MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum FQY_4 megaplasmid

Total Repeats: 1594

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021745	AAGAC	2	10	5113	5122	60 %	0 %	20 %	20 %	525710960
2	NC_021745	GTCCA	2	10	7072	7081	20 %	20 %	20 %	40 %	525710962
3	NC_021745	GCTGT	2	10	7144	7153	0 %	40 %	40 %	20 %	525710962
4	NC_021745	CGCGC	2	10	10430	10439	0 %	0 %	40 %	60 %	525710965
5	NC_021745	CGCAT	2	10	10749	10758	20 %	20 %	20 %	40 %	525710965
6	NC_021745	ATCGA	2	10	12051	12060	40 %	20 %	20 %	20 %	525710966
7	NC_021745	CGGCA	2	10	12612	12621	20 %	0 %	40 %	40 %	525710966
8	NC_021745	CCGCA	2	10	12851	12860	20 %	0 %	20 %	60 %	525710967
9	NC_021745	GCCGG	2	10	13133	13142	0 %	0 %	60 %	40 %	525710967
10	NC_021745	GCCAG	2	10	13342	13351	20 %	0 %	40 %	40 %	525710967
11	NC_021745	GCGCG	2	10	13709	13718	0 %	0 %	60 %	40 %	525710969
12	NC_021745	CCGGC	2	10	14001	14010	0 %	0 %	40 %	60 %	525710969
13	NC_021745	ATGCG	2	10	14970	14979	20 %	20 %	40 %	20 %	525710970
14	NC_021745	GCCGT	2	10	15825	15834	0 %	20 %	40 %	40 %	525710970
15	NC_021745	GCAGC	2	10	15943	15952	20 %	0 %	40 %	40 %	525710970
16	NC_021745	GATGC	2	10	15977	15986	20 %	20 %	40 %	20 %	525710970
17	NC_021745	CGCGC	2	10	16965	16974	0 %	0 %	40 %	60 %	525710971
18	NC_021745	AATGG	2	10	19476	19485	40 %	20 %	40 %	0 %	525710974
19	NC_021745	CGGCG	2	10	22734	22743	0 %	0 %	60 %	40 %	525710977
20	NC_021745	GATGA	2	10	27157	27166	40 %	20 %	40 %	0 %	525710982
21	NC_021745	CCAGG	2	10	28229	28238	20 %	0 %	40 %	40 %	525710983
22	NC_021745	GCAGG	2	10	29617	29626	20 %	0 %	60 %	20 %	525710986
23	NC_021745	TGTAA	2	10	30026	30035	40 %	40 %	20 %	0 %	525710987
24	NC_021745	GGCAC	2	10	31616	31625	20 %	0 %	40 %	40 %	525710988
25	NC_021745	ACGGC	2	10	32515	32524	20 %	0 %	40 %	40 %	525710988
26	NC_021745	AGCAA	2	10	32905	32914	60 %	0 %	20 %	20 %	525710988
27	NC_021745	AACGG	2	10	33129	33138	40 %	0 %	40 %	20 %	525710988
28	NC_021745	CTCAA	2	10	34146	34155	40 %	20 %	0 %	40 %	525710989
29	NC_021745	CCGTG	2	10	35702	35711	0 %	20 %	40 %	40 %	525710990
30	NC_021745	TGGCG	2	10	36761	36770	0 %	20 %	60 %	20 %	525710991
31	NC_021745	GAACG	2	10	38721	38730	40 %	0 %	40 %	20 %	525710994
32	NC_021745	ACGGC	2	10	41397	41406	20 %	0 %	40 %	40 %	525710998
33	NC_021745	TGGCG	2	10	41628	41637	0 %	20 %	60 %	20 %	525710998
34	NC_021745	TGGGA	2	10	42003	42012	20 %	20 %	60 %	0 %	525710998
35	NC_021745	GGCAT	2	10	50223	50232	20 %	20 %	40 %	20 %	525711004
36	NC_021745	GCTGC	2	10	51325	51334	0 %	20 %	40 %	40 %	525711005
37	NC_021745	GAGCC	2	10	52073	52082	20 %	0 %	40 %	40 %	525711006
38	NC_021745	CGGCG	2	10	52187	52196	0 %	0 %	60 %	40 %	525711006
