MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes HSC5

Total Repeats: 1416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021807	GGTAA	2	10	2667	2676	40 %	20 %	40 %	0 %	525808975
2	NC_021807	TGAAA	2	10	2977	2986	60 %	20 %	20 %	0 %	525808976
3	NC_021807	TGGTA	2	10	3603	3612	20 %	40 %	40 %	0 %	525808977
4	NC_021807	GATTT	2	10	6169	6178	20 %	60 %	20 %	0 %	525808979
5	NC_021807	TCAAT	2	10	11677	11686	40 %	40 %	0 %	20 %	525808983
6	NC_021807	ATTAA	2	10	11998	12007	60 %	40 %	0 %	0 %	525808983
7	NC_021807	TACAC	2	10	15946	15955	40 %	20 %	0 %	40 %	525808986
8	NC_021807	TAAAT	2	10	15956	15965	60 %	40 %	0 %	0 %	525808986
9	NC_021807	ACATT	2	10	16523	16532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021807	TCGTG	2	10	18142	18151	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021807	GTTAA	2	10	19039	19048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021807	GGGAG	2	10	19558	19567	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021807	AGGGA	2	10	21769	21778	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021807	GCTTA	2	10	22135	22144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021807	TCGTG	2	10	24144	24153	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021807	GTTAA	2	10	25041	25050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021807	GGGAG	2	10	25560	25569	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021807	AGGGA	2	10	27771	27780	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021807	GCTTA	2	10	28137	28146	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021807	TTCTT	2	10	29970	29979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021807	CTTTT	2	10	30076	30085	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021807	TATAA	2	10	32512	32521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021807	AGTGA	2	10	33259	33268	40 %	20 %	40 %	0 %	525808988
24	NC_021807	ATTTT	2	10	33958	33967	20 %	80 %	0 %	0 %	525808989
25	NC_021807	TTGAT	2	10	34147	34156	20 %	60 %	20 %	0 %	525808989
26	NC_021807	TGGTG	2	10	36231	36240	0 %	40 %	60 %	0 %	525808992
27	NC_021807	AGCAG	2	10	43479	43488	40 %	0 %	40 %	20 %	525808996
28	NC_021807	GGTCA	2	10	43843	43852	20 %	20 %	40 %	20 %	525808996
29	NC_021807	TTGGG	2	10	44239	44248	0 %	40 %	60 %	0 %	525808997
30	NC_021807	GCAGG	2	10	48319	48328	20 %	0 %	60 %	20 %	525808999
31	NC_021807	CTGCC	2	10	49283	49292	0 %	20 %	20 %	60 %	525809000
32	NC_021807	CTCAG	2	10	49676	49685	20 %	20 %	20 %	40 %	525809000
33	NC_021807	TACTA	2	10	51314	51323	40 %	40 %	0 %	20 %	525810409
34	NC_021807	AAATT	2	10	51607	51616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021807	CAAAT	2	10	51821	51830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021807	TGTAT	2	10	54144	54153	20 %	60 %	20 %	0 %	525809002
37	NC_021807	TATTT	2	10	54223	54232	20 %	80 %	0 %	0 %	525809002
38	NC_021807	TCGGA	2	10	54572	54581	20 %	20 %	40 %	20 %	525809003
39	NC_021807	GCTTT	2	10	57317	57326	0 %	60 %	20 %	20 %	525809006
40	NC_021807	TTTTC	2	10	57515	57524	0 %	80 %	0 %	20 %	525809006
41	NC_021807	AAACC	2	10	57580	57589	60 %	0 %	0 %	40 %	525809006
42	NC_021807	ATTCA	2	10	60036	60045	40 %	40 %	0 %	20 %	525809007
43	NC_021807	ATTTT	2	10	61301	61310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021807	AAATA	2	10	62569	62578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021807	TATAT	2	10	62654	62663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021807	TTTTA	2	10	63808	63817	20 %	80 %	0 %	0 %	525809009
47	NC_021807	AAAGC	2	10	64001	64010	60 %	0 %	20 %	20 %	525809009
48	NC_021807	TTTGG	2	10	67995	68004	0 %	60 %	40 %	0 %	525809016
49	NC_021807	TTCAC	2	10	68351	68360	20 %	40 %	0 %	40 %	525809017
50	NC_021807	GAAAT	2	10	69432	69441	60 %	20 %	20 %	0 %	525809019
51	NC_021807	AAGGA	2	10	70512	70521	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021807	TCCAA	2	10	75132	75141	40 %	20 %	0 %	40 %	525809031
53	NC_021807	AGAAT	2	10	75702	75711	60 %	20 %	20 %	0 %	525809031
