MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 2775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021810	AGAGA	2	10	3860	3869	60 %	0 %	40 %	0 %	525814196
2	NC_021810	CGCGC	2	10	4551	4560	0 %	0 %	40 %	60 %	525814197
3	NC_021810	CAGGC	2	10	8495	8504	20 %	0 %	40 %	40 %	525814200
4	NC_021810	CTCGC	2	10	9439	9448	0 %	20 %	20 %	60 %	525814201
5	NC_021810	ATTGA	2	10	10067	10076	40 %	40 %	20 %	0 %	525814202
6	NC_021810	CTGTT	2	10	10879	10888	0 %	60 %	20 %	20 %	525814203
7	NC_021810	CTTTG	2	10	12282	12291	0 %	60 %	20 %	20 %	525814205
8	NC_021810	CTGGT	2	10	13173	13182	0 %	40 %	40 %	20 %	525814205
9	NC_021810	AAAGC	2	10	14712	14721	60 %	0 %	20 %	20 %	525814206
10	NC_021810	CTACG	2	10	14896	14905	20 %	20 %	20 %	40 %	525814206
11	NC_021810	CCAGT	2	10	15843	15852	20 %	20 %	20 %	40 %	525814206
12	NC_021810	AATAA	2	10	16355	16364	80 %	20 %	0 %	0 %	525814206
13	NC_021810	AGCAA	2	10	16417	16426	60 %	0 %	20 %	20 %	525814206
14	NC_021810	CTTGT	2	10	20831	20840	0 %	60 %	20 %	20 %	525814210
15	NC_021810	CGCGT	2	10	25570	25579	0 %	20 %	40 %	40 %	525814214
16	NC_021810	GTTCA	2	10	27186	27195	20 %	40 %	20 %	20 %	525814215
17	NC_021810	AGGTA	2	10	28781	28790	40 %	20 %	40 %	0 %	525814216
18	NC_021810	GGCGC	2	10	34058	34067	0 %	0 %	60 %	40 %	525814219
19	NC_021810	ACCGC	2	10	34160	34169	20 %	0 %	20 %	60 %	525814219
20	NC_021810	CAGGC	2	10	36562	36571	20 %	0 %	40 %	40 %	525814223
21	NC_021810	TAACA	2	10	37263	37272	60 %	20 %	0 %	20 %	525814224
22	NC_021810	TCACT	2	10	40204	40213	20 %	40 %	0 %	40 %	525814228
23	NC_021810	CCACG	2	10	42507	42516	20 %	0 %	20 %	60 %	525814229
24	NC_021810	GCCGC	2	10	47286	47295	0 %	0 %	40 %	60 %	525814232
25	NC_021810	CGCTG	2	10	49023	49032	0 %	20 %	40 %	40 %	525814233
26	NC_021810	AGCGA	2	10	49049	49058	40 %	0 %	40 %	20 %	525814233
27	NC_021810	GCCCA	2	10	51057	51066	20 %	0 %	20 %	60 %	525814235
28	NC_021810	AAAGT	2	10	52654	52663	60 %	20 %	20 %	0 %	525814236
29	NC_021810	TTAAT	2	10	55707	55716	40 %	60 %	0 %	0 %	525814240
30	NC_021810	CGTCG	2	10	56916	56925	0 %	20 %	40 %	40 %	525814241
31	NC_021810	ACGGC	2	10	58432	58441	20 %	0 %	40 %	40 %	525814242
32	NC_021810	CGGCG	2	10	58907	58916	0 %	0 %	60 %	40 %	525814242
33	NC_021810	CGTAC	2	10	60189	60198	20 %	20 %	20 %	40 %	525814243
34	NC_021810	AGCAA	2	10	64494	64503	60 %	0 %	20 %	20 %	525814248
35	NC_021810	GGACA	2	10	65573	65582	40 %	0 %	40 %	20 %	525814248
36	NC_021810	CGCGC	2	10	68767	68776	0 %	0 %	40 %	60 %	525814250
37	NC_021810	TCCAT	2	10	69769	69778	20 %	40 %	0 %	40 %	525814252
38	NC_021810	TGTTA	2	10	70019	70028	20 %	60 %	20 %	0 %	525814252
39	NC_021810	TGACG	2	10	70240	70249	20 %	20 %	40 %	20 %	525814252
40	NC_021810	GCCCA	2	10	71486	71495	20 %	0 %	20 %	60 %	525814254
41	NC_021810	GCGCT	2	10	74376	74385	0 %	20 %	40 %	40 %	525814257
42	NC_021810	CCGGG	2	10	74584	74593	0 %	0 %	60 %	40 %	525814257
43	NC_021810	AGCGA	2	10	75142	75151	40 %	0 %	40 %	20 %	525814258
44	NC_021810	CTGCT	2	10	76242	76251	0 %	40 %	20 %	40 %	525814259
45	NC_021810	ACGCA	2	10	76989	76998	40 %	0 %	20 %	40 %	525814260
