MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_01

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021811	GGCT	2	8	292	299	0 %	25 %	50 %	25 %	525811114
2	NC_021811	AGGA	2	8	539	546	50 %	0 %	50 %	0 %	525811114
3	NC_021811	ACCA	2	8	980	987	50 %	0 %	0 %	50 %	525811115
4	NC_021811	TGAT	2	8	1003	1010	25 %	50 %	25 %	0 %	525811115
5	NC_021811	TCGG	2	8	1018	1025	0 %	25 %	50 %	25 %	525811115
6	NC_021811	GGCA	2	8	1046	1053	25 %	0 %	50 %	25 %	525811115
7	NC_021811	CAGG	2	8	1560	1567	25 %	0 %	50 %	25 %	525811115
8	NC_021811	GAAG	2	8	2377	2384	50 %	0 %	50 %	0 %	525811117
9	NC_021811	ATGC	2	8	2470	2477	25 %	25 %	25 %	25 %	525811117
10	NC_021811	CATC	2	8	2616	2623	25 %	25 %	0 %	50 %	525811117
11	NC_021811	CGCC	2	8	3026	3033	0 %	0 %	25 %	75 %	525811118
12	NC_021811	GCTG	2	8	3061	3068	0 %	25 %	50 %	25 %	525811118
13	NC_021811	ACAG	2	8	3326	3333	50 %	0 %	25 %	25 %	525811118
14	NC_021811	TGGA	2	8	3757	3764	25 %	25 %	50 %	0 %	525811118
15	NC_021811	ATGA	2	8	4599	4606	50 %	25 %	25 %	0 %	525811118
16	NC_021811	CAAA	2	8	4676	4683	75 %	0 %	0 %	25 %	525811118
17	NC_021811	TTCC	2	8	4764	4771	0 %	50 %	0 %	50 %	525811118
18	NC_021811	CAGA	2	8	5215	5222	50 %	0 %	25 %	25 %	525811118
19	NC_021811	ATTC	2	8	5915	5922	25 %	50 %	0 %	25 %	525811118
20	NC_021811	CAGG	2	8	6611	6618	25 %	0 %	50 %	25 %	525811118
21	NC_021811	GAGC	2	8	6797	6804	25 %	0 %	50 %	25 %	525811119
22	NC_021811	CTGT	2	8	6865	6872	0 %	50 %	25 %	25 %	525811119
23	NC_021811	TGAA	2	8	6975	6982	50 %	25 %	25 %	0 %	525811119
24	NC_021811	CAGC	2	8	7285	7292	25 %	0 %	25 %	50 %	525811120
25	NC_021811	AAGA	2	8	7465	7472	75 %	0 %	25 %	0 %	525811120
26	NC_021811	ACGC	2	8	7806	7813	25 %	0 %	25 %	50 %	525811121
27	NC_021811	CTGC	2	8	7904	7911	0 %	25 %	25 %	50 %	525811121
28	NC_021811	ACCA	2	8	8395	8402	50 %	0 %	0 %	50 %	525811121
29	NC_021811	GTTC	2	8	8564	8571	0 %	50 %	25 %	25 %	525811121
30	NC_021811	GAAA	2	8	8744	8751	75 %	0 %	25 %	0 %	525811122
31	NC_021811	ACCA	2	8	9174	9181	50 %	0 %	0 %	50 %	525811122
32	NC_021811	TGTT	2	8	9821	9828	0 %	75 %	25 %	0 %	525811122
33	NC_021811	ATCG	2	8	11183	11190	25 %	25 %	25 %	25 %	525811124
34	NC_021811	CTGG	2	8	11578	11585	0 %	25 %	50 %	25 %	525811125
35	NC_021811	TCTA	2	8	11592	11599	25 %	50 %	0 %	25 %	525811125
36	NC_021811	GTCT	2	8	12252	12259	0 %	50 %	25 %	25 %	525811127
37	NC_021811	CATC	2	8	12449	12456	25 %	25 %	0 %	50 %	525811127
38	NC_021811	ATTC	2	8	12693	12700	25 %	50 %	0 %	25 %	525811127
39	NC_021811	TTGA	2	8	12717	12724	25 %	50 %	25 %	0 %	525811127
40	NC_021811	CCTC	2	8	12781	12788	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_021811	GACA	2	8	12928	12935	50 %	0 %	25 %	25 %	525811128
42	NC_021811	GCTG	2	8	13298	13305	0 %	25 %	50 %	25 %	525811128
43	NC_021811	CAGA	2	8	13555	13562	50 %	0 %	25 %	25 %	525811128
44	NC_021811	CCTG	2	8	13596	13603	0 %	25 %	25 %	50 %	525811128
45	NC_021811	CAGC	2	8	13612	13619	25 %	0 %	25 %	50 %	525811128
46	NC_021811	GGCG	2	8	13719	13726	0 %	0 %	75 %	25 %	525811128
47	NC_021811	TACA	2	8	14240	14247	50 %	25 %	0 %	25 %	525811128
48	NC_021811	GAAA	2	8	14470	14477	75 %	0 %	25 %	0 %	525811128
49	NC_021811	GCAG	2	8	15118	15125	25 %	0 %	50 %	25 %	525811128
50	NC_021811	CGGG	2	8	15778	15785	0 %	0 %	75 %	25 %	525811128
51	NC_021811	ATCA	2	8	16625	16632	50 %	25 %	0 %	25 %	525811130
52	NC_021811	CCGC	2	8	17571	17578	0 %	0 %	25 %	75 %	525811130
53	NC_021811	CAAT	2	8	17616	17623	50 %	25 %	0 %	25 %	525811130
54	NC_021811	CCAT	2	8	17721	17728	25 %	25 %	0 %	50 %	525811131
55	NC_021811	GCCA	2	8	17904	17911	25 %	0 %	25 %	50 %	525811131
56	NC_021811	TGGC	2	8	18206	18213	0 %	25 %	50 %	25 %	525811131
57	NC_021811	TTAA	2	8	18297	18304	50 %	50 %	0 %	0 %	525811132
