MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 61923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021810	TGG	2	6	421	426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814192
2	NC_021810	TCG	2	6	547	552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814192
3	NC_021810	TTC	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814192
4	NC_021810	CGC	2	6	686	691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814192
5	NC_021810	CCG	2	6	727	732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814192
6	NC_021810	CGT	2	6	800	805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814192
7	NC_021810	GCC	2	6	873	878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814192
8	NC_021810	GAT	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814192
9	NC_021810	GAT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814192
10	NC_021810	AAC	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814192
11	NC_021810	CAG	2	6	981	986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814192
12	NC_021810	TTA	2	6	1015	1020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814192
13	NC_021810	CGG	2	6	1060	1065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814192
14	NC_021810	GCC	2	6	1075	1080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814192
15	NC_021810	CAC	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814192
16	NC_021810	CCG	2	6	1154	1159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814193
17	NC_021810	GCC	2	6	1260	1265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814193
18	NC_021810	CTG	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814193
19	NC_021810	CAT	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814193
20	NC_021810	CAG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814193
21	NC_021810	ATG	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814194
22	NC_021810	CAG	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814194
23	NC_021810	CAG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814194
24	NC_021810	ACC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814194
25	NC_021810	TCG	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814194
26	NC_021810	ATA	2	6	2023	2028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814195
27	NC_021810	CAG	2	6	2040	2045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814195
28	NC_021810	TAA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814195
29	NC_021810	GCG	2	6	2213	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814195
30	NC_021810	CCG	2	6	2355	2360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814195
31	NC_021810	CAC	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814195
32	NC_021810	GCG	2	6	2563	2568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814195
33	NC_021810	TCA	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814195
34	NC_021810	CCA	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814196
35	NC_021810	TTG	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814196
36	NC_021810	CGT	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814196
37	NC_021810	GCC	2	6	3065	3070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814196
38	NC_021810	AGC	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814196
39	NC_021810	CGC	2	6	3081	3086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814196
40	NC_021810	CTT	3	9	3141	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814196
41	NC_021810	GCA	2	6	3201	3206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814196
42	NC_021810	CAG	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814196
43	NC_021810	GCG	2	6	3401	3406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814196
44	NC_021810	TTG	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814196
45	NC_021810	CCA	3	9	3549	3557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814196
46	NC_021810	ATA	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814196
47	NC_021810	CAG	2	6	3802	3807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814196
48	NC_021810	GCA	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814196
49	NC_021810	TCA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814196
50	NC_021810	GCA	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814196
51	NC_021810	ATC	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814196
52	NC_021810	CGC	2	6	4002	4007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814196
53	NC_021810	TGT	2	6	4022	4027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814196
54	NC_021810	ATC	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814197
55	NC_021810	TGG	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814197
56	NC_021810	CCA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814197
57	NC_021810	TCA	2	6	4290	4295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814197
58	NC_021810	CAG	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814197
59	NC_021810	TTA	2	6	4433	4438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814197
60	NC_021810	GCC	2	6	4561	4566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814197
61	NC_021810	GCA	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814197
62	NC_021810	CGC	2	6	5228	5233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814198
63	NC_021810	AGC	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814198
64	NC_021810	CCG	2	6	5367	5372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814198
65	NC_021810	TGT	2	6	5376	5381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814198
66	NC_021810	ATT	2	6	5388	5393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814198
67	NC_021810	CAA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814198
68	NC_021810	CGC	2	6	5515	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814198
69	NC_021810	ATC	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814198
70	NC_021810	GAT	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814198
71	NC_021810	GGC	2	6	5674	5679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814198
72	NC_021810	CCA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814198
73	NC_021810	GAA	2	6	5735	5740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814198
74	NC_021810	GAA	2	6	5791	5796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814198
75	NC_021810	GCT	2	6	5803	5808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814198
76	NC_021810	TTG	2	6	5832	5837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814198
77	NC_021810	CGC	2	6	5935	5940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814198
78	NC_021810	ATG	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814198
79	NC_021810	CGA	2	6	6045	6050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814198
80	NC_021810	CCT	2	6	6099	6104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814198
81	NC_021810	ACG	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814198
82	NC_021810	TGC	2	6	6213	6218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814198
83	NC_021810	GAA	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814199
