MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 1276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	TCA	2	6	435	440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819455
2	NC_021813	CAT	2	6	469	474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819455
3	NC_021813	GGC	2	6	792	797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819456
4	NC_021813	CAC	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819457
5	NC_021813	ATG	2	6	1461	1466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819457
6	NC_021813	CCA	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819457
7	NC_021813	TCC	2	6	1636	1641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525819457
8	NC_021813	TAT	2	6	1791	1796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525819457
9	NC_021813	ATG	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819457
10	NC_021813	CCG	2	6	1916	1921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525819457
11	NC_021813	TTG	2	6	1934	1939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819457
12	NC_021813	ATT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525819457
13	NC_021813	CAC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819457
14	NC_021813	CCA	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819457
15	NC_021813	CCA	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819457
16	NC_021813	GTA	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819457
17	NC_021813	GTT	2	6	2627	2632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819457
18	NC_021813	TAC	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819457
19	NC_021813	AAT	3	9	3879	3887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819446
20	NC_021813	TTG	2	6	3936	3941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819446
21	NC_021813	TGC	2	6	4093	4098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819458
22	NC_021813	CTT	2	6	4126	4131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819458
23	NC_021813	AGT	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819458
24	NC_021813	GTT	2	6	4265	4270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819458
25	NC_021813	CTG	2	6	4416	4421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819458
26	NC_021813	AAC	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525819458
27	NC_021813	AAC	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525819458
28	NC_021813	TTC	2	6	4620	4625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819458
29	NC_021813	TTA	2	6	4626	4631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525819458
30	NC_021813	CTA	2	6	4660	4665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819458
31	NC_021813	TGT	2	6	4704	4709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819459
32	NC_021813	TAA	2	6	4882	4887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819459
33	NC_021813	GCT	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819459
34	NC_021813	GAT	2	6	4953	4958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819459
35	NC_021813	AAT	2	6	4978	4983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819459
36	NC_021813	GAA	2	6	5025	5030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819459
37	NC_021813	CGT	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819459
38	NC_021813	CAC	2	6	5280	5285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819459
39	NC_021813	TCA	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819459
40	NC_021813	GTG	2	6	5438	5443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525819459
41	NC_021813	CTT	2	6	5474	5479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819459
42	NC_021813	CAG	2	6	5680	5685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819459
43	NC_021813	TGT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819459
44	NC_021813	CAT	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819460
45	NC_021813	GAT	2	6	5839	5844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819460
46	NC_021813	GAA	2	6	5889	5894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819460
47	NC_021813	TGC	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819460
48	NC_021813	CGT	2	6	6072	6077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819460
49	NC_021813	TGA	2	6	6098	6103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819460
50	NC_021813	TCG	3	9	6173	6181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819460
51	NC_021813	AGG	2	6	6219	6224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525819460
52	NC_021813	ATC	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819460
53	NC_021813	GTC	2	6	6353	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819460
54	NC_021813	GGT	2	6	6388	6393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525819460
55	NC_021813	CAT	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819460
56	NC_021813	ATG	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819460
57	NC_021813	TCG	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819460
58	NC_021813	GCG	2	6	6682	6687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819460
59	NC_021813	GTT	2	6	6732	6737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819460
60	NC_021813	GAA	2	6	6889	6894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819460
61	NC_021813	TCT	2	6	7089	7094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819460
62	NC_021813	AAT	2	6	7129	7134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819460
63	NC_021813	CCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525819460
64	NC_021813	ACT	2	6	7196	7201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819460
65	NC_021813	AGC	2	6	7229	7234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819460
66	NC_021813	GTG	2	6	7374	7379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525819461
67	NC_021813	GTG	2	6	7452	7457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525819461
68	NC_021813	GAA	2	6	7486	7491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819461
69	NC_021813	ATA	2	6	7527	7532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819461
70	NC_021813	GCT	2	6	7564	7569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819461
71	NC_021813	GAT	2	6	7623	7628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819461
72	NC_021813	TTC	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819461
73	NC_021813	GTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819461
74	NC_021813	TGT	2	6	7707	7712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819461
75	NC_021813	GAA	2	6	7769	7774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819461
76	NC_021813	AAT	2	6	7787	7792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819461
77	NC_021813	CCG	2	6	7846	7851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525819462
78	NC_021813	AAC	2	6	7906	7911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525819462
79	NC_021813	TCA	2	6	7912	7917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819462
80	NC_021813	GTT	2	6	8072	8077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819462
81	NC_021813	CTT	2	6	8197	8202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819462
82	NC_021813	TCC	2	6	8223	8228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525819462
83	NC_021813	CTA	2	6	8504	8509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819462
84	NC_021813	TGC	2	6	8537	8542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819462
85	NC_021813	CGG	2	6	8566	8571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819462
86	NC_021813	CTG	2	6	8576	8581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819462
87	NC_021813	TAA	2	6	8594	8599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819462
88	NC_021813	CAT	2	6	8705	8710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819462
89	NC_021813	AAT	2	6	8840	8845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819462
