MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus CNRZ32

Total Repeats: 971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021744	GCAGAA	2	12	1076	1087	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525706522
2	NC_021744	GATGCA	2	12	6292	6303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525706526
3	NC_021744	GCAAGG	2	12	8679	8690	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525706527
4	NC_021744	GATCAA	2	12	8840	8851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525706527
5	NC_021744	TAATTT	2	12	9399	9410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706528
6	NC_021744	AGATAA	2	12	13942	13953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525706532
7	NC_021744	ATATCT	2	12	17002	17013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525706536
8	NC_021744	AGCTGA	2	12	22956	22967	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525706540
9	NC_021744	TGAAGT	2	12	24525	24536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706541
10	NC_021744	CCAAAA	2	12	31400	31411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021744	AAAAAT	2	12	31690	31701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021744	ATAAAT	2	12	35154	35165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021744	TCCTAT	2	12	39038	39049	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525706555
14	NC_021744	AAAGTA	2	12	41778	41789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021744	GCTGAA	2	12	42071	42082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525706559
16	NC_021744	CATCCC	2	12	42683	42694	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525706561
17	NC_021744	TTTTAT	2	12	45839	45850	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021744	AGATGC	2	12	45996	46007	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525706564
19	NC_021744	ATGGTG	2	12	46973	46984	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525706565
20	NC_021744	TTTGAA	2	12	48605	48616	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525706567
21	NC_021744	AGATGA	2	12	51878	51889	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525706568
22	NC_021744	TAAAGT	2	12	53894	53905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525706572
23	NC_021744	GGAATA	2	12	53943	53954	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525706572
24	NC_021744	AAATAC	2	12	56828	56839	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021744	TCATGA	2	12	57772	57783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706575
26	NC_021744	AAAAAG	2	12	58693	58704	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525706577
27	NC_021744	GCAACT	2	12	59191	59202	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525706578
28	NC_021744	GAATAT	2	12	61311	61322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525706581
29	NC_021744	TCACCG	2	12	63203	63214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525706582
30	NC_021744	ATATTT	2	12	65402	65413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021744	ATACTT	2	12	67075	67086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525706584
32	NC_021744	CTTTGA	2	12	67814	67825	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525706584
33	NC_021744	AGACAA	2	12	70673	70684	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021744	CTTGTT	2	12	71195	71206	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525706586
35	NC_021744	CTTCGT	2	12	71407	71418	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525706586
36	NC_021744	TTACAA	2	12	71506	71517	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525706586
37	NC_021744	CTTTTT	2	12	73571	73582	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021744	ATTGCA	2	12	75219	75230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021744	ATAAAA	2	12	76345	76356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525706589
40	NC_021744	CGGAGC	2	12	83983	83994	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021744	TACTTT	2	12	88335	88346	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021744	CACGGT	2	12	88875	88886	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021744	AACGTT	2	12	97392	97403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706598
44	NC_021744	ATTTTA	2	12	98674	98685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021744	TATTTT	2	12	99250	99261	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021744	CAGTTA	2	12	99516	99527	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706600
47	NC_021744	ATAAAA	2	12	103306	103317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525706605
48	NC_021744	ACTGCT	2	12	103458	103469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021744	CCAAAA	2	12	106005	106016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021744	AAAAAT	2	12	106295	106306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021744	GATTCA	2	12	107885	107896	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706609
52	NC_021744	AAATTC	2	12	109582	109593	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525706609
53	NC_021744	TAAGGA	2	12	114556	114567	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525706614
54	NC_021744	TCAACA	2	12	116355	116366	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525706615
55	NC_021744	AAAGAA	2	12	117460	117471	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021744	CTTGAT	2	12	118986	118997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525706618
57	NC_021744	TAACTG	2	12	119495	119506	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706619
58	NC_021744	AAGACA	2	12	123516	123527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525706622
59	NC_021744	CTATTC	2	12	127750	127761	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525706628
60	NC_021744	GCTTAA	2	12	131520	131531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021744	AATTTT	2	12	133350	133361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021744	AACTTG	2	12	134169	134180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706632
63	NC_021744	ATAAAT	2	12	136485	136496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706633
64	NC_021744	GCTTCA	2	12	136585	136596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525706633
65	NC_021744	TTCCGA	2	12	137720	137731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525706635
66	NC_021744	CTTTTT	2	12	138000	138011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525706636
67	NC_021744	CATAAT	2	12	138444	138455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525706636
68	NC_021744	TTATTT	2	12	140419	140430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021744	ATAAAT	2	12	141030	141041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706638
70	NC_021744	ACTTCT	2	12	142331	142342	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525706639
71	NC_021744	GTTTTG	2	12	146251	146262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706643
72	NC_021744	TGGCAA	2	12	147339	147350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525706645
73	NC_021744	TGTTGA	2	12	149385	149396	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525706647
74	NC_021744	CTAAGG	2	12	151163	151174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525706649
75	NC_021744	TTCTGG	2	12	152212	152223	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525706650
76	NC_021744	TAAAGA	2	12	157301	157312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525706654
77	NC_021744	TTGCAG	2	12	157731	157742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525706655
78	NC_021744	TTCCAA	2	12	158596	158607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706656
79	NC_021744	GAATAA	2	12	158756	158767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525706656
80	NC_021744	AACGCA	2	12	159749	159760	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525706658
81	NC_021744	CAATTT	2	12	159998	160009	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525706658
82	NC_021744	ATTGCC	2	12	160584	160595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525706658
83	NC_021744	TAACTT	2	12	165055	165066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525706662
