MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 11251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021810	ACGC	2	8	337	344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021810	TTCA	2	8	567	574	25 %	50 %	0 %	25 %	525814192
3	NC_021810	CGTT	2	8	865	872	0 %	50 %	25 %	25 %	525814192
4	NC_021810	ATAA	2	8	1655	1662	75 %	25 %	0 %	0 %	525814194
5	NC_021810	AAAT	2	8	2294	2301	75 %	25 %	0 %	0 %	525814195
6	NC_021810	AGGT	2	8	2437	2444	25 %	25 %	50 %	0 %	525814195
7	NC_021810	ACGG	2	8	2708	2715	25 %	0 %	50 %	25 %	525814196
8	NC_021810	GTCG	2	8	2775	2782	0 %	25 %	50 %	25 %	525814196
9	NC_021810	GCCC	2	8	2793	2800	0 %	0 %	25 %	75 %	525814196
10	NC_021810	CCAT	2	8	3012	3019	25 %	25 %	0 %	50 %	525814196
11	NC_021810	ATCG	2	8	3025	3032	25 %	25 %	25 %	25 %	525814196
12	NC_021810	CCAG	2	8	4362	4369	25 %	0 %	25 %	50 %	525814197
13	NC_021810	GAAC	2	8	4650	4657	50 %	0 %	25 %	25 %	525814197
14	NC_021810	GGTG	2	8	4938	4945	0 %	25 %	75 %	0 %	525814197
15	NC_021810	TGAA	2	8	5032	5039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021810	TCCT	2	8	5268	5275	0 %	50 %	0 %	50 %	525814198
17	NC_021810	ATTT	2	8	5452	5459	25 %	75 %	0 %	0 %	525814198
18	NC_021810	TACG	2	8	5569	5576	25 %	25 %	25 %	25 %	525814198
19	NC_021810	ATCC	2	8	5961	5968	25 %	25 %	0 %	50 %	525814198
20	NC_021810	TCGC	2	8	6440	6447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021810	TTAA	2	8	6502	6509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021810	TCCA	2	8	8072	8079	25 %	25 %	0 %	50 %	525814199
23	NC_021810	AAAG	2	8	8603	8610	75 %	0 %	25 %	0 %	525814200
24	NC_021810	GGCG	2	8	8857	8864	0 %	0 %	75 %	25 %	525814200
25	NC_021810	CCCA	2	8	9011	9018	25 %	0 %	0 %	75 %	525814200
26	NC_021810	TGCG	2	8	9119	9126	0 %	25 %	50 %	25 %	525814200
27	NC_021810	CATT	2	8	10029	10036	25 %	50 %	0 %	25 %	525814202
28	NC_021810	TGGT	2	8	10821	10828	0 %	50 %	50 %	0 %	525814203
29	NC_021810	TTTG	2	8	10938	10945	0 %	75 %	25 %	0 %	525814203
30	NC_021810	AATG	2	8	12125	12132	50 %	25 %	25 %	0 %	525814204
31	NC_021810	GTCA	2	8	12753	12760	25 %	25 %	25 %	25 %	525814205
32	NC_021810	CCAG	2	8	12839	12846	25 %	0 %	25 %	50 %	525814205
33	NC_021810	GCCA	2	8	12938	12945	25 %	0 %	25 %	50 %	525814205
34	NC_021810	ACGG	2	8	13773	13780	25 %	0 %	50 %	25 %	525814205
35	NC_021810	CAAT	2	8	13846	13853	50 %	25 %	0 %	25 %	525814206
36	NC_021810	GCCA	2	8	14082	14089	25 %	0 %	25 %	50 %	525814206
37	NC_021810	TCAA	2	8	14286	14293	50 %	25 %	0 %	25 %	525814206
38	NC_021810	GATA	2	8	14779	14786	50 %	25 %	25 %	0 %	525814206
39	NC_021810	AGCC	2	8	14883	14890	25 %	0 %	25 %	50 %	525814206
40	NC_021810	GACC	2	8	15368	15375	25 %	0 %	25 %	50 %	525814206
41	NC_021810	GCCA	2	8	15459	15466	25 %	0 %	25 %	50 %	525814206
42	NC_021810	GGAA	2	8	16249	16256	50 %	0 %	50 %	0 %	525814206
43	NC_021810	CTCA	2	8	16600	16607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021810	ACCA	2	8	16796	16803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021810	ATAA	2	8	17167	17174	75 %	25 %	0 %	0 %	525814207
46	NC_021810	ACTT	2	8	17549	17556	25 %	50 %	0 %	25 %	525814207
47	NC_021810	ACTC	2	8	17983	17990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021810	CTGC	2	8	18049	18056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021810	TTCA	2	8	18804	18811	25 %	50 %	0 %	25 %	525814208
