MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_01

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021811	GGCT	2	8	292	299	0 %	25 %	50 %	25 %	525811114
2	NC_021811	AGGA	2	8	539	546	50 %	0 %	50 %	0 %	525811114
3	NC_021811	ACCA	2	8	980	987	50 %	0 %	0 %	50 %	525811115
4	NC_021811	TGAT	2	8	1003	1010	25 %	50 %	25 %	0 %	525811115
5	NC_021811	TCGG	2	8	1018	1025	0 %	25 %	50 %	25 %	525811115
6	NC_021811	GGCA	2	8	1046	1053	25 %	0 %	50 %	25 %	525811115
7	NC_021811	CAGG	2	8	1560	1567	25 %	0 %	50 %	25 %	525811115
8	NC_021811	GAAG	2	8	2377	2384	50 %	0 %	50 %	0 %	525811117
9	NC_021811	ATGC	2	8	2470	2477	25 %	25 %	25 %	25 %	525811117
10	NC_021811	CATC	2	8	2616	2623	25 %	25 %	0 %	50 %	525811117
11	NC_021811	CGCC	2	8	3026	3033	0 %	0 %	25 %	75 %	525811118
12	NC_021811	GCTG	2	8	3061	3068	0 %	25 %	50 %	25 %	525811118
13	NC_021811	ACAG	2	8	3326	3333	50 %	0 %	25 %	25 %	525811118
14	NC_021811	TGGA	2	8	3757	3764	25 %	25 %	50 %	0 %	525811118
15	NC_021811	ATGA	2	8	4599	4606	50 %	25 %	25 %	0 %	525811118
16	NC_021811	CAAA	2	8	4676	4683	75 %	0 %	0 %	25 %	525811118
17	NC_021811	TTCC	2	8	4764	4771	0 %	50 %	0 %	50 %	525811118
18	NC_021811	CAGA	2	8	5215	5222	50 %	0 %	25 %	25 %	525811118
19	NC_021811	ATTC	2	8	5915	5922	25 %	50 %	0 %	25 %	525811118
20	NC_021811	CAGG	2	8	6611	6618	25 %	0 %	50 %	25 %	525811118
21	NC_021811	GAGC	2	8	6797	6804	25 %	0 %	50 %	25 %	525811119
22	NC_021811	CTGT	2	8	6865	6872	0 %	50 %	25 %	25 %	525811119
23	NC_021811	TGAA	2	8	6975	6982	50 %	25 %	25 %	0 %	525811119
24	NC_021811	CAGC	2	8	7285	7292	25 %	0 %	25 %	50 %	525811120
25	NC_021811	AAGA	2	8	7465	7472	75 %	0 %	25 %	0 %	525811120
26	NC_021811	ACGC	2	8	7806	7813	25 %	0 %	25 %	50 %	525811121
27	NC_021811	CTGC	2	8	7904	7911	0 %	25 %	25 %	50 %	525811121
28	NC_021811	ACCA	2	8	8395	8402	50 %	0 %	0 %	50 %	525811121
29	NC_021811	GTTC	2	8	8564	8571	0 %	50 %	25 %	25 %	525811121
30	NC_021811	GAAA	2	8	8744	8751	75 %	0 %	25 %	0 %	525811122
31	NC_021811	ACCA	2	8	9174	9181	50 %	0 %	0 %	50 %	525811122
32	NC_021811	TGTT	2	8	9821	9828	0 %	75 %	25 %	0 %	525811122
33	NC_021811	ATCG	2	8	11183	11190	25 %	25 %	25 %	25 %	525811124
34	NC_021811	CTGG	2	8	11578	11585	0 %	25 %	50 %	25 %	525811125
35	NC_021811	TCTA	2	8	11592	11599	25 %	50 %	0 %	25 %	525811125
36	NC_021811	GTCT	2	8	12252	12259	0 %	50 %	25 %	25 %	525811127
37	NC_021811	CATC	2	8	12449	12456	25 %	25 %	0 %	50 %	525811127
38	NC_021811	ATTC	2	8	12693	12700	25 %	50 %	0 %	25 %	525811127
39	NC_021811	TTGA	2	8	12717	12724	25 %	50 %	25 %	0 %	525811127
40	NC_021811	GACA	2	8	12928	12935	50 %	0 %	25 %	25 %	525811128
41	NC_021811	GCTG	2	8	13298	13305	0 %	25 %	50 %	25 %	525811128
42	NC_021811	CAGA	2	8	13555	13562	50 %	0 %	25 %	25 %	525811128
43	NC_021811	CCTG	2	8	13596	13603	0 %	25 %	25 %	50 %	525811128
44	NC_021811	CAGC	2	8	13612	13619	25 %	0 %	25 %	50 %	525811128
45	NC_021811	GGCG	2	8	13719	13726	0 %	0 %	75 %	25 %	525811128
46	NC_021811	TACA	2	8	14240	14247	50 %	25 %	0 %	25 %	525811128
47	NC_021811	GAAA	2	8	14470	14477	75 %	0 %	25 %	0 %	525811128
