MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_01

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021811	TC	3	6	1223	1228	0 %	50 %	0 %	50 %	525811115
2	NC_021811	AT	3	6	1397	1402	50 %	50 %	0 %	0 %	525811115
3	NC_021811	AT	3	6	1757	1762	50 %	50 %	0 %	0 %	525811115
4	NC_021811	AT	3	6	2568	2573	50 %	50 %	0 %	0 %	525811117
5	NC_021811	TC	3	6	2678	2683	0 %	50 %	0 %	50 %	525811117
6	NC_021811	CA	3	6	5591	5596	50 %	0 %	0 %	50 %	525811118
7	NC_021811	GA	3	6	5725	5730	50 %	0 %	50 %	0 %	525811118
8	NC_021811	GA	3	6	5785	5790	50 %	0 %	50 %	0 %	525811118
9	NC_021811	TC	3	6	6638	6643	0 %	50 %	0 %	50 %	525811118
10	NC_021811	CT	3	6	8059	8064	0 %	50 %	0 %	50 %	525811121
11	NC_021811	AT	3	6	9327	9332	50 %	50 %	0 %	0 %	525811122
12	NC_021811	CA	3	6	10226	10231	50 %	0 %	0 %	50 %	525811123
13	NC_021811	AC	3	6	12117	12122	50 %	0 %	0 %	50 %	525811127
14	NC_021811	CT	3	6	12539	12544	0 %	50 %	0 %	50 %	525811127
15	NC_021811	TC	3	6	12999	13004	0 %	50 %	0 %	50 %	525811128
16	NC_021811	CA	3	6	13698	13703	50 %	0 %	0 %	50 %	525811128
17	NC_021811	TG	3	6	14597	14602	0 %	50 %	50 %	0 %	525811128
18	NC_021811	CT	3	6	14603	14608	0 %	50 %	0 %	50 %	525811128
19	NC_021811	CT	3	6	15440	15445	0 %	50 %	0 %	50 %	525811128
20	NC_021811	AC	3	6	17052	17057	50 %	0 %	0 %	50 %	525811130
21	NC_021811	AT	3	6	17365	17370	50 %	50 %	0 %	0 %	525811130
22	NC_021811	TG	3	6	18309	18314	0 %	50 %	50 %	0 %	525811132
23	NC_021811	CA	3	6	18860	18865	50 %	0 %	0 %	50 %	525811132
24	NC_021811	AG	3	6	19267	19272	50 %	0 %	50 %	0 %	525811132
25	NC_021811	AT	3	6	19899	19904	50 %	50 %	0 %	0 %	525811132
26	NC_021811	TA	4	8	20097	20104	50 %	50 %	0 %	0 %	525811132
27	NC_021811	GA	3	6	20820	20825	50 %	0 %	50 %	0 %	525811133
28	NC_021811	CA	3	6	23181	23186	50 %	0 %	0 %	50 %	525811138
29	NC_021811	AG	3	6	24301	24306	50 %	0 %	50 %	0 %	525811139
30	NC_021811	TC	3	6	25087	25092	0 %	50 %	0 %	50 %	525811140
31	NC_021811	TG	3	6	25525	25530	0 %	50 %	50 %	0 %	525811140
32	NC_021811	GT	3	6	26616	26621	0 %	50 %	50 %	0 %	525811141
33	NC_021811	TC	3	6	26835	26840	0 %	50 %	0 %	50 %	525811141
34	NC_021811	TG	3	6	28878	28883	0 %	50 %	50 %	0 %	525811142
35	NC_021811	TG	3	6	29321	29326	0 %	50 %	50 %	0 %	525811142
36	NC_021811	GA	3	6	31615	31620	50 %	0 %	50 %	0 %	525811144
37	NC_021811	GC	3	6	32533	32538	0 %	0 %	50 %	50 %	525811145
38	NC_021811	TG	3	6	33504	33509	0 %	50 %	50 %	0 %	525811146
39	NC_021811	GA	3	6	35645	35650	50 %	0 %	50 %	0 %	525811149
40	NC_021811	CA	3	6	35959	35964	50 %	0 %	0 %	50 %	525811150
41	NC_021811	GC	3	6	37497	37502	0 %	0 %	50 %	50 %	525811152
42	NC_021811	GA	3	6	41447	41452	50 %	0 %	50 %	0 %	525811156
43	NC_021811	CG	3	6	43090	43095	0 %	0 %	50 %	50 %	525811157
44	NC_021811	CT	3	6	43766	43771	0 %	50 %	0 %	50 %	525811158
45	NC_021811	CA	3	6	44942	44947	50 %	0 %	0 %	50 %	525811160
