MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	AT	3	6	2402	2407	50 %	50 %	0 %	0 %	525819457
2	NC_021813	TA	3	6	2671	2676	50 %	50 %	0 %	0 %	525819457
3	NC_021813	CT	3	6	3575	3580	0 %	50 %	0 %	50 %	525819446
4	NC_021813	GC	4	8	3902	3909	0 %	0 %	50 %	50 %	525819446
5	NC_021813	GA	3	6	4753	4758	50 %	0 %	50 %	0 %	525819459
6	NC_021813	AG	3	6	5540	5545	50 %	0 %	50 %	0 %	525819459
7	NC_021813	GC	3	6	6865	6870	0 %	0 %	50 %	50 %	525819460
8	NC_021813	AG	3	6	8932	8937	50 %	0 %	50 %	0 %	525819462
9	NC_021813	TC	3	6	10479	10484	0 %	50 %	0 %	50 %	525819463
10	NC_021813	CT	3	6	10531	10536	0 %	50 %	0 %	50 %	525819463
11	NC_021813	CA	3	6	13000	13005	50 %	0 %	0 %	50 %	525819466
12	NC_021813	AG	3	6	14154	14159	50 %	0 %	50 %	0 %	525819468
13	NC_021813	TG	3	6	14324	14329	0 %	50 %	50 %	0 %	525819468
14	NC_021813	TA	4	8	14509	14516	50 %	50 %	0 %	0 %	525819468
15	NC_021813	CA	3	6	18334	18339	50 %	0 %	0 %	50 %	525819473
16	NC_021813	GC	3	6	18763	18768	0 %	0 %	50 %	50 %	525819473
17	NC_021813	CT	3	6	20911	20916	0 %	50 %	0 %	50 %	525819476
18	NC_021813	GC	3	6	21644	21649	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
19	NC_021813	GC	3	6	21974	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
20	NC_021813	CG	3	6	22678	22683	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
21	NC_021813	CG	3	6	22887	22892	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
22	NC_021813	GC	3	6	23088	23093	0 %	0 %	50 %	50 %	525819477
23	NC_021813	CG	3	6	23375	23380	0 %	0 %	50 %	50 %	525819478
24	NC_021813	GC	3	6	23618	23623	0 %	0 %	50 %	50 %	525819478
25	NC_021813	CG	3	6	23819	23824	0 %	0 %	50 %	50 %	525819478
26	NC_021813	GT	3	6	24519	24524	0 %	50 %	50 %	0 %	525819479
27	NC_021813	TG	3	6	25031	25036	0 %	50 %	50 %	0 %	525819479
28	NC_021813	CA	4	8	25356	25363	50 %	0 %	0 %	50 %	525819479
29	NC_021813	CG	3	6	26835	26840	0 %	0 %	50 %	50 %	525819481
30	NC_021813	CG	3	6	27063	27068	0 %	0 %	50 %	50 %	525819481
31	NC_021813	CG	3	6	28788	28793	0 %	0 %	50 %	50 %	525819483
32	NC_021813	GC	3	6	28893	28898	0 %	0 %	50 %	50 %	525819483
33	NC_021813	CG	3	6	29681	29686	0 %	0 %	50 %	50 %	525819483
34	NC_021813	GC	5	10	30236	30245	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
35	NC_021813	GC	3	6	30272	30277	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
36	NC_021813	GC	3	6	30575	30580	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
37	NC_021813	GC	3	6	31178	31183	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
38	NC_021813	GC	3	6	31220	31225	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
39	NC_021813	CG	3	6	31402	31407	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
40	NC_021813	CG	3	6	31600	31605	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