39	NC_021745	ATCGC	2	10	55163	55172	20 %	20 %	20 %	40 %	525711008
40	NC_021745	CGTGG	2	10	55795	55804	0 %	20 %	60 %	20 %	525711008
41	NC_021745	GGCGC	2	10	56400	56409	0 %	0 %	60 %	40 %	525711009
42	NC_021745	GGGCT	2	10	57619	57628	0 %	20 %	60 %	20 %	525711011
43	NC_021745	GCACG	2	10	57645	57654	20 %	0 %	40 %	40 %	525711011
44	NC_021745	CCGCG	2	10	58239	58248	0 %	0 %	40 %	60 %	525711011
45	NC_021745	TCGTC	2	10	59863	59872	0 %	40 %	20 %	40 %	525711012
46	NC_021745	TCGCC	2	10	59884	59893	0 %	20 %	20 %	60 %	525711012
47	NC_021745	GCGCC	2	10	72113	72122	0 %	0 %	40 %	60 %	525711023
48	NC_021745	CGGCG	2	10	75654	75663	0 %	0 %	60 %	40 %	525711024
49	NC_021745	TTCCA	2	10	75863	75872	20 %	40 %	0 %	40 %	525711024
50	NC_021745	TGGCC	2	10	76338	76347	0 %	20 %	40 %	40 %	525711024
51	NC_021745	CGGCG	2	10	76378	76387	0 %	0 %	60 %	40 %	525711024
52	NC_021745	ACCGC	2	10	78346	78355	20 %	0 %	20 %	60 %	525711025
53	NC_021745	GGCCG	2	10	78443	78452	0 %	0 %	60 %	40 %	525711025
54	NC_021745	CGGCG	2	10	78746	78755	0 %	0 %	60 %	40 %	525711025
55	NC_021745	CGGAC	2	10	79024	79033	20 %	0 %	40 %	40 %	525711025
56	NC_021745	TCCAG	2	10	81051	81060	20 %	20 %	20 %	40 %	525711027
57	NC_021745	GCGCG	2	10	84284	84293	0 %	0 %	60 %	40 %	525711030
58	NC_021745	CGGCG	2	10	85225	85234	0 %	0 %	60 %	40 %	525711031
59	NC_021745	CAGGC	2	10	86666	86675	20 %	0 %	40 %	40 %	525711031
60	NC_021745	CGGCG	2	10	86854	86863	0 %	0 %	60 %	40 %	525711031
61	NC_021745	CCGGT	2	10	92714	92723	0 %	20 %	40 %	40 %	525711036
62	NC_021745	GCGTG	2	10	95752	95761	0 %	20 %	60 %	20 %	525711040
63	NC_021745	CGCTG	2	10	96417	96426	0 %	20 %	40 %	40 %	525711040
64	NC_021745	ATCGC	2	10	97895	97904	20 %	20 %	20 %	40 %	525711040
65	NC_021745	CACAC	2	10	97952	97961	40 %	0 %	0 %	60 %	525711040
66	NC_021745	TCCGG	2	10	98309	98318	0 %	20 %	40 %	40 %	525711041
67	NC_021745	GCATC	2	10	98871	98880	20 %	20 %	20 %	40 %	525711041
68	NC_021745	CCGCG	2	10	99690	99699	0 %	0 %	40 %	60 %	525711042
69	NC_021745	ACGAG	2	10	100464	100473	40 %	0 %	40 %	20 %	525711042
70	NC_021745	CCGGC	2	10	102081	102090	0 %	0 %	40 %	60 %	525711043
71	NC_021745	CGCGC	2	10	102430	102439	0 %	0 %	40 %	60 %	525711043
72	NC_021745	CAAGG	2	10	102902	102911	40 %	0 %	40 %	20 %	525711045
73	NC_021745	ACCGA	2	10	103771	103780	40 %	0 %	20 %	40 %	525711047
74	NC_021745	TGTGC	2	10	106279	106288	0 %	40 %	40 %	20 %	525711048
75	NC_021745	TGCGG	2	10	107221	107230	0 %	20 %	60 %	20 %	525711048
76	NC_021745	CTTGC	2	10	108344	108353	0 %	40 %	20 %	40 %	525711049
77	NC_021745	GAGCC	2	10	109548	109557	20 %	0 %	40 %	40 %	525711050
