MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes HSC5

Total Repeats: 24908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021807	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021807	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021807	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808974
4	NC_021807	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808974
5	NC_021807	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808974
6	NC_021807	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808974
7	NC_021807	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808974
8	NC_021807	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808974
9	NC_021807	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808974
10	NC_021807	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808974
11	NC_021807	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808974
12	NC_021807	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808974
13	NC_021807	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808974
14	NC_021807	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808974
15	NC_021807	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525808974
16	NC_021807	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808974
17	NC_021807	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808974
18	NC_021807	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808974
19	NC_021807	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525808974
20	NC_021807	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808974
21	NC_021807	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021807	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021807	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021807	ATT	2	6	1769	1774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
25	NC_021807	TCA	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808975
26	NC_021807	TTA	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
27	NC_021807	ATT	2	6	1995	2000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
28	NC_021807	AAC	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525808975
29	NC_021807	GTT	2	6	2052	2057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808975
30	NC_021807	AAG	2	6	2122	2127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808975
31	NC_021807	ATT	2	6	2162	2167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
32	NC_021807	TAT	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
33	NC_021807	GTC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808975
34	NC_021807	CAG	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808975
35	NC_021807	CAG	2	6	2377	2382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808975
36	NC_021807	GAT	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808975
37	NC_021807	TTA	2	6	2505	2510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
38	NC_021807	GTT	2	6	2532	2537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808975
39	NC_021807	GAA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808975
40	NC_021807	TTA	2	6	2913	2918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021807	ATA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021807	ATG	2	6	3098	3103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808976
43	NC_021807	AGA	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021807	AAT	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021807	TCT	2	6	3404	3409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021807	TCT	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021807	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021807	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808977
49	NC_021807	GCT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808977
50	NC_021807	TGA	3	9	3801	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808977
51	NC_021807	GTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808977
52	NC_021807	AAC	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525808977
53	NC_021807	AGT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808977
54	NC_021807	AGA	3	9	4224	4232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808977
55	NC_021807	AGA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808977
56	NC_021807	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808977
57	NC_021807	ATC	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808977
58	NC_021807	CAG	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808977
59	NC_021807	GCT	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808977
60	NC_021807	TAT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808977
61	NC_021807	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808977
62	NC_021807	AAG	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808977
63	NC_021807	GAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808977
64	NC_021807	TGT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808977
65	NC_021807	CAT	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808977
66	NC_021807	GAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808978
67	NC_021807	TTG	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808978
68	NC_021807	GAT	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808978
69	NC_021807	TTA	2	6	4820	4825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808978
70	NC_021807	CTA	2	6	4853	4858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808978
71	NC_021807	AAT	2	6	4867	4872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808978
72	NC_021807	CTA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808978
73	NC_021807	ATG	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808978
74	NC_021807	CAG	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808978
75	NC_021807	GAC	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808978
76	NC_021807	TTA	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808978
77	NC_021807	ATA	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808978
78	NC_021807	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
79	NC_021807	ACC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525808979
80	NC_021807	GAT	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
81	NC_021807	TGA	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
82	NC_021807	TGA	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
83	NC_021807	GAT	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
84	NC_021807	AAC	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525808979
85	NC_021807	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
86	NC_021807	GAT	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
87	NC_021807	AGA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808979
88	NC_021807	ATT	2	6	6071	6076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
89	NC_021807	ATT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
90	NC_021807	GAT	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
91	NC_021807	AGA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808979
92	NC_021807	ACT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808979
93	NC_021807	CTT	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525808979
94	NC_021807	AAC	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525808979
95	NC_021807	TGA	2	6	6587	6592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
96	NC_021807	ACG	2	6	6641	6646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808979
97	NC_021807	TAG	2	6	6848	6853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
98	NC_021807	CTG	2	6	6871	6876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808979
99	NC_021807	TAA	2	6	6896	6901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808979
100	NC_021807	ATG	2	6	6907	6912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
101	NC_021807	TGA	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
102	NC_021807	AAG	2	6	6992	6997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808979
103	NC_021807	GAT	2	6	7026	7031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
104	NC_021807	TGA	3	9	7049	7057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
105	NC_021807	AGA	2	6	7076	7081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808979
106	NC_021807	TAG	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
107	NC_021807	CAG	2	6	7257	7262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808979
108	NC_021807	GTA	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
109	NC_021807	ATT	2	6	7386	7391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
110	NC_021807	AAC	2	6	7462	7467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525808979
111	NC_021807	AAT	2	6	7647	7652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808979
112	NC_021807	GGA	2	6	7695	7700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525808979
113	NC_021807	ATG	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
114	NC_021807	ATC	2	6	7878	7883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808979
115	NC_021807	GAA	2	6	7981	7986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808979
116	NC_021807	GAG	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525808979
117	NC_021807	ATT	2	6	8201	8206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
118	NC_021807	GAT	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
119	NC_021807	AAT	2	6	8502	8507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808979
120	NC_021807	CTT	2	6	8533	8538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525808979
121	NC_021807	ATT	2	6	8560	8565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
122	NC_021807	AGA	2	6	8669	8674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808979
123	NC_021807	ATA	2	6	8738	8743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808979
124	NC_021807	AAC	2	6	8750	8755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021807	TGC	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021807	TTA	2	6	8937	8942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808980
127	NC_021807	CGT	2	6	8945	8950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808980
128	NC_021807	AAG	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808980
129	NC_021807	GAA	2	6	9164	9169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808980
130	NC_021807	AAT	2	6	9189	9194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808981
131	NC_021807	GAA	4	12	9231	9242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808981
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140	NC_021807	TTA	2	6	10171	10176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808982
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253	NC_021807	GGA	2	6	17781	17786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_021807	GGT	2	6	18119	18124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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