MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 61551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021812	TGG	2	6	301	306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826476
2	NC_021812	TCG	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826476
3	NC_021812	CGA	2	6	361	366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826476
4	NC_021812	GGC	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826476
5	NC_021812	GCC	2	6	425	430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826476
6	NC_021812	ACA	2	6	532	537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826476
7	NC_021812	CCA	2	6	644	649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826476
8	NC_021812	ACG	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826476
9	NC_021812	CAG	2	6	725	730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826476
10	NC_021812	ATC	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826476
11	NC_021812	GCG	2	6	750	755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826476
12	NC_021812	CGT	2	6	1024	1029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826477
13	NC_021812	GGT	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826477
14	NC_021812	TCT	2	6	1219	1224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826477
15	NC_021812	TGC	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826477
16	NC_021812	CAT	2	6	1481	1486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826477
17	NC_021812	TGG	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826477
18	NC_021812	GCG	2	6	1582	1587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826477
19	NC_021812	GCT	2	6	1621	1626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826477
20	NC_021812	CTG	2	6	1754	1759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826477
21	NC_021812	CGC	2	6	1813	1818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826477
22	NC_021812	GTT	2	6	1967	1972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826477
23	NC_021812	CGG	2	6	1981	1986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826477
24	NC_021812	TGA	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826477
25	NC_021812	CGC	2	6	2044	2049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826477
26	NC_021812	AAG	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826477
27	NC_021812	GAT	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826477
28	NC_021812	ATG	2	6	2457	2462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826477
29	NC_021812	CAA	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826477
30	NC_021812	TCA	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826477
31	NC_021812	GAC	2	6	2731	2736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826477
32	NC_021812	CGT	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826477
33	NC_021812	TGT	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826478
34	NC_021812	TGT	2	6	2831	2836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826478
35	NC_021812	CGG	2	6	2928	2933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826478
36	NC_021812	CCA	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826478
37	NC_021812	GGA	2	6	3070	3075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826478
38	NC_021812	GGT	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826478
39	NC_021812	TCA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826478
40	NC_021812	GCG	2	6	3187	3192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826478
41	NC_021812	AGG	2	6	3414	3419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826478
42	NC_021812	ATA	2	6	3437	3442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826478
43	NC_021812	CGG	2	6	3456	3461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826478
44	NC_021812	TTC	2	6	3464	3469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826478
45	NC_021812	GCC	2	6	3490	3495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826478
46	NC_021812	CGG	2	6	3526	3531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826478
47	NC_021812	CTT	2	6	3591	3596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826478
48	NC_021812	CGG	3	9	3609	3617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826478
49	NC_021812	GTC	2	6	3628	3633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826478
50	NC_021812	CAG	2	6	3707	3712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826478
51	NC_021812	ACC	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826478
52	NC_021812	GGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826478
53	NC_021812	ACG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826478
54	NC_021812	ATT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826479
55	NC_021812	TAA	2	6	4502	4507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826479
56	NC_021812	CAC	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826479
57	NC_021812	GGT	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826479
58	NC_021812	ATA	2	6	4786	4791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826479
59	NC_021812	TGA	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826479
60	NC_021812	TAA	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826479
61	NC_021812	GTG	2	6	5032	5037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826479
62	NC_021812	AGA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826479
63	NC_021812	GAA	2	6	5119	5124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826479
64	NC_021812	ATA	2	6	5212	5217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826479
65	NC_021812	AAT	2	6	5283	5288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826479
66	NC_021812	GGT	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826479
67	NC_021812	TAA	2	6	5426	5431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826479
68	NC_021812	TTA	2	6	5445	5450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826479
69	NC_021812	AAG	2	6	5483	5488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826479
70	NC_021812	AAG	2	6	5491	5496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826479
71	NC_021812	GAT	2	6	5574	5579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826479
72	NC_021812	ATG	2	6	5581	5586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826479
73	NC_021812	CGC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826479
74	NC_021812	CTT	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826480
75	NC_021812	TAA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826480
76	NC_021812	GTC	2	6	5933	5938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826480
77	NC_021812	CTG	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826480
78	NC_021812	GCG	2	6	6004	6009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826480
79	NC_021812	CGG	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826480
80	NC_021812	CAG	2	6	6080	6085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826480
81	NC_021812	TCG	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826480
82	NC_021812	TCA	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826480
83	NC_021812	CGG	2	6	6193	6198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826480
84	NC_021812	CTT	2	6	6223	6228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826480
85	NC_021812	GGC	2	6	6230	6235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826480
86	NC_021812	GCA	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826480
87	NC_021812	CGC	2	6	6448	6453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826480
88	NC_021812	TCT	2	6	6463	6468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826480