78	NC_021745	CGGCG	2	10	109662	109671	0 %	0 %	60 %	40 %	525711050
79	NC_021745	GCCAG	2	10	111535	111544	20 %	0 %	40 %	40 %	525711051
80	NC_021745	TCCCC	2	10	112957	112966	0 %	20 %	0 %	80 %	525711052
81	NC_021745	AGCGC	2	10	115851	115860	20 %	0 %	40 %	40 %	525711054
82	NC_021745	CGTGC	2	10	116060	116069	0 %	20 %	40 %	40 %	525711054
83	NC_021745	GCGCC	2	10	117497	117506	0 %	0 %	40 %	60 %	525711055
84	NC_021745	GGGCA	2	10	119552	119561	20 %	0 %	60 %	20 %	525711056
85	NC_021745	TTCCC	2	10	122827	122836	0 %	40 %	0 %	60 %	525711061
86	NC_021745	TCGCG	2	10	123508	123517	0 %	20 %	40 %	40 %	525711062
87	NC_021745	CCGGT	2	10	123768	123777	0 %	20 %	40 %	40 %	525711063
88	NC_021745	GGCGT	2	10	123880	123889	0 %	20 %	60 %	20 %	525711063
89	NC_021745	CGGCA	2	10	124074	124083	20 %	0 %	40 %	40 %	525711063
90	NC_021745	GCAAT	2	10	127133	127142	40 %	20 %	20 %	20 %	525711066
91	NC_021745	GATGC	2	10	127359	127368	20 %	20 %	40 %	20 %	525711066
92	NC_021745	CCAGC	2	10	127461	127470	20 %	0 %	20 %	60 %	525711066
93	NC_021745	AGCAG	2	10	131053	131062	40 %	0 %	40 %	20 %	525711070
94	NC_021745	CTTTT	2	10	131456	131465	0 %	80 %	0 %	20 %	525711070
95	NC_021745	CGCTG	2	10	132922	132931	0 %	20 %	40 %	40 %	525711072
96	NC_021745	CAAGC	2	10	133082	133091	40 %	0 %	20 %	40 %	525711072
97	NC_021745	CCGGC	2	10	139994	140003	0 %	0 %	40 %	60 %	525711073
98	NC_021745	CACCT	2	10	141167	141176	20 %	20 %	0 %	60 %	525711073
99	NC_021745	CCGGC	2	10	141226	141235	0 %	0 %	40 %	60 %	525711073
100	NC_021745	TGGTT	2	10	144870	144879	0 %	60 %	40 %	0 %	525711076
101	NC_021745	GGAAC	2	10	144925	144934	40 %	0 %	40 %	20 %	525711076
102	NC_021745	CGCGC	2	10	145673	145682	0 %	0 %	40 %	60 %	525711076
103	NC_021745	GCGGG	2	10	147086	147095	0 %	0 %	80 %	20 %	525711077
104	NC_021745	GCGCG	2	10	147546	147555	0 %	0 %	60 %	40 %	525711079
105	NC_021745	CCAGC	2	10	147919	147928	20 %	0 %	20 %	60 %	525711079
106	NC_021745	CCGGC	2	10	150241	150250	0 %	0 %	40 %	60 %	525711079
107	NC_021745	AGGCC	2	10	151101	151110	20 %	0 %	40 %	40 %	525711079
108	NC_021745	GGCCC	2	10	152088	152097	0 %	0 %	40 %	60 %	525711079
109	NC_021745	GCAGC	2	10	152362	152371	20 %	0 %	40 %	40 %	525711079
110	NC_021745	GCGTC	2	10	153984	153993	0 %	20 %	40 %	40 %	525711079
111	NC_021745	CGGGC	2	10	157485	157494	0 %	0 %	60 %	40 %	525711079
112	NC_021745	CGGGT	2	10	159887	159896	0 %	20 %	60 %	20 %	525711079
113	NC_021745	CGGGC	2	10	160683	160692	0 %	0 %	60 %	40 %	525711079
114	NC_021745	ATGAA	2	10	165679	165688	60 %	20 %	20 %	0 %	525711083
115	NC_021745	TCGGC	2	10	165880	165889	0 %	20 %	40 %	40 %	525711083
116	NC_021745	TGCAG	2	10	166404	166413	20 %	20 %	40 %	20 %	525711084