54	NC_021807	GTTTC	2	10	77781	77790	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021807	TCGTG	2	10	82126	82135	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021807	GTTAA	2	10	83023	83032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021807	GGGAG	2	10	83542	83551	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021807	AGGGA	2	10	85753	85762	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021807	GCTTA	2	10	86119	86128	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021807	ATTAT	2	10	86409	86418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021807	TATAT	2	10	86492	86501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021807	CTTGG	2	10	90428	90437	0 %	40 %	40 %	20 %	525809039
63	NC_021807	TCTTA	2	10	90846	90855	20 %	60 %	0 %	20 %	525809039
64	NC_021807	CACTC	2	10	92391	92400	20 %	20 %	0 %	60 %	525809041
65	NC_021807	GATTG	2	10	94652	94661	20 %	40 %	40 %	0 %	525809042
66	NC_021807	TTGAT	2	10	104811	104820	20 %	60 %	20 %	0 %	525809046
67	NC_021807	AAATC	2	10	104979	104988	60 %	20 %	0 %	20 %	525809046
68	NC_021807	TGAAG	2	10	110295	110304	40 %	20 %	40 %	0 %	525809053
69	NC_021807	AGAAA	2	10	111736	111745	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021807	TTTAG	2	10	112005	112014	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021807	TTTAG	2	10	112154	112163	20 %	60 %	20 %	0 %	525809055
72	NC_021807	GTGTT	2	10	116557	116566	0 %	60 %	40 %	0 %	525810422
73	NC_021807	TTAAG	2	10	116757	116766	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021807	TAAAT	2	10	117513	117522	60 %	40 %	0 %	0 %	525809061
75	NC_021807	AAATC	2	10	118389	118398	60 %	20 %	0 %	20 %	525810423
76	NC_021807	GAGAG	2	10	118551	118560	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021807	TTTAA	2	10	118855	118864	40 %	60 %	0 %	0 %	525810424
78	NC_021807	TAAAA	2	10	121878	121887	80 %	20 %	0 %	0 %	525810425
79	NC_021807	AGGAG	2	10	129014	129023	40 %	0 %	60 %	0 %	525810431
80	NC_021807	TAATT	2	10	129841	129850	40 %	60 %	0 %	0 %	525810431
81	NC_021807	TCAGG	2	10	130304	130313	20 %	20 %	40 %	20 %	525810431
82	NC_021807	TTTTA	2	10	132076	132085	20 %	80 %	0 %	0 %	525809062
83	NC_021807	GCTTT	3	15	132652	132666	0 %	60 %	20 %	20 %	525809062
84	NC_021807	GTCAT	2	10	132971	132980	20 %	40 %	20 %	20 %	525809062
85	NC_021807	TAGTG	2	10	133916	133925	20 %	40 %	40 %	0 %	525809063
86	NC_021807	GTTAA	2	10	134319	134328	40 %	40 %	20 %	0 %	525809063
87	NC_021807	AATAA	2	10	134348	134357	80 %	20 %	0 %	0 %	525809063
88	NC_021807	TTGAT	2	10	135435	135444	20 %	60 %	20 %	0 %	525809064
89	NC_021807	TTGAC	2	10	136657	136666	20 %	40 %	20 %	20 %	525809066
90	NC_021807	TACCT	2	10	136838	136847	20 %	40 %	0 %	40 %	525809066
91	NC_021807	AATCA	2	10	137618	137627	60 %	20 %	0 %	20 %	525809067
92	NC_021807	TCATG	2	10	138225	138234	20 %	40 %	20 %	20 %	525809068
93	NC_021807	AACAA	2	10	139371	139380	80 %	0 %	0 %	20 %	525809069
94	NC_021807	TTGGC	2	10	139456	139465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021807	CAAAA	2	10	140589	140598	80 %	0 %	0 %	20 %	525809071
96	NC_021807	TTTTA	2	10	141662	141671	20 %	80 %	0 %	0 %	525809071
97	NC_021807	AAAGC	2	10	142850	142859	60 %	0 %	20 %	20 %	525809073
98	NC_021807	AGTTC	2	10	143100	143109	20 %	40 %	20 %	20 %	525809073
99	NC_021807	GCTGA	2	10	143120	143129	20 %	20 %	40 %	20 %	525809073
100	NC_021807	ATCGC	2	10	146494	146503	20 %	20 %	20 %	40 %	525809076
101	NC_021807	TTGGG	2	10	147897	147906	0 %	40 %	60 %	0 %	525809077
102	NC_021807	GTACG	2	10	152288	152297	20 %	20 %	40 %	20 %	525809081
103	NC_021807	GAAAA	2	10	153207	153216	80 %	0 %	20 %	0 %	525809082
104	NC_021807	GGATT	2	10	153324	153333	20 %	40 %	40 %	0 %	525809082
105	NC_021807	TTTTG	2	10	153844	153853	0 %	80 %	20 %	0 %	525809082
106	NC_021807	TCATG	2	10	155351	155360	20 %	40 %	20 %	20 %	525809084
107	NC_021807	GATGT	2	10	155985	155994	20 %	40 %	40 %	0 %	525809084
108	NC_021807	GTATC	2	10	156611	156620	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021807	GTCGC	2	10	157050	157059	0 %	20 %	40 %	40 %	525809085
110	NC_021807	ATTAT	2	10	159130	159139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021807	CTTGT	2	10	161657	161666	0 %	60 %	20 %	20 %	525809088
112	NC_021807	GCAAC	2	10	162590	162599	40 %	0 %	20 %	40 %	525809089
