MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021813	T	6	6	2836	2841	0 %	100 %	0 %	0 %	525819457
2	NC_021813	A	6	6	3184	3189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021813	A	6	6	3394	3399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021813	T	6	6	3723	3728	0 %	100 %	0 %	0 %	525819446
5	NC_021813	T	7	7	3811	3817	0 %	100 %	0 %	0 %	525819446
6	NC_021813	A	6	6	3994	3999	100 %	0 %	0 %	0 %	525819446
7	NC_021813	T	6	6	8040	8045	0 %	100 %	0 %	0 %	525819462
8	NC_021813	A	7	7	8509	8515	100 %	0 %	0 %	0 %	525819462
9	NC_021813	G	6	6	8652	8657	0 %	0 %	100 %	0 %	525819462
10	NC_021813	T	7	7	8994	9000	0 %	100 %	0 %	0 %	525819462
11	NC_021813	T	6	6	10525	10530	0 %	100 %	0 %	0 %	525819463
12	NC_021813	T	6	6	10657	10662	0 %	100 %	0 %	0 %	525819463
13	NC_021813	T	6	6	10762	10767	0 %	100 %	0 %	0 %	525819463
14	NC_021813	G	8	8	12098	12105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021813	T	8	8	12278	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021813	T	8	8	12677	12684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021813	A	6	6	12978	12983	100 %	0 %	0 %	0 %	525819466
18	NC_021813	T	6	6	13152	13157	0 %	100 %	0 %	0 %	525819466
19	NC_021813	A	6	6	13315	13320	100 %	0 %	0 %	0 %	525819466
20	NC_021813	A	6	6	13777	13782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021813	G	6	6	14234	14239	0 %	0 %	100 %	0 %	525819468
22	NC_021813	T	7	7	14267	14273	0 %	100 %	0 %	0 %	525819468
23	NC_021813	A	6	6	15462	15467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021813	A	6	6	15826	15831	100 %	0 %	0 %	0 %	525819470
25	NC_021813	T	6	6	16476	16481	0 %	100 %	0 %	0 %	525819471
26	NC_021813	A	6	6	16662	16667	100 %	0 %	0 %	0 %	525819471
27	NC_021813	A	6	6	16938	16943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021813	A	6	6	17070	17075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021813	A	6	6	17081	17086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021813	T	6	6	17335	17340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021813	T	7	7	17498	17504	0 %	100 %	0 %	0 %	525819472
32	NC_021813	T	7	7	21435	21441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021813	A	6	6	26303	26308	100 %	0 %	0 %	0 %	525819480
34	NC_021813	T	6	6	28636	28641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021813	T	6	6	28678	28683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021813	A	7	7	36141	36147	100 %	0 %	0 %	0 %	525819449
37	NC_021813	A	6	6	41694	41699	100 %	0 %	0 %	0 %	525819490
38	NC_021813	A	6	6	41801	41806	100 %	0 %	0 %	0 %	525819490
39	NC_021813	A	6	6	42201	42206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021813	T	6	6	42564	42569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021813	T	6	6	44771	44776	0 %	100 %	0 %	0 %	525819494
42	NC_021813	T	7	7	44944	44950	0 %	100 %	0 %	0 %	525819494
43	NC_021813	A	7	7	45665	45671	100 %	0 %	0 %	0 %	525819495
44	NC_021813	T	6	6	45769	45774	0 %	100 %	0 %	0 %	525819495
45	NC_021813	T	6	6	46141	46146	0 %	100 %	0 %	0 %	525819496
46	NC_021813	T	6	6	46324	46329	0 %	100 %	0 %	0 %	525819496
47	NC_021813	T	6	6	46361	46366	0 %	100 %	0 %	0 %	525819496
48	NC_021813	T	6	6	46401	46406	0 %	100 %	0 %	0 %	525819496
49	NC_021813	A	6	6	48601	48606	100 %	0 %	0 %	0 %	525819498
50	NC_021813	A	7	7	49054	49060	100 %	0 %	0 %	0 %	525819498
51	NC_021813	T	6	6	50088	50093	0 %	100 %	0 %	0 %	525819498
52	NC_021813	A	6	6	50563	50568	100 %	0 %	0 %	0 %	525819499
53	NC_021813	A	6	6	50769	50774	100 %	0 %	0 %	0 %	525819500
54	NC_021813	T	6	6	51020	51025	0 %	100 %	0 %	0 %	525819500
55	NC_021813	A	6	6	52519	52524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021813	T	6	6	52538	52543	0 %	100 %	0 %	0 %	525819503
57	NC_021813	G	6	6	52689	52694	0 %	0 %	100 %	0 %	525819503
58	NC_021813	G	6	6	53194	53199	0 %	0 %	100 %	0 %	525819504