117	NC_021745	CGCAG	2	10	166997	167006	20 %	0 %	40 %	40 %	525711085
118	NC_021745	CGCGA	2	10	168407	168416	20 %	0 %	40 %	40 %	525711086
119	NC_021745	AGCGA	2	10	170060	170069	40 %	0 %	40 %	20 %	525711086
120	NC_021745	GGGCA	2	10	170207	170216	20 %	0 %	60 %	20 %	525711086
121	NC_021745	GCAGC	2	10	170485	170494	20 %	0 %	40 %	40 %	525711086
122	NC_021745	GCGCG	2	10	173340	173349	0 %	0 %	60 %	40 %	525711088
123	NC_021745	CGAGC	2	10	174007	174016	20 %	0 %	40 %	40 %	525711088
124	NC_021745	CCGCG	2	10	174520	174529	0 %	0 %	40 %	60 %	525711089
125	NC_021745	AGCAG	2	10	177590	177599	40 %	0 %	40 %	20 %	525711093
126	NC_021745	GTCGA	2	10	178649	178658	20 %	20 %	40 %	20 %	525711094
127	NC_021745	GGTCC	2	10	178789	178798	0 %	20 %	40 %	40 %	525711094
128	NC_021745	TGCGG	2	10	178878	178887	0 %	20 %	60 %	20 %	525711094
129	NC_021745	CGGGC	2	10	179425	179434	0 %	0 %	60 %	40 %	525711094
130	NC_021745	CGAGC	2	10	179867	179876	20 %	0 %	40 %	40 %	525711095
131	NC_021745	GATCG	2	10	182467	182476	20 %	20 %	40 %	20 %	525711099
132	NC_021745	CCTGG	2	10	183297	183306	0 %	20 %	40 %	40 %	525711099
133	NC_021745	CCCAG	2	10	183612	183621	20 %	0 %	20 %	60 %	525711099
134	NC_021745	TGGGC	2	10	183654	183663	0 %	20 %	60 %	20 %	525711099
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248	NC_021745	GTACG	2	10	305669	305678	20 %	20 %	40 %	20 %	525711185
249	NC_021745	GCCGC	2	10	305855	305864	0 %	0 %	40 %	60 %	525711185
250	NC_021745	CCCGT	2	10	306014	306023	0 %	20 %	20 %	60 %	525711185
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252	NC_021745	CCGCC	2	10	307274	307283	0 %	0 %	20 %	80 %	525711186
253	NC_021745	GGTGG	2	10	308483	308492	0 %	20 %	80 %	0 %	525711187
254	NC_021745	CGTGG	2	10	309322	309331	0 %	20 %	60 %	20 %	525711188
255	NC_021745	CGGCG	2	10	314086	314095	0 %	0 %	60 %	40 %	525711193
256	NC_021745	CCGTC	2	10	316591	316600	0 %	20 %	20 %	60 %	525711196
257	NC_021745	CGGCA	2	10	316717	316726	20 %	0 %	40 %	40 %	525711196
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261	NC_021745	GGCAC	2	10	322559	322568	20 %	0 %	40 %	40 %	525711199
262	NC_021745	CCGTG	2	10	323606	323615	0 %	20 %	40 %	40 %	525711200
263	NC_021745	ATCGC	2	10	325489	325498	20 %	20 %	20 %	40 %	525711202
264	NC_021745	GGCCG	2	10	328453	328462	0 %	0 %	60 %	40 %	525711203
265	NC_021745	GTACG	2	10	329893	329902	20 %	20 %	40 %	20 %	525711205
266	NC_021745	CGATT	2	10	330134	330143	20 %	40 %	20 %	20 %	525711205
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383	NC_021745	CCGAT	2	10	520265	520274	20 %	20 %	20 %	40 %	525711317
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