MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum FQY_4 megaplasmid

Total Repeats: 1222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021745	GCCC	2	8	128	135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_021745	GCTT	2	8	564	571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021745	CCCG	2	8	658	665	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_021745	ACGC	2	8	728	735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021745	AGTC	2	8	949	956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021745	GTAT	2	8	1009	1016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021745	GACT	2	8	1187	1194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021745	CAAC	2	8	2697	2704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021745	GCAG	2	8	3001	3008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021745	GGCC	2	8	7777	7784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021745	CGGC	3	12	14068	14079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021745	GCCG	2	8	14134	14141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021745	ACGC	2	8	26295	26302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021745	GCCG	2	8	27594	27601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021745	CTGG	2	8	27637	27644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021745	TATC	3	12	28700	28711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021745	GAGG	2	8	28900	28907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021745	CCGA	2	8	30826	30833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021745	CTCC	2	8	37318	37325	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_021745	TGCA	2	8	37528	37535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021745	GACC	2	8	38011	38018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021745	CGGG	2	8	39483	39490	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021745	CTCG	2	8	39707	39714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021745	CCGC	2	8	39786	39793	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_021745	ATGC	2	8	43132	43139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021745	AAAG	2	8	43248	43255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021745	GGCC	2	8	43571	43578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021745	AGCG	2	8	44483	44490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021745	GGAT	2	8	44617	44624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021745	TGCG	2	8	46422	46429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021745	GACC	2	8	48810	48817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021745	GGGA	2	8	48852	48859	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021745	GTTG	2	8	49195	49202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021745	GCTC	2	8	49444	49451	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021745	GATT	2	8	49745	49752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021745	GCCG	2	8	49786	49793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021745	GCTC	2	8	52636	52643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021745	CCCG	2	8	58527	58534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_021745	ATGT	2	8	61387	61394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021745	TGCA	2	8	61706	61713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021745	TCGA	2	8	61771	61778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021745	TTTG	2	8	61986	61993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021745	AGAA	2	8	62074	62081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021745	AATA	2	8	62082	62089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021745	CGGG	2	8	62200	62207	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021745	CGAT	2	8	62259	62266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021745	GAAG	2	8	62411	62418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021745	GACG	2	8	63594	63601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021745	GCCT	2	8	63827	63834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021745	GCGT	2	8	64719	64726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021745	TGGG	2	8	67179	67186	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021745	AGCG	2	8	67241	67248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021745	CGAT	2	8	71043	71050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021745	GCAC	2	8	71977	71984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021745	CCGG	2	8	77693	77700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021745	TGCC	2	8	77858	77865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021745	GGCG	2	8	78052	78059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021745	GGCC	2	8	79741	79748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021745	GGGC	2	8	79778	79785	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021745	GGTT	2	8	79811	79818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021745	CGTT	2	8	82118	82125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021745	CGGT	2	8	82128	82135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021745	GGTA	2	8	82153	82160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021745	CGGT	2	8	82162	82169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021745	CGGG	2	8	82943	82950	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021745	TGAT	2	8	87169	87176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021745	TCCG	2	8	88244	88251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021745	CTGC	2	8	90009	90016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021745	TCCA	2	8	90931	90938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021745	GCCG	2	8	91482	91489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021745	GTCG	2	8	91889	91896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021745	CCCA	2	8	93347	93354	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_021745	GCGT	2	8	93818	93825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021745	AGTG	2	8	93854	93861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021745	GCCG	2	8	94321	94328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021745	GCCC	2	8	98249	98256	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_021745	CCGG	2	8	102677	102684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021745	CGTG	2	8	104262	104269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021745	GACG	2	8	104453	104460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021745	AGGG	2	8	104590	104597	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021745	GCAT	2	8	105235	105242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021745	TCGA	2	8	105276	105283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021745	GGTT	2	8	107275	107282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021745	TGGT	2	8	107310	107317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021745	GAAG	2	8	108000	108007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021745	CTTC	2	8	109074	109081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021745	ATTC	2	8	110130	110137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021745	CGCT	2	8	110328	110335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021745	GAAA	2	8	110650	110657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021745	CACC	2	8	118058	118065	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_021745	GGCC	2	8	118086	118093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021745	GCGG	2	8	118273	118280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021745	CGCC	2	8	120246	120253	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_021745	GCCC	2	8	120328	120335	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_021745	AGGC	2	8	121754	121761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021745	TTTC	2	8	122690	122697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021745	GATA	2	8	126823	126830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021745	GTCG	2	8	128835	128842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021745	CGTG	2	8	132338	132345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021745	TTTG	2	8	132712	132719	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021745	CATA	2	8	137872	137879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021745	GTTG	2	8	137908	137915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021745	GGGT	2	8	137976	137983	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021745	TGTT	2	8	138091	138098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021745	AAAT	2	8	138740	138747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021745	ATTA	2	8	138907	138914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021745	TGAT	2	8	138929	138936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021745	GATC	2	8	138998	139005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021745	TCGA	2	8	139049	139056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021745	GCCG	2	8	139364	139371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021745	GCCG	2	8	141569	141576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021745	GGCG	2	8	163359	163366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021745	AAAT	2	8	164382	164389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021745	CGGA	2	8	166614	166621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021745	GCGG	2	8	167177	167184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021745	CGCC	2	8	167334	167341	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_021745	GGCG	2	8	167347	167354	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021745	TGCA	2	8	167423	167430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021745	CGTT	2	8	167497	167504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021745	CCCG	2	8	167712	167719	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_021745	TGGC	2	8	171877	171884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021745	CCTG	2	8	171991	171998	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021745	CCGG	2	8	174287	174294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021745	GCGA	2	8	176615	176622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021745	CAGC	2	8	181617	181624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021745	TGGG	2	8	181660	181667	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021745	CGAT	2	8	181956	181963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021745	CGGC	2	8	183939	183946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021745	GCCG	2	8	184154	184161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021745	CCGC	2	8	184252	184259	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_021745	GCGG	2	8	184279	184286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021745	GCGG	2	8	186748	186755	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021745	CGTG	2	8	192198	192205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021745	GGAT	2	8	193333	193340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021745	CCCG	3	12	194177	194188	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_021745	GCAT	2	8	194591	194598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021745	CATT	2	8	194835	194842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021745	GCCG	2	8	195527	195534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021745	ATGG	2	8	200655	200662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021745	CGTC	2	8	201290	201297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021745	ATGC	2	8	201372	201379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021745	TTAT	2	8	201400	201407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021745	GTGG	2	8	201893	201900	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021745	CCGG	2	8	201981	201988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021745	GAGC	2	8	202017	202024	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021745	CGGC	2	8	202271	202278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021745	CGTT	2	8	202858	202865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021745	CTGC	2	8	203022	203029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021745	GCCA	2	8	203123	203130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021745	CCGT	2	8	203309	203316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021745	GTGG	2	8	204171	204178	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021745	TGCG	2	8	204229	204236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_021745	GGCG	2	8	204745	204752	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_021745	GGCG	2	8	206215	206222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_021745	ATGG	2	8	758149	758156	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

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