MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes HSC5

Total Repeats: 1107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021807	GGTAA	2	10	2667	2676	40 %	20 %	40 %	0 %	525808975
2	NC_021807	TGAAA	2	10	2977	2986	60 %	20 %	20 %	0 %	525808976
3	NC_021807	TGGTA	2	10	3603	3612	20 %	40 %	40 %	0 %	525808977
4	NC_021807	GATTT	2	10	6169	6178	20 %	60 %	20 %	0 %	525808979
5	NC_021807	TCAAT	2	10	11677	11686	40 %	40 %	0 %	20 %	525808983
6	NC_021807	ATTAA	2	10	11998	12007	60 %	40 %	0 %	0 %	525808983
7	NC_021807	TACAC	2	10	15946	15955	40 %	20 %	0 %	40 %	525808986
8	NC_021807	TAAAT	2	10	15956	15965	60 %	40 %	0 %	0 %	525808986
9	NC_021807	AGTGA	2	10	33259	33268	40 %	20 %	40 %	0 %	525808988
10	NC_021807	ATTTT	2	10	33958	33967	20 %	80 %	0 %	0 %	525808989
11	NC_021807	TTGAT	2	10	34147	34156	20 %	60 %	20 %	0 %	525808989
12	NC_021807	TGGTG	2	10	36231	36240	0 %	40 %	60 %	0 %	525808992
13	NC_021807	AGCAG	2	10	43479	43488	40 %	0 %	40 %	20 %	525808996
14	NC_021807	GGTCA	2	10	43843	43852	20 %	20 %	40 %	20 %	525808996
15	NC_021807	TTGGG	2	10	44239	44248	0 %	40 %	60 %	0 %	525808997
16	NC_021807	GCAGG	2	10	48319	48328	20 %	0 %	60 %	20 %	525808999
17	NC_021807	CTGCC	2	10	49283	49292	0 %	20 %	20 %	60 %	525809000
18	NC_021807	CTCAG	2	10	49676	49685	20 %	20 %	20 %	40 %	525809000
19	NC_021807	TACTA	2	10	51314	51323	40 %	40 %	0 %	20 %	525810409
20	NC_021807	TGTAT	2	10	54144	54153	20 %	60 %	20 %	0 %	525809002
21	NC_021807	TATTT	2	10	54223	54232	20 %	80 %	0 %	0 %	525809002
22	NC_021807	TCGGA	2	10	54572	54581	20 %	20 %	40 %	20 %	525809003
23	NC_021807	GCTTT	2	10	57317	57326	0 %	60 %	20 %	20 %	525809006
24	NC_021807	TTTTC	2	10	57515	57524	0 %	80 %	0 %	20 %	525809006
25	NC_021807	AAACC	2	10	57580	57589	60 %	0 %	0 %	40 %	525809006
26	NC_021807	ATTCA	2	10	60036	60045	40 %	40 %	0 %	20 %	525809007
27	NC_021807	TTTTA	2	10	63808	63817	20 %	80 %	0 %	0 %	525809009
28	NC_021807	AAAGC	2	10	64001	64010	60 %	0 %	20 %	20 %	525809009
29	NC_021807	TTTGG	2	10	67995	68004	0 %	60 %	40 %	0 %	525809016
30	NC_021807	TTCAC	2	10	68351	68360	20 %	40 %	0 %	40 %	525809017
31	NC_021807	GAAAT	2	10	69432	69441	60 %	20 %	20 %	0 %	525809019
32	NC_021807	TCCAA	2	10	75132	75141	40 %	20 %	0 %	40 %	525809031
33	NC_021807	AGAAT	2	10	75702	75711	60 %	20 %	20 %	0 %	525809031
34	NC_021807	CTTGG	2	10	90428	90437	0 %	40 %	40 %	20 %	525809039
35	NC_021807	TCTTA	2	10	90846	90855	20 %	60 %	0 %	20 %	525809039
36	NC_021807	CACTC	2	10	92391	92400	20 %	20 %	0 %	60 %	525809041
37	NC_021807	GATTG	2	10	94652	94661	20 %	40 %	40 %	0 %	525809042
38	NC_021807	TTGAT	2	10	104811	104820	20 %	60 %	20 %	0 %	525809046
39	NC_021807	AAATC	2	10	104979	104988	60 %	20 %	0 %	20 %	525809046
40	NC_021807	TGAAG	2	10	110295	110304	40 %	20 %	40 %	0 %	525809053
41	NC_021807	TTTAG	2	10	112154	112163	20 %	60 %	20 %	0 %	525809055
42	NC_021807	GTGTT	2	10	116557	116566	0 %	60 %	40 %	0 %	525810422
43	NC_021807	TAAAT	2	10	117513	117522	60 %	40 %	0 %	0 %	525809061
44	NC_021807	AAATC	2	10	118389	118398	60 %	20 %	0 %	20 %	525810423
45	NC_021807	TTTAA	2	10	118855	118864	40 %	60 %	0 %	0 %	525810424