46	NC_021811	GC	3	6	45730	45735	0 %	0 %	50 %	50 %	525811163
47	NC_021811	GC	3	6	47953	47958	0 %	0 %	50 %	50 %	525811167
48	NC_021811	GC	3	6	48318	48323	0 %	0 %	50 %	50 %	525811168
49	NC_021811	GT	3	6	48548	48553	0 %	50 %	50 %	0 %	525811169
50	NC_021811	CA	3	6	49879	49884	50 %	0 %	0 %	50 %	525811170
51	NC_021811	GT	3	6	50084	50089	0 %	50 %	50 %	0 %	525811170
52	NC_021811	CA	3	6	50169	50174	50 %	0 %	0 %	50 %	525811170
53	NC_021811	AT	3	6	51533	51538	50 %	50 %	0 %	0 %	525811173
54	NC_021811	TC	3	6	52009	52014	0 %	50 %	0 %	50 %	525811173
55	NC_021811	TA	3	6	52783	52788	50 %	50 %	0 %	0 %	525811174
56	NC_021811	CT	3	6	53031	53036	0 %	50 %	0 %	50 %	525811175
57	NC_021811	AT	3	6	53150	53155	50 %	50 %	0 %	0 %	525811175
58	NC_021811	AG	3	6	54608	54613	50 %	0 %	50 %	0 %	525811176
59	NC_021811	GC	3	6	54767	54772	0 %	0 %	50 %	50 %	525811176
60	NC_021811	GC	3	6	56378	56383	0 %	0 %	50 %	50 %	525811179
61	NC_021811	GC	3	6	56426	56431	0 %	0 %	50 %	50 %	525811179
62	NC_021811	AT	3	6	57310	57315	50 %	50 %	0 %	0 %	525811180
63	NC_021811	CT	3	6	59061	59066	0 %	50 %	0 %	50 %	525811181
64	NC_021811	TC	3	6	59118	59123	0 %	50 %	0 %	50 %	525811181
65	NC_021811	GT	3	6	59200	59205	0 %	50 %	50 %	0 %	525811181
66	NC_021811	TG	3	6	62183	62188	0 %	50 %	50 %	0 %	525811184
67	NC_021811	TA	3	6	62258	62263	50 %	50 %	0 %	0 %	525811184
68	NC_021811	GC	3	6	65483	65488	0 %	0 %	50 %	50 %	525811188
69	NC_021811	GC	3	6	66754	66759	0 %	0 %	50 %	50 %	525811188
70	NC_021811	GC	3	6	68158	68163	0 %	0 %	50 %	50 %	525811190
71	NC_021811	GA	3	6	68277	68282	50 %	0 %	50 %	0 %	525811190
72	NC_021811	GC	3	6	69154	69159	0 %	0 %	50 %	50 %	525811191
73	NC_021811	GC	3	6	69166	69171	0 %	0 %	50 %	50 %	525811191
74	NC_021811	CA	3	6	70186	70191	50 %	0 %	0 %	50 %	525811192
75	NC_021811	GC	3	6	71306	71311	0 %	0 %	50 %	50 %	525811195
76	NC_021811	GC	3	6	73459	73464	0 %	0 %	50 %	50 %	525811196
77	NC_021811	TC	3	6	73656	73661	0 %	50 %	0 %	50 %	525811196
78	NC_021811	TC	3	6	76327	76332	0 %	50 %	0 %	50 %	525811199
79	NC_021811	CG	3	6	76445	76450	0 %	0 %	50 %	50 %	525811199
80	NC_021811	AT	3	6	77584	77589	50 %	50 %	0 %	0 %	525811200
81	NC_021811	GC	4	8	78467	78474	0 %	0 %	50 %	50 %	525811201
82	NC_021811	TA	3	6	78725	78730	50 %	50 %	0 %	0 %	525811201
83	NC_021811	GC	4	8	79111	79118	0 %	0 %	50 %	50 %	525811201
84	NC_021811	GT	3	6	79287	79292	0 %	50 %	50 %	0 %	525811201
85	NC_021811	GC	3	6	81272	81277	0 %	0 %	50 %	50 %	525811205
86	NC_021811	CT	3	6	81761	81766	0 %	50 %	0 %	50 %	525811205
87	NC_021811	TG	3	6	81864	81869	0 %	50 %	50 %	0 %	525811205
88	NC_021811	CG	3	6	82806	82811	0 %	0 %	50 %	50 %	525811206
89	NC_021811	GC	3	6	82918	82923	0 %	0 %	50 %	50 %	525811206
90	NC_021811	GC	3	6	83736	83741	0 %	0 %	50 %	50 %	525811208
