MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	ACGCA	2	10	4517	4526	40 %	0 %	20 %	40 %	525819458
2	NC_021813	GTTGT	2	10	7741	7750	0 %	60 %	40 %	0 %	525819461
3	NC_021813	ACTGA	2	10	7938	7947	40 %	20 %	20 %	20 %	525819462
4	NC_021813	TCCAG	2	10	9768	9777	20 %	20 %	20 %	40 %	525819463
5	NC_021813	CAGCA	2	10	16528	16537	40 %	0 %	20 %	40 %	525819471
6	NC_021813	GCTTC	2	10	16579	16588	0 %	40 %	20 %	40 %	525819471
7	NC_021813	ATTTT	2	10	17492	17501	20 %	80 %	0 %	0 %	525819472
8	NC_021813	GAAGA	2	10	17553	17562	60 %	0 %	40 %	0 %	525819472
9	NC_021813	CTGAA	2	10	19886	19895	40 %	20 %	20 %	20 %	525819474
10	NC_021813	TGGCA	2	10	25779	25788	20 %	20 %	40 %	20 %	525819480
11	NC_021813	ATCCC	2	10	27626	27635	20 %	20 %	0 %	60 %	525819482
12	NC_021813	CGCTG	2	10	27769	27778	0 %	20 %	40 %	40 %	525819482
13	NC_021813	CGATC	2	10	29606	29615	20 %	20 %	20 %	40 %	525819483
14	NC_021813	ACCCT	2	10	30682	30691	20 %	20 %	0 %	60 %	525819484
15	NC_021813	GGTGC	2	10	31083	31092	0 %	20 %	60 %	20 %	525819484
16	NC_021813	GCGCC	2	10	31419	31428	0 %	0 %	40 %	60 %	525819484
17	NC_021813	GCTCG	2	10	32186	32195	0 %	20 %	40 %	40 %	525819448
18	NC_021813	CGAAC	2	10	36256	36265	40 %	0 %	20 %	40 %	525819487
19	NC_021813	GCCAA	2	10	39063	39072	40 %	0 %	20 %	40 %	525819489
20	NC_021813	GCATC	2	10	39554	39563	20 %	20 %	20 %	40 %	525819489
21	NC_021813	CGCGC	2	10	40733	40742	0 %	0 %	40 %	60 %	525819489
22	NC_021813	TCCGG	2	10	43287	43296	0 %	20 %	40 %	40 %	525819492
23	NC_021813	ACATC	2	10	43763	43772	40 %	20 %	0 %	40 %	525819492
24	NC_021813	CGTTC	2	10	44235	44244	0 %	40 %	20 %	40 %	525819493
25	NC_021813	TCTTT	2	10	46202	46211	0 %	80 %	0 %	20 %	525819496
26	NC_021813	AGAAA	2	10	49705	49714	80 %	0 %	20 %	0 %	525819498
27	NC_021813	CGGCC	2	10	51457	51466	0 %	0 %	40 %	60 %	525819501
28	NC_021813	CAAAA	2	10	54414	54423	80 %	0 %	0 %	20 %	525819505
29	NC_021813	CGTTA	2	10	55860	55869	20 %	40 %	20 %	20 %	525819507
30	NC_021813	CACTG	2	10	56190	56199	20 %	20 %	20 %	40 %	525819507
31	NC_021813	CTAAA	2	10	56297	56306	60 %	20 %	0 %	20 %	525819507
32	NC_021813	GCTGG	2	10	59300	59309	0 %	20 %	60 %	20 %	525819510
33	NC_021813	CCGCC	2	10	60973	60982	0 %	0 %	20 %	80 %	525819513
34	NC_021813	ACCGT	2	10	61733	61742	20 %	20 %	20 %	40 %	525819515
35	NC_021813	TGTAC	2	10	61968	61977	20 %	40 %	20 %	20 %	525819516
36	NC_021813	CTGTC	2	10	64293	64302	0 %	40 %	20 %	40 %	525819519
37	NC_021813	AAGTG	2	10	64930	64939	40 %	20 %	40 %	0 %	525819519
38	NC_021813	CTGGT	2	10	67170	67179	0 %	40 %	40 %	20 %	525819521
39	NC_021813	TGACC	2	10	68518	68527	20 %	20 %	20 %	40 %	525819523
40	NC_021813	GTTAC	2	10	70825	70834	20 %	40 %	20 %	20 %	525819453
41	NC_021813	ATGAC	2	10	74473	74482	40 %	20 %	20 %	20 %	525819531
42	NC_021813	ATCGT	2	10	75040	75049	20 %	40 %	20 %	20 %	525819531
43	NC_021813	CAGGG	2	10	80673	80682	20 %	0 %	60 %	20 %	525819534
44	NC_021813	CATAA	2	10	86474	86483	60 %	20 %	0 %	20 %	525819541
45	NC_021813	TGAGC	2	10	86484	86493	20 %	20 %	40 %	20 %	525819541
46	NC_021813	GTCTG	2	10	87527	87536	0 %	40 %	40 %	20 %	525819542
47	NC_021813	TCTTT	2	10	90748	90757	0 %	80 %	0 %	20 %	525819544
48	NC_021813	ACCGG	2	10	94377	94386	20 %	0 %	40 %	40 %	525819548
49	NC_021813	GACAG	2	10	103541	103550	40 %	0 %	40 %	20 %	525819557
50	NC_021813	AAAGG	2	10	105470	105479	60 %	0 %	40 %	0 %	525819559

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.