MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes HSC5

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021807	AGTGTA	2	12	21882	21893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021807	ACTAAT	2	12	21910	21921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021807	AGTGTA	2	12	27884	27895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021807	ACTAAT	2	12	27912	27923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021807	TATTTT	2	12	64812	64823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021807	AGTGTA	2	12	85866	85877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021807	ACTAAT	2	12	85894	85905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021807	TTCGGG	2	12	86836	86847	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021807	GTAAAA	2	12	121450	121461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021807	AGATAA	2	12	128401	128412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021807	AGATAA	2	12	139830	139841	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021807	CTTTAT	2	12	164706	164717	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021807	CTCTTT	2	12	166570	166581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021807	TGACAC	2	12	185305	185316	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021807	CAGTTC	2	12	189944	189955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021807	TTTAAA	2	12	191793	191804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021807	AGTGTA	2	12	264552	264563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021807	ACTAAT	2	12	264580	264591	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021807	TTAAAA	2	12	284972	284983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021807	TTTAAT	2	12	302052	302063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021807	TTTTAG	2	12	313407	313418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021807	ATTTAA	2	12	362936	362947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021807	TGACAA	2	12	388553	388564	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021807	GACTTC	2	12	391230	391241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021807	GAAATC	2	12	391653	391664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021807	ATTCAG	2	12	395157	395168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021807	AGAAAT	2	12	409647	409658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021807	ATTTTA	2	12	440922	440933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021807	GAGTAA	2	12	446711	446722	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021807	TAAAAA	2	12	468065	468076	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021807	AGGACT	2	12	473187	473198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021807	AAAAGA	2	12	485640	485651	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021807	TAAAAA	2	12	492603	492614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021807	AAAAGA	2	12	492786	492797	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021807	CCTTGT	2	12	560069	560080	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021807	TCAAGC	2	12	603261	603272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021807	TAAATA	2	12	674272	674283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021807	AGGTAA	2	12	685072	685083	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021807	TTCGGG	2	12	721138	721149	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021807	ATGCTT	2	12	725211	725222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021807	AAGAGG	2	12	777363	777374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021807	CAATTC	2	12	813561	813572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021807	TGGTTT	2	12	813699	813710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021807	GTATTG	2	12	830093	830104	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021807	TTAAAA	2	12	831997	832008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021807	ATCTCT	2	12	899348	899359	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021807	TTTAAA	2	12	942366	942377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021807	AGTCTT	2	12	945227	945238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021807	ATCAGT	2	12	992206	992217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021807	TTGTTT	2	12	1018770	1018781	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021807	ATATGA	2	12	1043959	1043970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021807	TCTTTT	2	12	1091076	1091087	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021807	CCTTGG	2	12	1123078	1123089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021807	AAATTT	2	12	1163876	1163887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021807	TGACTT	2	12	1182497	1182508	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021807	ATGATA	2	12	1189004	1189015	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021807	TAGAAT	2	12	1198848	1198859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021807	CTTAAG	2	12	1206703	1206714	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021807	TCCTTC	2	12	1264994	1265005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021807	CTCAAT	2	12	1269228	1269239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021807	TATTAG	2	12	1270521	1270532	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021807	TACACT	2	12	1270550	1270561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021807	GAAAAA	2	12	1276017	1276028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021807	CAATTC	2	12	1295105	1295116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021807	TATTTT	2	12	1296176	1296187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021807	AATACC	2	12	1305191	1305202	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021807	TTAATA	2	12	1311062	1311073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021807	ATAGGT	2	12	1311657	1311668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021807	ATCTCA	2	12	1311679	1311690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021807	CATTAA	2	12	1311698	1311709	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021807	AGCATG	2	12	1312248	1312259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021807	ACTGAC	2	12	1312490	1312501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021807	GTCCGT	2	12	1336736	1336747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021807	CTTTTC	2	12	1355570	1355581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021807	ATTCCA	2	12	1406632	1406643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021807	AGCCTT	2	12	1473222	1473233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021807	CTTTGT	2	12	1480386	1480397	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021807	AATATT	2	12	1517797	1517808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021807	TTGCTT	2	12	1533545	1533556	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021807	TATAAT	2	12	1536390	1536401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021807	AATTTT	2	12	1544075	1544086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021807	TTGGTT	2	12	1544442	1544453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021807	TAACAA	2	12	1547491	1547502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021807	TTTTTC	2	12	1549878	1549889	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021807	AGAAAA	2	12	1552574	1552585	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021807	TATTAG	2	12	1558906	1558917	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021807	TACACT	2	12	1558935	1558946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021807	GTTAAA	2	12	1574066	1574077	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021807	AAGATA	2	12	1585471	1585482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021807	TTAATA	2	12	1736432	1736443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021807	ATTTTA	2	12	1746857	1746868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021807	TTTTCA	2	12	1754051	1754062	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021807	TAAAAA	2	12	1766031	1766042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021807	AATTTA	3	18	1777501	1777518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021807	GAAAAA	2	12	1813895	1813906	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.