90	NC_021813	CTG	2	6	8911	8916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819462
91	NC_021813	TGA	2	6	8974	8979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819462
92	NC_021813	GAT	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819462
93	NC_021813	TCA	2	6	9085	9090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819462
94	NC_021813	TTG	2	6	9095	9100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819462
95	NC_021813	CCT	2	6	9101	9106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525819463
96	NC_021813	ATG	2	6	9125	9130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819463
97	NC_021813	TGC	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819463
98	NC_021813	ACC	2	6	9169	9174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819463
99	NC_021813	AAT	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819463
100	NC_021813	GTC	2	6	9215	9220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819463
101	NC_021813	CTT	2	6	9261	9266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819463
102	NC_021813	TTG	2	6	9354	9359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819463
103	NC_021813	GCA	2	6	9420	9425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819463
104	NC_021813	GGT	2	6	9442	9447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525819463
105	NC_021813	TGT	3	9	9466	9474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819463
106	NC_021813	GTT	3	9	9494	9502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819463
107	NC_021813	AGA	2	6	9626	9631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819463
108	NC_021813	GGC	2	6	9649	9654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819463
109	NC_021813	CGG	2	6	9738	9743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819463
110	NC_021813	ATA	2	6	9845	9850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819463
111	NC_021813	CCT	2	6	10067	10072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525819463
112	NC_021813	TTG	2	6	10089	10094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819463
113	NC_021813	CTG	3	9	10115	10123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819463
114	NC_021813	AGA	2	6	10235	10240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819463
115	NC_021813	TTG	2	6	10302	10307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819463
116	NC_021813	TGC	2	6	10308	10313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819463
117	NC_021813	GCT	2	6	10318	10323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819463
118	NC_021813	CCT	2	6	10385	10390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525819463
119	NC_021813	TGA	2	6	10419	10424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819463
120	NC_021813	TTG	2	6	10670	10675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819463
121	NC_021813	GAC	2	6	10796	10801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819464
122	NC_021813	CAG	2	6	10807	10812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819464
123	NC_021813	CAA	2	6	10924	10929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525819464
124	NC_021813	GTT	2	6	10936	10941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819464
125	NC_021813	TGT	2	6	10968	10973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819464
126	NC_021813	CTG	2	6	11042	11047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819464
127	NC_021813	ATC	2	6	11085	11090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819464
128	NC_021813	TCT	2	6	11152	11157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819464
129	NC_021813	GGC	2	6	11581	11586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819465
130	NC_021813	TGT	2	6	11650	11655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819465
131	NC_021813	GCT	2	6	11690	11695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819465
132	NC_021813	GCA	2	6	11729	11734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819465
133	NC_021813	TGT	2	6	11740	11745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819465
134	NC_021813	TAT	2	6	11760	11765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525819465
135	NC_021813	GTT	2	6	11790	11795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819465
136	NC_021813	ATT	2	6	13008	13013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525819466
137	NC_021813	GTT	2	6	13070	13075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819466
138	NC_021813	TGT	2	6	13127	13132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819466
139	NC_021813	ATA	2	6	13143	13148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819466
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142	NC_021813	GCG	2	6	13214	13219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819466
143	NC_021813	ACC	2	6	13251	13256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819466
144	NC_021813	TGA	2	6	13258	13263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819466
145	NC_021813	TGA	2	6	13340	13345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819466
146	NC_021813	GTT	2	6	13556	13561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819467
147	NC_021813	ACC	2	6	13569	13574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819467
148	NC_021813	CGA	2	6	13669	13674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819467
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150	NC_021813	CTG	2	6	14070	14075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819468
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153	NC_021813	CTT	2	6	14279	14284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819468
154	NC_021813	ATT	2	6	14373	14378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525819468
155	NC_021813	ATC	2	6	14421	14426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819468
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158	NC_021813	TCT	2	6	14605	14610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819469
159	NC_021813	CAC	2	6	14691	14696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525819469
160	NC_021813	TCG	2	6	14707	14712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819469
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162	NC_021813	GAT	2	6	15021	15026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819469
163	NC_021813	CTG	2	6	15103	15108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819469
164	NC_021813	GAG	2	6	15604	15609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525819470
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239	NC_021813	CTG	3	9	23446	23454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819478
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243	NC_021813	GCT	2	6	23601	23606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819478
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247	NC_021813	CCG	2	6	23748	23753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525819478
248	NC_021813	CTG	2	6	23767	23772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819478
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250	NC_021813	ACG	2	6	23903	23908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819478
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252	NC_021813	CTG	2	6	23920	23925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819478
253	NC_021813	CGC	2	6	23934	23939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525819478
254	NC_021813	GGC	3	9	24045	24053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819478
255	NC_021813	TCG	2	6	24056	24061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819478
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257	NC_021813	CGA	2	6	24294	24299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819479
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