46	NC_021807	TAAAA	2	10	121878	121887	80 %	20 %	0 %	0 %	525810425
47	NC_021807	AGGAG	2	10	129014	129023	40 %	0 %	60 %	0 %	525810431
48	NC_021807	TAATT	2	10	129841	129850	40 %	60 %	0 %	0 %	525810431
49	NC_021807	TCAGG	2	10	130304	130313	20 %	20 %	40 %	20 %	525810431
50	NC_021807	TTTTA	2	10	132076	132085	20 %	80 %	0 %	0 %	525809062
51	NC_021807	GCTTT	3	15	132652	132666	0 %	60 %	20 %	20 %	525809062
52	NC_021807	GTCAT	2	10	132971	132980	20 %	40 %	20 %	20 %	525809062
53	NC_021807	TAGTG	2	10	133916	133925	20 %	40 %	40 %	0 %	525809063
54	NC_021807	GTTAA	2	10	134319	134328	40 %	40 %	20 %	0 %	525809063
55	NC_021807	AATAA	2	10	134348	134357	80 %	20 %	0 %	0 %	525809063
56	NC_021807	TTGAT	2	10	135435	135444	20 %	60 %	20 %	0 %	525809064
57	NC_021807	TTGAC	2	10	136657	136666	20 %	40 %	20 %	20 %	525809066
58	NC_021807	TACCT	2	10	136838	136847	20 %	40 %	0 %	40 %	525809066
59	NC_021807	AATCA	2	10	137618	137627	60 %	20 %	0 %	20 %	525809067
60	NC_021807	TCATG	2	10	138225	138234	20 %	40 %	20 %	20 %	525809068
61	NC_021807	AACAA	2	10	139371	139380	80 %	0 %	0 %	20 %	525809069
62	NC_021807	CAAAA	2	10	140589	140598	80 %	0 %	0 %	20 %	525809071
63	NC_021807	TTTTA	2	10	141662	141671	20 %	80 %	0 %	0 %	525809071
64	NC_021807	AAAGC	2	10	142850	142859	60 %	0 %	20 %	20 %	525809073
65	NC_021807	AGTTC	2	10	143100	143109	20 %	40 %	20 %	20 %	525809073
66	NC_021807	GCTGA	2	10	143120	143129	20 %	20 %	40 %	20 %	525809073
67	NC_021807	ATCGC	2	10	146494	146503	20 %	20 %	20 %	40 %	525809076
68	NC_021807	TTGGG	2	10	147897	147906	0 %	40 %	60 %	0 %	525809077
69	NC_021807	GTACG	2	10	152288	152297	20 %	20 %	40 %	20 %	525809081
70	NC_021807	GAAAA	2	10	153207	153216	80 %	0 %	20 %	0 %	525809082
71	NC_021807	GGATT	2	10	153324	153333	20 %	40 %	40 %	0 %	525809082
72	NC_021807	TTTTG	2	10	153844	153853	0 %	80 %	20 %	0 %	525809082
73	NC_021807	TCATG	2	10	155351	155360	20 %	40 %	20 %	20 %	525809084
74	NC_021807	GATGT	2	10	155985	155994	20 %	40 %	40 %	0 %	525809084
75	NC_021807	GTCGC	2	10	157050	157059	0 %	20 %	40 %	40 %	525809085
76	NC_021807	CTTGT	2	10	161657	161666	0 %	60 %	20 %	20 %	525809088
77	NC_021807	GCAAC	2	10	162590	162599	40 %	0 %	20 %	40 %	525809089
78	NC_021807	ATTTG	2	10	170550	170559	20 %	60 %	20 %	0 %	525809096
79	NC_021807	CAAGA	2	10	172472	172481	60 %	0 %	20 %	20 %	525809097
80	NC_021807	TTTGG	2	10	173641	173650	0 %	60 %	40 %	0 %	525809098
81	NC_021807	TGGAT	2	10	174590	174599	20 %	40 %	40 %	0 %	525809099
82	NC_021807	TTGCC	2	10	174965	174974	0 %	40 %	20 %	40 %	525809099
83	NC_021807	ACCTA	2	10	175662	175671	40 %	20 %	0 %	40 %	525809099
84	NC_021807	GGAAA	2	10	180702	180711	60 %	0 %	40 %	0 %	525809103
85	NC_021807	TAATC	2	10	183527	183536	40 %	40 %	0 %	20 %	525809107
86	NC_021807	TTTAC	2	10	187658	187667	20 %	60 %	0 %	20 %	525810433
87	NC_021807	CAAAC	2	10	190177	190186	60 %	0 %	0 %	40 %	525809112
88	NC_021807	AGATA	2	10	190291	190300	60 %	20 %	20 %	0 %	525809112
89	NC_021807	ATATA	2	10	191080	191089	60 %	40 %	0 %	0 %	525809112
90	NC_021807	TTTTG	2	10	194967	194976	0 %	80 %	20 %	0 %	525809115