46	NC_021810	CCAGG	2	10	77923	77932	20 %	0 %	40 %	40 %	525814261
47	NC_021810	GTTTT	2	10	79823	79832	0 %	80 %	20 %	0 %	525814262
48	NC_021810	GCGCG	2	10	81167	81176	0 %	0 %	60 %	40 %	525814263
49	NC_021810	CCGTT	2	10	81896	81905	0 %	40 %	20 %	40 %	525814264
50	NC_021810	GGCTG	2	10	82108	82117	0 %	20 %	60 %	20 %	525814264
51	NC_021810	ACCAG	2	10	84966	84975	40 %	0 %	20 %	40 %	525814265
52	NC_021810	GCTGA	2	10	88355	88364	20 %	20 %	40 %	20 %	525814266
53	NC_021810	ATCGG	2	10	89079	89088	20 %	20 %	40 %	20 %	525814266
54	NC_021810	CGGAT	2	10	89924	89933	20 %	20 %	40 %	20 %	525814266
55	NC_021810	GGTAT	2	10	94639	94648	20 %	40 %	40 %	0 %	525814270
56	NC_021810	TGCCC	2	10	95034	95043	0 %	20 %	20 %	60 %	525814271
57	NC_021810	TGTAC	2	10	96488	96497	20 %	40 %	20 %	20 %	525814274
58	NC_021810	CTGAA	2	10	98786	98795	40 %	20 %	20 %	20 %	525814275
59	NC_021810	GGCGT	2	10	104688	104697	0 %	20 %	60 %	20 %	525814281
60	NC_021810	GCGGA	2	10	107196	107205	20 %	0 %	60 %	20 %	525814282
61	NC_021810	TACGC	2	10	110669	110678	20 %	20 %	20 %	40 %	525814285
62	NC_021810	CCGCC	2	10	112474	112483	0 %	0 %	20 %	80 %	525814286
63	NC_021810	CGGCG	2	10	114019	114028	0 %	0 %	60 %	40 %	525814288
64	NC_021810	CGAGC	2	10	114485	114494	20 %	0 %	40 %	40 %	525814288
65	NC_021810	ATGGC	2	10	116214	116223	20 %	20 %	40 %	20 %	525814290
66	NC_021810	GGCCG	2	10	118758	118767	0 %	0 %	60 %	40 %	525814292
67	NC_021810	CCGCG	2	10	121485	121494	0 %	0 %	40 %	60 %	525814295
68	NC_021810	GGCGA	2	10	122080	122089	20 %	0 %	60 %	20 %	525814296
69	NC_021810	TGGTC	2	10	122552	122561	0 %	40 %	40 %	20 %	525814296
70	NC_021810	TCCTG	2	10	123167	123176	0 %	40 %	20 %	40 %	525814297
71	NC_021810	AACAG	2	10	123432	123441	60 %	0 %	20 %	20 %	525814297
72	NC_021810	GCCGG	2	10	123544	123553	0 %	0 %	60 %	40 %	525814297
73	NC_021810	GCCAC	2	10	125499	125508	20 %	0 %	20 %	60 %	525814299
74	NC_021810	TGCAC	2	10	126136	126145	20 %	20 %	20 %	40 %	525814300
75	NC_021810	CATGC	2	10	127111	127120	20 %	20 %	20 %	40 %	525814300
76	NC_021810	GTACC	2	10	128186	128195	20 %	20 %	20 %	40 %	525814300
77	NC_021810	CGCGT	2	10	128324	128333	0 %	20 %	40 %	40 %	525814300
78	NC_021810	CATGG	2	10	128561	128570	20 %	20 %	40 %	20 %	525814300
79	NC_021810	AACGG	2	10	129086	129095	40 %	0 %	40 %	20 %	525814301
80	NC_021810	ACGCC	2	10	132853	132862	20 %	0 %	20 %	60 %	525814305
81	NC_021810	TCGGA	2	10	132934	132943	20 %	20 %	40 %	20 %	525814305
82	NC_021810	ACCCA	2	10	134728	134737	40 %	0 %	0 %	60 %	525814307
83	NC_021810	CACGC	2	10	140560	140569	20 %	0 %	20 %	60 %	525814315
84	NC_021810	GTAAT	2	10	143854	143863	40 %	40 %	20 %	0 %	525814319
85	NC_021810	TTCAT	2	10	146770	146779	20 %	60 %	0 %	20 %	525814321
86	NC_021810	ACGCC	2	10	148859	148868	20 %	0 %	20 %	60 %	525814322
87	NC_021810	ACGCC	2	10	149189	149198	20 %	0 %	20 %	60 %	525814322
88	NC_021810	CCAAT	2	10	154684	154693	40 %	20 %	0 %	40 %	525814330
89	NC_021810	GCATC	2	10	158477	158486	20 %	20 %	20 %	40 %	525814334
90	NC_021810	CAACC	2	10	164565	164574	40 %	0 %	0 %	60 %	525814338
