MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 281

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	TTAA	2	8	62	69	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021813	ACTG	2	8	550	557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021813	TGCG	2	8	872	879	0 %	25 %	50 %	25 %	525819456
4	NC_021813	CAAG	2	8	940	947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021813	ATAA	2	8	1657	1664	75 %	25 %	0 %	0 %	525819457
6	NC_021813	AGCC	2	8	2000	2007	25 %	0 %	25 %	50 %	525819457
7	NC_021813	AACC	2	8	2027	2034	50 %	0 %	0 %	50 %	525819457
8	NC_021813	TTTG	2	8	2732	2739	0 %	75 %	25 %	0 %	525819457
9	NC_021813	TGCC	2	8	3501	3508	0 %	25 %	25 %	50 %	525819446
10	NC_021813	TGTC	2	8	3588	3595	0 %	50 %	25 %	25 %	525819446
11	NC_021813	TTAT	2	8	3822	3829	25 %	75 %	0 %	0 %	525819446
12	NC_021813	CGGG	2	8	3975	3982	0 %	0 %	75 %	25 %	525819446
13	NC_021813	GTTT	2	8	4078	4085	0 %	75 %	25 %	0 %	525819458
14	NC_021813	GTTA	2	8	4181	4188	25 %	50 %	25 %	0 %	525819458
15	NC_021813	TTGT	2	8	4474	4481	0 %	75 %	25 %	0 %	525819458
16	NC_021813	CCAG	2	8	5928	5935	25 %	0 %	25 %	50 %	525819460
17	NC_021813	GCTG	2	8	6246	6253	0 %	25 %	50 %	25 %	525819460
18	NC_021813	TGTA	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	525819460
19	NC_021813	GTTT	2	8	7273	7280	0 %	75 %	25 %	0 %	525819460
20	NC_021813	GCTG	2	8	7441	7448	0 %	25 %	50 %	25 %	525819461
21	NC_021813	ATGG	2	8	7779	7786	25 %	25 %	50 %	0 %	525819461
22	NC_021813	TCGT	2	8	8235	8242	0 %	50 %	25 %	25 %	525819462
23	NC_021813	GCTG	2	8	8496	8503	0 %	25 %	50 %	25 %	525819462
24	NC_021813	GGCA	2	8	8520	8527	25 %	0 %	50 %	25 %	525819462
25	NC_021813	TCAG	2	8	10163	10170	25 %	25 %	25 %	25 %	525819463
26	NC_021813	TGTT	2	8	10519	10526	0 %	75 %	25 %	0 %	525819463
27	NC_021813	TGCC	2	8	10816	10823	0 %	25 %	25 %	50 %	525819464
28	NC_021813	TGCC	2	8	11478	11485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021813	ACTG	2	8	11928	11935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021813	TCCG	2	8	12367	12374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021813	TTTA	2	8	12508	12515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021813	TAAA	2	8	13399	13406	75 %	25 %	0 %	0 %	525819466
33	NC_021813	TCTG	2	8	13623	13630	0 %	50 %	25 %	25 %	525819467
34	NC_021813	AGAA	2	8	13803	13810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021813	ATGT	2	8	13937	13944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021813	TCAG	2	8	14184	14191	25 %	25 %	25 %	25 %	525819468
37	NC_021813	ACGG	2	8	14395	14402	25 %	0 %	50 %	25 %	525819468
38	NC_021813	ATAA	2	8	14629	14636	75 %	25 %	0 %	0 %	525819469
39	NC_021813	GGCC	2	8	15310	15317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021813	TTTC	2	8	15358	15365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021813	TCTT	2	8	15894	15901	0 %	75 %	0 %	25 %	525819470
42	NC_021813	AGGT	2	8	16589	16596	25 %	25 %	50 %	0 %	525819471
43	NC_021813	TGCC	2	8	16871	16878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021813	AAAG	2	8	17451	17458	75 %	0 %	25 %	0 %	525819472
45	NC_021813	TCTT	2	8	17768	17775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021813	GTCG	2	8	18248	18255	0 %	25 %	50 %	25 %	525819473
47	NC_021813	TCCG	2	8	18267	18274	0 %	25 %	25 %	50 %	525819473