91	NC_021807	ATCGC	2	10	196285	196294	20 %	20 %	20 %	40 %	525809117
92	NC_021807	TTTTA	2	10	197453	197462	20 %	80 %	0 %	0 %	525809118
93	NC_021807	CTAAT	2	10	197691	197700	40 %	40 %	0 %	20 %	525809118
94	NC_021807	GAATG	2	10	198214	198223	40 %	20 %	40 %	0 %	525809118
95	NC_021807	GACAG	2	10	200642	200651	40 %	0 %	40 %	20 %	525809120
96	NC_021807	CCTTC	2	10	202641	202650	0 %	40 %	0 %	60 %	525809122
97	NC_021807	GCTAA	2	10	202684	202693	40 %	20 %	20 %	20 %	525809122
98	NC_021807	TGGAT	2	10	204775	204784	20 %	40 %	40 %	0 %	525809124
99	NC_021807	CTTTT	2	10	204945	204954	0 %	80 %	0 %	20 %	525809124
100	NC_021807	GAGAA	2	10	206316	206325	60 %	0 %	40 %	0 %	525809125
101	NC_021807	GTTAT	2	10	207341	207350	20 %	60 %	20 %	0 %	525809126
102	NC_021807	AAGAT	2	10	207427	207436	60 %	20 %	20 %	0 %	525809126
103	NC_021807	AAATG	2	10	208975	208984	60 %	20 %	20 %	0 %	525809127
104	NC_021807	CAAAT	2	10	210120	210129	60 %	20 %	0 %	20 %	525809129
105	NC_021807	CTTTT	2	10	214487	214496	0 %	80 %	0 %	20 %	525809134
106	NC_021807	CTCAT	2	10	214564	214573	20 %	40 %	0 %	40 %	525809134
107	NC_021807	TTTTC	2	10	214784	214793	0 %	80 %	0 %	20 %	525809134
108	NC_021807	TTATT	2	10	215024	215033	20 %	80 %	0 %	0 %	525809134
109	NC_021807	TTGTC	2	10	216524	216533	0 %	60 %	20 %	20 %	525809136
110	NC_021807	GCAGC	2	10	220780	220789	20 %	0 %	40 %	40 %	525809140
111	NC_021807	ATTCC	2	10	222085	222094	20 %	40 %	0 %	40 %	525809141
112	NC_021807	AATCA	2	10	226627	226636	60 %	20 %	0 %	20 %	525809146
113	NC_021807	GAAAC	2	10	230747	230756	60 %	0 %	20 %	20 %	525809148
114	NC_021807	CCAAT	2	10	233002	233011	40 %	20 %	0 %	40 %	525809151
115	NC_021807	CAAGA	2	10	233776	233785	60 %	0 %	20 %	20 %	525809151
116	NC_021807	AAGCT	2	10	234206	234215	40 %	20 %	20 %	20 %	525809151
117	NC_021807	TTTGG	2	10	236756	236765	0 %	60 %	40 %	0 %	525809153
118	NC_021807	TTTTA	2	10	241260	241269	20 %	80 %	0 %	0 %	525809155
119	NC_021807	TGGTT	2	10	243198	243207	0 %	60 %	40 %	0 %	525809157
120	NC_021807	ATTAC	2	10	244593	244602	40 %	40 %	0 %	20 %	525809158
121	NC_021807	TGATT	2	10	245606	245615	20 %	60 %	20 %	0 %	525809159
122	NC_021807	CCAAT	2	10	245863	245872	40 %	20 %	0 %	40 %	525809159
123	NC_021807	GTGAT	2	10	247460	247469	20 %	40 %	40 %	0 %	525809161
124	NC_021807	GGTTC	2	10	251556	251565	0 %	40 %	40 %	20 %	525809164
125	NC_021807	ATAGT	2	10	251676	251685	40 %	40 %	20 %	0 %	525809164
126	NC_021807	CAAAA	2	10	253369	253378	80 %	0 %	0 %	20 %	525809165
127	NC_021807	GCTTG	2	10	266335	266344	0 %	40 %	40 %	20 %	525809170
128	NC_021807	TATCA	2	10	266684	266693	40 %	40 %	0 %	20 %	525809170
129	NC_021807	GCAGA	2	10	268909	268918	40 %	0 %	40 %	20 %	525809173
130	NC_021807	ATGGT	2	10	269126	269135	20 %	40 %	40 %	0 %	525809173
131	NC_021807	GATGA	2	10	271866	271875	40 %	20 %	40 %	0 %	525809176
132	NC_021807	AAGGC	2	10	273942	273951	40 %	0 %	40 %	20 %	525809178
133	NC_021807	AAAAC	2	10	276890	276899	80 %	0 %	0 %	20 %	525809181
134	NC_021807	AGTAA	2	10	277804	277813	60 %	20 %	20 %	0 %	525809182
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