50	NC_021810	CGCA	2	8	18960	18967	25 %	0 %	25 %	50 %	525814209
51	NC_021810	AGAC	2	8	19851	19858	50 %	0 %	25 %	25 %	525814209
52	NC_021810	ATCG	2	8	20325	20332	25 %	25 %	25 %	25 %	525814209
53	NC_021810	GATC	2	8	20878	20885	25 %	25 %	25 %	25 %	525814210
54	NC_021810	CAGT	2	8	22399	22406	25 %	25 %	25 %	25 %	525814210
55	NC_021810	ATTG	2	8	22709	22716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021810	GCCT	2	8	22893	22900	0 %	25 %	25 %	50 %	525814211
57	NC_021810	GATT	2	8	23238	23245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021810	AATT	2	8	24353	24360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021810	CGTT	2	8	24470	24477	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021810	AAAT	2	8	25026	25033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021810	ACCA	2	8	26652	26659	50 %	0 %	0 %	50 %	525814215
62	NC_021810	GCCA	2	8	26814	26821	25 %	0 %	25 %	50 %	525814215
63	NC_021810	TCAA	2	8	28157	28164	50 %	25 %	0 %	25 %	525814216
64	NC_021810	GAGG	2	8	29245	29252	25 %	0 %	75 %	0 %	525814216
65	NC_021810	GGGA	2	8	29446	29453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021810	ACAT	2	8	30732	30739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021810	AAAT	2	8	30741	30748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021810	TTAA	2	8	30934	30941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021810	CTGG	2	8	31458	31465	0 %	25 %	50 %	25 %	525814218
70	NC_021810	TAGG	2	8	31579	31586	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021810	ACCC	2	8	32103	32110	25 %	0 %	0 %	75 %	525814219
72	NC_021810	CTGT	2	8	33350	33357	0 %	50 %	25 %	25 %	525814219
73	NC_021810	CAAC	2	8	33723	33730	50 %	0 %	0 %	50 %	525814219
74	NC_021810	CTGG	2	8	34009	34016	0 %	25 %	50 %	25 %	525814219
75	NC_021810	CTGC	2	8	34184	34191	0 %	25 %	25 %	50 %	525814219
76	NC_021810	GCTG	2	8	34276	34283	0 %	25 %	50 %	25 %	525814219
77	NC_021810	ACCA	2	8	34340	34347	50 %	0 %	0 %	50 %	525814220
78	NC_021810	CTCG	2	8	34966	34973	0 %	25 %	25 %	50 %	525814220
79	NC_021810	CCCG	2	8	35728	35735	0 %	0 %	25 %	75 %	525814222
80	NC_021810	TTTA	2	8	36679	36686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021810	GATG	2	8	37167	37174	25 %	25 %	50 %	0 %	525814224
82	NC_021810	ATTT	2	8	37492	37499	25 %	75 %	0 %	0 %	525814224
83	NC_021810	GCAG	2	8	37805	37812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021810	CTGC	2	8	37862	37869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021810	TTTC	2	8	38023	38030	0 %	75 %	0 %	25 %	525814225
86	NC_021810	CTGG	2	8	38343	38350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021810	CCAT	2	8	38368	38375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021810	CTTA	2	8	38660	38667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021810	AATA	2	8	39289	39296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021810	GGCA	2	8	39415	39422	25 %	0 %	50 %	25 %	525814226
91	NC_021810	AATA	2	8	39641	39648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021810	ATCA	2	8	40477	40484	50 %	25 %	0 %	25 %	525814229
93	NC_021810	CGTC	2	8	40901	40908	0 %	25 %	25 %	50 %	525814229
94	NC_021810	GGCA	2	8	41428	41435	25 %	0 %	50 %	25 %	525814229
