MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	GTGAAA	2	12	18615	18626	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525819473
2	NC_021813	AGGTAA	2	12	21823	21834	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525819477
3	NC_021813	GCCCAC	2	12	23630	23641	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525819478
4	NC_021813	CAGGCA	2	12	26051	26062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819480
5	NC_021813	TGTCGG	2	12	33103	33114	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525819448
6	NC_021813	CGGTGG	2	12	33295	33306	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525819448
7	NC_021813	GCGGGC	2	12	33530	33541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819448
8	NC_021813	GACCTT	2	12	33735	33746	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525819485
9	NC_021813	CGATCC	2	12	41545	41556	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525819490
10	NC_021813	ATGCTC	2	12	47699	47710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525819497
11	NC_021813	TGCTGA	2	12	48887	48898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525819498
12	NC_021813	CTGGAA	2	12	59778	59789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525819511
13	NC_021813	GGCGCT	2	12	64816	64827	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525819519
14	NC_021813	CAGGTG	2	12	64847	64858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525819519
15	NC_021813	GCCGGA	2	12	65188	65199	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525819519
16	NC_021813	CCCGTA	2	12	70921	70932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525819453
17	NC_021813	GGATGA	2	12	74125	74136	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525819530
18	NC_021813	GATATC	2	12	78306	78317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525819532
19	NC_021813	ACCGGT	2	12	90600	90611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525819544
20	NC_021813	CTTTTC	2	12	93023	93034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819545
21	NC_021813	TTCCGG	2	12	93215	93226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819545
22	NC_021813	AGTGTC	2	12	99329	99340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525819554
23	NC_021813	CGGCAA	2	12	101442	101453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819554
24	NC_021813	GGAAAA	2	12	106514	106525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819454

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.