59	NC_021813	T	7	7	55354	55360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021813	T	6	6	55571	55576	0 %	100 %	0 %	0 %	525819507
61	NC_021813	A	6	6	56563	56568	100 %	0 %	0 %	0 %	525819508
62	NC_021813	A	6	6	56641	56646	100 %	0 %	0 %	0 %	525819508
63	NC_021813	G	6	6	56648	56653	0 %	0 %	100 %	0 %	525819508
64	NC_021813	A	6	6	56933	56938	100 %	0 %	0 %	0 %	525819508
65	NC_021813	T	7	7	57153	57159	0 %	100 %	0 %	0 %	525819451
66	NC_021813	A	6	6	57285	57290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68	NC_021813	G	6	6	58417	58422	0 %	0 %	100 %	0 %	525819509
69	NC_021813	A	6	6	59088	59093	100 %	0 %	0 %	0 %	525819510
70	NC_021813	G	6	6	63072	63077	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021813	A	6	6	63760	63765	100 %	0 %	0 %	0 %	525819452
72	NC_021813	T	6	6	66847	66852	0 %	100 %	0 %	0 %	525819521
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74	NC_021813	A	6	6	69494	69499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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78	NC_021813	A	6	6	71990	71995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021813	A	6	6	72048	72053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021813	T	7	7	72069	72075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021813	G	6	6	72335	72340	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021813	T	8	8	73432	73439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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84	NC_021813	T	6	6	73804	73809	0 %	100 %	0 %	0 %	525819529
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87	NC_021813	A	6	6	75424	75429	100 %	0 %	0 %	0 %	525819531
88	NC_021813	A	8	8	77092	77099	100 %	0 %	0 %	0 %	525819531
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92	NC_021813	T	6	6	78773	78778	0 %	100 %	0 %	0 %	525819532
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99	NC_021813	T	6	6	83318	83323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021813	T	6	6	83603	83608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_021813	T	6	6	87558	87563	0 %	100 %	0 %	0 %	525819542
106	NC_021813	T	6	6	89305	89310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021813	T	7	7	92462	92468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021813	T	6	6	92519	92524	0 %	100 %	0 %	0 %	525819545
109	NC_021813	T	6	6	92566	92571	0 %	100 %	0 %	0 %	525819545
110	NC_021813	T	6	6	93060	93065	0 %	100 %	0 %	0 %	525819545
111	NC_021813	C	6	6	93657	93662	0 %	0 %	0 %	100 %	525819547
112	NC_021813	T	6	6	93675	93680	0 %	100 %	0 %	0 %	525819547
113	NC_021813	A	7	7	93988	93994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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116	NC_021813	T	6	6	94884	94889	0 %	100 %	0 %	0 %	525819549
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121	NC_021813	A	6	6	100189	100194	100 %	0 %	0 %	0 %	525819554
122	NC_021813	T	7	7	100721	100727	0 %	100 %	0 %	0 %	525819554
123	NC_021813	T	6	6	101103	101108	0 %	100 %	0 %	0 %	525819554
124	NC_021813	C	6	6	101623	101628	0 %	0 %	0 %	100 %	525819554
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126	NC_021813	T	6	6	102016	102021	0 %	100 %	0 %	0 %	525819554
127	NC_021813	T	6	6	102265	102270	0 %	100 %	0 %	0 %	525819554
128	NC_021813	A	6	6	102348	102353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021813	A	7	7	102359	102365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021813	G	6	6	102391	102396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021813	T	6	6	102732	102737	0 %	100 %	0 %	0 %	525819555
132	NC_021813	T	7	7	102959	102965	0 %	100 %	0 %	0 %	525819555
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138	NC_021813	T	6	6	108900	108905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021813	T	7	7	109734	109740	0 %	100 %	0 %	0 %	525819562
140	NC_021813	A	6	6	110168	110173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.