91	NC_021810	ACTGA	2	10	165667	165676	40 %	20 %	20 %	20 %	525814338
92	NC_021810	CGGCG	2	10	166493	166502	0 %	0 %	60 %	40 %	525814339
93	NC_021810	CTGCG	2	10	166943	166952	0 %	20 %	40 %	40 %	525814339
94	NC_021810	AATTT	2	10	170566	170575	40 %	60 %	0 %	0 %	525814343
95	NC_021810	GCCGC	2	10	171234	171243	0 %	0 %	40 %	60 %	525814344
96	NC_021810	CGTGC	2	10	172327	172336	0 %	20 %	40 %	40 %	525814345
97	NC_021810	GTACC	2	10	174943	174952	20 %	20 %	20 %	40 %	525814348
98	NC_021810	GCTCA	2	10	176052	176061	20 %	20 %	20 %	40 %	525814349
99	NC_021810	GAGAA	2	10	176261	176270	60 %	0 %	40 %	0 %	525814349
100	NC_021810	ACCAG	2	10	178072	178081	40 %	0 %	20 %	40 %	525814351
101	NC_021810	CGCGG	2	10	180976	180985	0 %	0 %	60 %	40 %	525814354
102	NC_021810	CGCGT	2	10	189598	189607	0 %	20 %	40 %	40 %	525814363
103	NC_021810	CGCGA	2	10	189894	189903	20 %	0 %	40 %	40 %	525814363
104	NC_021810	GCCCT	2	10	190737	190746	0 %	20 %	20 %	60 %	525814364
105	NC_021810	TGCAA	2	10	193295	193304	40 %	20 %	20 %	20 %	525814367
106	NC_021810	TGCAA	2	10	194210	194219	40 %	20 %	20 %	20 %	525814368
107	NC_021810	GCACG	2	10	195404	195413	20 %	0 %	40 %	40 %	525814369
108	NC_021810	CAACC	2	10	198434	198443	40 %	0 %	0 %	60 %	525814372
109	NC_021810	CAGGC	2	10	201522	201531	20 %	0 %	40 %	40 %	525814375
110	NC_021810	CAGGC	2	10	206921	206930	20 %	0 %	40 %	40 %	525814381
111	NC_021810	CCGCC	2	10	208415	208424	0 %	0 %	20 %	80 %	525814384
112	NC_021810	CTGGC	2	10	209014	209023	0 %	20 %	40 %	40 %	525814385
113	NC_021810	GTTCG	2	10	209792	209801	0 %	40 %	40 %	20 %	525814386
114	NC_021810	CGTGA	2	10	210081	210090	20 %	20 %	40 %	20 %	525814386
115	NC_021810	TACCG	2	10	211735	211744	20 %	20 %	20 %	40 %	525814388
116	NC_021810	CCAGG	2	10	213688	213697	20 %	0 %	40 %	40 %	525814390
117	NC_021810	GCGCC	2	10	218972	218981	0 %	0 %	40 %	60 %	525814396
118	NC_021810	GCCAT	2	10	219564	219573	20 %	20 %	20 %	40 %	525814396
119	NC_021810	GACGC	2	10	220160	220169	20 %	0 %	40 %	40 %	525814396
120	NC_021810	TCACG	2	10	220187	220196	20 %	20 %	20 %	40 %	525814396
121	NC_021810	TGTTT	2	10	222720	222729	0 %	80 %	20 %	0 %	525814399
122	NC_021810	CGGCG	2	10	226553	226562	0 %	0 %	60 %	40 %	525814403
123	NC_021810	CGGCA	2	10	227896	227905	20 %	0 %	40 %	40 %	525814404
124	NC_021810	TGCCG	2	10	232653	232662	0 %	20 %	40 %	40 %	525814408
125	NC_021810	TACGC	2	10	236358	236367	20 %	20 %	20 %	40 %	525814412
126	NC_021810	CTGGA	2	10	242520	242529	20 %	20 %	40 %	20 %	525814419
127	NC_021810	GCGTT	2	10	242571	242580	0 %	40 %	40 %	20 %	525814419
128	NC_021810	CGCAG	2	10	254410	254419	20 %	0 %	40 %	40 %	525814431
129	NC_021810	CCACC	2	10	255892	255901	20 %	0 %	0 %	80 %	525814432
130	NC_021810	GTTTT	2	10	256591	256600	0 %	80 %	20 %	0 %	525814433
131	NC_021810	CGGCG	2	10	258650	258659	0 %	0 %	60 %	40 %	525814434
132	NC_021810	TGGAT	2	10	259696	259705	20 %	40 %	40 %	0 %	525814435
133	NC_021810	CAGAA	2	10	260223	260232	60 %	0 %	20 %	20 %	525814436
134	NC_021810	CGCCA	2	10	260623	260632	20 %	0 %	20 %	60 %	525814437