95	NC_021810	ACGC	2	8	41587	41594	25 %	0 %	25 %	50 %	525814229
96	NC_021810	AGCG	2	8	42130	42137	25 %	0 %	50 %	25 %	525814229
97	NC_021810	GACG	2	8	42279	42286	25 %	0 %	50 %	25 %	525814229
98	NC_021810	TGGC	2	8	44673	44680	0 %	25 %	50 %	25 %	525814231
99	NC_021810	CCCA	2	8	45064	45071	25 %	0 %	0 %	75 %	525814231
100	NC_021810	CAGC	2	8	45600	45607	25 %	0 %	25 %	50 %	525814231
101	NC_021810	GGCT	2	8	45704	45711	0 %	25 %	50 %	25 %	525814231
102	NC_021810	CTGT	2	8	45984	45991	0 %	50 %	25 %	25 %	525814231
103	NC_021810	TGAT	2	8	46589	46596	25 %	50 %	25 %	0 %	525814231
104	NC_021810	GCGG	2	8	47730	47737	0 %	0 %	75 %	25 %	525814232
105	NC_021810	AATG	2	8	47771	47778	50 %	25 %	25 %	0 %	525814232
106	NC_021810	CAGC	2	8	47908	47915	25 %	0 %	25 %	50 %	525814232
107	NC_021810	CCAG	2	8	48148	48155	25 %	0 %	25 %	50 %	525814233
108	NC_021810	GTTG	2	8	48324	48331	0 %	50 %	50 %	0 %	525814233
109	NC_021810	ATCG	2	8	48355	48362	25 %	25 %	25 %	25 %	525814233
110	NC_021810	GTCG	2	8	48571	48578	0 %	25 %	50 %	25 %	525814233
111	NC_021810	CGCC	2	8	48813	48820	0 %	0 %	25 %	75 %	525814233
112	NC_021810	GGCT	2	8	48950	48957	0 %	25 %	50 %	25 %	525814233
113	NC_021810	CCGC	2	8	49160	49167	0 %	0 %	25 %	75 %	525814233
114	NC_021810	GGCG	2	8	50579	50586	0 %	0 %	75 %	25 %	525814234
115	NC_021810	CAGC	2	8	51650	51657	25 %	0 %	25 %	50 %	525814235
116	NC_021810	GACC	2	8	51793	51800	25 %	0 %	25 %	50 %	525814235
117	NC_021810	GCAA	2	8	52603	52610	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021810	GCCA	2	8	53191	53198	25 %	0 %	25 %	50 %	525814237
119	NC_021810	CATC	2	8	53611	53618	25 %	25 %	0 %	50 %	525814237
120	NC_021810	AGCC	2	8	53619	53626	25 %	0 %	25 %	50 %	525814237
121	NC_021810	CCAG	2	8	53818	53825	25 %	0 %	25 %	50 %	525814237
122	NC_021810	AGCC	2	8	53838	53845	25 %	0 %	25 %	50 %	525814237
123	NC_021810	GTCA	2	8	55997	56004	25 %	25 %	25 %	25 %	525814240
124	NC_021810	CACC	2	8	56029	56036	25 %	0 %	0 %	75 %	525814240
125	NC_021810	GCCG	2	8	56754	56761	0 %	0 %	50 %	50 %	525814241
126	NC_021810	GAAC	2	8	57101	57108	50 %	0 %	25 %	25 %	525814241
127	NC_021810	TGGC	2	8	58977	58984	0 %	25 %	50 %	25 %	525814242
128	NC_021810	TCCT	2	8	59289	59296	0 %	50 %	0 %	50 %	525814242
129	NC_021810	GGCG	2	8	60087	60094	0 %	0 %	75 %	25 %	525814243
130	NC_021810	GTCA	2	8	60433	60440	25 %	25 %	25 %	25 %	525814243
131	NC_021810	CAGC	2	8	61346	61353	25 %	0 %	25 %	50 %	525814244
132	NC_021810	GCCC	2	8	61472	61479	0 %	0 %	25 %	75 %	525814244
133	NC_021810	GCTG	2	8	61669	61676	0 %	25 %	50 %	25 %	525814244
134	NC_021810	TTCA	2	8	63199	63206	25 %	50 %	0 %	25 %	525814245
135	NC_021810	GCCA	2	8	63378	63385	25 %	0 %	25 %	50 %	525814246
136	NC_021810	AATT	2	8	64041	64048	50 %	50 %	0 %	0 %	525814247
137	NC_021810	ACCG	2	8	64405	64412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021810	AAGC	2	8	64504	64511	50 %	0 %	25 %	25 %	525814248
139	NC_021810	CTAA	2	8	64616	64623	50 %	25 %	0 %	25 %	525814248
140	NC_021810	TCAG	2	8	64642	64649	25 %	25 %	25 %	25 %	525814248
141	NC_021810	TGAT	2	8	65833	65840	25 %	50 %	25 %	0 %	525814249
142	NC_021810	CTGG	2	8	66389	66396	0 %	25 %	50 %	25 %	525814249
143	NC_021810	GTAT	2	8	67443	67450	25 %	50 %	25 %	0 %	525814249
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