48	NC_021811	GCAG	2	8	15118	15125	25 %	0 %	50 %	25 %	525811128
49	NC_021811	CGGG	2	8	15778	15785	0 %	0 %	75 %	25 %	525811128
50	NC_021811	ATCA	2	8	16625	16632	50 %	25 %	0 %	25 %	525811130
51	NC_021811	CCGC	2	8	17571	17578	0 %	0 %	25 %	75 %	525811130
52	NC_021811	CAAT	2	8	17616	17623	50 %	25 %	0 %	25 %	525811130
53	NC_021811	CCAT	2	8	17721	17728	25 %	25 %	0 %	50 %	525811131
54	NC_021811	GCCA	2	8	17904	17911	25 %	0 %	25 %	50 %	525811131
55	NC_021811	TGGC	2	8	18206	18213	0 %	25 %	50 %	25 %	525811131
56	NC_021811	TTAA	2	8	18297	18304	50 %	50 %	0 %	0 %	525811132
57	NC_021811	CAGC	2	8	19039	19046	25 %	0 %	25 %	50 %	525811132
58	NC_021811	GGGT	2	8	19371	19378	0 %	25 %	75 %	0 %	525811132
59	NC_021811	GCTG	2	8	19433	19440	0 %	25 %	50 %	25 %	525811132
60	NC_021811	TACC	2	8	19950	19957	25 %	25 %	0 %	50 %	525811132
61	NC_021811	CATT	2	8	19966	19973	25 %	50 %	0 %	25 %	525811132
62	NC_021811	CCTA	2	8	20326	20333	25 %	25 %	0 %	50 %	525811132
63	NC_021811	AAGG	2	8	20640	20647	50 %	0 %	50 %	0 %	525811133
64	NC_021811	CTTT	2	8	20669	20676	0 %	75 %	0 %	25 %	525811133
65	NC_021811	ACAA	2	8	20844	20851	75 %	0 %	0 %	25 %	525811133
66	NC_021811	TATC	2	8	20961	20968	25 %	50 %	0 %	25 %	525811133
67	NC_021811	TGAT	2	8	24931	24938	25 %	50 %	25 %	0 %	525811140
68	NC_021811	CCTG	2	8	24982	24989	0 %	25 %	25 %	50 %	525811140
69	NC_021811	ACAG	2	8	25145	25152	50 %	0 %	25 %	25 %	525811140
70	NC_021811	GAAC	2	8	25371	25378	50 %	0 %	25 %	25 %	525811140
71	NC_021811	CCTG	2	8	25398	25405	0 %	25 %	25 %	50 %	525811140
72	NC_021811	ACCG	2	8	25503	25510	25 %	0 %	25 %	50 %	525811140
73	NC_021811	GACA	2	8	27242	27249	50 %	0 %	25 %	25 %	525811141
74	NC_021811	TTGA	2	8	27472	27479	25 %	50 %	25 %	0 %	525811141
75	NC_021811	CTTC	2	8	28238	28245	0 %	50 %	0 %	50 %	525811142
76	NC_021811	TTGT	2	8	28348	28355	0 %	75 %	25 %	0 %	525811142
77	NC_021811	CAGC	2	8	29073	29080	25 %	0 %	25 %	50 %	525811142
78	NC_021811	CAAA	2	8	29115	29122	75 %	0 %	0 %	25 %	525811142
79	NC_021811	CTTT	2	8	29378	29385	0 %	75 %	0 %	25 %	525811142
80	NC_021811	GCCA	2	8	29541	29548	25 %	0 %	25 %	50 %	525811142
81	NC_021811	CCAT	2	8	29978	29985	25 %	25 %	0 %	50 %	525811142
82	NC_021811	GTTT	2	8	30119	30126	0 %	75 %	25 %	0 %	525811142
83	NC_021811	GGCA	2	8	30252	30259	25 %	0 %	50 %	25 %	525811142
84	NC_021811	TGCC	2	8	30514	30521	0 %	25 %	25 %	50 %	525811142
85	NC_021811	CGAA	2	8	30786	30793	50 %	0 %	25 %	25 %	525811142
86	NC_021811	AACA	2	8	30941	30948	75 %	0 %	0 %	25 %	525811143
87	NC_021811	TCAC	2	8	31170	31177	25 %	25 %	0 %	50 %	525811143
88	NC_021811	CAGG	2	8	31708	31715	25 %	0 %	50 %	25 %	525811144
89	NC_021811	ATCA	2	8	32221	32228	50 %	25 %	0 %	25 %	525811145
90	NC_021811	GCTG	2	8	32325	32332	0 %	25 %	50 %	25 %	525811145
91	NC_021811	TGCA	2	8	34228	34235	25 %	25 %	25 %	25 %	525811148
92	NC_021811	TGGA	2	8	34366	34373	25 %	25 %	50 %	0 %	525811148
93	NC_021811	CCGG	2	8	34911	34918	0 %	0 %	50 %	50 %	525811148
94	NC_021811	GGCG	2	8	35256	35263	0 %	0 %	75 %	25 %	525811148
