MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 1334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021814	GT	3	6	298	303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021814	TC	3	6	1031	1036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021814	AT	3	6	1129	1134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021814	AG	3	6	1480	1485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021814	CG	3	6	6393	6398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021814	AT	4	8	6568	6575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021814	TC	3	6	6652	6657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021814	TC	3	6	12373	12378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021814	AG	3	6	12585	12590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021814	TG	3	6	12787	12792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021814	TG	3	6	17503	17508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021814	GT	3	6	19396	19401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021814	GC	3	6	20560	20565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021814	CG	3	6	22605	22610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021814	GA	3	6	27690	27695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021814	GT	3	6	33113	33118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021814	CT	4	8	34298	34305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021814	CT	3	6	39658	39663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021814	AT	3	6	42347	42352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021814	AG	4	8	52132	52139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021814	AG	3	6	54056	54061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021814	AT	3	6	58403	58408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021814	GA	3	6	66960	66965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021814	GC	3	6	72966	72971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021814	TG	3	6	77109	77114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021814	CA	3	6	81248	81253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021814	GC	3	6	94307	94312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021814	GA	3	6	99588	99593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021814	AG	3	6	105751	105756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021814	CT	3	6	105840	105845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021814	AG	3	6	115420	115425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021814	CG	3	6	115935	115940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021814	GA	3	6	121372	121377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021814	GA	4	8	121399	121406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021814	AT	3	6	123366	123371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021814	GT	3	6	140736	140741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021814	CA	3	6	144921	144926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021814	TG	3	6	148967	148972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021814	AG	3	6	150088	150093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021814	CG	3	6	152240	152245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021814	GC	3	6	152259	152264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021814	AG	3	6	152395	152400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021814	CG	3	6	152465	152470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021814	AG	3	6	158701	158706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021814	CT	3	6	166441	166446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021814	GC	3	6	167435	167440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021814	TC	4	8	168947	168954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021814	AC	3	6	172399	172404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021814	CA	3	6	175327	175332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021814	GT	3	6	182920	182925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021814	AG	3	6	184784	184789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021814	AT	3	6	187304	187309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021814	AT	3	6	187487	187492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021814	CT	3	6	193032	193037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021814	TA	3	6	195993	195998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021814	CG	3	6	203417	203422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021814	TC	3	6	203434	203439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021814	TC	3	6	205021	205026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021814	TG	3	6	208573	208578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021814	GC	3	6	208707	208712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021814	AT	3	6	212945	212950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021814	TA	3	6	212956	212961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021814	AG	3	6	230674	230679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021814	AT	3	6	236072	236077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021814	AT	3	6	238565	238570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021814	TA	3	6	238648	238653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021814	AT	3	6	238924	238929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021814	TA	3	6	238946	238951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021814	AG	3	6	239718	239723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021814	AG	3	6	240083	240088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021814	GC	3	6	240221	240226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021814	GC	3	6	240512	240517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021814	GC	3	6	240554	240559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021814	GA	3	6	240580	240585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021814	GC	3	6	240910	240915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021814	CA	3	6	241019	241024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021814	TG	4	8	241105	241112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021814	TC	3	6	243388	243393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021814	AT	3	6	245240	245245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021814	GC	3	6	250548	250553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021814	AT	3	6	251338	251343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021814	TA	3	6	251396	251401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021814	TA	3	6	253171	253176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021814	TA	3	6	260281	260286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021814	TA	3	6	260293	260298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021814	CT	3	6	267064	267069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021814	CT	3	6	273233	273238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021814	AT	3	6	273308	273313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021814	TG	4	8	275561	275568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021814	AT	3	6	275649	275654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021814	AG	3	6	275748	275753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021814	AG	3	6	282596	282601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021814	AT	3	6	282618	282623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021814	AT	3	6	287821	287826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021814	CT	3	6	300818	300823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021814	AT	4	8	300829	300836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021814	GC	3	6	316210	316215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021814	TG	3	6	319466	319471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021814	CT	3	6	319509	319514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021814	GA	3	6	320416	320421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021814	AT	4	8	326834	326841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021814	CG	3	6	328947	328952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021814	GA	3	6	339934	339939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021814	AG	3	6	340947	340952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021814	CA	4	8	342885	342892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021814	AG	3	6	345112	345117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021814	AT	3	6	355425	355430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021814	TC	3	6	355599	355604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021814	GC	4	8	365746	365753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021814	TA	3	6	372647	372652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021814	TA	3	6	372848	372853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021814	AT	3	6	372925	372930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021814	GA	3	6	373076	373081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021814	TA	3	6	374606	374611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021814	AC	3	6	382843	382848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021814	AC	3	6	386921	386926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021814	GC	3	6	389983	389988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021814	AT	3	6	391977	391982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021814	CG	3	6	399189	399194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021814	AT	3	6	406693	406698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021814	AG	3	6	409528	409533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021814	GC	3	6	409672	409677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021814	GC	3	6	426580	426585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021814	GA	3	6	442910	442915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021814	AG	4	8	443088	443095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021814	TA	3	6	448744	448749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021814	AG	3	6	451595	451600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021814	GA	3	6	452173	452178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021814	TA	3	6	452249	452254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021814	GT	4	8	454656	454663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021814	GC	3	6	454665	454670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021814	GA	3	6	467266	467271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021814	AT	3	6	467602	467607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021814	AT	3	6	467908	467913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021814	TG	3	6	468835	468840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021814	TG	3	6	468911	468916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021814	GT	3	6	473157	473162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021814	GT	3	6	473523	473528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021814	GT	3	6	474011	474016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021814	TG	3	6	474243	474248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021814	GC	3	6	474308	474313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021814	TA	3	6	482103	482108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021814	AT	3	6	482234	482239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021814	GC	3	6	483306	483311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021814	CA	3	6	483763	483768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021814	GA	3	6	484248	484253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021814	GA	3	6	484299	484304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021814	AT	3	6	490769	490774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021814	GT	3	6	490782	490787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021814	GC	3	6	516287	516292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021814	TA	3	6	519728	519733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021814	TA	3	6	520527	520532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021814	AT	3	6	522035	522040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_021814	AT	3	6	1769178	1769183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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