MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 276

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	TGA	2	6	27	32	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021813	CCA	2	6	112	117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021813	GTT	2	6	159	164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021813	ACC	2	6	189	194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021813	TGT	2	6	272	277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021813	CAG	2	6	337	342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021813	CGA	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021813	TAC	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021813	TGA	3	9	1162	1170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021813	CCA	2	6	1257	1262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021813	ACT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021813	CAG	2	6	1350	1355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021813	CGT	2	6	1401	1406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021813	CAG	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021813	CTT	2	6	2924	2929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021813	TCC	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021813	GCA	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021813	TGT	2	6	3129	3134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021813	ACC	2	6	3140	3145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021813	TAA	2	6	3210	3215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021813	GTG	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021813	ATG	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021813	AAT	2	6	3306	3311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021813	CAG	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021813	AAT	2	6	3429	3434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021813	ATG	2	6	11252	11257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021813	TCT	2	6	11441	11446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021813	GTA	2	6	11910	11915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021813	TTG	2	6	12024	12029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021813	GTT	2	6	12129	12134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021813	CAA	2	6	12177	12182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021813	TGC	2	6	12219	12224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021813	AAT	2	6	12248	12253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021813	GGC	2	6	12335	12340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021813	GAC	2	6	12355	12360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021813	TAA	2	6	12462	12467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021813	TCA	2	6	12557	12562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021813	TTA	2	6	12563	12568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021813	AAG	2	6	12727	12732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021813	AGT	2	6	12746	12751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021813	ATA	2	6	12764	12769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021813	TTA	2	6	12899	12904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021813	CCT	2	6	13420	13425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021813	AGC	2	6	13740	13745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021813	CGT	2	6	13751	13756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021813	AGT	2	6	13794	13799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021813	GGT	2	6	13830	13835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021813	GTG	2	6	13961	13966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021813	AGA	2	6	15268	15273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021813	TGG	2	6	15411	15416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021813	ATG	2	6	16060	16065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021813	CAG	2	6	16163	16168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021813	TTA	2	6	16364	16369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021813	GAC	2	6	16899	16904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021813	GAA	2	6	16955	16960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021813	CGA	2	6	16975	16980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021813	ATG	2	6	17126	17131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021813	TGT	2	6	17248	17253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021813	ATC	2	6	17288	17293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021813	ATT	2	6	17380	17385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021813	GCG	2	6	17651	17656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021813	AGA	2	6	17721	17726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021813	ACG	2	6	17790	17795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021813	ATC	2	6	18968	18973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021813	TCA	2	6	19082	19087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021813	GTT	2	6	19100	19105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021813	AAG	2	6	19142	19147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021813	ATT	2	6	19191	19196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021813	CGC	2	6	19215	19220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_021813	CAA	2	6	19362	19367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021813	GCA	2	6	19400	19405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021813	GCC	2	6	19437	19442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021813	AAC	2	6	19460	19465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021813	TGT	2	6	19484	19489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021813	ATC	2	6	19499	19504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021813	TCT	2	6	19513	19518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021813	TCG	2	6	19601	19606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021813	CGG	2	6	19722	19727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021813	GCC	2	6	19760	19765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021813	GTA	2	6	19831	19836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021813	CCG	2	6	21335	21340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021813	TTG	2	6	21342	21347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021813	GAT	2	6	21396	21401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021813	GGC	2	6	21443	21448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021813	ACA	2	6	26520	26525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021813	CCG	2	6	27214	27219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021813	TTA	2	6	28525	28530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021813	ATA	2	6	28544	28549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021813	GCA	2	6	29964	29969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021813	GCT	2	6	31771	31776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021813	GCG	2	6	33613	33618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021813	GCG	2	6	33621	33626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021813	GAA	2	6	34054	34059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021813	TTG	2	6	34073	34078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021813	GGC	2	6	34083	34088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021813	AAT	2	6	34144	34149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021813	CGA	2	6	34150	34155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021813	TTA	2	6	35086	35091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021813	ATA	2	6	35105	35110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021813	GCG	2	6	35193	35198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021813	TCC	2	6	37259	37264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021813	GCA	2	6	37284	37289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021813	CGT	2	6	37293	37298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021813	GCT	2	6	37322	37327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021813	TCT	2	6	37363	37368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021813	TTG	2	6	41825	41830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021813	TTC	2	6	41831	41836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021813	TCA	2	6	41841	41846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021813	ATG	2	6	41878	41883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021813	GTC	2	6	41946	41951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021813	TGC	2	6	41978	41983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021813	GCT	2	6	41991	41996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021813	GGT	2	6	42005	42010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021813	GAT	2	6	42040	42045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021813	AAT	2	6	42186	42191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021813	TAC	2	6	45099	45104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021813	TTC	2	6	45160	45165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021813	ATG	2	6	45230	45235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021813	ATT	2	6	45239	45244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021813	GGA	2	6	45256	45261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021813	TAA	2	6	46441	46446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021813	TAA	2	6	46497	46502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021813	GTA	2	6	46531	46536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021813	TGT	2	6	46615	46620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021813	AGA	3	9	46659	46667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021813	TGT	2	6	48156	48161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021813	TGC	2	6	48212	48217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021813	CAG	2	6	48226	48231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021813	TAA	2	6	48308	48313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021813	ATG	2	6	50277	50282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021813	ATA	3	9	50693	50701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021813	CAT	2	6	50731	50736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021813	CGG	2	6	51693	51698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021813	ATA	2	6	52042	52047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021813	GCT	2	6	52230	52235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021813	TGT	2	6	52248	52253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021813	ATG	2	6	52303	52308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021813	TGA	3	9	52424	52432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021813	ATG	2	6	52440	52445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021813	TGA	2	6	52474	52479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_021813	GTG	2	6	110302	110307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.