91	NC_021811	GC	3	6	85152	85157	0 %	0 %	50 %	50 %	525811209
92	NC_021811	CG	3	6	85999	86004	0 %	0 %	50 %	50 %	525811209
93	NC_021811	GC	3	6	86596	86601	0 %	0 %	50 %	50 %	525811209
94	NC_021811	GC	3	6	87023	87028	0 %	0 %	50 %	50 %	525811210
95	NC_021811	AG	3	6	87085	87090	50 %	0 %	50 %	0 %	525811210
96	NC_021811	GC	4	8	87602	87609	0 %	0 %	50 %	50 %	525811211
97	NC_021811	CG	3	6	87957	87962	0 %	0 %	50 %	50 %	525811212
98	NC_021811	GC	3	6	88191	88196	0 %	0 %	50 %	50 %	525811212
99	NC_021811	GC	4	8	88384	88391	0 %	0 %	50 %	50 %	525811212
100	NC_021811	GC	3	6	90380	90385	0 %	0 %	50 %	50 %	525811215
101	NC_021811	GC	3	6	90710	90715	0 %	0 %	50 %	50 %	525811215
102	NC_021811	AG	3	6	91443	91448	50 %	0 %	50 %	0 %	525811216
103	NC_021811	CA	3	6	92121	92126	50 %	0 %	0 %	50 %	525811217
104	NC_021811	AG	3	6	92132	92137	50 %	0 %	50 %	0 %	525811217
105	NC_021811	GC	3	6	92205	92210	0 %	0 %	50 %	50 %	525811217
106	NC_021811	AC	3	6	92343	92348	50 %	0 %	0 %	50 %	525811217
107	NC_021811	TG	3	6	92682	92687	0 %	50 %	50 %	0 %	525811217
108	NC_021811	TG	3	6	92754	92759	0 %	50 %	50 %	0 %	525811217
109	NC_021811	GC	3	6	94036	94041	0 %	0 %	50 %	50 %	525811218
110	NC_021811	TG	3	6	94465	94470	0 %	50 %	50 %	0 %	525811218
111	NC_021811	TA	4	8	98288	98295	50 %	50 %	0 %	0 %	525811223
112	NC_021811	CA	3	6	98475	98480	50 %	0 %	0 %	50 %	525811223
113	NC_021811	CT	3	6	98645	98650	0 %	50 %	0 %	50 %	525811223
114	NC_021811	GT	3	6	99798	99803	0 %	50 %	50 %	0 %	525811225
115	NC_021811	AG	3	6	101335	101340	50 %	0 %	50 %	0 %	525811226
116	NC_021811	AG	3	6	102268	102273	50 %	0 %	50 %	0 %	525811228
117	NC_021811	GA	3	6	102320	102325	50 %	0 %	50 %	0 %	525811228
118	NC_021811	CT	3	6	103867	103872	0 %	50 %	0 %	50 %	525811229
119	NC_021811	GC	3	6	105934	105939	0 %	0 %	50 %	50 %	525811231
120	NC_021811	CT	3	6	107259	107264	0 %	50 %	0 %	50 %	525811232
121	NC_021811	TC	3	6	108046	108051	0 %	50 %	0 %	50 %	525811232
122	NC_021811	GC	4	8	108895	108902	0 %	0 %	50 %	50 %	525811234
123	NC_021811	AG	3	6	109224	109229	50 %	0 %	50 %	0 %	525811234
124	NC_021811	TA	3	6	109340	109345	50 %	50 %	0 %	0 %	525811235
125	NC_021811	AC	3	6	109439	109444	50 %	0 %	0 %	50 %	525811235
126	NC_021811	AT	3	6	109653	109658	50 %	50 %	0 %	0 %	525811235
127	NC_021811	TA	3	6	109794	109799	50 %	50 %	0 %	0 %	525811235
128	NC_021811	GT	4	8	109810	109817	0 %	50 %	50 %	0 %	525811235
129	NC_021811	TA	3	6	110128	110133	50 %	50 %	0 %	0 %	525811236
130	NC_021811	AT	3	6	110397	110402	50 %	50 %	0 %	0 %	525811236
131	NC_021811	GT	3	6	111234	111239	0 %	50 %	50 %	0 %	525811236
132	NC_021811	CA	3	6	113677	113682	50 %	0 %	0 %	50 %	525811238
133	NC_021811	AT	3	6	114944	114949	50 %	50 %	0 %	0 %	525811239
134	NC_021811	TC	3	6	116331	116336	0 %	50 %	0 %	50 %	525811240

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.