
132	NC_021814	AG	3	6	69812	69817	50 %	0 %	50 %	0 %	525836845
133	NC_021814	GC	3	6	70226	70231	0 %	0 %	50 %	50 %	525836845
134	NC_021814	GC	3	6	70595	70600	0 %	0 %	50 %	50 %	525836845
135	NC_021814	GA	3	6	70617	70622	50 %	0 %	50 %	0 %	525836845
136	NC_021814	GC	3	6	71958	71963	0 %	0 %	50 %	50 %	525836845
137	NC_021814	GC	4	8	72162	72169	0 %	0 %	50 %	50 %	525836845
138	NC_021814	GC	3	6	72966	72971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021814	TG	3	6	73979	73984	0 %	50 %	50 %	0 %	525836846
140	NC_021814	GT	3	6	74128	74133	0 %	50 %	50 %	0 %	525836846
141	NC_021814	GC	3	6	75444	75449	0 %	0 %	50 %	50 %	525840462
142	NC_021814	GC	3	6	75880	75885	0 %	0 %	50 %	50 %	525840462
143	NC_021814	AG	3	6	76581	76586	50 %	0 %	50 %	0 %	525840462
144	NC_021814	TG	3	6	77109	77114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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