58	NC_021811	CAGC	2	8	19039	19046	25 %	0 %	25 %	50 %	525811132
59	NC_021811	GGGT	2	8	19371	19378	0 %	25 %	75 %	0 %	525811132
60	NC_021811	GCTG	2	8	19433	19440	0 %	25 %	50 %	25 %	525811132
61	NC_021811	TACC	2	8	19950	19957	25 %	25 %	0 %	50 %	525811132
62	NC_021811	CATT	2	8	19966	19973	25 %	50 %	0 %	25 %	525811132
63	NC_021811	CCTA	2	8	20326	20333	25 %	25 %	0 %	50 %	525811132
64	NC_021811	AAGG	2	8	20640	20647	50 %	0 %	50 %	0 %	525811133
65	NC_021811	CTTT	2	8	20669	20676	0 %	75 %	0 %	25 %	525811133
66	NC_021811	ACAA	2	8	20844	20851	75 %	0 %	0 %	25 %	525811133
67	NC_021811	TATC	2	8	20961	20968	25 %	50 %	0 %	25 %	525811133
68	NC_021811	CTCC	2	8	21247	21254	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_021811	AATC	2	8	21522	21529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021811	CACT	2	8	21552	21559	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021811	TGAA	2	8	21614	21621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021811	CAGA	2	8	21721	21728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021811	CAGC	2	8	21844	21851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021811	CATT	2	8	21853	21860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021811	ATTA	2	8	21880	21887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021811	CCAC	2	8	22542	22549	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_021811	AACC	2	8	22665	22672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021811	TTGA	2	8	23301	23308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021811	AAAT	2	8	23462	23469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021811	TGAT	2	8	24931	24938	25 %	50 %	25 %	0 %	525811140
81	NC_021811	CCTG	2	8	24982	24989	0 %	25 %	25 %	50 %	525811140
82	NC_021811	ACAG	2	8	25145	25152	50 %	0 %	25 %	25 %	525811140
83	NC_021811	GAAC	2	8	25371	25378	50 %	0 %	25 %	25 %	525811140
84	NC_021811	CCTG	2	8	25398	25405	0 %	25 %	25 %	50 %	525811140
85	NC_021811	ACCG	2	8	25503	25510	25 %	0 %	25 %	50 %	525811140
86	NC_021811	GACA	2	8	27242	27249	50 %	0 %	25 %	25 %	525811141
87	NC_021811	TTGA	2	8	27472	27479	25 %	50 %	25 %	0 %	525811141
88	NC_021811	CTTC	2	8	28238	28245	0 %	50 %	0 %	50 %	525811142
89	NC_021811	TTGT	2	8	28348	28355	0 %	75 %	25 %	0 %	525811142
90	NC_021811	CAGC	2	8	29073	29080	25 %	0 %	25 %	50 %	525811142
91	NC_021811	CAAA	2	8	29115	29122	75 %	0 %	0 %	25 %	525811142
92	NC_021811	CTTT	2	8	29378	29385	0 %	75 %	0 %	25 %	525811142
93	NC_021811	GCCA	2	8	29541	29548	25 %	0 %	25 %	50 %	525811142
94	NC_021811	CCAT	2	8	29978	29985	25 %	25 %	0 %	50 %	525811142
95	NC_021811	GTTT	2	8	30119	30126	0 %	75 %	25 %	0 %	525811142
96	NC_021811	GGCA	2	8	30252	30259	25 %	0 %	50 %	25 %	525811142
97	NC_021811	TGCC	2	8	30514	30521	0 %	25 %	25 %	50 %	525811142
98	NC_021811	CGAA	2	8	30786	30793	50 %	0 %	25 %	25 %	525811142
99	NC_021811	AACA	2	8	30941	30948	75 %	0 %	0 %	25 %	525811143
100	NC_021811	TCAC	2	8	31170	31177	25 %	25 %	0 %	50 %	525811143
101	NC_021811	CAGG	2	8	31708	31715	25 %	0 %	50 %	25 %	525811144
102	NC_021811	ATCA	2	8	32221	32228	50 %	25 %	0 %	25 %	525811145
103	NC_021811	GCTG	2	8	32325	32332	0 %	25 %	50 %	25 %	525811145
104	NC_021811	ATGT	2	8	32919	32926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021811	TTAT	2	8	33185	33192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021811	TGCA	2	8	34228	34235	25 %	25 %	25 %	25 %	525811148
107	NC_021811	TGGA	2	8	34366	34373	25 %	25 %	50 %	0 %	525811148
108	NC_021811	CCGG	2	8	34911	34918	0 %	0 %	50 %	50 %	525811148
109	NC_021811	GGCG	2	8	35256	35263	0 %	0 %	75 %	25 %	525811148
110	NC_021811	CCAG	2	8	35620	35627	25 %	0 %	25 %	50 %	525811149
111	NC_021811	CCGG	2	8	35735	35742	0 %	0 %	50 %	50 %	525811150
