MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_01

Total Repeats: 268

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021811	GTT	2	6	35	40	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021811	CTT	2	6	41	46	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021811	GGT	2	6	64	69	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021811	CCA	2	6	79	84	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021811	GTC	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021811	TGG	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021811	CCA	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021811	CAC	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021811	CGG	2	6	2854	2859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021811	AGG	2	6	11741	11746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021811	TTC	2	6	12728	12733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021811	ATA	2	6	20549	20554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021811	ACA	2	6	21292	21297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021811	ATG	2	6	21656	21661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021811	CAA	2	6	21729	21734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021811	GAA	2	6	21778	21783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021811	TGT	2	6	22602	22607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021811	CAA	2	6	23033	23038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021811	GCG	2	6	23040	23045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021811	GCC	2	6	23057	23062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021811	CGG	2	6	23247	23252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021811	CTA	2	6	23261	23266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021811	TGT	2	6	23270	23275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021811	CTG	2	6	23331	23336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021811	CAA	2	6	23409	23414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021811	AGG	2	6	31218	31223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021811	CAT	2	6	31307	31312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021811	TGA	2	6	31365	31370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021811	ATG	2	6	31776	31781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021811	GGA	2	6	32730	32735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021811	CAC	2	6	32805	32810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021811	GAC	2	6	32896	32901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021811	GCG	2	6	32965	32970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021811	GAA	2	6	33057	33062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021811	ACG	2	6	33065	33070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021811	CAA	2	6	33074	33079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021811	TGG	2	6	33087	33092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021811	CAC	2	6	33102	33107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021811	TGA	2	6	33212	33217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021811	GGA	2	6	36349	36354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021811	CTG	2	6	36423	36428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021811	TCC	2	6	37410	37415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021811	GCC	2	6	37440	37445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021811	CGG	2	6	37793	37798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021811	TAA	2	6	38030	38035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021811	CGG	2	6	38073	38078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021811	CTG	2	6	38137	38142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021811	TGC	2	6	38250	38255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021811	CTG	2	6	38280	38285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021811	CTT	2	6	38347	38352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021811	CTG	2	6	38490	38495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021811	GGC	2	6	38557	38562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021811	GCG	2	6	38645	38650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021811	CGG	2	6	38728	38733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021811	CAG	2	6	38750	38755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021811	GAC	2	6	38777	38782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021811	GCC	2	6	38788	38793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021811	AAC	2	6	38836	38841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021811	CCT	2	6	38909	38914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021811	CGG	2	6	38950	38955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021811	CCG	2	6	38973	38978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021811	TCC	2	6	39502	39507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021811	AGG	2	6	39685	39690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021811	GCG	2	6	39706	39711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021811	ACG	2	6	39771	39776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021811	GCC	2	6	39837	39842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021811	CGC	2	6	39877	39882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021811	ACC	2	6	39894	39899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021811	GCC	2	6	41718	41723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_021811	CGG	2	6	41731	41736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021811	GTT	2	6	41746	41751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021811	ATC	2	6	43714	43719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021811	CCT	2	6	44595	44600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021811	CTC	2	6	44671	44676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021811	GGC	2	6	45333	45338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021811	GGC	2	6	45989	45994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021811	GCC	2	6	45998	46003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021811	TCC	2	6	46448	46453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021811	GTT	2	6	46454	46459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021811	CGG	2	6	46786	46791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021811	CGC	2	6	47656	47661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021811	GGC	2	6	47667	47672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021811	CGT	2	6	49155	49160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021811	TCA	2	6	49206	49211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021811	GGA	3	9	50445	50453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021811	ACG	2	6	50454	50459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021811	GAG	2	6	50474	50479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021811	CAG	2	6	50608	50613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021811	TTA	2	6	50688	50693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021811	ACT	2	6	52418	52423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021811	ACT	2	6	52492	52497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021811	GCA	2	6	52525	52530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021811	TGC	2	6	52557	52562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021811	GCA	2	6	52586	52591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021811	TGC	2	6	52596	52601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021811	TGC	2	6	53632	53637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021811	GCA	2	6	53644	53649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021811	GCA	2	6	53713	53718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021811	CAA	2	6	53725	53730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021811	AAT	2	6	53733	53738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021811	TGC	2	6	53922	53927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021811	ATT	2	6	53945	53950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021811	CGC	2	6	53967	53972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_021811	AAG	2	6	54044	54049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021811	CAT	2	6	55490	55495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021811	ATC	3	9	55502	55510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021811	ATC	2	6	55625	55630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021811	GCG	2	6	55654	55659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021811	ACA	2	6	55682	55687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021811	TCA	2	6	55695	55700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021811	TGT	2	6	55722	55727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021811	AGC	2	6	55826	55831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021811	TGG	2	6	56849	56854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021811	CCA	2	6	56876	56881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_021811	CCA	2	6	56950	56955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021811	GCC	2	6	57079	57084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_021811	AGA	2	6	57096	57101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021811	ATG	2	6	57199	57204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021811	ATT	3	9	57232	57240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021811	CAT	2	6	57653	57658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021811	TTA	2	6	59622	59627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021811	GTG	2	6	59680	59685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021811	CTG	2	6	59704	59709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021811	GCA	2	6	59718	59723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021811	AAC	2	6	59773	59778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021811	TCT	3	9	61268	61276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021811	ACA	2	6	61315	61320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021811	TAC	2	6	61399	61404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021811	TTA	2	6	61433	61438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021811	ATT	2	6	61488	61493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021811	TAT	2	6	63036	63041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021811	ATC	2	6	63183	63188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021811	ACC	2	6	63218	63223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_021811	AGC	2	6	63232	63237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021811	AGC	2	6	63244	63249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021811	GAC	2	6	63277	63282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021811	CAT	2	6	63345	63350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021811	ATG	2	6	63381	63386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021811	GAA	2	6	63392	63397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021811	CAA	2	6	63398	63403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NC_021811	TGA	2	6	63945	63950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_021811	ATT	2	6	117458	117463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.