MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_01

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021811	A	6	6	697	702	100 %	0 %	0 %	0 %	525811114
2	NC_021811	A	7	7	2263	2269	100 %	0 %	0 %	0 %	525811117
3	NC_021811	A	6	6	2491	2496	100 %	0 %	0 %	0 %	525811117
4	NC_021811	C	6	6	2832	2837	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_021811	T	7	7	2863	2869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021811	T	6	6	2875	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021811	A	6	6	2958	2963	100 %	0 %	0 %	0 %	525811118
8	NC_021811	A	6	6	3207	3212	100 %	0 %	0 %	0 %	525811118
9	NC_021811	A	6	6	3217	3222	100 %	0 %	0 %	0 %	525811118
10	NC_021811	G	6	6	3600	3605	0 %	0 %	100 %	0 %	525811118
11	NC_021811	A	6	6	4120	4125	100 %	0 %	0 %	0 %	525811118
12	NC_021811	A	7	7	4501	4507	100 %	0 %	0 %	0 %	525811118
13	NC_021811	T	6	6	5034	5039	0 %	100 %	0 %	0 %	525811118
14	NC_021811	A	7	7	5046	5052	100 %	0 %	0 %	0 %	525811118
15	NC_021811	G	6	6	5836	5841	0 %	0 %	100 %	0 %	525811118
16	NC_021811	A	6	6	6619	6624	100 %	0 %	0 %	0 %	525811118
17	NC_021811	A	7	7	6881	6887	100 %	0 %	0 %	0 %	525811119
18	NC_021811	A	6	6	10339	10344	100 %	0 %	0 %	0 %	525811123
19	NC_021811	A	6	6	10400	10405	100 %	0 %	0 %	0 %	525811123
20	NC_021811	A	7	7	10524	10530	100 %	0 %	0 %	0 %	525811123
21	NC_021811	T	7	7	11234	11240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021811	A	6	6	11548	11553	100 %	0 %	0 %	0 %	525811125
23	NC_021811	G	6	6	11566	11571	0 %	0 %	100 %	0 %	525811125
24	NC_021811	A	6	6	12163	12168	100 %	0 %	0 %	0 %	525811127
25	NC_021811	A	6	6	12657	12662	100 %	0 %	0 %	0 %	525811127
26	NC_021811	A	6	6	12704	12709	100 %	0 %	0 %	0 %	525811127
27	NC_021811	A	7	7	12760	12766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021811	A	6	6	15918	15923	100 %	0 %	0 %	0 %	525811129
29	NC_021811	A	6	6	17665	17670	100 %	0 %	0 %	0 %	525811131
30	NC_021811	A	6	6	17712	17717	100 %	0 %	0 %	0 %	525811131
31	NC_021811	A	6	6	19216	19221	100 %	0 %	0 %	0 %	525811132
32	NC_021811	T	6	6	20147	20152	0 %	100 %	0 %	0 %	525811132
33	NC_021811	A	6	6	20587	20592	100 %	0 %	0 %	0 %	525811133
34	NC_021811	A	6	6	21620	21625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021811	A	6	6	21905	21910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021811	A	6	6	21937	21942	100 %	0 %	0 %	0 %	525811135
37	NC_021811	A	7	7	22566	22572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021811	T	7	7	22590	22596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021811	A	6	6	22695	22700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021811	A	7	7	23310	23316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021811	A	6	6	25233	25238	100 %	0 %	0 %	0 %	525811140
42	NC_021811	A	6	6	26450	26455	100 %	0 %	0 %	0 %	525811141
43	NC_021811	G	6	6	26550	26555	0 %	0 %	100 %	0 %	525811141
44	NC_021811	A	6	6	27094	27099	100 %	0 %	0 %	0 %	525811141
45	NC_021811	A	7	7	28060	28066	100 %	0 %	0 %	0 %	525811141
46	NC_021811	T	8	8	28129	28136	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
47	NC_021811	T	6	6	29799	29804	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
48	NC_021811	T	7	7	29901	29907	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
49	NC_021811	T	7	7	30124	30130	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
50	NC_021811	A	6	6	31419	31424	100 %	0 %	0 %	0 %	525811144
51	NC_021811	A	6	6	31656	31661	100 %	0 %	0 %	0 %	525811144
52	NC_021811	A	8	8	31789	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021811	C	6	6	32888	32893	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_021811	A	7	7	33153	33159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021811	T	6	6	33175	33180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021811	T	6	6	33233	33238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59	NC_021811	A	6	6	36431	36436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021811	T	7	7	37825	37831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021811	A	6	6	38235	38240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021811	T	6	6	38436	38441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_021811	T	6	6	49858	49863	0 %	100 %	0 %	0 %	525811170
70	NC_021811	T	6	6	50645	50650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021811	A	7	7	50776	50782	100 %	0 %	0 %	0 %	525811171
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77	NC_021811	A	7	7	52575	52581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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82	NC_021811	A	6	6	56910	56915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021811	T	6	6	57161	57166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_021811	A	6	6	61606	61611	100 %	0 %	0 %	0 %	525811183
91	NC_021811	A	6	6	61789	61794	100 %	0 %	0 %	0 %	525811183
92	NC_021811	A	6	6	62161	62166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94	NC_021811	A	6	6	62659	62664	100 %	0 %	0 %	0 %	525811184
95	NC_021811	T	6	6	63022	63027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_021811	T	8	8	74114	74121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_021811	A	6	6	77924	77929	100 %	0 %	0 %	0 %	525811200
111	NC_021811	A	6	6	78164	78169	100 %	0 %	0 %	0 %	525811200
112	NC_021811	T	7	7	79043	79049	0 %	100 %	0 %	0 %	525811201
113	NC_021811	A	6	6	80594	80599	100 %	0 %	0 %	0 %	525811203
114	NC_021811	A	7	7	82123	82129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021811	T	6	6	86921	86926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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117	NC_021811	A	7	7	90918	90924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021811	A	7	7	92310	92316	100 %	0 %	0 %	0 %	525811217
119	NC_021811	A	6	6	92455	92460	100 %	0 %	0 %	0 %	525811217
120	NC_021811	A	7	7	95300	95306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021811	A	6	6	95464	95469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021811	T	6	6	95718	95723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021811	T	6	6	95729	95734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_021811	C	6	6	98565	98570	0 %	0 %	0 %	100 %	525811223
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133	NC_021811	A	6	6	99647	99652	100 %	0 %	0 %	0 %	525811225
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.