113	NC_021807	CGTCA	2	10	164469	164478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_021807	AACAA	2	10	166208	166217	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021807	ATTTG	2	10	170550	170559	20 %	60 %	20 %	0 %	525809096
116	NC_021807	CAAGA	2	10	172472	172481	60 %	0 %	20 %	20 %	525809097
117	NC_021807	TTTGG	2	10	173641	173650	0 %	60 %	40 %	0 %	525809098
118	NC_021807	TGGAT	2	10	174590	174599	20 %	40 %	40 %	0 %	525809099
119	NC_021807	TTGCC	2	10	174965	174974	0 %	40 %	20 %	40 %	525809099
120	NC_021807	ACCTA	2	10	175662	175671	40 %	20 %	0 %	40 %	525809099
121	NC_021807	GGAAA	2	10	180702	180711	60 %	0 %	40 %	0 %	525809103
122	NC_021807	TAATC	2	10	183527	183536	40 %	40 %	0 %	20 %	525809107
123	NC_021807	TCTAA	2	10	186809	186818	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021807	TTTAC	2	10	187658	187667	20 %	60 %	0 %	20 %	525810433
125	NC_021807	CAAAC	2	10	190177	190186	60 %	0 %	0 %	40 %	525809112
126	NC_021807	AGATA	2	10	190291	190300	60 %	20 %	20 %	0 %	525809112
127	NC_021807	ATATA	2	10	191080	191089	60 %	40 %	0 %	0 %	525809112
128	NC_021807	TTAAA	2	10	191591	191600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021807	TTTTG	2	10	194967	194976	0 %	80 %	20 %	0 %	525809115
130	NC_021807	ATCGC	2	10	196285	196294	20 %	20 %	20 %	40 %	525809117
131	NC_021807	TTTTA	2	10	197453	197462	20 %	80 %	0 %	0 %	525809118
132	NC_021807	CTAAT	2	10	197691	197700	40 %	40 %	0 %	20 %	525809118
133	NC_021807	GAATG	2	10	198214	198223	40 %	20 %	40 %	0 %	525809118
134	NC_021807	GACAG	2	10	200642	200651	40 %	0 %	40 %	20 %	525809120
135	NC_021807	TGTCT	2	10	200708	200717	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021807	TAAGA	2	10	202226	202235	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021807	CCTTC	2	10	202641	202650	0 %	40 %	0 %	60 %	525809122
138	NC_021807	GCTAA	2	10	202684	202693	40 %	20 %	20 %	20 %	525809122
139	NC_021807	TGGAT	2	10	204775	204784	20 %	40 %	40 %	0 %	525809124
140	NC_021807	CTTTT	2	10	204945	204954	0 %	80 %	0 %	20 %	525809124
141	NC_021807	GTAAA	2	10	205368	205377	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_021807	TTGTC	2	10	216524	216533	0 %	60 %	20 %	20 %	525809136
152	NC_021807	AAAAG	2	10	219044	219053	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_021807	TTGTA	2	10	258808	258817	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021807	TCGTG	2	10	260813	260822	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
174	NC_021807	GTTAA	2	10	261709	261718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021807	GGGAG	2	10	262228	262237	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_021807	AAAAG	2	10	265115	265124	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_021807	ATTAT	2	10	279010	279019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_021807	ATTTT	2	10	280683	280692	20 %	80 %	0 %	0 %	525809184
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244	NC_021807	AGTTG	2	10	337067	337076	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_021807	AACAA	2	10	338125	338134	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_021807	AATGA	2	10	341320	341329	60 %	20 %	20 %	0 %	525809244
253	NC_021807	TCTAC	2	10	341402	341411	20 %	40 %	0 %	40 %	525809244
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255	NC_021807	TTGAT	2	10	344777	344786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
256	NC_021807	TGGAA	2	10	347047	347056	40 %	20 %	40 %	0 %	525809246
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259	NC_021807	AGTAG	2	10	348583	348592	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021807	CCATG	2	10	351709	351718	20 %	20 %	20 %	40 %	525809249
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262	NC_021807	AGAAA	2	10	354443	354452	80 %	0 %	20 %	0 %	525809251
263	NC_021807	ATTTC	2	10	355159	355168	20 %	60 %	0 %	20 %	525810450
264	NC_021807	ATGTG	2	10	355844	355853	20 %	40 %	40 %	0 %	525810451
265	NC_021807	ACTGC	2	10	357344	357353	20 %	20 %	20 %	40 %	525809253
266	NC_021807	TGAGA	2	10	357742	357751	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
267	NC_021807	TAAAT	2	10	361605	361614	60 %	40 %	0 %	0 %	525809257
268	NC_021807	CAATT	2	10	363892	363901	40 %	40 %	0 %	20 %	525809261
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