MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	TTTTGT	2	12	13440	13451	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021813	GTTTAT	2	12	16388	16399	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021813	GTGAAA	2	12	18615	18626	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525819473
4	NC_021813	AGGTAA	2	12	21823	21834	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525819477
5	NC_021813	GCCCAC	2	12	23630	23641	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525819478
6	NC_021813	CAGGCA	2	12	26051	26062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819480
7	NC_021813	TGTCGG	2	12	33103	33114	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525819448
8	NC_021813	CGGTGG	2	12	33295	33306	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525819448
9	NC_021813	GCGGGC	2	12	33530	33541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819448
10	NC_021813	GACCTT	2	12	33735	33746	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525819485
11	NC_021813	CGATCC	2	12	41545	41556	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525819490
12	NC_021813	TGAGAA	2	12	41926	41937	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021813	ATGCTC	2	12	47699	47710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525819497
14	NC_021813	TGCTGA	2	12	48887	48898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525819498
15	NC_021813	CAATAA	2	12	50704	50715	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021813	CTGGAA	2	12	59778	59789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525819511
17	NC_021813	GGCGCT	2	12	64816	64827	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525819519
18	NC_021813	CAGGTG	2	12	64847	64858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525819519
19	NC_021813	GCCGGA	2	12	65188	65199	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525819519
20	NC_021813	CCCGTA	2	12	70921	70932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525819453
21	NC_021813	GGATGA	2	12	74125	74136	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525819530
22	NC_021813	GATATC	2	12	78306	78317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525819532
23	NC_021813	ACCGGT	2	12	90600	90611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525819544
24	NC_021813	CTTTTC	2	12	93023	93034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819545
25	NC_021813	TTCCGG	2	12	93215	93226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819545
26	NC_021813	AGTGTC	2	12	99329	99340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525819554
27	NC_021813	CGGCAA	2	12	101442	101453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819554
28	NC_021813	GGAAAA	2	12	106514	106525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819454

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.