89	NC_021812	TCT	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826480
90	NC_021812	GAT	2	6	6572	6577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826480
91	NC_021812	AGC	2	6	6592	6597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826480
92	NC_021812	CGA	2	6	6886	6891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826480
93	NC_021812	TTG	2	6	7056	7061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826481
94	NC_021812	TCA	2	6	7121	7126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826481
95	NC_021812	CAA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826481
96	NC_021812	ATT	2	6	7231	7236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826481
97	NC_021812	TGA	2	6	7248	7253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826481
98	NC_021812	GCC	2	6	7273	7278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826481
99	NC_021812	GCC	3	9	7282	7290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826481
100	NC_021812	TCG	2	6	7328	7333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826481
101	NC_021812	GTG	2	6	7415	7420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826481
102	NC_021812	CAG	2	6	7426	7431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826481
103	NC_021812	CAA	2	6	7590	7595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826481
104	NC_021812	TGG	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826482
105	NC_021812	GCC	2	6	8134	8139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826482
106	NC_021812	TCG	2	6	8150	8155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826482
107	NC_021812	GAA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826483
108	NC_021812	ACG	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826483
109	NC_021812	CCG	2	6	8476	8481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826483
110	NC_021812	GCA	2	6	8509	8514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826483
111	NC_021812	CAT	2	6	8521	8526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826483
112	NC_021812	CAG	2	6	8585	8590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826483
113	NC_021812	CAG	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826483
114	NC_021812	GAT	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826483
115	NC_021812	GTC	2	6	8675	8680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826483
116	NC_021812	CCA	2	6	8704	8709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826483
117	NC_021812	CCA	2	6	8737	8742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826483
118	NC_021812	CAG	2	6	8744	8749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826483
119	NC_021812	GCC	2	6	8754	8759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826483
120	NC_021812	GGC	2	6	8873	8878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826483
121	NC_021812	CGG	2	6	8893	8898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826483
122	NC_021812	GCC	2	6	8909	8914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826483
123	NC_021812	GCA	2	6	9058	9063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826483
124	NC_021812	GCA	2	6	9118	9123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826483
125	NC_021812	GCC	2	6	9212	9217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826483
126	NC_021812	CAG	2	6	9218	9223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826483
127	NC_021812	CAG	2	6	9254	9259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826483
128	NC_021812	GGC	2	6	9335	9340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826483
129	NC_021812	GAA	2	6	9551	9556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826483
130	NC_021812	CAC	2	6	9623	9628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826483
131	NC_021812	CGG	2	6	9634	9639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826483
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133	NC_021812	GCG	2	6	9721	9726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826483
134	NC_021812	AAT	2	6	9770	9775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826483
135	NC_021812	AAT	2	6	9882	9887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826483
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159	NC_021812	CCG	2	6	11777	11782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826485
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162	NC_021812	TCA	2	6	11859	11864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826485
163	NC_021812	TAA	2	6	11923	11928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826485
164	NC_021812	TCA	2	6	12078	12083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826485
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253	NC_021812	CGG	2	6	18938	18943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826492
254	NC_021812	AAT	2	6	18958	18963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826492
255	NC_021812	AAT	2	6	19017	19022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826492
256	NC_021812	CAA	3	9	19101	19109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826492
257	NC_021812	ATA	3	9	19141	19149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826492
258	NC_021812	GCA	2	6	19180	19185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826492
259	NC_021812	ACG	2	6	19231	19236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826492
260	NC_021812	GCT	2	6	19317	19322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826492
261	NC_021812	GCT	2	6	19377	19382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826492
262	NC_021812	TTC	2	6	19792	19797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826493
263	NC_021812	AAG	2	6	19822	19827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826493
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265	NC_021812	TGA	2	6	19874	19879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826493
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267	NC_021812	GAT	2	6	19950	19955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826493
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269	NC_021812	GGC	2	6	20374	20379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826494
270	NC_021812	TGT	2	6	20606	20611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826495
271	NC_021812	ATG	2	6	20745	20750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826495
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273	NC_021812	CTG	2	6	21147	21152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826495
274	NC_021812	TAT	2	6	21222	21227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826495
275	NC_021812	AGC	2	6	21550	21555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826495
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281	NC_021812	CGG	2	6	22040	22045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826496
282	NC_021812	ATC	2	6	22135	22140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826496
283	NC_021812	GGT	2	6	22215	22220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826496
284	NC_021812	GCC	2	6	22243	22248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826496
285	NC_021812	CGG	3	9	22286	22294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826496
286	NC_021812	TGT	2	6	22297	22302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826496
287	NC_021812	TCC	2	6	22318	22323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826496
288	NC_021812	GAC	2	6	22374	22379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826496
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