41	NC_021813	GC	3	6	31665	31670	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
42	NC_021813	GC	3	6	31703	31708	0 %	0 %	50 %	50 %	525819484
43	NC_021813	CG	3	6	32237	32242	0 %	0 %	50 %	50 %	525819448
44	NC_021813	CG	3	6	32389	32394	0 %	0 %	50 %	50 %	525819448
45	NC_021813	CG	3	6	32615	32620	0 %	0 %	50 %	50 %	525819448
46	NC_021813	GC	3	6	33361	33366	0 %	0 %	50 %	50 %	525819448
47	NC_021813	GC	4	8	33749	33756	0 %	0 %	50 %	50 %	525819485
48	NC_021813	CG	3	6	33960	33965	0 %	0 %	50 %	50 %	525819485
49	NC_021813	GC	5	10	33979	33988	0 %	0 %	50 %	50 %	525819485
50	NC_021813	GC	3	6	34208	34213	0 %	0 %	50 %	50 %	525819486
51	NC_021813	GC	3	6	34270	34275	0 %	0 %	50 %	50 %	525819486
52	NC_021813	CG	3	6	34557	34562	0 %	0 %	50 %	50 %	525819486
53	NC_021813	GC	3	6	34911	34916	0 %	0 %	50 %	50 %	525819486
54	NC_021813	GC	3	6	35287	35292	0 %	0 %	50 %	50 %	525819449
55	NC_021813	CT	3	6	35776	35781	0 %	50 %	0 %	50 %	525819449
56	NC_021813	TG	3	6	35879	35884	0 %	50 %	50 %	0 %	525819449
57	NC_021813	CG	3	6	36824	36829	0 %	0 %	50 %	50 %	525819487
58	NC_021813	GC	3	6	36936	36941	0 %	0 %	50 %	50 %	525819487
59	NC_021813	GC	3	6	38053	38058	0 %	0 %	50 %	50 %	525819450
60	NC_021813	GC	3	6	38208	38213	0 %	0 %	50 %	50 %	525819450
61	NC_021813	GC	3	6	39796	39801	0 %	0 %	50 %	50 %	525819489
62	NC_021813	GC	3	6	41067	41072	0 %	0 %	50 %	50 %	525819489
63	NC_021813	GA	3	6	44552	44557	50 %	0 %	50 %	0 %	525819493
64	NC_021813	CA	3	6	44866	44871	50 %	0 %	0 %	50 %	525819494
65	NC_021813	TA	3	6	45672	45677	50 %	50 %	0 %	0 %	525819495
66	NC_021813	CA	3	6	45747	45752	50 %	0 %	0 %	50 %	525819495
67	NC_021813	AC	3	6	48730	48735	50 %	0 %	0 %	50 %	525819498
68	NC_021813	GA	3	6	48812	48817	50 %	0 %	50 %	0 %	525819498
69	NC_021813	AG	3	6	48869	48874	50 %	0 %	50 %	0 %	525819498
70	NC_021813	AT	3	6	49776	49781	50 %	50 %	0 %	0 %	525819498
71	NC_021813	AT	3	6	50620	50625	50 %	50 %	0 %	0 %	525819499
72	NC_021813	GC	3	6	51504	51509	0 %	0 %	50 %	50 %	525819501
73	NC_021813	GC	3	6	53163	53168	0 %	0 %	50 %	50 %	525819504
74	NC_021813	CT	3	6	53322	53327	0 %	50 %	0 %	50 %	525819504
75	NC_021813	AT	3	6	54780	54785	50 %	50 %	0 %	0 %	525819505
76	NC_021813	GA	3	6	54898	54903	50 %	0 %	50 %	0 %	525819505
77	NC_021813	TA	3	6	55147	55152	50 %	50 %	0 %	0 %	525819506
78	NC_021813	GA	3	6	55921	55926	50 %	0 %	50 %	0 %	525819507
79	NC_021813	TA	3	6	56396	56401	50 %	50 %	0 %	0 %	525819507
80	NC_021813	TG	3	6	57761	57766	0 %	50 %	50 %	0 %	525819509
81	NC_021813	AC	3	6	57846	57851	50 %	0 %	0 %	50 %	525819509
82	NC_021813	TG	3	6	58051	58056	0 %	50 %	50 %	0 %	525819509
83	NC_021813	CA	3	6	59381	59386	50 %	0 %	0 %	50 %	525819510
84	NC_021813	GC	3	6	59612	59617	0 %	0 %	50 %	50 %	525819511
85	NC_021813	GC	3	6	59977	59982	0 %	0 %	50 %	50 %	525819512
86	NC_021813	GC	3	6	62200	62205	0 %	0 %	50 %	50 %	525819516