84	NC_021744	CTAAGG	2	12	166820	166831	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525706664
85	NC_021744	TAAAGA	2	12	170720	170731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525706669
86	NC_021744	GTCATC	2	12	171457	171468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525706669
87	NC_021744	CTAAGA	2	12	174186	174197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525706671
88	NC_021744	TATTGA	2	12	178801	178812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525706675
89	NC_021744	CTGAAG	2	12	182433	182444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525706678
90	NC_021744	TGTGGT	2	12	184274	184285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021744	CAATAG	2	12	184938	184949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021744	GTAACA	2	12	185654	185665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021744	GATGAA	2	12	187402	187413	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525706680
94	NC_021744	TATCCT	3	18	187436	187453	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525706680
95	NC_021744	CTAGAA	2	12	187465	187476	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525706680
96	NC_021744	AATACT	2	12	189083	189094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525706683
97	NC_021744	TGTTAA	2	12	189790	189801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525706683
98	NC_021744	GTAACT	2	12	189842	189853	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706683
99	NC_021744	ATATAG	2	12	192307	192318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021744	TTGATT	2	12	195874	195885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525706689
101	NC_021744	TTTGCA	2	12	198118	198129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021744	TTTCTT	2	12	199780	199791	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021744	CTAGAA	2	12	203251	203262	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525706693
104	NC_021744	ATTAAT	2	12	203380	203391	50 %	50 %	0 %	0 %	525706693
105	NC_021744	AATTTC	2	12	205563	205574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525706697
106	NC_021744	CTACAT	2	12	206468	206479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706697
107	NC_021744	TGATCA	2	12	208959	208970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706700
108	NC_021744	TATTCA	2	12	212431	212442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525706705
109	NC_021744	GAGCTT	2	12	213610	213621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525706706
110	NC_021744	TAAAAA	2	12	214936	214947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525706707
111	NC_021744	TGAATA	2	12	215163	215174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525706707
112	NC_021744	AAATCA	2	12	216277	216288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021744	TGCCAT	2	12	217372	217383	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021744	AATTTT	2	12	217586	217597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021744	CAAAGG	2	12	218306	218317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021744	TCTTAT	2	12	219231	219242	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021744	ATTGGT	2	12	219940	219951	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525706710
118	NC_021744	TATGAA	2	12	220504	220515	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525706710
119	NC_021744	AATCTT	2	12	227658	227669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525706716
120	NC_021744	ATTGTG	2	12	229260	229271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_021744	CGGAGC	2	12	544268	544279	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_021744	TATGAA	2	12	547446	547457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
239	NC_021744	TTCCTT	2	12	547482	547493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_021744	ATGCTA	2	12	548698	548709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706959
241	NC_021744	GATACT	2	12	558024	558035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525706967
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243	NC_021744	AAAAAG	2	12	562360	562371	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
244	NC_021744	GAAGTA	2	12	566634	566645	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_021744	AAGTGC	2	12	590494	590505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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262	NC_021744	GGTTCA	2	12	614600	614611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525707004
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268	NC_021744	CAATGT	2	12	622004	622015	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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342	NC_021744	CAATTG	2	12	808190	808201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525707134
343	NC_021744	CTTTAA	2	12	808758	808769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525707135
344	NC_021744	CTGAAG	2	12	809007	809018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525707135
345	NC_021744	TAAAAA	2	12	813654	813665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_021744	AATACT	2	12	814192	814203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
347	NC_021744	AAGAAT	2	12	814714	814725	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
348	NC_021744	CTTTTC	2	12	815575	815586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
349	NC_021744	TTTGCC	2	12	820506	820517	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525707141
350	NC_021744	GTTCCA	2	12	821401	821412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525707142
351	NC_021744	ATCTAT	2	12	824075	824086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
352	NC_021744	TTCATA	2	12	825094	825105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525707146
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354	NC_021744	TAAAAG	2	12	828710	828721	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525707151
355	NC_021744	AATGAA	2	12	830349	830360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525707152
356	NC_021744	ATGAAA	2	12	830497	830508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525707152
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467	NC_021744	GGTACT	2	12	1059396	1059407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525707322
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470	NC_021744	AATGAA	2	12	1065720	1065731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_021744	AATGTT	2	12	1073191	1073202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525707329
472	NC_021744	TTAATT	2	12	1073713	1073724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_021744	ATTAGT	2	12	1077160	1077171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525707331
474	NC_021744	GTCATC	2	12	1079241	1079252	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525707334
475	NC_021744	GAAGAT	2	12	1081189	1081200	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525707336
476	NC_021744	ATGTTG	2	12	1081337	1081348	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525707336
477	NC_021744	AAATCA	2	12	1081542	1081553	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525707337
478	NC_021744	ATTTTA	2	12	1082802	1082813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525707338
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481	NC_021744	AAAAGC	2	12	1092071	1092082	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525707344
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488	NC_021744	TGACTA	2	12	1099869	1099880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
489	NC_021744	CTTAAG	2	12	1102111	1102122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
490	NC_021744	ATTGAT	2	12	1104033	1104044	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_021744	AATTGA	2	12	1131674	1131685	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525707371
499	NC_021744	TGTCGA	2	12	1131901	1131912	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525707372
500	NC_021744	GTTAAG	2	12	1132829	1132840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525707372

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