112	NC_021811	AGGC	2	8	36113	36120	25 %	0 %	50 %	25 %	525811150
113	NC_021811	AGTG	2	8	36470	36477	25 %	25 %	50 %	0 %	525811151
114	NC_021811	CAGC	2	8	36707	36714	25 %	0 %	25 %	50 %	525811151
115	NC_021811	CCAG	2	8	36986	36993	25 %	0 %	25 %	50 %	525811151
116	NC_021811	ATAG	2	8	37750	37757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021811	CGTC	2	8	38389	38396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021811	CAGG	2	8	38921	38928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021811	CAGC	2	8	39098	39105	25 %	0 %	25 %	50 %	525811153
120	NC_021811	ACGA	2	8	39654	39661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021811	TCGC	2	8	40247	40254	0 %	25 %	25 %	50 %	525811154
122	NC_021811	ACGG	2	8	40943	40950	25 %	0 %	50 %	25 %	525811155
123	NC_021811	CAGC	2	8	41028	41035	25 %	0 %	25 %	50 %	525811155
124	NC_021811	GAAA	2	8	41133	41140	75 %	0 %	25 %	0 %	525811155
125	NC_021811	GTGA	2	8	41598	41605	25 %	25 %	50 %	0 %	525811156
126	NC_021811	CCAG	2	8	41820	41827	25 %	0 %	25 %	50 %	525811157
127	NC_021811	CCTT	2	8	42229	42236	0 %	50 %	0 %	50 %	525811157
128	NC_021811	GCGT	2	8	42398	42405	0 %	25 %	50 %	25 %	525811157
129	NC_021811	GTTC	2	8	42695	42702	0 %	50 %	25 %	25 %	525811157
130	NC_021811	CAGG	2	8	43466	43473	25 %	0 %	50 %	25 %	525811157
131	NC_021811	GCTT	2	8	43668	43675	0 %	50 %	25 %	25 %	525811157
132	NC_021811	CTGC	2	8	45670	45677	0 %	25 %	25 %	50 %	525811163
133	NC_021811	CCGT	2	8	46004	46011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021811	AGAC	2	8	46387	46394	50 %	0 %	25 %	25 %	525811164
135	NC_021811	GCCA	2	8	46991	46998	25 %	0 %	25 %	50 %	525811166
136	NC_021811	GCCA	2	8	47300	47307	25 %	0 %	25 %	50 %	525811166
137	NC_021811	ACTG	2	8	47370	47377	25 %	25 %	25 %	25 %	525811166
138	NC_021811	TCAT	2	8	48264	48271	25 %	50 %	0 %	25 %	525811168
139	NC_021811	CTGC	2	8	48513	48520	0 %	25 %	25 %	50 %	525811169
140	NC_021811	CCGG	2	8	49283	49290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021811	GCCC	2	8	49396	49403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_021811	GCCA	2	8	49555	49562	25 %	0 %	25 %	50 %	525811170
143	NC_021811	TGAA	2	8	49677	49684	50 %	25 %	25 %	0 %	525811170
144	NC_021811	CAGC	2	8	50090	50097	25 %	0 %	25 %	50 %	525811170
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147	NC_021811	TGTT	2	8	52747	52754	0 %	75 %	25 %	0 %	525811174
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152	NC_021811	CTCA	2	8	55134	55141	25 %	25 %	0 %	50 %	525811177
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162	NC_021811	AGCA	2	8	58931	58938	50 %	0 %	25 %	25 %	525811181
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165	NC_021811	AGTA	2	8	61203	61210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021811	TTTA	2	8	61300	61307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021811	CCAG	2	8	61505	61512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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187	NC_021811	GATT	2	8	68680	68687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_021811	GTTC	2	8	69272	69279	0 %	50 %	25 %	25 %	525811191
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245	NC_021811	TGCC	2	8	91633	91640	0 %	25 %	25 %	50 %	525811216
246	NC_021811	TGTA	2	8	91663	91670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
247	NC_021811	GCTA	2	8	91684	91691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
248	NC_021811	CCAG	2	8	93280	93287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
249	NC_021811	TTTG	2	8	93670	93677	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_021811	GAAA	2	8	97439	97446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021811	GGCC	2	8	97487	97494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
