MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	TTAA	2	8	62	69	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021813	ACTG	2	8	550	557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021813	CAAG	2	8	940	947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021813	TGCC	2	8	11478	11485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021813	ACTG	2	8	11928	11935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021813	TCCG	2	8	12367	12374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021813	TTTA	2	8	12508	12515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021813	AGAA	2	8	13803	13810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021813	ATGT	2	8	13937	13944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021813	GGCC	2	8	15310	15317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021813	TTTC	2	8	15358	15365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021813	TGCC	2	8	16871	16878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021813	TCTT	2	8	17768	17775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021813	CAAA	2	8	19127	19134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021813	ATCA	2	8	19693	19700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021813	ATGT	2	8	21368	21375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021813	CTGG	2	8	21485	21492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021813	GGGT	2	8	26528	26535	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021813	GCGG	2	8	27296	27303	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021813	CTTG	2	8	31915	31922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021813	GAGG	2	8	34123	34130	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021813	GTTG	2	8	41997	42004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021813	ATTT	2	8	42084	42091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021813	GGCT	2	8	46421	46428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021813	ATAA	2	8	46627	46634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021813	TACT	2	8	46725	46732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021813	CTCC	2	8	52177	52184	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_021813	TCGC	2	8	53936	53943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021813	CGGG	2	8	58531	58538	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021813	CCGG	2	8	58645	58652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021813	ACGG	2	8	61924	61931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021813	TCAG	2	8	63329	63336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021813	TCGT	2	8	68274	68281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021813	GCCT	2	8	69006	69013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021813	CTAT	2	8	70178	70185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021813	ATAA	2	8	72036	72043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021813	TACA	2	8	72301	72308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021813	TTCG	2	8	74435	74442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021813	ATTT	2	8	81759	81766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021813	ATCA	2	8	81919	81926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021813	TGGT	2	8	82555	82562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021813	GTGG	2	8	82679	82686	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021813	TAAT	2	8	83341	83348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021813	AATG	2	8	83368	83375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021813	GCTG	2	8	83377	83384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021813	TGTC	2	8	83498	83505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021813	AGTG	2	8	83669	83676	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021813	GATT	2	8	83699	83706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021813	GGAG	2	8	83974	83981	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021813	CTAT	2	8	84669	84676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021813	TTAA	2	8	86924	86931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021813	ACAG	2	8	105744	105751	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021813	GTTT	2	8	105758	105765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021813	AAAT	2	8	105788	105795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021813	CTGG	2	8	105852	105859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021813	CGGT	2	8	110210	110217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021813	AATT	2	8	110234	110241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.