135	NC_021810	CAGCG	2	10	261145	261154	20 %	0 %	40 %	40 %	525814437
136	NC_021810	CGCGC	2	10	261208	261217	0 %	0 %	40 %	60 %	525814437
137	NC_021810	ACCCC	2	10	261954	261963	20 %	0 %	0 %	80 %	525814437
138	NC_021810	TACAT	2	10	262811	262820	40 %	40 %	0 %	20 %	525814438
139	NC_021810	TTAAT	2	10	263857	263866	40 %	60 %	0 %	0 %	525814440
140	NC_021810	GTTAC	2	10	265274	265283	20 %	40 %	20 %	20 %	525814442
141	NC_021810	GACCA	2	10	265466	265475	40 %	0 %	20 %	40 %	525814443
142	NC_021810	TACCC	2	10	265872	265881	20 %	20 %	0 %	60 %	525814444
143	NC_021810	GCGCG	2	10	265891	265900	0 %	0 %	60 %	40 %	525814444
144	NC_021810	GCGAC	2	10	266247	266256	20 %	0 %	40 %	40 %	525814444
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147	NC_021810	TGCCT	2	10	272989	272998	0 %	40 %	20 %	40 %	525814451
148	NC_021810	CGGCT	2	10	279326	279335	0 %	20 %	40 %	40 %	525814457
149	NC_021810	AATGA	2	10	279906	279915	60 %	20 %	20 %	0 %	525814457
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151	NC_021810	GTATC	2	10	287737	287746	20 %	40 %	20 %	20 %	525814464
152	NC_021810	CCCTT	2	10	287826	287835	0 %	40 %	0 %	60 %	525814464
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154	NC_021810	GATCA	2	10	292978	292987	40 %	20 %	20 %	20 %	525814469
155	NC_021810	GCGCC	2	10	295836	295845	0 %	0 %	40 %	60 %	525814472
156	NC_021810	CGGCG	2	10	296622	296631	0 %	0 %	60 %	40 %	525814473
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159	NC_021810	CCGGT	2	10	299419	299428	0 %	20 %	40 %	40 %	525814476
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163	NC_021810	GCAGC	2	10	311666	311675	20 %	0 %	40 %	40 %	525814487
164	NC_021810	GCCAG	2	10	313825	313834	20 %	0 %	40 %	40 %	525814488
165	NC_021810	TGATC	2	10	315995	316004	20 %	40 %	20 %	20 %	525814490
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167	NC_021810	TCGCT	2	10	321210	321219	0 %	40 %	20 %	40 %	525814496
168	NC_021810	AAGGC	2	10	321423	321432	40 %	0 %	40 %	20 %	525814496
169	NC_021810	CGAAG	2	10	324036	324045	40 %	0 %	40 %	20 %	525814497
170	NC_021810	CAAGC	2	10	329383	329392	40 %	0 %	20 %	40 %	525814502
171	NC_021810	CGCCA	2	10	332893	332902	20 %	0 %	20 %	60 %	525814504
172	NC_021810	GGATC	2	10	333142	333151	20 %	20 %	40 %	20 %	525814504
173	NC_021810	AACGG	2	10	334455	334464	40 %	0 %	40 %	20 %	525814505
174	NC_021810	AAGTG	2	10	336346	336355	40 %	20 %	40 %	0 %	525814507
175	NC_021810	CATGT	2	10	337129	337138	20 %	40 %	20 %	20 %	525814508
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181	NC_021810	CCGCA	2	10	352526	352535	20 %	0 %	20 %	60 %	525814525
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183	NC_021810	GATCG	2	10	353573	353582	20 %	20 %	40 %	20 %	525814525
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186	NC_021810	GCGTC	2	10	354427	354436	0 %	20 %	40 %	40 %	525814525
187	NC_021810	GCCGC	2	10	355435	355444	0 %	0 %	40 %	60 %	525814526
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192	NC_021810	TGGTC	2	10	369216	369225	0 %	40 %	40 %	20 %	525814539
