MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_01

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021811	TTGCCG	2	12	3775	3786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811118
2	NC_021811	ACCGGA	2	12	12001	12012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811127
3	NC_021811	GAAAAG	2	12	12194	12205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525811127
4	NC_021811	TACCGG	2	12	14616	14627	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525811128
5	NC_021811	GATATC	2	12	26911	26922	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525811141
6	NC_021811	TCATCC	2	12	31092	31103	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525811143
7	NC_021811	GTACGG	2	12	37002	37013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525811151
8	NC_021811	TCCGGC	2	12	42736	42747	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525811157
9	NC_021811	CCAGCG	2	12	43106	43117	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525811157
10	NC_021811	CTCATC	2	12	44000	44011	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525811158
11	NC_021811	TTCCAG	2	12	48146	48157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525811168
12	NC_021811	CAGCGG	2	12	54442	54453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525811176
13	NC_021811	ATCAGC	2	12	59036	59047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525811181
14	NC_021811	ATTCTC	2	12	59267	59278	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525811181
15	NC_021811	GGATCG	2	12	63672	63683	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525811186
16	NC_021811	AATTCA	2	12	79704	79715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525811201
17	NC_021811	TGGACG	2	12	85694	85705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525811209
18	NC_021811	TTCGGG	2	12	88418	88429	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525811212
19	NC_021811	TTACCT	2	12	90525	90536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525811215
20	NC_021811	GGGAAT	2	12	92146	92157	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525811217
21	NC_021811	TTTCAC	2	12	94178	94189	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525811218
22	NC_021811	TTTTCC	2	12	116633	116644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811241

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.