262	NC_021811	TTAT	2	8	98168	98175	25 %	75 %	0 %	0 %	525811222
263	NC_021811	GTCC	2	8	98400	98407	0 %	25 %	25 %	50 %	525811223
264	NC_021811	ACAT	2	8	98860	98867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
265	NC_021811	TTCT	2	8	98994	99001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
266	NC_021811	ACAG	2	8	99173	99180	50 %	0 %	25 %	25 %	525811224
267	NC_021811	TTTA	2	8	99398	99405	25 %	75 %	0 %	0 %	525811225
268	NC_021811	AATA	2	8	100287	100294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_021811	CGGA	2	8	100430	100437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
270	NC_021811	AACA	2	8	100481	100488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
271	NC_021811	GTCA	2	8	100867	100874	25 %	25 %	25 %	25 %	525811226
272	NC_021811	GGCA	2	8	101319	101326	25 %	0 %	50 %	25 %	525811226
273	NC_021811	GGCA	2	8	101981	101988	25 %	0 %	50 %	25 %	525811227
274	NC_021811	CTGA	2	8	102634	102641	25 %	25 %	25 %	25 %	525811228
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276	NC_021811	ACGA	2	8	104562	104569	50 %	0 %	25 %	25 %	525811229
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278	NC_021811	CAGC	2	8	105356	105363	25 %	0 %	25 %	50 %	525811230
279	NC_021811	AAAC	2	8	105524	105531	75 %	0 %	0 %	25 %	525811231
280	NC_021811	GGAA	2	8	106125	106132	50 %	0 %	50 %	0 %	525811231
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282	NC_021811	CAGC	2	8	106551	106558	25 %	0 %	25 %	50 %	525811231
283	NC_021811	CTGG	2	8	106869	106876	0 %	25 %	50 %	25 %	525811231
284	NC_021811	ACAA	2	8	108323	108330	75 %	0 %	0 %	25 %	525811233
285	NC_021811	TAAC	2	8	108616	108623	50 %	25 %	0 %	25 %	525811233
286	NC_021811	ACAA	2	8	108717	108724	75 %	0 %	0 %	25 %	525811233
287	NC_021811	CCCG	2	8	108822	108829	0 %	0 %	25 %	75 %	525811234
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289	NC_021811	GACA	2	8	109209	109216	50 %	0 %	25 %	25 %	525811234
290	NC_021811	AGGC	2	8	109295	109302	25 %	0 %	50 %	25 %	525811234
291	NC_021811	CAAA	2	8	110065	110072	75 %	0 %	0 %	25 %	525811236
292	NC_021811	TGGT	2	8	110769	110776	0 %	50 %	50 %	0 %	525811236
293	NC_021811	GGCT	2	8	110797	110804	0 %	25 %	50 %	25 %	525811236
294	NC_021811	ATAA	2	8	111486	111493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021811	ACTG	2	8	111818	111825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
296	NC_021811	TGCG	2	8	112136	112143	0 %	25 %	50 %	25 %	525811237
297	NC_021811	CAAG	2	8	112204	112211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
298	NC_021811	CGGT	2	8	112474	112481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
299	NC_021811	AATT	2	8	112498	112505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_021811	TTAA	2	8	112689	112696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_021811	TACA	2	8	113182	113189	50 %	25 %	0 %	25 %	525811238
302	NC_021811	CGTT	2	8	113194	113201	0 %	50 %	25 %	25 %	525811238
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309	NC_021811	CATC	2	8	117223	117230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
310	NC_021811	CCAG	2	8	117299	117306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
311	NC_021811	ATTT	2	8	117363	117370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_021811	AAAC	2	8	117393	117400	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
313	NC_021811	CTGT	2	8	117407	117414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
314	NC_021811	CTGG	2	8	117506	117513	0 %	25 %	50 %	25 %	525811242
315	NC_021811	GAAC	2	8	117718	117725	50 %	0 %	25 %	25 %	525811242

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.