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194	NC_021810	GCACG	2	10	372108	372117	20 %	0 %	40 %	40 %	525814541
195	NC_021810	CGGCG	2	10	377692	377701	0 %	0 %	60 %	40 %	525814547
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201	NC_021810	TACGT	2	10	391206	391215	20 %	40 %	20 %	20 %	525814561
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229	NC_021810	TGATC	2	10	447369	447378	20 %	40 %	20 %	20 %	525814615
230	NC_021810	AGCTG	2	10	452899	452908	20 %	20 %	40 %	20 %	525814622
231	NC_021810	TCCGT	2	10	453052	453061	0 %	40 %	20 %	40 %	525814622
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234	NC_021810	TGATT	2	10	455694	455703	20 %	60 %	20 %	0 %	525814624
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240	NC_021810	ATCGG	2	10	466882	466891	20 %	20 %	40 %	20 %	525814636
241	NC_021810	ATAAG	2	10	469106	469115	60 %	20 %	20 %	0 %	525814639
242	NC_021810	CTGGC	2	10	472750	472759	0 %	20 %	40 %	40 %	525814643
243	NC_021810	CTTTG	2	10	476227	476236	0 %	60 %	20 %	20 %	525814644
244	NC_021810	AGGTC	2	10	477324	477333	20 %	20 %	40 %	20 %	525814644
245	NC_021810	ACTAC	2	10	479889	479898	40 %	20 %	0 %	40 %	525814647
246	NC_021810	CAGTA	2	10	480171	480180	40 %	20 %	20 %	20 %	525814647
247	NC_021810	TCGCA	2	10	480831	480840	20 %	20 %	20 %	40 %	525814648
248	NC_021810	AAATA	2	10	481206	481215	80 %	20 %	0 %	0 %	525814648
249	NC_021810	CCGCG	2	10	483603	483612	0 %	0 %	40 %	60 %	525814650
250	NC_021810	AAGAT	2	10	485885	485894	60 %	20 %	20 %	0 %	525814651
251	NC_021810	AACCG	2	10	486342	486351	40 %	0 %	20 %	40 %	525814652
252	NC_021810	TCGCT	2	10	486980	486989	0 %	40 %	20 %	40 %	525814652
253	NC_021810	GCGTT	2	10	487585	487594	0 %	40 %	40 %	20 %	525814653
254	NC_021810	TGCTG	2	10	490130	490139	0 %	40 %	40 %	20 %	525814656
255	NC_021810	CTGGG	2	10	490406	490415	0 %	20 %	60 %	20 %	525814657
256	NC_021810	ATTAC	2	10	491303	491312	40 %	40 %	0 %	20 %	525814657
257	NC_021810	TGCCA	2	10	491646	491655	20 %	20 %	20 %	40 %	525814658
258	NC_021810	CTGGC	2	10	494749	494758	0 %	20 %	40 %	40 %	525814661
259	NC_021810	TCACC	2	10	499547	499556	20 %	20 %	0 %	60 %	525814665
260	NC_021810	TGGTA	2	10	501380	501389	20 %	40 %	40 %	0 %	525814666
261	NC_021810	TTTTC	2	10	512629	512638	0 %	80 %	0 %	20 %	525814673
262	NC_021810	TCGCC	2	10	514642	514651	0 %	20 %	20 %	60 %	525814675
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264	NC_021810	TTGGC	2	10	516918	516927	0 %	40 %	40 %	20 %	525814678
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381	NC_021810	CAGTA	2	10	704133	704142	40 %	20 %	20 %	20 %	525814864
382	NC_021810	ATGAA	2	10	704866	704875	60 %	20 %	20 %	0 %	525814865
383	NC_021810	GCCGT	2	10	706474	706483	0 %	20 %	40 %	40 %	525814866
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385	NC_021810	CCAGG	2	10	708205	708214	20 %	0 %	40 %	40 %	525814868
386	NC_021810	TACCG	2	10	708253	708262	20 %	20 %	20 %	40 %	525814868
387	NC_021810	TGCGA	2	10	708719	708728	20 %	20 %	40 %	20 %	525814868
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