48	NC_021813	CTGC	2	8	18785	18792	0 %	25 %	25 %	50 %	525819473
49	NC_021813	GCTG	2	8	18919	18926	0 %	25 %	50 %	25 %	525819473
50	NC_021813	CAAA	2	8	19127	19134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021813	ATCA	2	8	19693	19700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021813	GCCA	2	8	20145	20152	25 %	0 %	25 %	50 %	525819475
53	NC_021813	CAGC	2	8	20233	20240	25 %	0 %	25 %	50 %	525819475
54	NC_021813	GCTG	2	8	20657	20664	0 %	25 %	50 %	25 %	525819476
55	NC_021813	GGCA	2	8	20719	20726	25 %	0 %	50 %	25 %	525819476
56	NC_021813	GACC	2	8	20970	20977	25 %	0 %	25 %	50 %	525819476
57	NC_021813	CTGG	2	8	21053	21060	0 %	25 %	50 %	25 %	525819476
58	NC_021813	GCTG	2	8	21089	21096	0 %	25 %	50 %	25 %	525819476
59	NC_021813	GGCA	2	8	21178	21185	25 %	0 %	50 %	25 %	525819476
60	NC_021813	ATGT	2	8	21368	21375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021813	CTGG	2	8	21485	21492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021813	GCAG	2	8	23200	23207	25 %	0 %	50 %	25 %	525819477
63	NC_021813	CACC	2	8	23505	23512	25 %	0 %	0 %	75 %	525819478
64	NC_021813	CCGT	2	8	23575	23582	0 %	25 %	25 %	50 %	525819478
65	NC_021813	GTTG	2	8	23802	23809	0 %	50 %	50 %	0 %	525819478
66	NC_021813	CCTA	2	8	23828	23835	25 %	25 %	0 %	50 %	525819478
67	NC_021813	GGGT	2	8	26528	26535	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021813	GGCG	2	8	27077	27084	0 %	0 %	75 %	25 %	525819481
69	NC_021813	GCGG	2	8	27296	27303	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021813	CGGC	2	8	27980	27987	0 %	0 %	50 %	50 %	525819482
71	NC_021813	TGGC	2	8	28009	28016	0 %	25 %	50 %	25 %	525819482
72	NC_021813	GGAT	2	8	28336	28343	25 %	25 %	50 %	0 %	525819447
73	NC_021813	AGAA	2	8	28355	28362	75 %	0 %	25 %	0 %	525819447
74	NC_021813	AGCC	2	8	28485	28492	25 %	0 %	25 %	50 %	525819447
75	NC_021813	GCCA	2	8	28822	28829	25 %	0 %	25 %	50 %	525819483
76	NC_021813	CGGC	2	8	30224	30231	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
77	NC_021813	AGCC	2	8	30997	31004	25 %	0 %	25 %	50 %	525819484
78	NC_021813	AGGT	2	8	31540	31547	25 %	25 %	50 %	0 %	525819484
79	NC_021813	GCGG	2	8	31577	31584	0 %	0 %	75 %	25 %	525819484
80	NC_021813	CGGC	2	8	31691	31698	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
81	NC_021813	CTTG	2	8	31915	31922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021813	CGGC	2	8	31981	31988	0 %	0 %	50 %	50 %	525819448
83	NC_021813	CTTC	2	8	31990	31997	0 %	50 %	0 %	50 %	525819448
84	NC_021813	CGAG	2	8	32647	32654	25 %	0 %	50 %	25 %	525819448
85	NC_021813	CCTT	2	8	33057	33064	0 %	50 %	0 %	50 %	525819448
86	NC_021813	GAGG	2	8	34123	34130	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021813	GTCC	2	8	34888	34895	0 %	25 %	25 %	50 %	525819486
88	NC_021813	TGGC	2	8	35639	35646	0 %	25 %	50 %	25 %	525819449
89	NC_021813	CTGG	2	8	36360	36367	0 %	25 %	50 %	25 %	525819487
90	NC_021813	GCCA	2	8	38549	38556	25 %	0 %	25 %	50 %	525819489
91	NC_021813	GAGC	2	8	38729	38736	25 %	0 %	50 %	25 %	525819489
92	NC_021813	GCCC	2	8	38885	38892	0 %	0 %	25 %	75 %	525819489
93	NC_021813	GGCA	2	8	39115	39122	25 %	0 %	50 %	25 %	525819489
94	NC_021813	CGCC	2	8	39631	39638	0 %	0 %	25 %	75 %	525819489
95	NC_021813	ACCG	2	8	39716	39723	25 %	0 %	25 %	50 %	525819489