87	NC_021813	AG	3	6	64164	64169	50 %	0 %	50 %	0 %	525819518
88	NC_021813	CG	3	6	64840	64845	0 %	0 %	50 %	50 %	525819519
89	NC_021813	TC	3	6	66483	66488	0 %	50 %	0 %	50 %	525819520
90	NC_021813	TG	3	6	67908	67913	0 %	50 %	50 %	0 %	525819522
91	NC_021813	CG	3	6	70432	70437	0 %	0 %	50 %	50 %	525819525
92	NC_021813	CA	3	6	71719	71724	50 %	0 %	0 %	50 %	525819527
93	NC_021813	GC	3	6	72690	72695	0 %	0 %	50 %	50 %	525819528
94	NC_021813	TC	3	6	73608	73613	0 %	50 %	0 %	50 %	525819529
95	NC_021813	CA	3	6	75902	75907	50 %	0 %	0 %	50 %	525819531
96	NC_021813	CA	3	6	76345	76350	50 %	0 %	0 %	50 %	525819531
97	NC_021813	GA	3	6	78388	78393	50 %	0 %	50 %	0 %	525819532
98	NC_021813	CA	3	6	78606	78611	50 %	0 %	0 %	50 %	525819532
99	NC_021813	CA	3	6	79698	79703	50 %	0 %	0 %	50 %	525819533
100	NC_021813	AG	3	6	80135	80140	50 %	0 %	50 %	0 %	525819533
101	NC_021813	CT	3	6	80922	80927	0 %	50 %	0 %	50 %	525819534
102	NC_021813	TG	3	6	82042	82047	0 %	50 %	50 %	0 %	525819535
103	NC_021813	TC	3	6	84403	84408	0 %	50 %	0 %	50 %	525819540
104	NC_021813	TA	4	8	85124	85131	50 %	50 %	0 %	0 %	525819541
105	NC_021813	AT	3	6	85324	85329	50 %	50 %	0 %	0 %	525819541
106	NC_021813	CT	3	6	85956	85961	0 %	50 %	0 %	50 %	525819541
107	NC_021813	TG	3	6	86363	86368	0 %	50 %	50 %	0 %	525819541
108	NC_021813	AT	3	6	87858	87863	50 %	50 %	0 %	0 %	525819543
109	NC_021813	GT	3	6	88171	88176	0 %	50 %	50 %	0 %	525819543
110	NC_021813	AG	3	6	89783	89788	50 %	0 %	50 %	0 %	525819544
111	NC_021813	AG	3	6	90620	90625	50 %	0 %	50 %	0 %	525819544
112	NC_021813	CA	3	6	90626	90631	50 %	0 %	0 %	50 %	525819544
113	NC_021813	TG	3	6	91525	91530	0 %	50 %	50 %	0 %	525819544
114	NC_021813	AG	3	6	92223	92228	50 %	0 %	50 %	0 %	525819544
115	NC_021813	AG	3	6	92684	92689	50 %	0 %	50 %	0 %	525819545
116	NC_021813	GT	3	6	93106	93111	0 %	50 %	50 %	0 %	525819545
117	NC_021813	AT	3	6	95896	95901	50 %	50 %	0 %	0 %	525819550
118	NC_021813	AG	3	6	97164	97169	50 %	0 %	50 %	0 %	525819551
119	NC_021813	GA	3	6	98585	98590	50 %	0 %	50 %	0 %	525819554
120	NC_021813	CT	3	6	99437	99442	0 %	50 %	0 %	50 %	525819554
121	NC_021813	CT	3	6	99497	99502	0 %	50 %	0 %	50 %	525819554
122	NC_021813	TG	3	6	99632	99637	0 %	50 %	50 %	0 %	525819554
123	NC_021813	GA	3	6	102545	102550	50 %	0 %	50 %	0 %	525819555
124	NC_021813	AT	3	6	102655	102660	50 %	50 %	0 %	0 %	525819555
125	NC_021813	AT	3	6	103466	103471	50 %	50 %	0 %	0 %	525819557
126	NC_021813	AT	3	6	103826	103831	50 %	50 %	0 %	0 %	525819557
127	NC_021813	GA	3	6	104000	104005	50 %	0 %	50 %	0 %	525819557
128	NC_021813	GA	3	6	106822	106827	50 %	0 %	50 %	0 %	525819560
129	NC_021813	AT	3	6	108209	108214	50 %	50 %	0 %	0 %	525819561
130	NC_021813	TG	3	6	109476	109481	0 %	50 %	50 %	0 %	525819562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.