84	NC_021810	TTG	2	6	8140	8145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814199
85	NC_021810	TAC	2	6	8156	8161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814199
86	NC_021810	GCG	2	6	8287	8292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814199
87	NC_021810	ACC	2	6	8313	8318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814199
88	NC_021810	TCA	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814199
89	NC_021810	GGC	2	6	8381	8386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814200
90	NC_021810	GGT	2	6	8408	8413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814200
91	NC_021810	CTT	2	6	8508	8513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814200
92	NC_021810	CCG	2	6	8523	8528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814200
93	NC_021810	AGC	2	6	8536	8541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814200
94	NC_021810	CAC	2	6	8560	8565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814200
95	NC_021810	TGA	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814200
96	NC_021810	CGC	2	6	8653	8658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814200
97	NC_021810	CGC	2	6	8698	8703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814200
98	NC_021810	GAC	2	6	8719	8724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814200
99	NC_021810	ACG	2	6	8851	8856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814200
100	NC_021810	CAC	2	6	8899	8904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814200
101	NC_021810	TCA	2	6	8918	8923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814200
102	NC_021810	GCC	2	6	8968	8973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814200
103	NC_021810	GGA	2	6	8983	8988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814200
104	NC_021810	GGA	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814200
105	NC_021810	CGT	2	6	9248	9253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814201
106	NC_021810	ATC	3	9	9265	9273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814201
107	NC_021810	GCT	2	6	9372	9377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814201
108	NC_021810	ATC	2	6	9385	9390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814201
109	NC_021810	CTG	3	9	9414	9422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814201
110	NC_021810	GCC	2	6	9496	9501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814201
111	NC_021810	TGC	2	6	9502	9507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814201
112	NC_021810	GGC	2	6	9690	9695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814201
113	NC_021810	TGC	2	6	9773	9778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814201
114	NC_021810	CGC	2	6	9818	9823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814201
115	NC_021810	CCA	2	6	9827	9832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814201
116	NC_021810	TCC	2	6	9897	9902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814202
117	NC_021810	AAC	2	6	9942	9947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814202
118	NC_021810	GGC	2	6	9955	9960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814202
119	NC_021810	CGA	2	6	9975	9980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814202
120	NC_021810	CAG	2	6	10127	10132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814202
121	NC_021810	GCG	2	6	10135	10140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814202
122	NC_021810	TGT	2	6	10197	10202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814202
123	NC_021810	ACG	2	6	10204	10209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814202
124	NC_021810	ATC	2	6	10260	10265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814202
125	NC_021810	GTA	2	6	10280	10285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814202
126	NC_021810	CGG	2	6	10338	10343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814202
127	NC_021810	GCC	3	9	10494	10502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814202
128	NC_021810	AGC	2	6	10503	10508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814202
129	NC_021810	CAG	2	6	10511	10516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814202
130	NC_021810	CTG	2	6	10671	10676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814203
131	NC_021810	TCA	2	6	10679	10684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814203
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250	NC_021810	GAT	2	6	19425	19430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814209
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252	NC_021810	CAG	2	6	19485	19490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814209
253	NC_021810	GTT	2	6	19560	19565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814209
254	NC_021810	CGC	2	6	19595	19600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814209
255	NC_021810	CGT	2	6	19749	19754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814209
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257	NC_021810	CGC	2	6	19859	19864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814209
258	NC_021810	CCA	2	6	19865	19870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814209
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285	NC_021810	GCG	2	6	21715	21720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814210
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376	NC_021810	TGA	2	6	31428	31433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814218
377	NC_021810	GCA	2	6	31471	31476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814218
378	NC_021810	CAG	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814218
379	NC_021810	GCC	2	6	31510	31515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814218
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381	NC_021810	CAT	2	6	32137	32142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814219
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384	NC_021810	CTA	2	6	32335	32340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814219
385	NC_021810	TGC	2	6	32460	32465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814219
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387	NC_021810	ATC	2	6	32751	32756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814219
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389	NC_021810	GGC	2	6	32825	32830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814219
390	NC_021810	GTG	2	6	32888	32893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814219
391	NC_021810	GAC	2	6	32942	32947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814219
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402	NC_021810	ATG	2	6	33902	33907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814219
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405	NC_021810	TCT	2	6	34047	34052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814219
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500	NC_021810	ATC	2	6	43427	43432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814230

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