96	NC_021813	GGAC	2	8	40454	40461	25 %	0 %	50 %	25 %	525819489
97	NC_021813	GGAC	2	8	40530	40537	25 %	0 %	50 %	25 %	525819489
98	NC_021813	GTTG	2	8	41997	42004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021813	ATTT	2	8	42084	42091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021813	TGCA	2	8	43135	43142	25 %	25 %	25 %	25 %	525819492
101	NC_021813	TGGA	2	8	43273	43280	25 %	25 %	50 %	0 %	525819492
102	NC_021813	CCGG	2	8	43818	43825	0 %	0 %	50 %	50 %	525819492
103	NC_021813	GGCG	2	8	44163	44170	0 %	0 %	75 %	25 %	525819492
104	NC_021813	CCAG	2	8	44527	44534	25 %	0 %	25 %	50 %	525819493
105	NC_021813	CCGG	2	8	44642	44649	0 %	0 %	50 %	50 %	525819494
106	NC_021813	AGGC	2	8	45020	45027	25 %	0 %	50 %	25 %	525819494
107	NC_021813	CCCG	2	8	45402	45409	0 %	0 %	25 %	75 %	525819495
108	NC_021813	GAAA	2	8	45545	45552	75 %	0 %	25 %	0 %	525819495
109	NC_021813	GGGA	2	8	46180	46187	25 %	0 %	75 %	0 %	525819496
110	NC_021813	CTGG	2	8	46221	46228	0 %	25 %	50 %	25 %	525819496
111	NC_021813	GGCT	2	8	46421	46428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021813	ATAA	2	8	46627	46634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021813	TACT	2	8	46725	46732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021813	AAAG	2	8	47798	47805	75 %	0 %	25 %	0 %	525819497
115	NC_021813	GCAG	2	8	48800	48807	25 %	0 %	50 %	25 %	525819498
116	NC_021813	TGCT	2	8	48997	49004	0 %	50 %	25 %	25 %	525819498
117	NC_021813	AAAT	2	8	49723	49730	75 %	25 %	0 %	0 %	525819498
118	NC_021813	CGTC	2	8	51469	51476	0 %	25 %	25 %	50 %	525819501
119	NC_021813	CAGC	2	8	51518	51525	25 %	0 %	25 %	50 %	525819501
120	NC_021813	CAGC	2	8	51652	51659	25 %	0 %	25 %	50 %	525819501
121	NC_021813	CATT	2	8	51786	51793	25 %	50 %	0 %	25 %	525819502
122	NC_021813	CATC	2	8	51960	51967	25 %	25 %	0 %	50 %	525819502
123	NC_021813	CTCC	2	8	52177	52184	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_021813	TGAG	2	8	52794	52801	25 %	25 %	50 %	0 %	525819503
125	NC_021813	AGGG	2	8	52833	52840	25 %	0 %	75 %	0 %	525819503
126	NC_021813	CAGC	2	8	53342	53349	25 %	0 %	25 %	50 %	525819504
127	NC_021813	CAGG	2	8	53404	53411	25 %	0 %	50 %	25 %	525819504
128	NC_021813	TCGC	2	8	53936	53943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021813	GGTA	2	8	54744	54751	25 %	25 %	50 %	0 %	525819505
130	NC_021813	AAAC	2	8	55180	55187	75 %	0 %	0 %	25 %	525819506
131	NC_021813	GATC	2	8	55848	55855	25 %	25 %	25 %	25 %	525819507
132	NC_021813	ATAA	2	8	56335	56342	75 %	25 %	0 %	0 %	525819507
133	NC_021813	GCTG	2	8	57838	57845	0 %	25 %	50 %	25 %	525819509
134	NC_021813	TTCA	2	8	58251	58258	25 %	50 %	0 %	25 %	525819509
135	NC_021813	TGGC	2	8	58373	58380	0 %	25 %	50 %	25 %	525819509
136	NC_021813	CGGG	2	8	58531	58538	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021813	CCGG	2	8	58645	58652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021813	GCAG	2	8	59415	59422	25 %	0 %	50 %	25 %	525819510
139	NC_021813	ATGA	2	8	59664	59671	50 %	25 %	25 %	0 %	525819511
140	NC_021813	CAGT	2	8	60558	60565	25 %	25 %	25 %	25 %	525819513
141	NC_021813	TGGC	2	8	60628	60635	0 %	25 %	50 %	25 %	525819513
142	NC_021813	TGGC	2	8	60937	60944	0 %	25 %	50 %	25 %	525819513
143	NC_021813	GTCT	2	8	61541	61548	0 %	50 %	25 %	25 %	525819515
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.