95	NC_021811	CCAG	2	8	35620	35627	25 %	0 %	25 %	50 %	525811149
96	NC_021811	CCGG	2	8	35735	35742	0 %	0 %	50 %	50 %	525811150
97	NC_021811	AGGC	2	8	36113	36120	25 %	0 %	50 %	25 %	525811150
98	NC_021811	AGTG	2	8	36470	36477	25 %	25 %	50 %	0 %	525811151
99	NC_021811	CAGC	2	8	36707	36714	25 %	0 %	25 %	50 %	525811151
100	NC_021811	CCAG	2	8	36986	36993	25 %	0 %	25 %	50 %	525811151
101	NC_021811	CAGC	2	8	39098	39105	25 %	0 %	25 %	50 %	525811153
102	NC_021811	TCGC	2	8	40247	40254	0 %	25 %	25 %	50 %	525811154
103	NC_021811	ACGG	2	8	40943	40950	25 %	0 %	50 %	25 %	525811155
104	NC_021811	CAGC	2	8	41028	41035	25 %	0 %	25 %	50 %	525811155
105	NC_021811	GAAA	2	8	41133	41140	75 %	0 %	25 %	0 %	525811155
106	NC_021811	GTGA	2	8	41598	41605	25 %	25 %	50 %	0 %	525811156
107	NC_021811	CCAG	2	8	41820	41827	25 %	0 %	25 %	50 %	525811157
108	NC_021811	CCTT	2	8	42229	42236	0 %	50 %	0 %	50 %	525811157
109	NC_021811	GCGT	2	8	42398	42405	0 %	25 %	50 %	25 %	525811157
110	NC_021811	GTTC	2	8	42695	42702	0 %	50 %	25 %	25 %	525811157
111	NC_021811	CAGG	2	8	43466	43473	25 %	0 %	50 %	25 %	525811157
112	NC_021811	GCTT	2	8	43668	43675	0 %	50 %	25 %	25 %	525811157
113	NC_021811	CTGC	2	8	45670	45677	0 %	25 %	25 %	50 %	525811163
114	NC_021811	AGAC	2	8	46387	46394	50 %	0 %	25 %	25 %	525811164
115	NC_021811	GCCA	2	8	46991	46998	25 %	0 %	25 %	50 %	525811166
116	NC_021811	GCCA	2	8	47300	47307	25 %	0 %	25 %	50 %	525811166
117	NC_021811	ACTG	2	8	47370	47377	25 %	25 %	25 %	25 %	525811166
118	NC_021811	TCAT	2	8	48264	48271	25 %	50 %	0 %	25 %	525811168
119	NC_021811	CTGC	2	8	48513	48520	0 %	25 %	25 %	50 %	525811169
120	NC_021811	GCCA	2	8	49555	49562	25 %	0 %	25 %	50 %	525811170
121	NC_021811	TGAA	2	8	49677	49684	50 %	25 %	25 %	0 %	525811170
122	NC_021811	CAGC	2	8	50090	50097	25 %	0 %	25 %	50 %	525811170
123	NC_021811	TTTA	2	8	51592	51599	25 %	75 %	0 %	0 %	525811173
124	NC_021811	GATC	2	8	52080	52087	25 %	25 %	25 %	25 %	525811173
125	NC_021811	TGTT	2	8	52747	52754	0 %	75 %	25 %	0 %	525811174
126	NC_021811	TACC	2	8	53184	53191	25 %	25 %	0 %	50 %	525811175
127	NC_021811	CCTG	2	8	54524	54531	0 %	25 %	25 %	50 %	525811176
128	NC_021811	GCTG	2	8	54586	54593	0 %	25 %	50 %	25 %	525811176
129	NC_021811	CTCA	2	8	55134	55141	25 %	25 %	0 %	50 %	525811177
130	NC_021811	GGAT	2	8	55967	55974	25 %	25 %	50 %	0 %	525811178
131	NC_021811	AATG	2	8	56142	56149	50 %	25 %	25 %	0 %	525811178
132	NC_021811	GCTG	2	8	56276	56283	0 %	25 %	50 %	25 %	525811179
133	NC_021811	GGCT	2	8	56409	56416	0 %	25 %	50 %	25 %	525811179
134	NC_021811	GACG	2	8	56459	56466	25 %	0 %	50 %	25 %	525811179
135	NC_021811	CCGG	2	8	56467	56474	0 %	0 %	50 %	50 %	525811179
136	NC_021811	ATTT	2	8	58205	58212	25 %	75 %	0 %	0 %	525811181
137	NC_021811	AGCA	2	8	58931	58938	50 %	0 %	25 %	25 %	525811181
138	NC_021811	CTGC	2	8	59128	59135	0 %	25 %	25 %	50 %	525811181
139	NC_021811	CTTT	2	8	60130	60137	0 %	75 %	0 %	25 %	525811182
140	NC_021811	GCCA	2	8	61706	61713	25 %	0 %	25 %	50 %	525811183
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.