MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_01

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021811	CCTC	2	8	12781	12788	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_021811	CTCC	2	8	21247	21254	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_021811	AATC	2	8	21522	21529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021811	CACT	2	8	21552	21559	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021811	TGAA	2	8	21614	21621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021811	CAGA	2	8	21721	21728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021811	CAGC	2	8	21844	21851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021811	CATT	2	8	21853	21860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021811	ATTA	2	8	21880	21887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021811	CCAC	2	8	22542	22549	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_021811	AACC	2	8	22665	22672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021811	TTGA	2	8	23301	23308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021811	AAAT	2	8	23462	23469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021811	ATGT	2	8	32919	32926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021811	TTAT	2	8	33185	33192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021811	ATAG	2	8	37750	37757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021811	CGTC	2	8	38389	38396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021811	CAGG	2	8	38921	38928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021811	ACGA	2	8	39654	39661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021811	CCGT	2	8	46004	46011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021811	CCGG	2	8	49283	49290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021811	GCCC	2	8	49396	49403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_021811	AGCG	2	8	53991	53998	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021811	CATC	2	8	55450	55457	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021811	GGAG	2	8	55751	55758	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021811	AGTA	2	8	61203	61210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021811	TTTA	2	8	61300	61307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021811	CCAG	2	8	61505	61512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021811	AAAT	2	8	63137	63144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021811	CAAC	2	8	63224	63231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021811	GCTT	2	8	63880	63887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021811	TAAA	2	8	65158	65165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021811	GATT	2	8	68680	68687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021811	AAGG	2	8	71206	71213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021811	AGCG	2	8	72448	72455	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021811	GATT	2	8	75554	75561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021811	CCAG	2	8	90867	90874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021811	ACAT	2	8	90984	90991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021811	TGTA	2	8	91663	91670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021811	GCTA	2	8	91684	91691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021811	CCAG	2	8	93280	93287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021811	TTTG	2	8	93670	93677	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021811	AAGA	2	8	95029	95036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021811	TCTT	2	8	95345	95352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021811	GAAA	2	8	97439	97446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021811	GGCC	2	8	97487	97494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021811	ACAT	2	8	98860	98867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021811	TTCT	2	8	98994	99001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021811	AATA	2	8	100287	100294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021811	CGGA	2	8	100430	100437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021811	AACA	2	8	100481	100488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021811	ATAA	2	8	111486	111493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021811	ACTG	2	8	111818	111825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021811	CAAG	2	8	112204	112211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021811	CGGT	2	8	112474	112481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021811	AATT	2	8	112498	112505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021811	TTAA	2	8	112689	112696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021811	CATC	2	8	117223	117230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021811	CCAG	2	8	117299	117306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021811	ATTT	2	8	117363	117370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021811	AAAC	2	8	117393	117400	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021811	CTGT	2	8	117407	117414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.